MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_022525	GACT	2	8	342114	342121	25 %	25 %	25 %	25 %	549478379
6502	NC_022525	GCTG	2	8	342236	342243	0 %	25 %	50 %	25 %	549478379
6503	NC_022525	CTGG	2	8	342246	342253	0 %	25 %	50 %	25 %	549478379
6504	NC_022525	GGC	2	6	342261	342266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478379
6505	NC_022525	GCA	2	6	342267	342272	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478379
6506	NC_022525	GCG	2	6	342291	342296	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478379
6507	NC_022525	GGC	2	6	342299	342304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478379
6508	NC_022525	GTG	2	6	342351	342356	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478379
6509	NC_022525	ACG	2	6	342378	342383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478379
6510	NC_022525	CGCAG	2	10	342389	342398	20 %	0 %	40 %	40 %	549478379
6511	NC_022525	GTA	2	6	342433	342438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478379
6512	NC_022525	GCGT	2	8	342449	342456	0 %	25 %	50 %	25 %	549478379
6513	NC_022525	GGCA	2	8	342494	342501	25 %	0 %	50 %	25 %	549478379
6514	NC_022525	GCA	2	6	342525	342530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478379
6515	NC_022525	AAT	2	6	342575	342580	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478379
6516	NC_022525	TAA	2	6	342645	342650	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481710
6517	NC_022525	TGC	3	9	342744	342752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481710
6518	NC_022525	ATA	2	6	342791	342796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481710
6519	NC_022525	TC	3	6	342805	342810	0 %	50 %	0 %	50 %	549481710
6520	NC_022525	CAT	2	6	342821	342826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481710
6521	NC_022525	TCAG	2	8	342828	342835	25 %	25 %	25 %	25 %	549481710
6522	NC_022525	T	6	6	342878	342883	0 %	100 %	0 %	0 %	549481710
6523	NC_022525	A	6	6	342943	342948	100 %	0 %	0 %	0 %	549481710
6524	NC_022525	GCT	2	6	342979	342984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481710
6525	NC_022525	TGG	2	6	343011	343016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481710
6526	NC_022525	CTG	2	6	343040	343045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481710
6527	NC_022525	AAT	2	6	343047	343052	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481710
6528	NC_022525	TAT	2	6	343053	343058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481710
6529	NC_022525	AAT	2	6	343088	343093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549481710
6530	NC_022525	GT	3	6	343775	343780	0 %	50 %	50 %	0 %	549481711
6531	NC_022525	ATCC	2	8	343785	343792	25 %	25 %	0 %	50 %	549481711
6532	NC_022525	AAC	2	6	343832	343837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549481711
6533	NC_022525	A	7	7	343848	343854	100 %	0 %	0 %	0 %	549481711
6534	NC_022525	AGG	2	6	343954	343959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	549481711
6535	NC_022525	TAT	2	6	344008	344013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549481711
6536	NC_022525	ACC	2	6	344069	344074	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481711
6537	NC_022525	GAT	2	6	344104	344109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481712
6538	NC_022525	GACT	2	8	344118	344125	25 %	25 %	25 %	25 %	549481712
6539	NC_022525	GT	3	6	344212	344217	0 %	50 %	50 %	0 %	549481712
6540	NC_022525	GCG	2	6	344225	344230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481712
6541	NC_022525	TGC	2	6	344290	344295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549481712
6542	NC_022525	CAT	2	6	344313	344318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481712
6543	NC_022525	GGT	2	6	344450	344455	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481712
6544	NC_022525	CCA	2	6	344472	344477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549481712
6545	NC_022525	TGG	2	6	344608	344613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549481712
6546	NC_022525	AACAA	2	10	344614	344623	80 %	0 %	0 %	20 %	549481712
6547	NC_022525	ATA	2	6	345042	345047	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478380
6548	NC_022525	GAC	2	6	345067	345072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478380
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6550	NC_022525	GCG	2	6	345143	345148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478380
6551	NC_022525	AGC	2	6	345226	345231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478380
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6553	NC_022525	CTG	2	6	345288	345293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478380
6554	NC_022525	CCG	2	6	345344	345349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478380
6555	NC_022525	CGG	2	6	345376	345381	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478380
6556	NC_022525	CGG	2	6	345459	345464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478380
6557	NC_022525	TGG	2	6	345486	345491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478380
6558	NC_022525	TGG	2	6	345523	345528	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478380
6559	NC_022525	CGG	2	6	345558	345563	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478380
6560	NC_022525	GTG	2	6	345569	345574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478380
6561	NC_022525	CTG	2	6	345629	345634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478380
6562	NC_022525	GTG	2	6	345674	345679	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478380
6563	NC_022525	TGG	2	6	345732	345737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478380
6564	NC_022525	TGATTT	2	12	345781	345792	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	549478380
6565	NC_022525	TGG	2	6	345827	345832	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478380
6566	NC_022525	CGC	2	6	345906	345911	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478380
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6570	NC_022525	G	6	6	346189	346194	0 %	0 %	100 %	0 %	549478380
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6572	NC_022525	GCA	2	6	346312	346317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478380
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6574	NC_022525	CGGG	2	8	346480	346487	0 %	0 %	75 %	25 %	549478380
6575	NC_022525	CTG	2	6	346540	346545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478380
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6577	NC_022525	GAT	2	6	346585	346590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478380
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6581	NC_022525	TGC	2	6	346773	346778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478380
6582	NC_022525	GAC	2	6	346784	346789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478380
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6593	NC_022525	C	6	6	347190	347195	0 %	0 %	0 %	100 %	549478380
6594	NC_022525	CCTG	2	8	347274	347281	0 %	25 %	25 %	50 %	549478381
6595	NC_022525	GAAC	2	8	347329	347336	50 %	0 %	25 %	25 %	549478381
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6599	NC_022525	CAGG	2	8	347467	347474	25 %	0 %	50 %	25 %	549478381
6600	NC_022525	ATG	2	6	347483	347488	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478381
6601	NC_022525	GCC	2	6	347509	347514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478381
6602	NC_022525	TGA	2	6	347616	347621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478381
6603	NC_022525	CTGG	2	8	347646	347653	0 %	25 %	50 %	25 %	549478381
6604	NC_022525	AAT	2	6	347678	347683	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478381
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6606	NC_022525	GAT	2	6	347722	347727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481713
6607	NC_022525	GC	3	6	347744	347749	0 %	0 %	50 %	50 %	549481713
6608	NC_022525	ATC	2	6	347773	347778	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549481713
6609	NC_022525	GCC	2	6	347800	347805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549481713
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6622	NC_022525	CGG	2	6	348315	348320	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481713
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6724	NC_022525	TA	3	6	352120	352125	50 %	50 %	0 %	0 %	549481714
6725	NC_022525	A	6	6	352194	352199	100 %	0 %	0 %	0 %	549481714
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6728	NC_022525	TAAA	2	8	352352	352359	75 %	25 %	0 %	0 %	549481714
6729	NC_022525	CTTAT	2	10	352368	352377	20 %	60 %	0 %	20 %	549481714
6730	NC_022525	A	6	6	352396	352401	100 %	0 %	0 %	0 %	549481714
6731	NC_022525	TTTC	2	8	352412	352419	0 %	75 %	0 %	25 %	549481714
6732	NC_022525	T	7	7	352448	352454	0 %	100 %	0 %	0 %	549481714
6733	NC_022525	CT	3	6	352471	352476	0 %	50 %	0 %	50 %	549481714
6734	NC_022525	A	7	7	352591	352597	100 %	0 %	0 %	0 %	549481714
6735	NC_022525	AAAT	2	8	352619	352626	75 %	25 %	0 %	0 %	549481714
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6740	NC_022525	TGA	2	6	352919	352924	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549481715
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6742	NC_022525	GGC	2	6	353111	353116	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549481715
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6990	NC_022525	CAG	2	6	366123	366128	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478383
6991	NC_022525	TGG	2	6	366152	366157	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478383
6992	NC_022525	ACC	2	6	366209	366214	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478383
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6999	NC_022525	TAAA	2	8	366569	366576	75 %	25 %	0 %	0 %	549478383
7000	NC_022525	AGT	2	6	366640	366645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478384

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