MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
76001	NC_022525	CGATGC	2	12	4112064	4112075	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549481252
76002	NC_022525	TTC	2	6	4112105	4112110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481252
76003	NC_022525	T	6	6	4112169	4112174	0 %	100 %	0 %	0 %	549481252
76004	NC_022525	T	7	7	4112612	4112618	0 %	100 %	0 %	0 %	549481253
76005	NC_022525	CAT	3	9	4112679	4112687	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481253
76006	NC_022525	GCG	2	6	4112761	4112766	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481253
76007	NC_022525	GT	3	6	4112772	4112777	0 %	50 %	50 %	0 %	549481253
76008	NC_022525	TGC	2	6	4112890	4112895	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481253
76009	NC_022525	GCAGGA	2	12	4112897	4112908	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	549481253
76010	NC_022525	GT	3	6	4112944	4112949	0 %	50 %	50 %	0 %	549481253
76011	NC_022525	GCA	2	6	4112951	4112956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481253
76012	NC_022525	GGTC	2	8	4112969	4112976	0 %	25 %	50 %	25 %	549481253
76013	NC_022525	GC	3	6	4112984	4112989	0 %	0 %	50 %	50 %	549481253
76014	NC_022525	ACT	2	6	4113044	4113049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481253
76015	NC_022525	GTT	2	6	4113053	4113058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481253
76016	NC_022525	CGC	2	6	4113060	4113065	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481253
76017	NC_022525	ACG	2	6	4113094	4113099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481253
76018	NC_022525	CAAC	2	8	4113107	4113114	50 %	0 %	0 %	50 %	549481253
76019	NC_022525	ATGGC	2	10	4113117	4113126	20 %	20 %	40 %	20 %	549481253
76020	NC_022525	ACGC	2	8	4113191	4113198	25 %	0 %	25 %	50 %	549481253
76021	NC_022525	CGC	2	6	4113232	4113237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481253
76022	NC_022525	CGC	2	6	4113382	4113387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481253
76023	NC_022525	CGATG	2	10	4113407	4113416	20 %	20 %	40 %	20 %	549481253
76024	NC_022525	A	6	6	4113602	4113607	100 %	0 %	0 %	0 %	549481254
76025	NC_022525	T	7	7	4113610	4113616	0 %	100 %	0 %	0 %	549481254
76026	NC_022525	TGA	2	6	4113619	4113624	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481254
76027	NC_022525	GCA	2	6	4113625	4113630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481254
76028	NC_022525	TGC	2	6	4113825	4113830	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481254
76029	NC_022525	ATT	2	6	4113836	4113841	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481254
76030	NC_022525	GAT	2	6	4113883	4113888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481254
76031	NC_022525	GGC	2	6	4113924	4113929	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481254
76032	NC_022525	GAAT	2	8	4113942	4113949	50 %	25 %	25 %	0 %	549481254
76033	NC_022525	TGA	2	6	4114044	4114049	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481254
76034	NC_022525	CGAC	2	8	4114071	4114078	25 %	0 %	25 %	50 %	549481254
76035	NC_022525	ATTA	2	8	4114117	4114124	50 %	50 %	0 %	0 %	549481254
76036	NC_022525	CAG	2	6	4114175	4114180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481254
76037	NC_022525	TGC	2	6	4114200	4114205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481254
76038	NC_022525	GCA	2	6	4114207	4114212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481254
76039	NC_022525	TGA	2	6	4114302	4114307	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481254
76040	NC_022525	ATT	2	6	4114347	4114352	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481254
76041	NC_022525	GTG	2	6	4114358	4114363	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481254
76042	NC_022525	CGC	2	6	4114453	4114458	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481255
76043	NC_022525	ATA	2	6	4114460	4114465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481255
76044	NC_022525	CGG	2	6	4114502	4114507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481255
76045	NC_022525	C	6	6	4114546	4114551	0 %	0 %	0 %	100 %	549481255
76046	NC_022525	GCACA	2	10	4114552	4114561	40 %	0 %	20 %	40 %	549481255
76047	NC_022525	GCA	2	6	4114575	4114580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481255
76048	NC_022525	GC	3	6	4114612	4114617	0 %	0 %	50 %	50 %	549481255
76049	NC_022525	CAG	2	6	4114675	4114680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481255
76050	NC_022525	GC	3	6	4114782	4114787	0 %	0 %	50 %	50 %	549481255
76051	NC_022525	CGC	3	9	4114785	4114793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481255
76052	NC_022525	CAC	2	6	4114801	4114806	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481255
76053	NC_022525	GCA	2	6	4114850	4114855	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481255
76054	NC_022525	CCG	2	6	4114899	4114904	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481255
76055	NC_022525	CAG	2	6	4114927	4114932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481255
76056	NC_022525	TTC	2	6	4114940	4114945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481255
76057	NC_022525	CTC	2	6	4114954	4114959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481255
76058	NC_022525	GC	3	6	4114997	4115002	0 %	0 %	50 %	50 %	549481255
76059	NC_022525	TGA	2	6	4115094	4115099	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481255
76060	NC_022525	TCA	2	6	4115106	4115111	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481255
76061	NC_022525	CGA	2	6	4115118	4115123	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481255
76062	NC_022525	TAAT	2	8	4115189	4115196	50 %	50 %	0 %	0 %	549481255
76063	NC_022525	ATA	2	6	4115263	4115268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481255
76064	NC_022525	GCC	2	6	4115332	4115337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481255
76065	NC_022525	CTTG	2	8	4115373	4115380	0 %	50 %	25 %	25 %	549481255
76066	NC_022525	GCC	2	6	4115408	4115413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481255
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76068	NC_022525	TTAAA	2	10	4115982	4115991	60 %	40 %	0 %	0 %	549482367
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76071	NC_022525	TGA	2	6	4116172	4116177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481256
76072	NC_022525	CG	3	6	4116416	4116421	0 %	0 %	50 %	50 %	549481256
76073	NC_022525	TGG	2	6	4116443	4116448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481256
76074	NC_022525	GC	4	8	4116453	4116460	0 %	0 %	50 %	50 %	549481256
76075	NC_022525	TTC	2	6	4116484	4116489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481256
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76078	NC_022525	GGC	2	6	4116611	4116616	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481256
76079	NC_022525	TAT	2	6	4116652	4116657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481256
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76082	NC_022525	TAAT	2	8	4116971	4116978	50 %	50 %	0 %	0 %	549481257
76083	NC_022525	GCA	2	6	4117010	4117015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481257
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76085	NC_022525	GCA	2	6	4117169	4117174	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481257
76086	NC_022525	CAA	2	6	4117230	4117235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481257
76087	NC_022525	CAG	2	6	4117356	4117361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481257
76088	NC_022525	ATG	2	6	4117366	4117371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481257
76089	NC_022525	CAA	2	6	4117449	4117454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481257
76090	NC_022525	CAC	2	6	4117464	4117469	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481257
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76097	NC_022525	CG	4	8	4117820	4117827	0 %	0 %	50 %	50 %	549481257
76098	NC_022525	CGC	2	6	4117844	4117849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481257
76099	NC_022525	GGC	2	6	4117863	4117868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481257
76100	NC_022525	CAT	2	6	4117896	4117901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481257
76101	NC_022525	CGA	2	6	4117907	4117912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481257
76102	NC_022525	AG	3	6	4117923	4117928	50 %	0 %	50 %	0 %	549481257
76103	NC_022525	GGC	2	6	4117977	4117982	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481257
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76106	NC_022525	CAT	2	6	4118112	4118117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481257
76107	NC_022525	GC	3	6	4118156	4118161	0 %	0 %	50 %	50 %	549481257
76108	NC_022525	ACA	2	6	4118176	4118181	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481257
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76112	NC_022525	GCA	2	6	4118385	4118390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481258
76113	NC_022525	GCC	2	6	4118413	4118418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481258
76114	NC_022525	AAT	2	6	4118464	4118469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481258
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76116	NC_022525	TCG	2	6	4118487	4118492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481258
76117	NC_022525	AG	3	6	4118511	4118516	50 %	0 %	50 %	0 %	549481258
76118	NC_022525	GCA	2	6	4118589	4118594	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481258
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76220	NC_022525	CCA	2	6	4123071	4123076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481263
76221	NC_022525	ATC	2	6	4123129	4123134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481263
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76223	NC_022525	CCAGCG	2	12	4123217	4123228	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549481263
76224	NC_022525	AGA	2	6	4123235	4123240	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481263
76225	NC_022525	GC	3	6	4123251	4123256	0 %	0 %	50 %	50 %	549481263
76226	NC_022525	GCG	2	6	4123352	4123357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481264
76227	NC_022525	ACC	2	6	4123443	4123448	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481264
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76229	NC_022525	CTG	3	9	4123595	4123603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481264
76230	NC_022525	GC	3	6	4123640	4123645	0 %	0 %	50 %	50 %	549481264
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76232	NC_022525	CG	4	8	4123729	4123736	0 %	0 %	50 %	50 %	549481264
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76466	NC_022525	TCC	2	6	4134444	4134449	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481274
76467	NC_022525	GGC	2	6	4134525	4134530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481274
76468	NC_022525	GC	3	6	4134542	4134547	0 %	0 %	50 %	50 %	549481274
76469	NC_022525	TTA	2	6	4134562	4134567	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481274
76470	NC_022525	ACG	2	6	4134599	4134604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481274
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76477	NC_022525	AGC	2	6	4135048	4135053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481274
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76484	NC_022525	CG	3	6	4135383	4135388	0 %	0 %	50 %	50 %	549481274
76485	NC_022525	ATAA	2	8	4135434	4135441	75 %	25 %	0 %	0 %	549481274
76486	NC_022525	GGC	2	6	4135497	4135502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481274
76487	NC_022525	TGC	2	6	4135597	4135602	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481274
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76491	NC_022525	AAT	2	6	4135901	4135906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481275
76492	NC_022525	CGC	2	6	4135924	4135929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481275
76493	NC_022525	AATT	2	8	4135982	4135989	50 %	50 %	0 %	0 %	549481275
76494	NC_022525	AAT	2	6	4136012	4136017	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481275
76495	NC_022525	A	7	7	4136033	4136039	100 %	0 %	0 %	0 %	549481275
76496	NC_022525	GTT	2	6	4136083	4136088	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481275
76497	NC_022525	GGC	2	6	4136162	4136167	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481275
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76499	NC_022525	GC	3	6	4136247	4136252	0 %	0 %	50 %	50 %	549481275
76500	NC_022525	GCG	2	6	4136254	4136259	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481275

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