MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_022443	ATT	2	6	2213144	2213149	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638469
42503	NC_022443	ACA	2	6	2213267	2213272	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638469
42504	NC_022443	ATT	2	6	2213344	2213349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638469
42505	NC_022443	ACTT	2	8	2213365	2213372	25 %	50 %	0 %	25 %	545638469
42506	NC_022443	A	6	6	2213417	2213422	100 %	0 %	0 %	0 %	545638469
42507	NC_022443	TGG	2	6	2213494	2213499	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638469
42508	NC_022443	TTC	2	6	2213513	2213518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638469
42509	NC_022443	TGG	2	6	2213539	2213544	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638469
42510	NC_022443	TATCC	2	10	2213548	2213557	20 %	40 %	0 %	40 %	545638469
42511	NC_022443	GAAA	2	8	2213735	2213742	75 %	0 %	25 %	0 %	545638469
42512	NC_022443	TCG	2	6	2213746	2213751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638469
42513	NC_022443	TAT	4	12	2213776	2213787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638469
42514	NC_022443	AAT	2	6	2214406	2214411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638470
42515	NC_022443	TAA	2	6	2214417	2214422	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638470
42516	NC_022443	GTC	2	6	2214437	2214442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638470
42517	NC_022443	AAT	2	6	2214490	2214495	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638470
42518	NC_022443	CAA	2	6	2214526	2214531	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638470
42519	NC_022443	GTC	2	6	2214533	2214538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638470
42520	NC_022443	ATCAT	2	10	2214542	2214551	40 %	40 %	0 %	20 %	545638470
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42522	NC_022443	TAG	2	6	2214627	2214632	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638470
42523	NC_022443	TA	3	6	2214637	2214642	50 %	50 %	0 %	0 %	545638470
42524	NC_022443	CTTT	2	8	2214643	2214650	0 %	75 %	0 %	25 %	545638470
42525	NC_022443	ATGT	2	8	2214782	2214789	25 %	50 %	25 %	0 %	545638470
42526	NC_022443	TAA	2	6	2214808	2214813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638470
42527	NC_022443	CTAC	2	8	2214866	2214873	25 %	25 %	0 %	50 %	545638470
42528	NC_022443	AGTA	2	8	2214876	2214883	50 %	25 %	25 %	0 %	545638470
42529	NC_022443	CAC	2	6	2214903	2214908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638470
42530	NC_022443	ATAA	2	8	2214928	2214935	75 %	25 %	0 %	0 %	545638470
42531	NC_022443	TCA	2	6	2215002	2215007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638470
42532	NC_022443	A	6	6	2215045	2215050	100 %	0 %	0 %	0 %	545638470
42533	NC_022443	TGACT	2	10	2215191	2215200	20 %	40 %	20 %	20 %	545638470
42534	NC_022443	TAA	2	6	2215252	2215257	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638470
42535	NC_022443	AAT	2	6	2215258	2215263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638470
42536	NC_022443	TAA	2	6	2215579	2215584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638471
42537	NC_022443	TTA	2	6	2215875	2215880	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638472
42538	NC_022443	ATT	2	6	2215922	2215927	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638472
42539	NC_022443	GT	3	6	2215932	2215937	0 %	50 %	50 %	0 %	545638472
42540	NC_022443	TTA	2	6	2215940	2215945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638472
42541	NC_022443	ACG	2	6	2215961	2215966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638472
42542	NC_022443	TGG	2	6	2215988	2215993	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638472
42543	NC_022443	TTA	2	6	2216006	2216011	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638472
42544	NC_022443	A	6	6	2216054	2216059	100 %	0 %	0 %	0 %	545638472
42545	NC_022443	ATT	2	6	2216095	2216100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638472
42546	NC_022443	AT	3	6	2216111	2216116	50 %	50 %	0 %	0 %	545638472
42547	NC_022443	TAT	2	6	2216133	2216138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638472
42548	NC_022443	T	7	7	2216348	2216354	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
42549	NC_022443	AT	3	6	2216372	2216377	50 %	50 %	0 %	0 %	545638473
42550	NC_022443	TGA	2	6	2216408	2216413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638473
42551	NC_022443	ACC	2	6	2216420	2216425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638473
42552	NC_022443	AGC	2	6	2216435	2216440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638473
42553	NC_022443	TTG	2	6	2216503	2216508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
42554	NC_022443	CTT	2	6	2216563	2216568	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638473
42555	NC_022443	ATT	2	6	2216591	2216596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
42556	NC_022443	TAC	2	6	2216630	2216635	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
42557	NC_022443	AAT	2	6	2216705	2216710	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
42558	NC_022443	TAA	2	6	2216776	2216781	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
42559	NC_022443	CATTG	2	10	2216837	2216846	20 %	40 %	20 %	20 %	545638473
42560	NC_022443	ATC	2	6	2216852	2216857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
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42562	NC_022443	ATT	2	6	2216885	2216890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
42563	NC_022443	ATT	2	6	2216903	2216908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
42564	NC_022443	CCAC	2	8	2216937	2216944	25 %	0 %	0 %	75 %	545638473
42565	NC_022443	GTT	2	6	2217018	2217023	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
42566	NC_022443	TAAC	2	8	2217025	2217032	50 %	25 %	0 %	25 %	545638473
42567	NC_022443	ACC	2	6	2217059	2217064	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638473
42568	NC_022443	TAT	2	6	2217085	2217090	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
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42570	NC_022443	TTTG	2	8	2217124	2217131	0 %	75 %	25 %	0 %	545638473
42571	NC_022443	T	6	6	2217178	2217183	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
42572	NC_022443	TTCA	2	8	2217194	2217201	25 %	50 %	0 %	25 %	545638473
42573	NC_022443	TTA	2	6	2217405	2217410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
42574	NC_022443	TAA	2	6	2217475	2217480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
42575	NC_022443	TAC	2	6	2217550	2217555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
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42577	NC_022443	TGCT	2	8	2217659	2217666	0 %	50 %	25 %	25 %	545638473
42578	NC_022443	CTG	2	6	2217718	2217723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638473
42579	NC_022443	TCC	2	6	2217749	2217754	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638473
42580	NC_022443	CAATG	2	10	2217822	2217831	40 %	20 %	20 %	20 %	545638473
42581	NC_022443	T	6	6	2217833	2217838	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
42582	NC_022443	TGT	2	6	2217842	2217847	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
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42585	NC_022443	ACG	2	6	2217884	2217889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638473
42586	NC_022443	T	6	6	2217899	2217904	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
42587	NC_022443	TAA	2	6	2217947	2217952	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
42588	NC_022443	TAA	2	6	2217959	2217964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
42589	NC_022443	ATA	2	6	2218044	2218049	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638473
42590	NC_022443	ATT	2	6	2218068	2218073	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
42591	NC_022443	GTT	2	6	2218123	2218128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
42592	NC_022443	CAA	2	6	2218162	2218167	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638473
42593	NC_022443	AATCG	2	10	2218172	2218181	40 %	20 %	20 %	20 %	545638473
42594	NC_022443	AAG	2	6	2218271	2218276	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638473
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42596	NC_022443	CGT	2	6	2218307	2218312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638473
42597	NC_022443	ATG	2	6	2218366	2218371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638473
42598	NC_022443	TCA	2	6	2218452	2218457	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
42599	NC_022443	TAT	2	6	2218636	2218641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
42600	NC_022443	TGC	2	6	2218665	2218670	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638473
42601	NC_022443	TCC	2	6	2218742	2218747	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	545638473
42602	NC_022443	CAA	3	9	2218807	2218815	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638473
42603	NC_022443	TTTATC	2	12	2218820	2218831	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	545638473
42604	NC_022443	GTG	2	6	2218852	2218857	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638473
42605	NC_022443	TTG	2	6	2218864	2218869	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
42606	NC_022443	CAT	2	6	2218891	2218896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
42607	NC_022443	CAG	2	6	2218897	2218902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545638473
42608	NC_022443	TTCA	2	8	2219021	2219028	25 %	50 %	0 %	25 %	545638473
42609	NC_022443	T	6	6	2219042	2219047	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
42610	NC_022443	AATTT	2	10	2219142	2219151	40 %	60 %	0 %	0 %	545638473
42611	NC_022443	T	6	6	2219162	2219167	0 %	100 %	0 %	0 %	545638473
42612	NC_022443	TTC	2	6	2219174	2219179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638473
42613	NC_022443	TAT	2	6	2219197	2219202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638473
42614	NC_022443	TAC	2	6	2219296	2219301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638473
42615	NC_022443	TTG	3	9	2219341	2219349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638473
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42617	NC_022443	AAC	2	6	2219435	2219440	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638473
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42731	NC_022443	A	6	6	2226537	2226542	100 %	0 %	0 %	0 %	545638481
42732	NC_022443	TTC	3	9	2226546	2226554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638481
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42996	NC_022443	ATCA	2	8	2238992	2238999	50 %	25 %	0 %	25 %	545638498
42997	NC_022443	TTG	2	6	2239039	2239044	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638498
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