MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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71002	NC_022525	CGG	2	6	3845610	3845615	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481055
71003	NC_022525	CCA	2	6	3845676	3845681	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481055
71004	NC_022525	GC	3	6	3845682	3845687	0 %	0 %	50 %	50 %	549481055
71005	NC_022525	C	6	6	3845696	3845701	0 %	0 %	0 %	100 %	549481055
71006	NC_022525	CGC	2	6	3845788	3845793	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481055
71007	NC_022525	GC	3	6	3845792	3845797	0 %	0 %	50 %	50 %	549481055
71008	NC_022525	AGC	2	6	3845828	3845833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481055
71009	NC_022525	GCC	2	6	3845928	3845933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481055
71010	NC_022525	CGG	2	6	3845944	3845949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481055
71011	NC_022525	GCC	2	6	3845979	3845984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481055
71012	NC_022525	GCAA	2	8	3846011	3846018	50 %	0 %	25 %	25 %	549481055
71013	NC_022525	CCA	2	6	3846024	3846029	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481055
71014	NC_022525	GCCA	2	8	3846042	3846049	25 %	0 %	25 %	50 %	549481055
71015	NC_022525	CCG	2	6	3846092	3846097	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481055
71016	NC_022525	GCC	2	6	3846130	3846135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481055
71017	NC_022525	AGCG	2	8	3846306	3846313	25 %	0 %	50 %	25 %	549481055
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71019	NC_022525	CGGCG	2	10	3846430	3846439	0 %	0 %	60 %	40 %	549481055
71020	NC_022525	CCAA	2	8	3846480	3846487	50 %	0 %	0 %	50 %	549481055
71021	NC_022525	GCC	3	9	3846504	3846512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481055
71022	NC_022525	TGA	2	6	3846549	3846554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481055
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71025	NC_022525	CTG	2	6	3846715	3846720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481056
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71028	NC_022525	TGGCAT	2	12	3846810	3846821	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	549481056
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71033	NC_022525	GCT	2	6	3847056	3847061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481056
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71040	NC_022525	TAA	2	6	3847336	3847341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481056
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71043	NC_022525	TCA	2	6	3847392	3847397	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481056
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71045	NC_022525	GCCA	2	8	3847419	3847426	25 %	0 %	25 %	50 %	549481056
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71047	NC_022525	CAG	3	9	3847528	3847536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481056
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71051	NC_022525	CAG	2	6	3847675	3847680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481056
71052	NC_022525	CAGGG	2	10	3847715	3847724	20 %	0 %	60 %	20 %	549481056
71053	NC_022525	CGG	2	6	3847740	3847745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481056
71054	NC_022525	AC	3	6	3847830	3847835	50 %	0 %	0 %	50 %	549481056
71055	NC_022525	ATC	2	6	3847841	3847846	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481056
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71057	NC_022525	CG	3	6	3847932	3847937	0 %	0 %	50 %	50 %	549481056
71058	NC_022525	GCA	2	6	3847944	3847949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481056
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71062	NC_022525	A	6	6	3848056	3848061	100 %	0 %	0 %	0 %	549481056
71063	NC_022525	CAA	2	6	3848067	3848072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481056
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71065	NC_022525	ATGCG	2	10	3848119	3848128	20 %	20 %	40 %	20 %	549481057
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71067	NC_022525	CG	3	6	3848172	3848177	0 %	0 %	50 %	50 %	549481057
71068	NC_022525	CGG	2	6	3848213	3848218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481057
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71087	NC_022525	GC	3	6	3849301	3849306	0 %	0 %	50 %	50 %	549481058
71088	NC_022525	ACC	2	6	3849321	3849326	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481058
71089	NC_022525	ATG	2	6	3849344	3849349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481058
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71091	NC_022525	CGT	2	6	3849418	3849423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481058
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71099	NC_022525	ACC	2	6	3849941	3849946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481059
71100	NC_022525	CAG	2	6	3850040	3850045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481059
71101	NC_022525	GCGCCA	2	12	3850098	3850109	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	549481059
71102	NC_022525	GC	3	6	3850125	3850130	0 %	0 %	50 %	50 %	549481059
71103	NC_022525	TCA	2	6	3850176	3850181	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481059
71104	NC_022525	A	6	6	3850207	3850212	100 %	0 %	0 %	0 %	549481059
71105	NC_022525	CAG	2	6	3850447	3850452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481059
71106	NC_022525	CAC	2	6	3850465	3850470	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481059
71107	NC_022525	TGCC	2	8	3850620	3850627	0 %	25 %	25 %	50 %	549481059
71108	NC_022525	ATC	2	6	3850694	3850699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481059
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71112	NC_022525	A	6	6	3850901	3850906	100 %	0 %	0 %	0 %	549481059
71113	NC_022525	T	6	6	3851239	3851244	0 %	100 %	0 %	0 %	549481060
71114	NC_022525	GGC	2	6	3851248	3851253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481060
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71116	NC_022525	CGC	2	6	3851313	3851318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481060
71117	NC_022525	GC	3	6	3851382	3851387	0 %	0 %	50 %	50 %	549481060
71118	NC_022525	ATA	2	6	3851408	3851413	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481060
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71125	NC_022525	TGA	2	6	3851733	3851738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481060
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71152	NC_022525	TGA	2	6	3853029	3853034	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481061
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71219	NC_022525	T	6	6	3856730	3856735	0 %	100 %	0 %	0 %	549481064
71220	NC_022525	GCCT	2	8	3856745	3856752	0 %	25 %	25 %	50 %	549481064
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71224	NC_022525	GGT	2	6	3856894	3856899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481064
71225	NC_022525	CGC	2	6	3856900	3856905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481064
71226	NC_022525	GC	3	6	3856932	3856937	0 %	0 %	50 %	50 %	549481064
71227	NC_022525	TGG	2	6	3856983	3856988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481064
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71231	NC_022525	GCT	2	6	3857385	3857390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481065
71232	NC_022525	CCT	2	6	3857393	3857398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549481065
71233	NC_022525	GCC	2	6	3857452	3857457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481065
71234	NC_022525	TCG	2	6	3857467	3857472	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481065
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71239	NC_022525	GC	3	6	3857720	3857725	0 %	0 %	50 %	50 %	549481065
71240	NC_022525	CTG	2	6	3857739	3857744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481065
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71242	NC_022525	CCCGC	2	10	3857794	3857803	0 %	0 %	20 %	80 %	549481065
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71323	NC_022525	GCGG	2	8	3861586	3861593	0 %	0 %	75 %	25 %	549481067
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71331	NC_022525	ATC	2	6	3861799	3861804	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481067
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71334	NC_022525	TGAA	2	8	3861893	3861900	50 %	25 %	25 %	0 %	549481067
71335	NC_022525	ACG	2	6	3861916	3861921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481067
71336	NC_022525	CTGG	2	8	3861949	3861956	0 %	25 %	50 %	25 %	549481067
71337	NC_022525	ATC	2	6	3861976	3861981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481067
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71340	NC_022525	CGC	2	6	3862145	3862150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481068
71341	NC_022525	GC	3	6	3862164	3862169	0 %	0 %	50 %	50 %	549481068
71342	NC_022525	CCGCTG	2	12	3862204	3862215	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	549481068
71343	NC_022525	A	7	7	3862310	3862316	100 %	0 %	0 %	0 %	549481068
71344	NC_022525	GC	3	6	3862350	3862355	0 %	0 %	50 %	50 %	549481068
71345	NC_022525	GGC	2	6	3862356	3862361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481068
71346	NC_022525	ACGC	2	8	3862377	3862384	25 %	0 %	25 %	50 %	549481068
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71348	NC_022525	TTC	2	6	3862464	3862469	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549481068
71349	NC_022525	CAGTA	2	10	3862473	3862482	40 %	20 %	20 %	20 %	549481068
71350	NC_022525	ATCG	2	8	3862514	3862521	25 %	25 %	25 %	25 %	549481068
71351	NC_022525	A	6	6	3862587	3862592	100 %	0 %	0 %	0 %	549481068
71352	NC_022525	GAT	2	6	3862635	3862640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481068
71353	NC_022525	AGC	2	6	3862670	3862675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549481068
71354	NC_022525	GAT	2	6	3862704	3862709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481068
71355	NC_022525	CGT	2	6	3862787	3862792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481068
71356	NC_022525	TGTT	2	8	3862810	3862817	0 %	75 %	25 %	0 %	549481068
71357	NC_022525	GCG	2	6	3862828	3862833	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481068
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71360	NC_022525	CGG	2	6	3862999	3863004	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481068
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71362	NC_022525	GCTGG	2	10	3863108	3863117	0 %	20 %	60 %	20 %	549481068
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71450	NC_022525	ACC	2	6	3867663	3867668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481072
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71456	NC_022525	CGG	2	6	3868270	3868275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482333
71457	NC_022525	CG	3	6	3868299	3868304	0 %	0 %	50 %	50 %	549482333
71458	NC_022525	GAT	2	6	3868315	3868320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549482333
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71460	NC_022525	CG	3	6	3868443	3868448	0 %	0 %	50 %	50 %	549482333
71461	NC_022525	GAG	3	9	3868460	3868468	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549482333
71462	NC_022525	C	6	6	3868492	3868497	0 %	0 %	0 %	100 %	549482333
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