MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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78002	NC_022525	CGA	2	6	4222321	4222326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481336
78003	NC_022525	GTC	2	6	4222407	4222412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481336
78004	NC_022525	CAG	3	9	4222604	4222612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481336
78005	NC_022525	GAT	2	6	4222700	4222705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481336
78006	NC_022525	TGC	2	6	4222710	4222715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481336
78007	NC_022525	AAG	2	6	4222776	4222781	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481336
78008	NC_022525	GCT	2	6	4222795	4222800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481336
78009	NC_022525	TACATG	2	12	4222889	4222900	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	549481336
78010	NC_022525	ACC	2	6	4222911	4222916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481336
78011	NC_022525	TGA	2	6	4222921	4222926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481336
78012	NC_022525	ATGC	2	8	4222931	4222938	25 %	25 %	25 %	25 %	549481336
78013	NC_022525	CAG	2	6	4222970	4222975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481336
78014	NC_022525	GGT	2	6	4222982	4222987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481336
78015	NC_022525	GGT	2	6	4223000	4223005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481336
78016	NC_022525	GCC	2	6	4223051	4223056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481336
78017	NC_022525	TGA	2	6	4223089	4223094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481336
78018	NC_022525	CGCT	2	8	4223195	4223202	0 %	25 %	25 %	50 %	549481336
78019	NC_022525	TTA	2	6	4223319	4223324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481337
78020	NC_022525	GTG	2	6	4223551	4223556	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481337
78021	NC_022525	GCG	2	6	4223572	4223577	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481337
78022	NC_022525	CTG	2	6	4223685	4223690	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78023	NC_022525	GTACT	2	10	4223721	4223730	20 %	40 %	20 %	20 %	549481337
78024	NC_022525	CTGA	2	8	4223787	4223794	25 %	25 %	25 %	25 %	549481337
78025	NC_022525	CTG	2	6	4223871	4223876	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78026	NC_022525	CTG	2	6	4223976	4223981	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78027	NC_022525	CAA	2	6	4224002	4224007	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481337
78028	NC_022525	GAT	2	6	4224017	4224022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481337
78029	NC_022525	GCC	2	6	4224044	4224049	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481337
78030	NC_022525	TGG	2	6	4224077	4224082	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481337
78031	NC_022525	TCG	2	6	4224116	4224121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78032	NC_022525	AAC	2	6	4224135	4224140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481337
78033	NC_022525	CTG	2	6	4224153	4224158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78034	NC_022525	CAT	2	6	4224176	4224181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481337
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78038	NC_022525	GTC	2	6	4224238	4224243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78039	NC_022525	ACT	2	6	4224352	4224357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481337
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78042	NC_022525	GAA	2	6	4224500	4224505	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481337
78043	NC_022525	GAA	2	6	4224519	4224524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481337
78044	NC_022525	CGT	2	6	4224527	4224532	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78045	NC_022525	CTG	2	6	4224573	4224578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
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78049	NC_022525	TAC	2	6	4224840	4224845	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481337
78050	NC_022525	AAG	2	6	4224901	4224906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481337
78051	NC_022525	TATC	2	8	4224914	4224921	25 %	50 %	0 %	25 %	549481337
78052	NC_022525	CT	3	6	4224935	4224940	0 %	50 %	0 %	50 %	549481337
78053	NC_022525	GC	3	6	4224945	4224950	0 %	0 %	50 %	50 %	549481337
78054	NC_022525	GAT	2	6	4225049	4225054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481337
78055	NC_022525	ACCG	2	8	4225154	4225161	25 %	0 %	25 %	50 %	549481337
78056	NC_022525	TGA	2	6	4225232	4225237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481337
78057	NC_022525	A	6	6	4225254	4225259	100 %	0 %	0 %	0 %	549481337
78058	NC_022525	ATC	2	6	4225266	4225271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481337
78059	NC_022525	GTCTG	2	10	4225316	4225325	0 %	40 %	40 %	20 %	549481337
78060	NC_022525	GCG	2	6	4225371	4225376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481337
78061	NC_022525	GAT	2	6	4225397	4225402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481337
78062	NC_022525	AAACCG	2	12	4225414	4225425	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	549481337
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78065	NC_022525	CAT	2	6	4225568	4225573	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481337
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78068	NC_022525	TGA	2	6	4225771	4225776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481337
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78085	NC_022525	GGT	2	6	4226517	4226522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481337
78086	NC_022525	TTG	2	6	4226548	4226553	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481337
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78088	NC_022525	GGT	2	6	4226715	4226720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481337
78089	NC_022525	CG	3	6	4226725	4226730	0 %	0 %	50 %	50 %	549481337
78090	NC_022525	CGT	2	6	4226751	4226756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
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78094	NC_022525	TCTGCG	2	12	4226969	4226980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
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78101	NC_022525	CCGG	2	8	4227381	4227388	0 %	0 %	50 %	50 %	549481337
78102	NC_022525	ACC	2	6	4227403	4227408	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481337
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78104	NC_022525	AGC	2	6	4227439	4227444	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481337
78105	NC_022525	CTG	2	6	4227495	4227500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481337
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78109	NC_022525	TA	4	8	4227726	4227733	50 %	50 %	0 %	0 %	549482377
78110	NC_022525	TATT	3	12	4227756	4227767	25 %	75 %	0 %	0 %	549482377
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78112	NC_022525	TTC	2	6	4227795	4227800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549482377
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78231	NC_022525	CAG	2	6	4233955	4233960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481343
78232	NC_022525	TCG	2	6	4233989	4233994	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481343
78233	NC_022525	GTC	2	6	4234027	4234032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481343
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78235	NC_022525	CTG	2	6	4234090	4234095	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481343
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78302	NC_022525	GC	3	6	4237745	4237750	0 %	0 %	50 %	50 %	549481347
78303	NC_022525	CAT	2	6	4237904	4237909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481348
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78334	NC_022525	CCCATA	2	12	4239713	4239724	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	549481351
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78338	NC_022525	GCC	2	6	4239757	4239762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481351
78339	NC_022525	GC	3	6	4239963	4239968	0 %	0 %	50 %	50 %	549481351
78340	NC_022525	ATC	2	6	4239985	4239990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481351
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78342	NC_022525	CTG	2	6	4240012	4240017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481351
78343	NC_022525	TTG	2	6	4240061	4240066	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481351
78344	NC_022525	GGC	2	6	4240087	4240092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481351
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78462	NC_022525	TGG	2	6	4245331	4245336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481355
78463	NC_022525	CTT	2	6	4245363	4245368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481355
78464	NC_022525	CGG	2	6	4245404	4245409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481355
78465	NC_022525	CTT	2	6	4245410	4245415	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481355
78466	NC_022525	TGC	2	6	4245443	4245448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481355
78467	NC_022525	AGT	2	6	4245452	4245457	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481355
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78469	NC_022525	GT	3	6	4245484	4245489	0 %	50 %	50 %	0 %	549481355
78470	NC_022525	CATC	2	8	4245548	4245555	25 %	25 %	0 %	50 %	549481355
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78480	NC_022525	GGCG	2	8	4245905	4245912	0 %	0 %	75 %	25 %	549481355
78481	NC_022525	C	6	6	4245916	4245921	0 %	0 %	0 %	100 %	549481355
78482	NC_022525	CAG	2	6	4245927	4245932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481355
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78484	NC_022525	GCG	2	6	4246005	4246010	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481355
78485	NC_022525	GAC	2	6	4246016	4246021	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481355
78486	NC_022525	GTT	2	6	4246022	4246027	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481355
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78489	NC_022525	TCG	2	6	4252273	4252278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481356
78490	NC_022525	AGC	2	6	4252465	4252470	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481356
78491	NC_022525	CGTG	2	8	4252583	4252590	0 %	25 %	50 %	25 %	549481356
78492	NC_022525	ATC	3	9	4252660	4252668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481356
78493	NC_022525	CCG	2	6	4252852	4252857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481357
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78499	NC_022525	ACT	2	6	4253027	4253032	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481357
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