MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022443	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
2	NC_022443	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
3	NC_022443	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636472
4	NC_022443	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636472
5	NC_022443	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
6	NC_022443	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636472
7	NC_022443	ACA	2	6	805	810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
8	NC_022443	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636472
9	NC_022443	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	545636472
10	NC_022443	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
11	NC_022443	GGTT	2	8	987	994	0 %	50 %	50 %	0 %	545636472
12	NC_022443	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	545636472
13	NC_022443	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636472
14	NC_022443	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636472
15	NC_022443	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
16	NC_022443	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
17	NC_022443	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636472
18	NC_022443	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
19	NC_022443	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
20	NC_022443	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636472
21	NC_022443	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636472
22	NC_022443	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
23	NC_022443	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
24	NC_022443	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636472
25	NC_022443	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	545636472
26	NC_022443	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	545636472
27	NC_022443	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636472
28	NC_022443	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636472
29	NC_022443	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	545636472
30	NC_022443	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	545636472
31	NC_022443	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	545636472
32	NC_022443	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
33	NC_022443	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636472
34	NC_022443	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	545636472
35	NC_022443	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	545636472
36	NC_022443	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
37	NC_022443	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636472
38	NC_022443	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
39	NC_022443	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
40	NC_022443	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
41	NC_022443	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636473
42	NC_022443	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
43	NC_022443	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636473
44	NC_022443	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	545636473
45	NC_022443	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
46	NC_022443	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	545636473
47	NC_022443	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
48	NC_022443	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	545636473
49	NC_022443	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	545636473
50	NC_022443	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
51	NC_022443	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636473
52	NC_022443	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	545636473
53	NC_022443	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
54	NC_022443	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
55	NC_022443	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	545636473
56	NC_022443	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
57	NC_022443	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636473
58	NC_022443	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	545636473
59	NC_022443	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636473
60	NC_022443	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636473
61	NC_022443	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
62	NC_022443	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636473
63	NC_022443	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
64	NC_022443	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636473
65	NC_022443	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636473
66	NC_022443	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	545636473
67	NC_022443	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
68	NC_022443	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	545636473
69	NC_022443	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
70	NC_022443	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636473
71	NC_022443	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636473
72	NC_022443	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636473
73	NC_022443	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	545636473
74	NC_022443	AGA	2	6	3555	3560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636474
75	NC_022443	AT	3	6	3567	3572	50 %	50 %	0 %	0 %	545636474
76	NC_022443	A	7	7	3581	3587	100 %	0 %	0 %	0 %	545636474
77	NC_022443	GAAA	2	8	3618	3625	75 %	0 %	25 %	0 %	545636474
78	NC_022443	AGTA	2	8	3677	3684	50 %	25 %	25 %	0 %	545636474
79	NC_022443	ACC	2	6	3686	3691	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636474
80	NC_022443	ATC	2	6	3704	3709	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636474
81	NC_022443	TTG	2	6	3712	3717	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636474
82	NC_022443	AGT	2	6	3735	3740	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636474
83	NC_022443	GTAG	2	8	3825	3832	25 %	25 %	50 %	0 %	545636474
84	NC_022443	A	6	6	3837	3842	100 %	0 %	0 %	0 %	545636474
85	NC_022443	GAA	2	6	3906	3911	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636474
86	NC_022443	GA	3	6	3931	3936	50 %	0 %	50 %	0 %	545636474
87	NC_022443	AGAA	2	8	3948	3955	75 %	0 %	25 %	0 %	545636474
88	NC_022443	A	6	6	3954	3959	100 %	0 %	0 %	0 %	545636474
89	NC_022443	AAG	2	6	4430	4435	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636475
90	NC_022443	GTA	2	6	4438	4443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636475
91	NC_022443	ATT	2	6	4486	4491	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636475
92	NC_022443	TGG	2	6	4497	4502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636475
93	NC_022443	ATTA	2	8	4536	4543	50 %	50 %	0 %	0 %	545636475
94	NC_022443	TTCT	2	8	4626	4633	0 %	75 %	0 %	25 %	545636475
95	NC_022443	TCAT	2	8	4637	4644	25 %	50 %	0 %	25 %	545636475
96	NC_022443	ATG	2	6	4696	4701	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636476
97	NC_022443	A	6	6	4920	4925	100 %	0 %	0 %	0 %	545636476
98	NC_022443	AT	3	6	4973	4978	50 %	50 %	0 %	0 %	545636476
99	NC_022443	AGA	2	6	5009	5014	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636476
100	NC_022443	CTC	2	6	5035	5040	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545636476
101	NC_022443	GAC	2	6	5047	5052	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636476
102	NC_022443	CTG	2	6	5083	5088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636476
103	NC_022443	AAT	2	6	5136	5141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636476
104	NC_022443	A	7	7	5167	5173	100 %	0 %	0 %	0 %	545636476
105	NC_022443	CAG	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636476
106	NC_022443	AAG	2	6	5308	5313	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636476
107	NC_022443	ATT	2	6	5326	5331	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636476
108	NC_022443	ATA	2	6	5404	5409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636476
109	NC_022443	GAT	2	6	5457	5462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636476
110	NC_022443	TTA	3	9	5592	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636476
111	NC_022443	GAT	2	6	5622	5627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636476
112	NC_022443	TTA	2	6	5643	5648	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636476
113	NC_022443	ACA	2	6	5803	5808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636477
114	NC_022443	GTAT	2	8	5875	5882	25 %	50 %	25 %	0 %	545636477
115	NC_022443	AG	4	8	5897	5904	50 %	0 %	50 %	0 %	545636477
116	NC_022443	ATA	2	6	5935	5940	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636477
117	NC_022443	CAAAT	2	10	5968	5977	60 %	20 %	0 %	20 %	545636477
118	NC_022443	GTT	2	6	5982	5987	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636477
119	NC_022443	A	6	6	6052	6057	100 %	0 %	0 %	0 %	545636477
120	NC_022443	TGG	2	6	6101	6106	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636477
121	NC_022443	TGGCGG	2	12	6113	6124	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	545636477
122	NC_022443	TGG	2	6	6137	6142	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636477
123	NC_022443	TCA	2	6	6159	6164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636477
124	NC_022443	TA	3	6	6218	6223	50 %	50 %	0 %	0 %	545636477
125	NC_022443	TCA	2	6	6224	6229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636477
126	NC_022443	A	6	6	6237	6242	100 %	0 %	0 %	0 %	545636477
127	NC_022443	AAG	2	6	6265	6270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
128	NC_022443	AG	3	6	6375	6380	50 %	0 %	50 %	0 %	545636477
129	NC_022443	TGA	2	6	6428	6433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636477
130	NC_022443	AGA	2	6	6446	6451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
131	NC_022443	ATG	2	6	6520	6525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636477
132	NC_022443	TCA	2	6	6539	6544	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636477
133	NC_022443	GAT	2	6	6552	6557	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636477
134	NC_022443	TACG	2	8	6632	6639	25 %	25 %	25 %	25 %	545636477
135	NC_022443	GGT	2	6	6642	6647	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636477
136	NC_022443	AGA	2	6	6722	6727	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636477
137	NC_022443	TATC	2	8	6778	6785	25 %	50 %	0 %	25 %	545636477
138	NC_022443	ATT	2	6	6863	6868	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636477
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169	NC_022443	CTG	2	6	8407	8412	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636478
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173	NC_022443	A	6	6	8572	8577	100 %	0 %	0 %	0 %	545636478
174	NC_022443	TCGT	2	8	8587	8594	0 %	50 %	25 %	25 %	545636478
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247	NC_022443	ATT	2	6	11713	11718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636480
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249	NC_022443	A	7	7	11740	11746	100 %	0 %	0 %	0 %	545636480
250	NC_022443	TAT	2	6	11766	11771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636480
251	NC_022443	AAG	2	6	11912	11917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636480
252	NC_022443	ATG	2	6	11929	11934	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636480
253	NC_022443	ATT	2	6	11952	11957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636480
254	NC_022443	ACAATT	2	12	11994	12005	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545636480
255	NC_022443	T	6	6	12004	12009	0 %	100 %	0 %	0 %	545636480
256	NC_022443	TAT	2	6	12021	12026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636480
257	NC_022443	CAA	2	6	12040	12045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636480
258	NC_022443	CT	3	6	12048	12053	0 %	50 %	0 %	50 %	545636480
259	NC_022443	TTAGCA	2	12	12088	12099	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636480
260	NC_022443	GAA	2	6	12133	12138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636480
261	NC_022443	AAG	2	6	12197	12202	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636480
262	NC_022443	TA	3	6	12256	12261	50 %	50 %	0 %	0 %	545636480
263	NC_022443	AGA	2	6	12267	12272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636480
264	NC_022443	TGC	2	6	12297	12302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636480
265	NC_022443	ATG	2	6	12347	12352	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636480
266	NC_022443	ACG	2	6	12430	12435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636480
267	NC_022443	CGTTG	2	10	12470	12479	0 %	40 %	40 %	20 %	545636480
268	NC_022443	AATG	2	8	12546	12553	50 %	25 %	25 %	0 %	545636480
269	NC_022443	GGT	2	6	12610	12615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636480
270	NC_022443	ATC	2	6	12650	12655	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636480
271	NC_022443	CGT	2	6	12694	12699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636480
272	NC_022443	GAT	2	6	12780	12785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636480
273	NC_022443	TGC	3	9	12795	12803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636480
274	NC_022443	AAG	2	6	12875	12880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636480
275	NC_022443	GCT	2	6	12904	12909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636480
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280	NC_022443	CCAT	2	8	13054	13061	25 %	25 %	0 %	50 %	545636480
281	NC_022443	CAAT	2	8	13117	13124	50 %	25 %	0 %	25 %	545636480
282	NC_022443	ATT	2	6	13541	13546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636481
283	NC_022443	GAT	2	6	13593	13598	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636481
284	NC_022443	ACG	2	6	13637	13642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636481
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286	NC_022443	AGA	2	6	13661	13666	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636481
287	NC_022443	CGT	2	6	13677	13682	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636481
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289	NC_022443	A	7	7	13709	13715	100 %	0 %	0 %	0 %	545636481
290	NC_022443	TAA	2	6	13718	13723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636481
291	NC_022443	TGA	2	6	13733	13738	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636481
292	NC_022443	ATA	2	6	13807	13812	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636481
293	NC_022443	TAA	2	6	13846	13851	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636481
294	NC_022443	TGA	2	6	13853	13858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636481
295	NC_022443	TGA	2	6	13877	13882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636481
296	NC_022443	AGA	2	6	13958	13963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636481
297	NC_022443	GCA	2	6	13989	13994	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636481
298	NC_022443	ACA	2	6	14082	14087	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636481
299	NC_022443	ATG	2	6	14106	14111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636481
300	NC_022443	GAA	2	6	14169	14174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636481
301	NC_022443	ATTT	2	8	14176	14183	25 %	75 %	0 %	0 %	545636481
302	NC_022443	AAG	2	6	14194	14199	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636481
303	NC_022443	TA	3	6	14203	14208	50 %	50 %	0 %	0 %	545636481
304	NC_022443	CTG	2	6	14218	14223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636481
305	NC_022443	ATT	2	6	14256	14261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636481
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322	NC_022443	TGC	2	6	15615	15620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636482
323	NC_022443	TAT	2	6	15627	15632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636482
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325	NC_022443	AT	3	6	15921	15926	50 %	50 %	0 %	0 %	545636482
326	NC_022443	ATT	2	6	16042	16047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636482
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334	NC_022443	ATT	2	6	16434	16439	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636483
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342	NC_022443	GCAA	2	8	17248	17255	50 %	0 %	25 %	25 %	545636484
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376	NC_022443	TAT	2	6	18784	18789	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636485
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383	NC_022443	TCA	2	6	19101	19106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636486
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388	NC_022443	TAGA	2	8	19437	19444	50 %	25 %	25 %	0 %	545636486
389	NC_022443	ACAA	2	8	19543	19550	75 %	0 %	0 %	25 %	545636486
390	NC_022443	ATT	2	6	19588	19593	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636486
391	NC_022443	ATGA	2	8	19625	19632	50 %	25 %	25 %	0 %	545636486
392	NC_022443	TCAAT	2	10	19650	19659	40 %	40 %	0 %	20 %	545636486
393	NC_022443	AT	3	6	19698	19703	50 %	50 %	0 %	0 %	545636486
394	NC_022443	A	6	6	19749	19754	100 %	0 %	0 %	0 %	545636486
395	NC_022443	AGA	2	6	19768	19773	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636486
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397	NC_022443	GTG	3	9	19923	19931	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636486
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401	NC_022443	AAT	2	6	20147	20152	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636486
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404	NC_022443	AG	3	6	20240	20245	50 %	0 %	50 %	0 %	545636486
405	NC_022443	TTA	2	6	20250	20255	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636486
406	NC_022443	GAT	2	6	20261	20266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636486
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499	NC_022443	TCG	2	6	24129	24134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636489
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