MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
68001	NC_022525	GCC	2	6	3679287	3679292	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480933
68002	NC_022525	CGG	2	6	3679346	3679351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480933
68003	NC_022525	GTGG	2	8	3679440	3679447	0 %	25 %	75 %	0 %	549480933
68004	NC_022525	CGG	2	6	3679457	3679462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480933
68005	NC_022525	ACAGC	2	10	3679465	3679474	40 %	0 %	20 %	40 %	549480933
68006	NC_022525	AC	3	6	3679532	3679537	50 %	0 %	0 %	50 %	549480933
68007	NC_022525	CGT	2	6	3679602	3679607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480933
68008	NC_022525	CT	3	6	3679611	3679616	0 %	50 %	0 %	50 %	549480933
68009	NC_022525	GCA	2	6	3679656	3679661	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480933
68010	NC_022525	GTGCTG	2	12	3679693	3679704	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	549480933
68011	NC_022525	GCG	2	6	3679721	3679726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480933
68012	NC_022525	GGT	2	6	3679776	3679781	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549480933
68013	NC_022525	CG	5	10	3679801	3679810	0 %	0 %	50 %	50 %	549480933
68014	NC_022525	GCC	2	6	3679818	3679823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480933
68015	NC_022525	TGA	2	6	3679848	3679853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549480933
68016	NC_022525	TAT	2	6	3679877	3679882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480933
68017	NC_022525	AAG	2	6	3679900	3679905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549480933
68018	NC_022525	GTCA	2	8	3679906	3679913	25 %	25 %	25 %	25 %	549480933
68019	NC_022525	TGG	2	6	3679937	3679942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549480933
68020	NC_022525	GTT	3	9	3680318	3680326	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549480934
68021	NC_022525	GCC	2	6	3680336	3680341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480934
68022	NC_022525	TATCG	2	10	3680372	3680381	20 %	40 %	20 %	20 %	549480934
68023	NC_022525	GAC	2	6	3680395	3680400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480934
68024	NC_022525	CTG	2	6	3680420	3680425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480934
68025	NC_022525	CGG	2	6	3680513	3680518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480934
68026	NC_022525	GCG	2	6	3680530	3680535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480934
68027	NC_022525	CGTT	2	8	3680553	3680560	0 %	50 %	25 %	25 %	549480934
68028	NC_022525	T	6	6	3680600	3680605	0 %	100 %	0 %	0 %	549480934
68029	NC_022525	AC	3	6	3680623	3680628	50 %	0 %	0 %	50 %	549480934
68030	NC_022525	TAA	2	6	3680632	3680637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549480934
68031	NC_022525	ATC	2	6	3680676	3680681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480934
68032	NC_022525	TCA	2	6	3680838	3680843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480934
68033	NC_022525	TCA	2	6	3680856	3680861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480934
68034	NC_022525	TAT	2	6	3680914	3680919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480934
68035	NC_022525	TTA	2	6	3681036	3681041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480934
68036	NC_022525	CCGCC	2	10	3681043	3681052	0 %	0 %	20 %	80 %	549480934
68037	NC_022525	AAAG	2	8	3681075	3681082	75 %	0 %	25 %	0 %	549480934
68038	NC_022525	TCG	2	6	3681085	3681090	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480934
68039	NC_022525	CGC	2	6	3681116	3681121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480934
68040	NC_022525	T	7	7	3681126	3681132	0 %	100 %	0 %	0 %	549480934
68041	NC_022525	GTC	2	6	3681195	3681200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480934
68042	NC_022525	ACG	2	6	3681216	3681221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480934
68043	NC_022525	TTA	2	6	3681274	3681279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480934
68044	NC_022525	ATT	2	6	3681284	3681289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480934
68045	NC_022525	CGA	2	6	3681293	3681298	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480934
68046	NC_022525	CCA	2	6	3681367	3681372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480934
68047	NC_022525	CGC	2	6	3681373	3681378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480934
68048	NC_022525	T	7	7	3681417	3681423	0 %	100 %	0 %	0 %	549480934
68049	NC_022525	CAG	2	6	3681434	3681439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480934
68050	NC_022525	CGTA	2	8	3681509	3681516	25 %	25 %	25 %	25 %	549480934
68051	NC_022525	CAA	2	6	3681524	3681529	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549480934
68052	NC_022525	CAC	2	6	3681611	3681616	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480934
68053	NC_022525	GA	3	6	3681624	3681629	50 %	0 %	50 %	0 %	549480934
68054	NC_022525	GGT	2	6	3681638	3681643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549480934
68055	NC_022525	AAT	2	6	3681656	3681661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549480934
68056	NC_022525	CAC	2	6	3681674	3681679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480934
68057	NC_022525	TAA	2	6	3681696	3681701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549480934
68058	NC_022525	CAC	2	6	3681722	3681727	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480934
68059	NC_022525	AGA	2	6	3681771	3681776	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549480934
68060	NC_022525	AAG	2	6	3681783	3681788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549480934
68061	NC_022525	CGG	2	6	3681873	3681878	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549480934
68062	NC_022525	GCAA	2	8	3681918	3681925	50 %	0 %	25 %	25 %	549480934
68063	NC_022525	ATT	2	6	3682184	3682189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480935
68064	NC_022525	GT	3	6	3682303	3682308	0 %	50 %	50 %	0 %	549480935
68065	NC_022525	TTG	2	6	3682341	3682346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549480935
68066	NC_022525	CCA	2	6	3682351	3682356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480935
68067	NC_022525	ACGCC	2	10	3682373	3682382	20 %	0 %	20 %	60 %	549480935
68068	NC_022525	CGC	3	9	3682388	3682396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480935
68069	NC_022525	CAC	2	6	3682542	3682547	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480935
68070	NC_022525	GCC	2	6	3682594	3682599	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480935
68071	NC_022525	CAG	2	6	3682628	3682633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480935
68072	NC_022525	GCC	2	6	3682651	3682656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480935
68073	NC_022525	TGG	2	6	3682738	3682743	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482295
68074	NC_022525	CGG	2	6	3682762	3682767	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549482295
68075	NC_022525	GGT	2	6	3682781	3682786	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482295
68076	NC_022525	GTC	2	6	3682832	3682837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482295
68077	NC_022525	TGC	2	6	3683128	3683133	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549482295
68078	NC_022525	AT	3	6	3683178	3683183	50 %	50 %	0 %	0 %	549482295
68079	NC_022525	GAC	2	6	3683187	3683192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549482295
68080	NC_022525	ATT	2	6	3683241	3683246	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482295
68081	NC_022525	TAC	2	6	3683338	3683343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482295
68082	NC_022525	GTT	2	6	3683369	3683374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549482295
68083	NC_022525	GT	3	6	3683401	3683406	0 %	50 %	50 %	0 %	549482295
68084	NC_022525	C	6	6	3683424	3683429	0 %	0 %	0 %	100 %	549482295
68085	NC_022525	TCGC	2	8	3683442	3683449	0 %	25 %	25 %	50 %	549482295
68086	NC_022525	ATT	3	9	3683459	3683467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549482295
68087	NC_022525	CT	3	6	3683487	3683492	0 %	50 %	0 %	50 %	549482295
68088	NC_022525	AG	3	6	3683547	3683552	50 %	0 %	50 %	0 %	549482295
68089	NC_022525	ATC	2	6	3683555	3683560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549482295
68090	NC_022525	TGG	2	6	3683668	3683673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549482295
68091	NC_022525	CAC	2	6	3683839	3683844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480936
68092	NC_022525	TAT	2	6	3683850	3683855	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549480936
68093	NC_022525	TGT	2	6	3683858	3683863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549480936
68094	NC_022525	TGC	2	6	3683979	3683984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480936
68095	NC_022525	CAG	2	6	3684004	3684009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480936
68096	NC_022525	TCA	2	6	3684060	3684065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549480936
68097	NC_022525	CGC	2	6	3684111	3684116	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480936
68098	NC_022525	GTT	2	6	3684160	3684165	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549480936
68099	NC_022525	GTAAG	2	10	3684209	3684218	40 %	20 %	40 %	0 %	549480936
68100	NC_022525	CAC	2	6	3684252	3684257	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549480936
68101	NC_022525	GTT	2	6	3684259	3684264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549480936
68102	NC_022525	GC	3	6	3684273	3684278	0 %	0 %	50 %	50 %	549480936
68103	NC_022525	CG	4	8	3684279	3684286	0 %	0 %	50 %	50 %	549480936
68104	NC_022525	CCG	2	6	3684362	3684367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480936
68105	NC_022525	CTG	2	6	3684385	3684390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480936
68106	NC_022525	GTTGTA	2	12	3684400	3684411	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	549480936
68107	NC_022525	CGC	2	6	3684432	3684437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549480936
68108	NC_022525	TGC	2	6	3684480	3684485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480936
68109	NC_022525	CTG	2	6	3684550	3684555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480936
68110	NC_022525	GGT	2	6	3684585	3684590	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549480936
68111	NC_022525	AGT	2	6	3684759	3684764	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549480936
68112	NC_022525	CTG	2	6	3684766	3684771	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480936
68113	NC_022525	TGC	2	6	3684809	3684814	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549480936
68114	NC_022525	CAG	2	6	3684934	3684939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480936
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68116	NC_022525	TCC	2	6	3685084	3685089	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	549480936
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68500	NC_022525	CAG	2	6	3707407	3707412	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549480952

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