MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
81501	NC_022525	T	7	7	4416060	4416066	0 %	100 %	0 %	0 %	549482420
81502	NC_022525	ATAA	2	8	4416087	4416094	75 %	25 %	0 %	0 %	549482420
81503	NC_022525	CGCGG	2	10	4416141	4416150	0 %	0 %	60 %	40 %	549482420
81504	NC_022525	TGTAG	2	10	4416180	4416189	20 %	40 %	40 %	0 %	549482421
81505	NC_022525	CGG	2	6	4416214	4416219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482421
81506	NC_022525	CA	3	6	4416331	4416336	50 %	0 %	0 %	50 %	549482421
81507	NC_022525	TCT	2	6	4417186	4417191	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549482422
81508	NC_022525	ATT	2	6	4417203	4417208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482422
81509	NC_022525	CTC	2	6	4417221	4417226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549482422
81510	NC_022525	GC	3	6	4417385	4417390	0 %	0 %	50 %	50 %	549482422
81511	NC_022525	ATA	2	6	4417409	4417414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549482422
81512	NC_022525	ATA	2	6	4417539	4417544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549482422
81513	NC_022525	T	7	7	4417545	4417551	0 %	100 %	0 %	0 %	549482422
81514	NC_022525	GTA	2	6	4417566	4417571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482422
81515	NC_022525	GCC	2	6	4417572	4417577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482422
81516	NC_022525	AGA	2	6	4417585	4417590	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549482422
81517	NC_022525	ACT	2	6	4417645	4417650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482422
81518	NC_022525	CAG	2	6	4417697	4417702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482422
81519	NC_022525	CCT	2	6	4417751	4417756	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549482422
81520	NC_022525	ATC	2	6	4417776	4417781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482422
81521	NC_022525	GGT	3	9	4417792	4417800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482422
81522	NC_022525	ACTG	2	8	4417808	4417815	25 %	25 %	25 %	25 %	549482422
81523	NC_022525	TTC	2	6	4417824	4417829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549482422
81524	NC_022525	CTG	2	6	4417856	4417861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482422
81525	NC_022525	A	6	6	4417890	4417895	100 %	0 %	0 %	0 %	549482422
81526	NC_022525	ATT	2	6	4418335	4418340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482423
81527	NC_022525	TGA	2	6	4418349	4418354	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482423
81528	NC_022525	TTA	2	6	4418424	4418429	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482423
81529	NC_022525	TAA	2	6	4418434	4418439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549482423
81530	NC_022525	TAAG	2	8	4418452	4418459	50 %	25 %	25 %	0 %	549482423
81531	NC_022525	GC	3	6	4418826	4418831	0 %	0 %	50 %	50 %	549481455
81532	NC_022525	CG	3	6	4419022	4419027	0 %	0 %	50 %	50 %	549481455
81533	NC_022525	TTG	2	6	4419031	4419036	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481455
81534	NC_022525	TGGGT	2	10	4419059	4419068	0 %	40 %	60 %	0 %	549481455
81535	NC_022525	GGC	2	6	4419085	4419090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481455
81536	NC_022525	TTA	2	6	4419116	4419121	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481455
81537	NC_022525	CAG	2	6	4419168	4419173	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481455
81538	NC_022525	TCA	2	6	4419182	4419187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481455
81539	NC_022525	AGA	2	6	4419188	4419193	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481455
81540	NC_022525	CTG	2	6	4419217	4419222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481455
81541	NC_022525	CTT	2	6	4419255	4419260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481455
81542	NC_022525	CCA	2	6	4419312	4419317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481455
81543	NC_022525	GTA	2	6	4419326	4419331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481455
81544	NC_022525	GC	3	6	4419453	4419458	0 %	0 %	50 %	50 %	549481456
81545	NC_022525	GGC	2	6	4419466	4419471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481456
81546	NC_022525	TGG	2	6	4419534	4419539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481456
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81548	NC_022525	CTG	2	6	4419634	4419639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481456
81549	NC_022525	GCC	2	6	4419857	4419862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481456
81550	NC_022525	AAAG	2	8	4419931	4419938	75 %	0 %	25 %	0 %	549481456
81551	NC_022525	CAG	2	6	4419946	4419951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481456
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81553	NC_022525	CCG	2	6	4420145	4420150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481456
81554	NC_022525	GTA	2	6	4420208	4420213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481456
81555	NC_022525	CCG	2	6	4420259	4420264	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481456
81556	NC_022525	GCC	2	6	4420270	4420275	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481456
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81558	NC_022525	TGC	2	6	4420403	4420408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481456
81559	NC_022525	GCC	2	6	4420412	4420417	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481456
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81561	NC_022525	CGA	2	6	4420440	4420445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481456
81562	NC_022525	CAG	3	9	4420498	4420506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481456
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81564	NC_022525	C	6	6	4420535	4420540	0 %	0 %	0 %	100 %	549481456
81565	NC_022525	CAG	2	6	4420609	4420614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481456
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81567	NC_022525	CAG	2	6	4420677	4420682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481456
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81572	NC_022525	TCG	2	6	4420923	4420928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481456
81573	NC_022525	GTA	2	6	4420957	4420962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481456
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81575	NC_022525	GCGA	2	8	4421049	4421056	25 %	0 %	50 %	25 %	549481456
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81583	NC_022525	GGC	2	6	4421334	4421339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481457
81584	NC_022525	GGC	2	6	4421361	4421366	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481457
81585	NC_022525	CAC	2	6	4421406	4421411	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481457
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81588	NC_022525	GAA	2	6	4421646	4421651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481458
81589	NC_022525	GGT	2	6	4421654	4421659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481458
81590	NC_022525	CATC	2	8	4421696	4421703	25 %	25 %	0 %	50 %	549481458
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81593	NC_022525	GAAG	2	8	4421763	4421770	50 %	0 %	50 %	0 %	549481458
81594	NC_022525	GA	3	6	4421786	4421791	50 %	0 %	50 %	0 %	549481458
81595	NC_022525	CAGCGC	2	12	4421796	4421807	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549481458
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81599	NC_022525	CAG	2	6	4421880	4421885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481458
81600	NC_022525	GCCAC	2	10	4421963	4421972	20 %	0 %	20 %	60 %	549481458
81601	NC_022525	ATACAG	2	12	4421980	4421991	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	549481458
81602	NC_022525	TGG	2	6	4422056	4422061	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481458
81603	NC_022525	ATG	2	6	4422082	4422087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481458
81604	NC_022525	TGG	2	6	4422101	4422106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481458
81605	NC_022525	TCA	2	6	4422110	4422115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481458
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81609	NC_022525	CAC	2	6	4422239	4422244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481458
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81612	NC_022525	AGGA	2	8	4422325	4422332	50 %	0 %	50 %	0 %	549481458
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81614	NC_022525	CAG	2	6	4422375	4422380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481458
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