MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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74002	NC_022525	GTG	2	6	4002470	4002475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481168
74003	NC_022525	ATC	2	6	4002497	4002502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481168
74004	NC_022525	TTC	2	6	4002506	4002511	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481168
74005	NC_022525	GAA	2	6	4002515	4002520	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481168
74006	NC_022525	CAC	2	6	4002584	4002589	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481168
74007	NC_022525	GAA	2	6	4002605	4002610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481168
74008	NC_022525	CG	3	6	4002725	4002730	0 %	0 %	50 %	50 %	549481168
74009	NC_022525	GCC	2	6	4002769	4002774	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481168
74010	NC_022525	CGC	2	6	4002795	4002800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481168
74011	NC_022525	GCA	2	6	4002805	4002810	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481168
74012	NC_022525	TGC	2	6	4002929	4002934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481169
74013	NC_022525	CGC	2	6	4002937	4002942	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481169
74014	NC_022525	CAG	2	6	4002949	4002954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481169
74015	NC_022525	CGC	2	6	4002969	4002974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481169
74016	NC_022525	GCC	2	6	4003018	4003023	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481169
74017	NC_022525	GCCA	2	8	4003034	4003041	25 %	0 %	25 %	50 %	549481169
74018	NC_022525	TAA	2	6	4003068	4003073	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481169
74019	NC_022525	CGC	2	6	4003110	4003115	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481169
74020	NC_022525	TTC	2	6	4003165	4003170	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481169
74021	NC_022525	GACG	2	8	4003366	4003373	25 %	0 %	50 %	25 %	549481170
74022	NC_022525	ACA	2	6	4003401	4003406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481170
74023	NC_022525	CCA	2	6	4003410	4003415	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481170
74024	NC_022525	GCC	2	6	4003429	4003434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481170
74025	NC_022525	GC	3	6	4003466	4003471	0 %	0 %	50 %	50 %	549481170
74026	NC_022525	GCTTT	2	10	4003473	4003482	0 %	60 %	20 %	20 %	549481170
74027	NC_022525	CGTGC	2	10	4003558	4003567	0 %	20 %	40 %	40 %	549481170
74028	NC_022525	CAA	2	6	4003578	4003583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481170
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74030	NC_022525	GCC	3	9	4004480	4004488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481171
74031	NC_022525	A	6	6	4004493	4004498	100 %	0 %	0 %	0 %	549481171
74032	NC_022525	ATG	2	6	4004613	4004618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481172
74033	NC_022525	GTC	2	6	4004658	4004663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481172
74034	NC_022525	T	7	7	4004685	4004691	0 %	100 %	0 %	0 %	549481172
74035	NC_022525	TCG	2	6	4004705	4004710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481172
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74037	NC_022525	GCT	2	6	4004747	4004752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481172
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74039	NC_022525	GCC	2	6	4004762	4004767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481172
74040	NC_022525	GC	4	8	4004842	4004849	0 %	0 %	50 %	50 %	549481172
74041	NC_022525	CG	3	6	4004855	4004860	0 %	0 %	50 %	50 %	549481172
74042	NC_022525	CAA	2	6	4005011	4005016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481172
74043	NC_022525	TAT	2	6	4005032	4005037	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481172
74044	NC_022525	GCG	2	6	4005042	4005047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481172
74045	NC_022525	GCG	2	6	4005064	4005069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481172
74046	NC_022525	CGG	2	6	4005121	4005126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481172
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74049	NC_022525	TGCCGT	2	12	4005284	4005295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481172
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74051	NC_022525	GCT	2	6	4005311	4005316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481172
74052	NC_022525	GAA	2	6	4005321	4005326	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481172
74053	NC_022525	CGG	2	6	4005403	4005408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481172
74054	NC_022525	ACG	2	6	4005418	4005423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481172
74055	NC_022525	GAA	2	6	4005452	4005457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481173
74056	NC_022525	GTC	2	6	4005494	4005499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481173
74057	NC_022525	T	6	6	4005524	4005529	0 %	100 %	0 %	0 %	549481173
74058	NC_022525	CG	4	8	4005614	4005621	0 %	0 %	50 %	50 %	549481173
74059	NC_022525	GAA	2	6	4005641	4005646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481173
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74062	NC_022525	CGC	2	6	4005727	4005732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481173
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74065	NC_022525	GCA	2	6	4005913	4005918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481173
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74070	NC_022525	TGC	2	6	4006104	4006109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481173
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74084	NC_022525	GCT	2	6	4006932	4006937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481174
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74088	NC_022525	AAT	2	6	4007039	4007044	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481174
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74099	NC_022525	GAT	2	6	4007604	4007609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481175
74100	NC_022525	TGGC	2	8	4007623	4007630	0 %	25 %	50 %	25 %	549481175
74101	NC_022525	CTG	2	6	4007654	4007659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481175
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74103	NC_022525	GGCG	2	8	4007978	4007985	0 %	0 %	75 %	25 %	549481176
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74107	NC_022525	GCG	3	9	4008090	4008098	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481176
74108	NC_022525	CCAG	2	8	4008133	4008140	25 %	0 %	25 %	50 %	549481176
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74110	NC_022525	CG	3	6	4008189	4008194	0 %	0 %	50 %	50 %	549481176
74111	NC_022525	CAT	2	6	4008195	4008200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481176
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74220	NC_022525	AAG	2	6	4014042	4014047	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481180
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74225	NC_022525	GCTG	2	8	4014425	4014432	0 %	25 %	50 %	25 %	549481180
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74227	NC_022525	CGA	2	6	4014586	4014591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481180
74228	NC_022525	AT	3	6	4014610	4014615	50 %	50 %	0 %	0 %	549481180
74229	NC_022525	TTA	2	6	4014619	4014624	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481180
74230	NC_022525	CGG	2	6	4014700	4014705	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481180
74231	NC_022525	GTCGGC	2	12	4014815	4014826	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549481180
74232	NC_022525	TCT	2	6	4014843	4014848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481180
74233	NC_022525	GATTG	2	10	4014849	4014858	20 %	40 %	40 %	0 %	549481180
74234	NC_022525	ATT	2	6	4015030	4015035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481181
74235	NC_022525	GTC	2	6	4015066	4015071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74236	NC_022525	CGG	3	9	4015080	4015088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481181
74237	NC_022525	GTT	2	6	4015116	4015121	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481181
74238	NC_022525	TGGA	2	8	4015124	4015131	25 %	25 %	50 %	0 %	549481181
74239	NC_022525	CGT	3	9	4015137	4015145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74240	NC_022525	TGA	2	6	4015163	4015168	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481181
74241	NC_022525	GGC	3	9	4015203	4015211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481181
74242	NC_022525	AGC	3	9	4015238	4015246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74243	NC_022525	CTG	2	6	4015285	4015290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74244	NC_022525	ATC	2	6	4015331	4015336	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481181
74245	NC_022525	TCCG	2	8	4015406	4015413	0 %	25 %	25 %	50 %	549481181
74246	NC_022525	ACCGCC	2	12	4015474	4015485	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	549481181
74247	NC_022525	GAC	2	6	4015486	4015491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74248	NC_022525	ATT	2	6	4015507	4015512	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481181
74249	NC_022525	GACC	2	8	4015558	4015565	25 %	0 %	25 %	50 %	549481181
74250	NC_022525	ATC	2	6	4015651	4015656	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481181
74251	NC_022525	CCG	2	6	4015688	4015693	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481181
74252	NC_022525	CG	3	6	4015692	4015697	0 %	0 %	50 %	50 %	549481181
74253	NC_022525	GCG	2	6	4015720	4015725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481181
74254	NC_022525	CGA	2	6	4015785	4015790	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74255	NC_022525	GTG	2	6	4015801	4015806	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481181
74256	NC_022525	AAAC	2	8	4015833	4015840	75 %	0 %	0 %	25 %	549481181
74257	NC_022525	ACGT	2	8	4015844	4015851	25 %	25 %	25 %	25 %	549481181
74258	NC_022525	TCG	2	6	4015853	4015858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74259	NC_022525	CTA	2	6	4015890	4015895	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481181
74260	NC_022525	CTGC	2	8	4015927	4015934	0 %	25 %	25 %	50 %	549481181
74261	NC_022525	CGT	2	6	4015978	4015983	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74262	NC_022525	ATG	2	6	4016162	4016167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481181
74263	NC_022525	TCAT	2	8	4016360	4016367	25 %	50 %	0 %	25 %	549481181
74264	NC_022525	GCA	2	6	4016394	4016399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74265	NC_022525	CG	3	6	4016424	4016429	0 %	0 %	50 %	50 %	549481181
74266	NC_022525	TCG	2	6	4016477	4016482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481181
74267	NC_022525	CGG	2	6	4016514	4016519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481181
74268	NC_022525	TGA	2	6	4016574	4016579	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481181
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74271	NC_022525	CG	3	6	4016731	4016736	0 %	0 %	50 %	50 %	549481181
74272	NC_022525	TGA	2	6	4016748	4016753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481181
74273	NC_022525	AGT	2	6	4016759	4016764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481181
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74286	NC_022525	A	6	6	4017109	4017114	100 %	0 %	0 %	0 %	549481182
74287	NC_022525	GCG	3	9	4017121	4017129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481182
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74290	NC_022525	GCG	2	6	4017265	4017270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481182
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74300	NC_022525	TGC	2	6	4017686	4017691	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481183
74301	NC_022525	ATG	2	6	4017695	4017700	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481183
74302	NC_022525	AAGA	2	8	4017721	4017728	75 %	0 %	25 %	0 %	549481183
74303	NC_022525	GCG	2	6	4017827	4017832	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481183
74304	NC_022525	AGATA	2	10	4017855	4017864	60 %	20 %	20 %	0 %	549481183
74305	NC_022525	GAG	2	6	4017898	4017903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481183
74306	NC_022525	CCA	2	6	4017936	4017941	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481183
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74310	NC_022525	TCA	2	6	4018471	4018476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481184
74311	NC_022525	ACC	2	6	4018480	4018485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481184
74312	NC_022525	GCG	2	6	4018569	4018574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481184
74313	NC_022525	GCA	2	6	4018580	4018585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481184
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74315	NC_022525	GTGCG	2	10	4018677	4018686	0 %	20 %	60 %	20 %	549481184
74316	NC_022525	CCTT	2	8	4018734	4018741	0 %	50 %	0 %	50 %	549481184
74317	NC_022525	GGCG	2	8	4018819	4018826	0 %	0 %	75 %	25 %	549481184
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74320	NC_022525	GGC	2	6	4018917	4018922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481184
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74322	NC_022525	GCGA	2	8	4018980	4018987	25 %	0 %	50 %	25 %	549481184
74323	NC_022525	ACG	2	6	4018992	4018997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481184
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74331	NC_022525	GTC	2	6	4019377	4019382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481185
74332	NC_022525	GC	3	6	4019449	4019454	0 %	0 %	50 %	50 %	549481185
74333	NC_022525	GTG	2	6	4019529	4019534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481185
74334	NC_022525	CGA	3	9	4019570	4019578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481185
74335	NC_022525	T	6	6	4019615	4019620	0 %	100 %	0 %	0 %	549481185
74336	NC_022525	GCT	2	6	4019660	4019665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481185
74337	NC_022525	GTT	2	6	4019717	4019722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549481185
74338	NC_022525	CG	3	6	4019744	4019749	0 %	0 %	50 %	50 %	549481185
74339	NC_022525	GGCG	2	8	4019804	4019811	0 %	0 %	75 %	25 %	549481185
74340	NC_022525	ACG	2	6	4019899	4019904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481185
74341	NC_022525	CAT	2	6	4019936	4019941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481185
74342	NC_022525	TCA	2	6	4020141	4020146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482352
74343	NC_022525	GGC	2	6	4020244	4020249	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482352
74344	NC_022525	TGG	2	6	4020315	4020320	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482352
74345	NC_022525	CAT	2	6	4020337	4020342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482352
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74347	NC_022525	CGC	2	6	4020411	4020416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549482352
74348	NC_022525	TGA	2	6	4020441	4020446	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482352
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74463	NC_022525	GCA	2	6	4025545	4025550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481188
74464	NC_022525	TG	3	6	4025559	4025564	0 %	50 %	50 %	0 %	549481188
74465	NC_022525	CTG	2	6	4025651	4025656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481188
74466	NC_022525	CCA	2	6	4025665	4025670	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481188
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74469	NC_022525	GTC	2	6	4025751	4025756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481188
74470	NC_022525	GGC	2	6	4025783	4025788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481188
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74472	NC_022525	T	6	6	4025863	4025868	0 %	100 %	0 %	0 %	549481188
74473	NC_022525	GCT	2	6	4025905	4025910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481188
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74475	NC_022525	CG	3	6	4025959	4025964	0 %	0 %	50 %	50 %	549481188
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74478	NC_022525	A	6	6	4026026	4026031	100 %	0 %	0 %	0 %	549481188
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74482	NC_022525	CCG	2	6	4026337	4026342	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481189
74483	NC_022525	CCA	2	6	4026419	4026424	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481189
74484	NC_022525	GCT	2	6	4026445	4026450	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481189
74485	NC_022525	GCG	2	6	4026469	4026474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481189
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74488	NC_022525	CCG	2	6	4026535	4026540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481189
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74491	NC_022525	GTC	2	6	4026707	4026712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481189
74492	NC_022525	TCG	2	6	4026820	4026825	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481189
74493	NC_022525	ATC	2	6	4026880	4026885	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481189
74494	NC_022525	GGAT	2	8	4026921	4026928	25 %	25 %	50 %	0 %	549481189
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74497	NC_022525	GC	3	6	4027358	4027363	0 %	0 %	50 %	50 %	549481190
74498	NC_022525	CGG	2	6	4027406	4027411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481190
74499	NC_022525	GAA	2	6	4027434	4027439	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549481190
74500	NC_022525	CTT	2	6	4027463	4027468	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481190

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