MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
43001	NC_022443	CAT	2	6	2239336	2239341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638498
43002	NC_022443	TCGC	2	8	2239366	2239373	0 %	25 %	25 %	50 %	545638498
43003	NC_022443	A	6	6	2239434	2239439	100 %	0 %	0 %	0 %	545638498
43004	NC_022443	TTC	2	6	2239454	2239459	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638498
43005	NC_022443	TA	3	6	2239460	2239465	50 %	50 %	0 %	0 %	545638498
43006	NC_022443	AGC	2	6	2239466	2239471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638498
43007	NC_022443	AAT	2	6	2239475	2239480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638498
43008	NC_022443	CAT	2	6	2239537	2239542	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638498
43009	NC_022443	TTG	2	6	2239579	2239584	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638498
43010	NC_022443	ATT	2	6	2239631	2239636	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638498
43011	NC_022443	CCAA	2	8	2239715	2239722	50 %	0 %	0 %	50 %	545638498
43012	NC_022443	TCT	2	6	2239779	2239784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638498
43013	NC_022443	CAC	2	6	2239798	2239803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638498
43014	NC_022443	CTT	2	6	2239837	2239842	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638498
43015	NC_022443	GTT	2	6	2239962	2239967	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638498
43016	NC_022443	TCAT	2	8	2239989	2239996	25 %	50 %	0 %	25 %	545638498
43017	NC_022443	ATA	2	6	2240248	2240253	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638499
43018	NC_022443	AAT	2	6	2240267	2240272	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638499
43019	NC_022443	TGT	3	9	2240315	2240323	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638499
43020	NC_022443	CAC	2	6	2240333	2240338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638499
43021	NC_022443	TAA	2	6	2240345	2240350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638499
43022	NC_022443	A	6	6	2240358	2240363	100 %	0 %	0 %	0 %	545638499
43023	NC_022443	AAT	2	6	2240439	2240444	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638499
43024	NC_022443	ATC	2	6	2240456	2240461	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638499
43025	NC_022443	ACC	2	6	2240468	2240473	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638499
43026	NC_022443	TGC	2	6	2240525	2240530	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638499
43027	NC_022443	ATAC	2	8	2240562	2240569	50 %	25 %	0 %	25 %	545638499
43028	NC_022443	CCA	2	6	2240571	2240576	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638499
43029	NC_022443	AAT	2	6	2240616	2240621	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638499
43030	NC_022443	TGAA	2	8	2240625	2240632	50 %	25 %	25 %	0 %	545638499
43031	NC_022443	TTG	2	6	2240646	2240651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638499
43032	NC_022443	TC	3	6	2240796	2240801	0 %	50 %	0 %	50 %	545638499
43033	NC_022443	GCA	3	9	2240805	2240813	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638499
43034	NC_022443	TAA	2	6	2240825	2240830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638499
43035	NC_022443	CAT	2	6	2240926	2240931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638499
43036	NC_022443	TAAT	2	8	2240949	2240956	50 %	50 %	0 %	0 %	545638499
43037	NC_022443	TAC	2	6	2240983	2240988	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638499
43038	NC_022443	GCT	2	6	2240997	2241002	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638499
43039	NC_022443	AAT	2	6	2241027	2241032	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638499
43040	NC_022443	AAAC	2	8	2241044	2241051	75 %	0 %	0 %	25 %	545638499
43041	NC_022443	TTA	2	6	2241060	2241065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638499
43042	NC_022443	ACT	2	6	2241075	2241080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638499
43043	NC_022443	AT	3	6	2241085	2241090	50 %	50 %	0 %	0 %	545638499
43044	NC_022443	GGC	2	6	2241422	2241427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638500
43045	NC_022443	CGT	3	9	2241438	2241446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638500
43046	NC_022443	ATC	2	6	2241469	2241474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638500
43047	NC_022443	ATT	2	6	2241503	2241508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638500
43048	NC_022443	AGA	2	6	2241575	2241580	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638500
43049	NC_022443	ATGG	2	8	2241585	2241592	25 %	25 %	50 %	0 %	545638500
43050	NC_022443	ATT	2	6	2241709	2241714	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638501
43051	NC_022443	TAA	2	6	2241738	2241743	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638501
43052	NC_022443	CAT	2	6	2241745	2241750	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638501
43053	NC_022443	CATTTT	2	12	2241808	2241819	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545638501
43054	NC_022443	GCA	2	6	2241832	2241837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638501
43055	NC_022443	AGC	2	6	2241891	2241896	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638501
43056	NC_022443	A	6	6	2241919	2241924	100 %	0 %	0 %	0 %	545638501
43057	NC_022443	TGA	2	6	2242023	2242028	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638501
43058	NC_022443	ATG	2	6	2242031	2242036	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638501
43059	NC_022443	TGA	2	6	2242065	2242070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638501
43060	NC_022443	A	6	6	2242081	2242086	100 %	0 %	0 %	0 %	545638501
43061	NC_022443	GGA	2	6	2242087	2242092	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545638501
43062	NC_022443	GAA	2	6	2242224	2242229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638502
43063	NC_022443	TGG	3	9	2242238	2242246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638502
43064	NC_022443	TGA	2	6	2242292	2242297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638502
43065	NC_022443	TTA	2	6	2242333	2242338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638502
43066	NC_022443	GTT	2	6	2242353	2242358	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638502
43067	NC_022443	ATT	2	6	2242440	2242445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638502
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43069	NC_022443	CTG	2	6	2242492	2242497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638502
43070	NC_022443	TTA	2	6	2242522	2242527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638502
43071	NC_022443	TGG	3	9	2242577	2242585	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638502
43072	NC_022443	CAA	2	6	2242612	2242617	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638502
43073	NC_022443	CAA	2	6	2242708	2242713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638502
43074	NC_022443	TGA	2	6	2242820	2242825	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638502
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43076	NC_022443	TGG	2	6	2242940	2242945	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638502
43077	NC_022443	TTAA	2	8	2242962	2242969	50 %	50 %	0 %	0 %	545638502
43078	NC_022443	ATA	2	6	2243029	2243034	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638502
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43082	NC_022443	ATTA	2	8	2243465	2243472	50 %	50 %	0 %	0 %	545638502
43083	NC_022443	CGG	2	6	2243552	2243557	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638502
43084	NC_022443	A	6	6	2243755	2243760	100 %	0 %	0 %	0 %	545638502
43085	NC_022443	GCA	2	6	2243772	2243777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638502
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43088	NC_022443	TTG	2	6	2243833	2243838	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638503
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43090	NC_022443	ATA	2	6	2244031	2244036	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638503
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43097	NC_022443	AC	3	6	2244286	2244291	50 %	0 %	0 %	50 %	545638504
43098	NC_022443	ATT	2	6	2244297	2244302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638504
43099	NC_022443	TCAT	2	8	2244342	2244349	25 %	50 %	0 %	25 %	545638504
43100	NC_022443	AT	3	6	2244363	2244368	50 %	50 %	0 %	0 %	545638504
43101	NC_022443	ATG	2	6	2244386	2244391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638504
43102	NC_022443	GTTTA	2	10	2244464	2244473	20 %	60 %	20 %	0 %	545638504
43103	NC_022443	ATG	2	6	2244488	2244493	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638504
43104	NC_022443	TGTT	2	8	2244527	2244534	0 %	75 %	25 %	0 %	545638504
43105	NC_022443	ATC	2	6	2244635	2244640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638504
43106	NC_022443	ATT	2	6	2244701	2244706	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638504
43107	NC_022443	ATT	2	6	2244727	2244732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638504
43108	NC_022443	CTG	2	6	2244803	2244808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638504
43109	NC_022443	TA	3	6	2244838	2244843	50 %	50 %	0 %	0 %	545638504
43110	NC_022443	GAA	2	6	2244844	2244849	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638504
43111	NC_022443	AAG	2	6	2244875	2244880	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638504
43112	NC_022443	TCATA	2	10	2244953	2244962	40 %	40 %	0 %	20 %	545638504
43113	NC_022443	ATTGGT	2	12	2244994	2245005	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	545638505
43114	NC_022443	AATT	2	8	2245031	2245038	50 %	50 %	0 %	0 %	545638505
43115	NC_022443	TTA	2	6	2245082	2245087	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638505
43116	NC_022443	AT	4	8	2245094	2245101	50 %	50 %	0 %	0 %	545638505
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43226	NC_022443	TAAT	2	8	2250125	2250132	50 %	50 %	0 %	0 %	545638510
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43231	NC_022443	ATC	2	6	2250310	2250315	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638510
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43233	NC_022443	CAT	2	6	2250360	2250365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638510
43234	NC_022443	CAT	2	6	2250375	2250380	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638510
43235	NC_022443	TTG	2	6	2250382	2250387	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638510
43236	NC_022443	GATT	2	8	2250390	2250397	25 %	50 %	25 %	0 %	545638510
43237	NC_022443	AT	3	6	2250424	2250429	50 %	50 %	0 %	0 %	545638510
43238	NC_022443	CTTC	2	8	2250444	2250451	0 %	50 %	0 %	50 %	545638510
43239	NC_022443	ACT	2	6	2250454	2250459	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638510
43240	NC_022443	AAT	2	6	2250489	2250494	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638510
43241	NC_022443	GAA	2	6	2251116	2251121	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638511
43242	NC_022443	CTA	2	6	2251133	2251138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638511
43243	NC_022443	CAT	2	6	2251235	2251240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638511
43244	NC_022443	CTA	2	6	2251332	2251337	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638511
43245	NC_022443	TAC	3	9	2251345	2251353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638511
43246	NC_022443	ATAACT	2	12	2251364	2251375	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545638511
43247	NC_022443	ACA	2	6	2251376	2251381	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638511
43248	NC_022443	ACA	2	6	2251385	2251390	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638511
43249	NC_022443	ACA	2	6	2251421	2251426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638511
43250	NC_022443	ACT	2	6	2251427	2251432	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638511
43251	NC_022443	ATA	2	6	2251436	2251441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638511
43252	NC_022443	ATCA	2	8	2251442	2251449	50 %	25 %	0 %	25 %	545638511
43253	NC_022443	ACA	2	6	2251475	2251480	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638511
43254	NC_022443	TGG	2	6	2251497	2251502	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638511
43255	NC_022443	CAA	2	6	2251530	2251535	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638511
43256	NC_022443	CAT	2	6	2251562	2251567	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638511
43257	NC_022443	TAC	2	6	2251636	2251641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638511
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43262	NC_022443	ATAA	2	8	2252431	2252438	75 %	25 %	0 %	0 %	545638512
43263	NC_022443	GA	3	6	2252575	2252580	50 %	0 %	50 %	0 %	545638512
43264	NC_022443	AC	3	6	2252611	2252616	50 %	0 %	0 %	50 %	545638512
43265	NC_022443	ATA	2	6	2252622	2252627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638512
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43272	NC_022443	CAAA	2	8	2253011	2253018	75 %	0 %	0 %	25 %	545638512
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43280	NC_022443	A	6	6	2253432	2253437	100 %	0 %	0 %	0 %	545638512
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43285	NC_022443	A	6	6	2253671	2253676	100 %	0 %	0 %	0 %	545638512
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43291	NC_022443	CAATTA	2	12	2253947	2253958	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545638513
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43302	NC_022443	CTG	2	6	2254487	2254492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638513
43303	NC_022443	TCT	2	6	2254570	2254575	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638513
43304	NC_022443	TGC	2	6	2254605	2254610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638513
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43315	NC_022443	CTG	2	6	2254886	2254891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638513
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43319	NC_022443	TAT	2	6	2255286	2255291	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638514
43320	NC_022443	A	6	6	2255317	2255322	100 %	0 %	0 %	0 %	545638514
43321	NC_022443	A	6	6	2255352	2255357	100 %	0 %	0 %	0 %	545638514
43322	NC_022443	AT	3	6	2255379	2255384	50 %	50 %	0 %	0 %	545638514
43323	NC_022443	TCATTA	2	12	2255453	2255464	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	545638514
43324	NC_022443	TCA	2	6	2255471	2255476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638514
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43326	NC_022443	GT	3	6	2255544	2255549	0 %	50 %	50 %	0 %	545638514
43327	NC_022443	ATTT	2	8	2255595	2255602	25 %	75 %	0 %	0 %	545638514
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43337	NC_022443	GTAT	2	8	2256053	2256060	25 %	50 %	25 %	0 %	545638515
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43339	NC_022443	GCT	3	9	2256114	2256122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638515
43340	NC_022443	TCT	2	6	2256180	2256185	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638515
43341	NC_022443	AACTAC	2	12	2256318	2256329	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	545638515
43342	NC_022443	TTAA	2	8	2256813	2256820	50 %	50 %	0 %	0 %	545638516
43343	NC_022443	TAT	2	6	2256853	2256858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638516
43344	NC_022443	TAA	2	6	2256932	2256937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638516
43345	NC_022443	A	6	6	2256961	2256966	100 %	0 %	0 %	0 %	545638516
43346	NC_022443	AC	3	6	2256982	2256987	50 %	0 %	0 %	50 %	545638516
43347	NC_022443	CAA	2	6	2256997	2257002	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638516
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43349	NC_022443	CGT	2	6	2257047	2257052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638516
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43351	NC_022443	TCG	2	6	2257184	2257189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638516
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43453	NC_022443	T	6	6	2263003	2263008	0 %	100 %	0 %	0 %	545638521
43454	NC_022443	AAT	2	6	2263014	2263019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638521
43455	NC_022443	CAAT	2	8	2263078	2263085	50 %	25 %	0 %	25 %	545638521
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43464	NC_022443	CAC	2	6	2263543	2263548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638521
43465	NC_022443	T	6	6	2263646	2263651	0 %	100 %	0 %	0 %	545638521
43466	NC_022443	ATCA	2	8	2263658	2263665	50 %	25 %	0 %	25 %	545638521
43467	NC_022443	CAT	2	6	2263730	2263735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638521
43468	NC_022443	CAT	2	6	2263801	2263806	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638521
43469	NC_022443	CAAT	2	8	2263839	2263846	50 %	25 %	0 %	25 %	545638521
43470	NC_022443	CATC	2	8	2263999	2264006	25 %	25 %	0 %	50 %	545638521
43471	NC_022443	TAT	2	6	2264008	2264013	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638521
43472	NC_022443	ATT	2	6	2264030	2264035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638521
43473	NC_022443	CTT	2	6	2264089	2264094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638521
43474	NC_022443	ATT	2	6	2264114	2264119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638521
43475	NC_022443	ATCA	2	8	2264144	2264151	50 %	25 %	0 %	25 %	545638521
43476	NC_022443	TAC	2	6	2264155	2264160	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638521
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43479	NC_022443	TAA	2	6	2264967	2264972	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638522
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43481	NC_022443	TTA	2	6	2265061	2265066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638522
43482	NC_022443	ATT	2	6	2265138	2265143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638522
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43484	NC_022443	GAT	2	6	2265181	2265186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638522
43485	NC_022443	TTA	2	6	2265199	2265204	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638522
43486	NC_022443	GTT	2	6	2265233	2265238	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638522
43487	NC_022443	CAC	2	6	2265251	2265256	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638522
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43489	NC_022443	TAA	2	6	2265281	2265286	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638522
43490	NC_022443	TTAC	2	8	2265364	2265371	25 %	50 %	0 %	25 %	545638522
43491	NC_022443	CCG	2	6	2265382	2265387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	545638522
43492	NC_022443	CTAT	2	8	2265391	2265398	25 %	50 %	0 %	25 %	545638522
43493	NC_022443	CCAT	2	8	2265412	2265419	25 %	25 %	0 %	50 %	545638522
43494	NC_022443	CATT	2	8	2265449	2265456	25 %	50 %	0 %	25 %	545638522
43495	NC_022443	CCA	2	6	2265490	2265495	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638522
43496	NC_022443	T	6	6	2265515	2265520	0 %	100 %	0 %	0 %	545638522
43497	NC_022443	AGT	2	6	2265522	2265527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638522
43498	NC_022443	CAA	2	6	2265536	2265541	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638522
43499	NC_022443	TACT	2	8	2265566	2265573	25 %	50 %	0 %	25 %	545638522
43500	NC_022443	TTC	2	6	2265583	2265588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638522

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