MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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83002	NC_022525	ATTC	2	8	4495901	4495908	25 %	50 %	0 %	25 %	549481524
83003	NC_022525	CGCC	2	8	4495928	4495935	0 %	0 %	25 %	75 %	549481524
83004	NC_022525	CGC	2	6	4496006	4496011	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481524
83005	NC_022525	CAG	2	6	4496049	4496054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481524
83006	NC_022525	GAT	2	6	4496076	4496081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481524
83007	NC_022525	AC	3	6	4496100	4496105	50 %	0 %	0 %	50 %	549481524
83008	NC_022525	TTC	2	6	4496140	4496145	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481524
83009	NC_022525	GAT	2	6	4496178	4496183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481524
83010	NC_022525	CG	3	6	4496189	4496194	0 %	0 %	50 %	50 %	549481524
83011	NC_022525	AGA	2	6	4496202	4496207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481524
83012	NC_022525	CTTG	2	8	4496258	4496265	0 %	50 %	25 %	25 %	549481524
83013	NC_022525	CGCC	2	8	4496273	4496280	0 %	0 %	25 %	75 %	549481524
83014	NC_022525	GC	3	6	4496282	4496287	0 %	0 %	50 %	50 %	549481524
83015	NC_022525	CCA	2	6	4496294	4496299	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481524
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83017	NC_022525	GTC	2	6	4496325	4496330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481524
83018	NC_022525	TGT	2	6	4496366	4496371	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481524
83019	NC_022525	TGA	2	6	4496435	4496440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481524
83020	NC_022525	GA	3	6	4496533	4496538	50 %	0 %	50 %	0 %	549481524
83021	NC_022525	GCT	2	6	4496549	4496554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481524
83022	NC_022525	GGCG	2	8	4496598	4496605	0 %	0 %	75 %	25 %	549481524
83023	NC_022525	CGA	2	6	4496621	4496626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481524
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83028	NC_022525	GTA	2	6	4497122	4497127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482436
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83031	NC_022525	GCT	2	6	4497337	4497342	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482436
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83033	NC_022525	T	6	6	4497647	4497652	0 %	100 %	0 %	0 %	549482436
83034	NC_022525	A	7	7	4497986	4497992	100 %	0 %	0 %	0 %	549481525
83035	NC_022525	CT	3	6	4498006	4498011	0 %	50 %	0 %	50 %	549481525
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83039	NC_022525	TCA	2	6	4498401	4498406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481525
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83053	NC_022525	GC	3	6	4499220	4499225	0 %	0 %	50 %	50 %	549481525
83054	NC_022525	CCG	2	6	4499266	4499271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481525
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83089	NC_022525	TGGCG	2	10	4500939	4500948	0 %	20 %	60 %	20 %	549481526
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83101	NC_022525	CG	3	6	4501665	4501670	0 %	0 %	50 %	50 %	549481526
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83118	NC_022525	CCG	2	6	4502481	4502486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481526
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83220	NC_022525	TCT	2	6	4507890	4507895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481531
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83223	NC_022525	GAC	2	6	4508036	4508041	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481531
83224	NC_022525	CTT	2	6	4508053	4508058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481531
83225	NC_022525	CGATG	2	10	4508060	4508069	20 %	20 %	40 %	20 %	549481531
83226	NC_022525	CG	3	6	4508083	4508088	0 %	0 %	50 %	50 %	549481531
83227	NC_022525	CTG	2	6	4508135	4508140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481531
83228	NC_022525	TTG	2	6	4508199	4508204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481531
83229	NC_022525	GAT	2	6	4508216	4508221	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481531
83230	NC_022525	GA	3	6	4508275	4508280	50 %	0 %	50 %	0 %	549481531
83231	NC_022525	TGC	2	6	4508286	4508291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481531
83232	NC_022525	G	7	7	4508536	4508542	0 %	0 %	100 %	0 %	549481532
83233	NC_022525	GCTC	2	8	4508555	4508562	0 %	25 %	25 %	50 %	549481532
83234	NC_022525	CCG	2	6	4508603	4508608	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481532
83235	NC_022525	TGATC	2	10	4508638	4508647	20 %	40 %	20 %	20 %	549481532
83236	NC_022525	GCCA	2	8	4508660	4508667	25 %	0 %	25 %	50 %	549481532
83237	NC_022525	CG	3	6	4508712	4508717	0 %	0 %	50 %	50 %	549481532
83238	NC_022525	CGTG	2	8	4508724	4508731	0 %	25 %	50 %	25 %	549481532
83239	NC_022525	A	7	7	4508745	4508751	100 %	0 %	0 %	0 %	549481532
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83254	NC_022525	CGCC	2	8	4509427	4509434	0 %	0 %	25 %	75 %	549481532
83255	NC_022525	GCGAA	2	10	4509453	4509462	40 %	0 %	40 %	20 %	549481532
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83339	NC_022525	GTTG	2	8	4513935	4513942	0 %	50 %	50 %	0 %	549481535
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83343	NC_022525	T	6	6	4514227	4514232	0 %	100 %	0 %	0 %	549481535
83344	NC_022525	TGC	2	6	4514234	4514239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481535
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83346	NC_022525	CGG	2	6	4514412	4514417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481535
83347	NC_022525	GTC	2	6	4514440	4514445	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481535
83348	NC_022525	GGCC	2	8	4515004	4515011	0 %	0 %	50 %	50 %	549481536
83349	NC_022525	TAG	2	6	4515024	4515029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481536
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83351	NC_022525	GGT	2	6	4515058	4515063	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481536
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83467	NC_022525	GAA	2	6	4522586	4522591	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481542
83468	NC_022525	TG	3	6	4522637	4522642	0 %	50 %	50 %	0 %	549481542
83469	NC_022525	GTC	2	6	4522703	4522708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481542
83470	NC_022525	TGA	2	6	4522798	4522803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481542
83471	NC_022525	GGC	2	6	4522960	4522965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481542
83472	NC_022525	CTT	2	6	4523005	4523010	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481542
83473	NC_022525	GCA	2	6	4523028	4523033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83474	NC_022525	CCG	2	6	4523046	4523051	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481543
83475	NC_022525	CAG	2	6	4523056	4523061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83476	NC_022525	AGA	2	6	4523078	4523083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481543
83477	NC_022525	CTG	2	6	4523089	4523094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83478	NC_022525	CAG	2	6	4523113	4523118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83479	NC_022525	CAGCCG	2	12	4523249	4523260	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549481543
83480	NC_022525	CGC	2	6	4523266	4523271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481543
83481	NC_022525	CAGCG	2	10	4523278	4523287	20 %	0 %	40 %	40 %	549481543
83482	NC_022525	CTG	2	6	4523289	4523294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83483	NC_022525	AGT	2	6	4523336	4523341	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481543
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83486	NC_022525	CGA	2	6	4523550	4523555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83487	NC_022525	GAT	2	6	4523626	4523631	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481543
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83489	NC_022525	GGCC	2	8	4523667	4523674	0 %	0 %	50 %	50 %	549481543
83490	NC_022525	GCG	2	6	4523697	4523702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481543
83491	NC_022525	GCCA	2	8	4523774	4523781	25 %	0 %	25 %	50 %	549481543
83492	NC_022525	CAG	2	6	4523830	4523835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
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83494	NC_022525	AGC	2	6	4523867	4523872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83495	NC_022525	CAG	2	6	4523905	4523910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83496	NC_022525	GCG	2	6	4523918	4523923	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481543
83497	NC_022525	CTG	3	9	4524061	4524069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83498	NC_022525	GCA	2	6	4524081	4524086	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481543
83499	NC_022525	TGT	2	6	4524164	4524169	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481543
83500	NC_022525	AGT	2	6	4524270	4524275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482439

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