MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_022525	GTCA	2	8	366863	366870	25 %	25 %	25 %	25 %	549478384
7003	NC_022525	AGC	2	6	366919	366924	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478384
7004	NC_022525	AAT	2	6	366989	366994	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478384
7005	NC_022525	GCAACT	2	12	366997	367008	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	549478384
7006	NC_022525	GAT	2	6	367070	367075	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478384
7007	NC_022525	TGA	2	6	367092	367097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478384
7008	NC_022525	CTT	2	6	367158	367163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478384
7009	NC_022525	GCGTG	2	10	367196	367205	0 %	20 %	60 %	20 %	549478384
7010	NC_022525	AGT	2	6	367232	367237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478384
7011	NC_022525	GGCA	2	8	367254	367261	25 %	0 %	50 %	25 %	549478384
7012	NC_022525	GTC	2	6	367302	367307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478384
7013	NC_022525	ACA	2	6	367386	367391	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478384
7014	NC_022525	CGCA	2	8	367442	367449	25 %	0 %	25 %	50 %	549478384
7015	NC_022525	ACA	2	6	367488	367493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478384
7016	NC_022525	ACAG	2	8	367538	367545	50 %	0 %	25 %	25 %	549478384
7017	NC_022525	GTG	2	6	367548	367553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478384
7018	NC_022525	CGG	2	6	367759	367764	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478384
7019	NC_022525	G	6	6	367807	367812	0 %	0 %	100 %	0 %	549478384
7020	NC_022525	TC	3	6	367814	367819	0 %	50 %	0 %	50 %	549478384
7021	NC_022525	AC	4	8	367854	367861	50 %	0 %	0 %	50 %	549478384
7022	NC_022525	CCT	2	6	367896	367901	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549478384
7023	NC_022525	T	7	7	367945	367951	0 %	100 %	0 %	0 %	549478384
7024	NC_022525	ATG	2	6	368019	368024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478384
7025	NC_022525	ACC	2	6	368072	368077	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478384
7026	NC_022525	AGTC	2	8	368087	368094	25 %	25 %	25 %	25 %	549478384
7027	NC_022525	G	6	6	368096	368101	0 %	0 %	100 %	0 %	549478384
7028	NC_022525	ATG	2	6	368163	368168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478384
7029	NC_022525	GC	3	6	368256	368261	0 %	0 %	50 %	50 %	549478384
7030	NC_022525	AAT	2	6	368321	368326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478384
7031	NC_022525	GGT	2	6	368363	368368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478384
7032	NC_022525	CAA	2	6	368375	368380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478384
7033	NC_022525	TCAG	2	8	368403	368410	25 %	25 %	25 %	25 %	549478384
7034	NC_022525	GGT	3	9	368459	368467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478384
7035	NC_022525	GGT	2	6	368516	368521	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478384
7036	NC_022525	CCA	2	6	368584	368589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478384
7037	NC_022525	GGC	2	6	368669	368674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478384
7038	NC_022525	CAGT	2	8	368745	368752	25 %	25 %	25 %	25 %	549478384
7039	NC_022525	CA	3	6	368788	368793	50 %	0 %	0 %	50 %	549478384
7040	NC_022525	GTG	2	6	368807	368812	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478384
7041	NC_022525	GGT	2	6	368827	368832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478384
7042	NC_022525	TGA	2	6	368871	368876	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478384
7043	NC_022525	TGG	2	6	368955	368960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478384
7044	NC_022525	ACC	2	6	369048	369053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478384
7045	NC_022525	CGC	2	6	369217	369222	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478385
7046	NC_022525	GATGG	2	10	369281	369290	20 %	20 %	60 %	0 %	549478385
7047	NC_022525	TGC	2	6	369384	369389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478385
7048	NC_022525	AC	3	6	369584	369589	50 %	0 %	0 %	50 %	549478385
7049	NC_022525	GAG	2	6	369590	369595	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478385
7050	NC_022525	TGGC	2	8	370109	370116	0 %	25 %	50 %	25 %	549478386
7051	NC_022525	CTGG	2	8	370122	370129	0 %	25 %	50 %	25 %	549478386
7052	NC_022525	CTG	2	6	370140	370145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478386
7053	NC_022525	GGC	2	6	370211	370216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478386
7054	NC_022525	TGC	2	6	370248	370253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478386
7055	NC_022525	TCTT	2	8	370278	370285	0 %	75 %	0 %	25 %	549478386
7056	NC_022525	ATG	2	6	370347	370352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478386
7057	NC_022525	TGA	2	6	370384	370389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478386
7058	NC_022525	TGC	2	6	370395	370400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478386
7059	NC_022525	TTG	2	6	370437	370442	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478386
7060	NC_022525	CGCACA	2	12	370452	370463	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	549478386
7061	NC_022525	TTC	2	6	370527	370532	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478386
7062	NC_022525	GCTG	2	8	370737	370744	0 %	25 %	50 %	25 %	549478386
7063	NC_022525	CGT	2	6	370748	370753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478386
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7065	NC_022525	GCT	2	6	370786	370791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478386
7066	NC_022525	CTGA	2	8	370821	370828	25 %	25 %	25 %	25 %	549478386
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7070	NC_022525	ATT	2	6	371083	371088	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481729
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7080	NC_022525	ACTG	2	8	371833	371840	25 %	25 %	25 %	25 %	549478387
7081	NC_022525	AGCT	2	8	372007	372014	25 %	25 %	25 %	25 %	549478387
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7089	NC_022525	TAT	2	6	372503	372508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478387
7090	NC_022525	AAT	2	6	372554	372559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478387
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7092	NC_022525	GTAA	2	8	372940	372947	50 %	25 %	25 %	0 %	549478388
7093	NC_022525	CAT	2	6	372987	372992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478388
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7098	NC_022525	CAGA	2	8	373143	373150	50 %	0 %	25 %	25 %	549478388
7099	NC_022525	TTA	2	6	373184	373189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478388
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7101	NC_022525	T	6	6	373301	373306	0 %	100 %	0 %	0 %	549478388
7102	NC_022525	AAT	2	6	373336	373341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478388
7103	NC_022525	CGC	2	6	373446	373451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478388
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7107	NC_022525	TTTCA	2	10	373645	373654	20 %	60 %	0 %	20 %	549478388
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7110	NC_022525	ATA	2	6	374071	374076	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478389
7111	NC_022525	TGT	2	6	374084	374089	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478389
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7115	NC_022525	GTT	2	6	374217	374222	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478389
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7117	NC_022525	GGGC	2	8	374289	374296	0 %	0 %	75 %	25 %	549478389
7118	NC_022525	GGA	2	6	374300	374305	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549478389
7119	NC_022525	CGCC	2	8	374340	374347	0 %	0 %	25 %	75 %	549478389
7120	NC_022525	CGA	2	6	374760	374765	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478390
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7122	NC_022525	CGG	2	6	374805	374810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478390
7123	NC_022525	CGC	2	6	374850	374855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478390
7124	NC_022525	GC	4	8	374924	374931	0 %	0 %	50 %	50 %	549478390
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7242	NC_022525	GGA	2	6	382386	382391	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481731
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7244	NC_022525	GCA	2	6	382410	382415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481731
7245	NC_022525	GGC	3	9	382447	382455	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481731
7246	NC_022525	GCA	2	6	382473	382478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481731
7247	NC_022525	TCG	2	6	382490	382495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481731
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7488	NC_022525	GGC	2	6	397319	397324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478406
7489	NC_022525	ATGA	2	8	397351	397358	50 %	25 %	25 %	0 %	549478406
7490	NC_022525	TGT	2	6	397364	397369	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478406
7491	NC_022525	GAC	2	6	397415	397420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478406
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