MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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45011	NC_022443	ATG	2	6	2343327	2343332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638595
45012	NC_022443	TA	3	6	2343342	2343347	50 %	50 %	0 %	0 %	545638595
45013	NC_022443	CAG	2	6	2343396	2343401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638595
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45119	NC_022443	CAA	2	6	2348962	2348967	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638601
45120	NC_022443	TGTT	2	8	2348968	2348975	0 %	75 %	25 %	0 %	545638601
45121	NC_022443	TGAT	2	8	2349031	2349038	25 %	50 %	25 %	0 %	545638601
45122	NC_022443	TAA	2	6	2349070	2349075	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638601
45123	NC_022443	TGTAA	2	10	2349135	2349144	40 %	40 %	20 %	0 %	545638601
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45128	NC_022443	T	6	6	2349718	2349723	0 %	100 %	0 %	0 %	545638602
45129	NC_022443	CAATA	2	10	2349774	2349783	60 %	20 %	0 %	20 %	545638602
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45132	NC_022443	TAAA	2	8	2349927	2349934	75 %	25 %	0 %	0 %	545638602
45133	NC_022443	GGT	2	6	2349941	2349946	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638602
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45221	NC_022443	TTA	2	6	2353468	2353473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638607
45222	NC_022443	GAT	2	6	2353501	2353506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638607
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45225	NC_022443	ATA	2	6	2353661	2353666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638608
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45227	NC_022443	CAA	2	6	2353727	2353732	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638608
45228	NC_022443	ATA	2	6	2353736	2353741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638608
45229	NC_022443	AT	3	6	2353755	2353760	50 %	50 %	0 %	0 %	545638608
45230	NC_022443	CAC	2	6	2353782	2353787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638608
45231	NC_022443	TCA	2	6	2353788	2353793	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638608
45232	NC_022443	ATAA	2	8	2353814	2353821	75 %	25 %	0 %	0 %	545638608
45233	NC_022443	TGT	2	6	2353868	2353873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638608
45234	NC_022443	TAA	3	9	2353918	2353926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638608
45235	NC_022443	AT	3	6	2353938	2353943	50 %	50 %	0 %	0 %	545638608
45236	NC_022443	GTA	2	6	2353976	2353981	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638608
45237	NC_022443	TAA	2	6	2353996	2354001	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638608
45238	NC_022443	TTA	2	6	2354019	2354024	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638608
45239	NC_022443	AC	3	6	2354076	2354081	50 %	0 %	0 %	50 %	545638608
45240	NC_022443	CATC	2	8	2354088	2354095	25 %	25 %	0 %	50 %	545638608
45241	NC_022443	A	6	6	2354131	2354136	100 %	0 %	0 %	0 %	545638608
45242	NC_022443	AAT	2	6	2354143	2354148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638608
45243	NC_022443	ATA	2	6	2354160	2354165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638608
45244	NC_022443	TTTC	2	8	2354186	2354193	0 %	75 %	0 %	25 %	545638608
45245	NC_022443	ATAACG	2	12	2354233	2354244	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	545638608
45246	NC_022443	ATG	2	6	2354315	2354320	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638608
45247	NC_022443	AAT	2	6	2354441	2354446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638609
45248	NC_022443	ATA	2	6	2354578	2354583	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638609
45249	NC_022443	AT	3	6	2354643	2354648	50 %	50 %	0 %	0 %	545638609
45250	NC_022443	T	6	6	2354657	2354662	0 %	100 %	0 %	0 %	545638609
45251	NC_022443	TCA	2	6	2354716	2354721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638609
45252	NC_022443	CTA	2	6	2354737	2354742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638609
45253	NC_022443	GAT	2	6	2354758	2354763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638609
45254	NC_022443	TTC	2	6	2354777	2354782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638609
45255	NC_022443	TGT	2	6	2354826	2354831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638609
45256	NC_022443	AT	3	6	2354835	2354840	50 %	50 %	0 %	0 %	545638609
45257	NC_022443	T	6	6	2354858	2354863	0 %	100 %	0 %	0 %	545638609
45258	NC_022443	CGC	2	6	2354984	2354989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545638610
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45260	NC_022443	TG	3	6	2355044	2355049	0 %	50 %	50 %	0 %	545638610
45261	NC_022443	TAA	2	6	2355090	2355095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638610
45262	NC_022443	TCA	2	6	2355194	2355199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638610
45263	NC_022443	TTC	2	6	2355285	2355290	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638610
45264	NC_022443	GTG	2	6	2355362	2355367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638610
45265	NC_022443	CAATC	2	10	2355470	2355479	40 %	20 %	0 %	40 %	545638610
45266	NC_022443	CTT	2	6	2355515	2355520	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638610
45267	NC_022443	AT	3	6	2355539	2355544	50 %	50 %	0 %	0 %	545638610
45268	NC_022443	CTG	2	6	2355578	2355583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638610
45269	NC_022443	GCT	2	6	2355586	2355591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638610
45270	NC_022443	CAT	2	6	2355608	2355613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638610
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45272	NC_022443	TCA	2	6	2355820	2355825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638610
45273	NC_022443	GCAAC	2	10	2355856	2355865	40 %	0 %	20 %	40 %	545638610
45274	NC_022443	CAT	2	6	2355903	2355908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638610
45275	NC_022443	TCT	3	9	2355937	2355945	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638610
45276	NC_022443	T	6	6	2355947	2355952	0 %	100 %	0 %	0 %	545638610
45277	NC_022443	ACC	2	6	2355984	2355989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638610
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45279	NC_022443	GTT	2	6	2356093	2356098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638610
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45281	NC_022443	TAAT	2	8	2356139	2356146	50 %	50 %	0 %	0 %	545638610
45282	NC_022443	A	6	6	2356163	2356168	100 %	0 %	0 %	0 %	545638610
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45289	NC_022443	ACC	2	6	2356588	2356593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638611
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45306	NC_022443	TGT	2	6	2357866	2357871	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638611
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45311	NC_022443	GTTT	2	8	2358065	2358072	0 %	75 %	25 %	0 %	545638611
45312	NC_022443	CG	3	6	2358091	2358096	0 %	0 %	50 %	50 %	545638611
45313	NC_022443	CTT	2	6	2358138	2358143	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
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45317	NC_022443	AACC	2	8	2358188	2358195	50 %	0 %	0 %	50 %	545638611
45318	NC_022443	GCT	2	6	2358203	2358208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
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45322	NC_022443	CATAA	2	10	2358464	2358473	60 %	20 %	0 %	20 %	545638611
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45324	NC_022443	CTT	2	6	2358630	2358635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
45325	NC_022443	TCG	2	6	2358665	2358670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
45326	NC_022443	ACG	2	6	2358700	2358705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638611
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45328	NC_022443	CTT	2	6	2358928	2358933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
45329	NC_022443	CTT	2	6	2358936	2358941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
45330	NC_022443	TAC	2	6	2358970	2358975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638611
45331	NC_022443	CAT	2	6	2358993	2358998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638611
45332	NC_022443	TGT	2	6	2359027	2359032	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638611
45333	NC_022443	TCAC	2	8	2359043	2359050	25 %	25 %	0 %	50 %	545638611
45334	NC_022443	TTCATC	2	12	2359081	2359092	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	545638611
45335	NC_022443	GCA	2	6	2359208	2359213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638611
45336	NC_022443	ATA	2	6	2359367	2359372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638611
45337	NC_022443	ATG	2	6	2359377	2359382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638611
45338	NC_022443	GGT	2	6	2359445	2359450	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638611
45339	NC_022443	CAC	2	6	2359485	2359490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638611
45340	NC_022443	TGA	2	6	2359500	2359505	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638611
45341	NC_022443	CTG	2	6	2359515	2359520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
45342	NC_022443	T	7	7	2359582	2359588	0 %	100 %	0 %	0 %	545638611
45343	NC_022443	TGC	2	6	2359606	2359611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638611
45344	NC_022443	GCTT	2	8	2359667	2359674	0 %	50 %	25 %	25 %	545638611
45345	NC_022443	CAA	2	6	2359701	2359706	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638611
45346	NC_022443	GCA	2	6	2359718	2359723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638611
45347	NC_022443	TCT	2	6	2359742	2359747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
45348	NC_022443	AT	3	6	2359784	2359789	50 %	50 %	0 %	0 %	545638611
45349	NC_022443	TTG	2	6	2359900	2359905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638611
45350	NC_022443	TAA	2	6	2359917	2359922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638611
45351	NC_022443	TGT	2	6	2359978	2359983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638611
45352	NC_022443	CTT	2	6	2359989	2359994	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638611
45353	NC_022443	T	6	6	2360022	2360027	0 %	100 %	0 %	0 %	545638611
45354	NC_022443	TACTTT	2	12	2360037	2360048	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545638611
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45363	NC_022443	ATA	2	6	2360748	2360753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638612
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45444	NC_022443	TTTGC	2	10	2364102	2364111	0 %	60 %	20 %	20 %	545638614
45445	NC_022443	TAA	2	6	2364219	2364224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638615
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45450	NC_022443	GAT	2	6	2364376	2364381	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638615
45451	NC_022443	TC	3	6	2364405	2364410	0 %	50 %	0 %	50 %	545638615
45452	NC_022443	CAA	2	6	2364516	2364521	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638615
45453	NC_022443	TTG	2	6	2364535	2364540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638615
45454	NC_022443	GTT	2	6	2364570	2364575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638615
45455	NC_022443	TG	3	6	2364599	2364604	0 %	50 %	50 %	0 %	545638615
45456	NC_022443	CGT	2	6	2364644	2364649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638615
45457	NC_022443	TTCAT	2	10	2364650	2364659	20 %	60 %	0 %	20 %	545638615
45458	NC_022443	CGT	2	6	2364751	2364756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638615
45459	NC_022443	AAAT	2	8	2364837	2364844	75 %	25 %	0 %	0 %	545638615
45460	NC_022443	GTC	2	6	2364864	2364869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638615
45461	NC_022443	CAA	2	6	2364888	2364893	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638615
45462	NC_022443	TGG	2	6	2365144	2365149	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638616
45463	NC_022443	CAT	3	9	2365218	2365226	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638616
45464	NC_022443	T	6	6	2365257	2365262	0 %	100 %	0 %	0 %	545638616
45465	NC_022443	CTT	2	6	2365347	2365352	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638616
45466	NC_022443	TAAG	2	8	2365358	2365365	50 %	25 %	25 %	0 %	545638616
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45468	NC_022443	TCA	3	9	2365490	2365498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638616
45469	NC_022443	GTA	2	6	2365514	2365519	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638616
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45490	NC_022443	GTA	2	6	2367251	2367256	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638618
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45499	NC_022443	TAT	2	6	2367827	2367832	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638619
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