MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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75002	NC_022525	CTG	2	6	4059324	4059329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481212
75003	NC_022525	A	6	6	4059339	4059344	100 %	0 %	0 %	0 %	549481212
75004	NC_022525	CGG	2	6	4059364	4059369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481212
75005	NC_022525	CGG	2	6	4059412	4059417	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481212
75006	NC_022525	TGA	2	6	4059443	4059448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481212
75007	NC_022525	GCG	2	6	4059468	4059473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481212
75008	NC_022525	CT	3	6	4059474	4059479	0 %	50 %	0 %	50 %	549481212
75009	NC_022525	GAC	2	6	4059504	4059509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481212
75010	NC_022525	A	6	6	4059540	4059545	100 %	0 %	0 %	0 %	549481212
75011	NC_022525	ATA	2	6	4059586	4059591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481212
75012	NC_022525	CGC	2	6	4059593	4059598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481212
75013	NC_022525	TGG	2	6	4059604	4059609	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481212
75014	NC_022525	CTG	2	6	4059711	4059716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481212
75015	NC_022525	GCT	2	6	4059722	4059727	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481212
75016	NC_022525	GGTAAA	2	12	4059933	4059944	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	549481212
75017	NC_022525	GGA	2	6	4059974	4059979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481212
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75019	NC_022525	CAG	2	6	4060050	4060055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481212
75020	NC_022525	GAA	2	6	4060170	4060175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481212
75021	NC_022525	AAAG	2	8	4060202	4060209	75 %	0 %	25 %	0 %	549481212
75022	NC_022525	CGA	2	6	4060246	4060251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481212
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75024	NC_022525	GGC	2	6	4060311	4060316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481212
75025	NC_022525	GC	3	6	4060315	4060320	0 %	0 %	50 %	50 %	549481212
75026	NC_022525	TGA	2	6	4060438	4060443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481212
75027	NC_022525	ATC	2	6	4060477	4060482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481212
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75030	NC_022525	TAT	2	6	4060637	4060642	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481212
75031	NC_022525	GAAGG	2	10	4060686	4060695	40 %	0 %	60 %	0 %	549481212
75032	NC_022525	CGG	3	9	4060711	4060719	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481212
75033	NC_022525	AT	3	6	4060901	4060906	50 %	50 %	0 %	0 %	549481212
75034	NC_022525	CGC	2	6	4060962	4060967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481212
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75036	NC_022525	CG	3	6	4061007	4061012	0 %	0 %	50 %	50 %	549481212
75037	NC_022525	CG	3	6	4061022	4061027	0 %	0 %	50 %	50 %	549481212
75038	NC_022525	ATC	2	6	4061064	4061069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481212
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75040	NC_022525	AGC	2	6	4061110	4061115	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481212
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75042	NC_022525	GAC	2	6	4061172	4061177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481212
75043	NC_022525	TGG	2	6	4061245	4061250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481212
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75046	NC_022525	CAG	2	6	4061824	4061829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481213
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75048	NC_022525	ATC	2	6	4061867	4061872	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481213
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75050	NC_022525	CATAGC	2	12	4062003	4062014	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549481213
75051	NC_022525	GC	3	6	4062094	4062099	0 %	0 %	50 %	50 %	549481213
75052	NC_022525	T	6	6	4062105	4062110	0 %	100 %	0 %	0 %	549481213
75053	NC_022525	TCA	2	6	4062216	4062221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481213
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75056	NC_022525	TGG	2	6	4062704	4062709	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482357
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75059	NC_022525	CGT	2	6	4062886	4062891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481214
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75061	NC_022525	CG	3	6	4062920	4062925	0 %	0 %	50 %	50 %	549481214
75062	NC_022525	A	6	6	4062940	4062945	100 %	0 %	0 %	0 %	549481214
75063	NC_022525	CG	3	6	4062970	4062975	0 %	0 %	50 %	50 %	549481214
75064	NC_022525	GCGG	2	8	4062976	4062983	0 %	0 %	75 %	25 %	549481214
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75088	NC_022525	TGC	2	6	4064455	4064460	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481215
75089	NC_022525	CTG	2	6	4064502	4064507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481215
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75108	NC_022525	GC	3	6	4065669	4065674	0 %	0 %	50 %	50 %	549481216
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75116	NC_022525	GCC	2	6	4066042	4066047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481216
75117	NC_022525	GAA	2	6	4066156	4066161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481216
75118	NC_022525	AAT	2	6	4066176	4066181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481216
75119	NC_022525	GGCG	2	8	4066200	4066207	0 %	0 %	75 %	25 %	549481216
75120	NC_022525	TGT	2	6	4066224	4066229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481216
75121	NC_022525	GCT	4	12	4066256	4066267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481216
75122	NC_022525	CG	3	6	4066284	4066289	0 %	0 %	50 %	50 %	549481216
75123	NC_022525	TCA	2	6	4066309	4066314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481216
75124	NC_022525	CTG	2	6	4066350	4066355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481216
75125	NC_022525	CGG	2	6	4066367	4066372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481216
75126	NC_022525	ATG	2	6	4066399	4066404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481216
75127	NC_022525	GGT	2	6	4066542	4066547	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481216
75128	NC_022525	ATC	3	9	4066602	4066610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481216
75129	NC_022525	GAC	2	6	4066611	4066616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481216
75130	NC_022525	GATA	2	8	4066742	4066749	50 %	25 %	25 %	0 %	549481217
75131	NC_022525	GCC	2	6	4066763	4066768	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481217
75132	NC_022525	GGA	2	6	4066815	4066820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481217
75133	NC_022525	CGC	2	6	4066853	4066858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481217
75134	NC_022525	GGTACG	2	12	4066898	4066909	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	549481217
75135	NC_022525	CGC	2	6	4066921	4066926	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481217
75136	NC_022525	CAG	2	6	4066967	4066972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481217
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75138	NC_022525	TATG	2	8	4067095	4067102	25 %	50 %	25 %	0 %	549481217
75139	NC_022525	TGC	2	6	4067127	4067132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481217
75140	NC_022525	ATG	2	6	4067181	4067186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481217
75141	NC_022525	GCGCC	2	10	4067239	4067248	0 %	0 %	40 %	60 %	549481217
75142	NC_022525	GCC	2	6	4067255	4067260	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481217
75143	NC_022525	GCG	2	6	4067307	4067312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481217
75144	NC_022525	TGC	2	6	4067316	4067321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481217
75145	NC_022525	TGC	2	6	4067325	4067330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481217
75146	NC_022525	GAC	2	6	4067347	4067352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481217
75147	NC_022525	TCG	2	6	4067391	4067396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481217
75148	NC_022525	AG	3	6	4067417	4067422	50 %	0 %	50 %	0 %	549481217
75149	NC_022525	GCGA	2	8	4067428	4067435	25 %	0 %	50 %	25 %	549481217
75150	NC_022525	ATCA	2	8	4067438	4067445	50 %	25 %	0 %	25 %	549481217
75151	NC_022525	CTG	2	6	4067582	4067587	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481217
75152	NC_022525	CGT	2	6	4067620	4067625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481217
75153	NC_022525	ACC	2	6	4067628	4067633	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481217
75154	NC_022525	GTA	2	6	4067979	4067984	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481218
75155	NC_022525	ACGC	2	8	4068015	4068022	25 %	0 %	25 %	50 %	549481218
75156	NC_022525	TCT	2	6	4068028	4068033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481218
75157	NC_022525	ATCG	2	8	4068057	4068064	25 %	25 %	25 %	25 %	549481218
75158	NC_022525	CGC	2	6	4068080	4068085	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481218
75159	NC_022525	GGTCCA	2	12	4068104	4068115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	549481218
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75162	NC_022525	CGG	2	6	4068174	4068179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481218
75163	NC_022525	CAG	2	6	4068252	4068257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481218
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75171	NC_022525	GTA	2	6	4068486	4068491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481218
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75173	NC_022525	TCG	2	6	4068676	4068681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481218
75174	NC_022525	T	6	6	4068684	4068689	0 %	100 %	0 %	0 %	549481218
75175	NC_022525	GCC	2	6	4068876	4068881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481218
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75179	NC_022525	GAA	2	6	4069137	4069142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481218
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75182	NC_022525	TGA	2	6	4069267	4069272	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481218
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75186	NC_022525	CG	3	6	4069853	4069858	0 %	0 %	50 %	50 %	549481219
75187	NC_022525	GGT	2	6	4069998	4070003	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481219
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75189	NC_022525	TGG	2	6	4070044	4070049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481219
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75201	NC_022525	ATC	2	6	4070469	4070474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481219
75202	NC_022525	ATT	2	6	4070571	4070576	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481219
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75214	NC_022525	TGCG	2	8	4071391	4071398	0 %	25 %	50 %	25 %	549481219
75215	NC_022525	TGA	2	6	4071470	4071475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481219
75216	NC_022525	CGA	2	6	4071476	4071481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481219
75217	NC_022525	TATCCG	2	12	4071506	4071517	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549481219
75218	NC_022525	CGC	2	6	4071543	4071548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481219
75219	NC_022525	AGAA	2	8	4071565	4071572	75 %	0 %	25 %	0 %	549481219
75220	NC_022525	T	7	7	4071628	4071634	0 %	100 %	0 %	0 %	549481220
75221	NC_022525	A	6	6	4071664	4071669	100 %	0 %	0 %	0 %	549481220
75222	NC_022525	TAT	2	6	4071686	4071691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481220
75223	NC_022525	TGCTGT	2	12	4071829	4071840	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	549481220
75224	NC_022525	TGA	2	6	4071895	4071900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481220
75225	NC_022525	GTT	2	6	4071962	4071967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481220
75226	NC_022525	TCA	2	6	4072021	4072026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481220
75227	NC_022525	ATT	2	6	4072036	4072041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481220
75228	NC_022525	ATC	2	6	4072044	4072049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481220
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75230	NC_022525	CAGCGG	2	12	4072113	4072124	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	549481220
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