MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Thompson str. RM6836

Total Repeats: 86779

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_022525	TGG	2	6	284331	284336	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478339
5502	NC_022525	TGC	2	6	284431	284436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5503	NC_022525	GAT	2	6	284504	284509	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478339
5504	NC_022525	ACG	2	6	284541	284546	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5505	NC_022525	CGA	2	6	284557	284562	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5506	NC_022525	ATT	2	6	284580	284585	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478339
5507	NC_022525	GCA	2	6	284590	284595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5508	NC_022525	GAA	3	9	284609	284617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478339
5509	NC_022525	ACC	2	6	284741	284746	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478339
5510	NC_022525	A	6	6	284762	284767	100 %	0 %	0 %	0 %	549478339
5511	NC_022525	GAA	2	6	284813	284818	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	549478339
5512	NC_022525	TGG	2	6	284988	284993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478339
5513	NC_022525	CTG	2	6	285038	285043	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5514	NC_022525	GGC	2	6	285190	285195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
5515	NC_022525	GCC	2	6	285271	285276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478339
5516	NC_022525	GGC	2	6	285419	285424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
5517	NC_022525	CAT	2	6	285571	285576	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478339
5518	NC_022525	GAT	2	6	285592	285597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478339
5519	NC_022525	CAA	2	6	285598	285603	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478339
5520	NC_022525	GCG	2	6	285604	285609	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
5521	NC_022525	GCC	2	6	285625	285630	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478339
5522	NC_022525	CGC	2	6	285640	285645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478339
5523	NC_022525	TGC	2	6	285678	285683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5524	NC_022525	CGG	2	6	285699	285704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
5525	NC_022525	CG	3	6	285720	285725	0 %	0 %	50 %	50 %	549478339
5526	NC_022525	TGG	2	6	285783	285788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478339
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5528	NC_022525	CT	3	6	285863	285868	0 %	50 %	0 %	50 %	549478339
5529	NC_022525	GCA	2	6	285886	285891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478339
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5531	NC_022525	CGG	2	6	285988	285993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
5532	NC_022525	TGC	2	6	286002	286007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478339
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5534	NC_022525	TGG	2	6	286122	286127	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478339
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5539	NC_022525	GTC	2	6	286271	286276	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478339
5540	NC_022525	TGG	2	6	286281	286286	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478339
5541	NC_022525	GCC	2	6	286318	286323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478339
5542	NC_022525	ATC	2	6	286427	286432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478339
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5544	NC_022525	GGC	2	6	286448	286453	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
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5546	NC_022525	CCG	2	6	286507	286512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478339
5547	NC_022525	CCGCG	2	10	286564	286573	0 %	0 %	40 %	60 %	549478339
5548	NC_022525	TGA	2	6	286575	286580	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478339
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5552	NC_022525	CGG	2	6	286813	286818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478339
5553	NC_022525	CAC	2	6	286861	286866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	549478339
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5555	NC_022525	TGA	2	6	287050	287055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478339
5556	NC_022525	G	6	6	287063	287068	0 %	0 %	100 %	0 %	549478339
5557	NC_022525	CCGC	2	8	287079	287086	0 %	0 %	25 %	75 %	549478339
5558	NC_022525	TGA	2	6	287161	287166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478339
5559	NC_022525	CTA	2	6	287233	287238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478339
5560	NC_022525	TGCGCG	2	12	287251	287262	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549478339
5561	NC_022525	TC	3	6	287289	287294	0 %	50 %	0 %	50 %	549478339
5562	NC_022525	GCC	2	6	287454	287459	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478340
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5564	NC_022525	A	6	6	287511	287516	100 %	0 %	0 %	0 %	549478340
5565	NC_022525	GC	3	6	287576	287581	0 %	0 %	50 %	50 %	549478340
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5568	NC_022525	GGCG	2	8	287644	287651	0 %	0 %	75 %	25 %	549478340
5569	NC_022525	TGA	2	6	287665	287670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478340
5570	NC_022525	TCG	2	6	287679	287684	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
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5572	NC_022525	TGA	2	6	287715	287720	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478340
5573	NC_022525	TCA	2	6	287728	287733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478340
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5575	NC_022525	TCG	2	6	287761	287766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
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5580	NC_022525	CAT	2	6	288133	288138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478340
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5582	NC_022525	CAT	2	6	288175	288180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478340
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5585	NC_022525	GCT	2	6	288244	288249	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
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5588	NC_022525	CGT	2	6	288299	288304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478340
5589	NC_022525	TGA	2	6	288315	288320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478340
5590	NC_022525	A	6	6	288528	288533	100 %	0 %	0 %	0 %	549478341
5591	NC_022525	GCCGC	2	10	288590	288599	0 %	0 %	40 %	60 %	549478341
5592	NC_022525	AGT	2	6	288608	288613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478341
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5594	NC_022525	GC	3	6	288745	288750	0 %	0 %	50 %	50 %	549478341
5595	NC_022525	GC	4	8	288823	288830	0 %	0 %	50 %	50 %	549478341
5596	NC_022525	TACT	2	8	288838	288845	25 %	50 %	0 %	25 %	549478341
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5600	NC_022525	CTG	2	6	289229	289234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478341
5601	NC_022525	TGG	2	6	289248	289253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478341
5602	NC_022525	TCT	3	9	289284	289292	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	549478341
5603	NC_022525	GCC	2	6	289306	289311	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	549478341
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5605	NC_022525	GGC	2	6	289418	289423	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
5606	NC_022525	GCG	3	9	289431	289439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
5607	NC_022525	CTA	2	6	289474	289479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478341
5608	NC_022525	GTGCCG	2	12	289505	289516	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	549478341
5609	NC_022525	GGC	2	6	289562	289567	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478341
5610	NC_022525	AGTT	2	8	289647	289654	25 %	50 %	25 %	0 %	549478341
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5613	NC_022525	GAT	2	6	289736	289741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	549478341
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5615	NC_022525	GCCGG	2	10	289820	289829	0 %	0 %	60 %	40 %	549478341
5616	NC_022525	CGAC	2	8	289878	289885	25 %	0 %	25 %	50 %	549478341
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5619	NC_022525	CCTG	2	8	290114	290121	0 %	25 %	25 %	50 %	549478341
5620	NC_022525	AGC	3	9	290123	290131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478341
5621	NC_022525	GCCT	2	8	290221	290228	0 %	25 %	25 %	50 %	549478341
5622	NC_022525	TAA	2	6	290279	290284	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	549478341
5623	NC_022525	CAT	2	6	290362	290367	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478342
5624	NC_022525	TAT	2	6	290393	290398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	549478342
5625	NC_022525	TTG	2	6	290480	290485	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	549478342
5626	NC_022525	GCG	2	6	290514	290519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	549478342
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5629	NC_022525	GCTG	2	8	290680	290687	0 %	25 %	50 %	25 %	549478342
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5634	NC_022525	CTGT	2	8	290848	290855	0 %	50 %	25 %	25 %	549478342
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5655	NC_022525	CTG	2	6	291953	291958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478342
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5730	NC_022525	GTAT	3	12	296474	296485	25 %	50 %	25 %	0 %	549481705
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5986	NC_022525	CAA	2	6	316121	316126	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	549478358
5987	NC_022525	CA	3	6	316128	316133	50 %	0 %	0 %	50 %	549478358
5988	NC_022525	TCA	2	6	316141	316146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478358
5989	NC_022525	AT	3	6	316201	316206	50 %	50 %	0 %	0 %	549478358
5990	NC_022525	CT	3	6	316252	316257	0 %	50 %	0 %	50 %	549478359
5991	NC_022525	TAC	2	6	316306	316311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478359
5992	NC_022525	CAG	2	6	316327	316332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	549478359
5993	NC_022525	CCTT	2	8	316485	316492	0 %	50 %	0 %	50 %	549478359
5994	NC_022525	CTG	2	6	316519	316524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	549478359
5995	NC_022525	GTG	2	6	316539	316544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	549478359
5996	NC_022525	ATTG	2	8	316584	316591	25 %	50 %	25 %	0 %	549478359
5997	NC_022525	TCA	2	6	316607	316612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	549478359
5998	NC_022525	ACTGG	2	10	316713	316722	20 %	20 %	40 %	20 %	549478359
5999	NC_022525	AGGG	2	8	316787	316794	25 %	0 %	75 %	0 %	549478359
6000	NC_022525	CGCTTA	2	12	316865	316876	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	549478359

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