MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
35501	NC_022443	ATA	2	6	1817993	1817998	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638106
35502	NC_022443	TGA	2	6	1818192	1818197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638107
35503	NC_022443	ATT	2	6	1818218	1818223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638107
35504	NC_022443	T	7	7	1818251	1818257	0 %	100 %	0 %	0 %	545638107
35505	NC_022443	TTA	2	6	1818260	1818265	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638107
35506	NC_022443	TAT	2	6	1818359	1818364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638107
35507	NC_022443	A	6	6	1818370	1818375	100 %	0 %	0 %	0 %	545638107
35508	NC_022443	TATAT	2	10	1818397	1818406	40 %	60 %	0 %	0 %	545638107
35509	NC_022443	TTG	2	6	1818415	1818420	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638107
35510	NC_022443	CAC	2	6	1818455	1818460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638107
35511	NC_022443	ATT	2	6	1818535	1818540	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638107
35512	NC_022443	GAA	2	6	1818553	1818558	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545638107
35513	NC_022443	GATT	2	8	1818572	1818579	25 %	50 %	25 %	0 %	545638107
35514	NC_022443	ATC	2	6	1818599	1818604	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638107
35515	NC_022443	T	7	7	1818605	1818611	0 %	100 %	0 %	0 %	545638107
35516	NC_022443	TTC	2	6	1818634	1818639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638107
35517	NC_022443	TACT	2	8	1818711	1818718	25 %	50 %	0 %	25 %	545638107
35518	NC_022443	AAAAC	2	10	1818721	1818730	80 %	0 %	0 %	20 %	545638107
35519	NC_022443	TAGAA	2	10	1819255	1819264	60 %	20 %	20 %	0 %	545638108
35520	NC_022443	T	6	6	1819351	1819356	0 %	100 %	0 %	0 %	545638108
35521	NC_022443	CTG	2	6	1819365	1819370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638108
35522	NC_022443	TAA	2	6	1819377	1819382	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638108
35523	NC_022443	TCA	2	6	1819397	1819402	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638108
35524	NC_022443	AAT	2	6	1819418	1819423	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638108
35525	NC_022443	ATA	2	6	1819440	1819445	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638108
35526	NC_022443	TAATGG	2	12	1819492	1819503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638108
35527	NC_022443	T	6	6	1819645	1819650	0 %	100 %	0 %	0 %	545638108
35528	NC_022443	TGC	2	6	1819732	1819737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638108
35529	NC_022443	TTTC	2	8	1819800	1819807	0 %	75 %	0 %	25 %	545638108
35530	NC_022443	CTT	2	6	1819812	1819817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638108
35531	NC_022443	TGT	2	6	1819870	1819875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638108
35532	NC_022443	TTGT	2	8	1819888	1819895	0 %	75 %	25 %	0 %	545638108
35533	NC_022443	GCT	2	6	1819904	1819909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638108
35534	NC_022443	TTC	2	6	1819915	1819920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638108
35535	NC_022443	TTTAG	2	10	1819952	1819961	20 %	60 %	20 %	0 %	545638108
35536	NC_022443	ATATA	2	10	1819964	1819973	60 %	40 %	0 %	0 %	545638108
35537	NC_022443	A	7	7	1820234	1820240	100 %	0 %	0 %	0 %	545638109
35538	NC_022443	ATT	2	6	1820265	1820270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638109
35539	NC_022443	ATTAA	2	10	1820328	1820337	60 %	40 %	0 %	0 %	545638109
35540	NC_022443	TTA	2	6	1820353	1820358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638109
35541	NC_022443	ATT	2	6	1820463	1820468	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638109
35542	NC_022443	A	6	6	1820524	1820529	100 %	0 %	0 %	0 %	545638109
35543	NC_022443	TA	3	6	1820791	1820796	50 %	50 %	0 %	0 %	545638110
35544	NC_022443	GGT	2	6	1820805	1820810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638110
35545	NC_022443	TTA	2	6	1820823	1820828	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638110
35546	NC_022443	TTTCT	2	10	1820839	1820848	0 %	80 %	0 %	20 %	545638110
35547	NC_022443	T	7	7	1820940	1820946	0 %	100 %	0 %	0 %	545638110
35548	NC_022443	A	7	7	1820963	1820969	100 %	0 %	0 %	0 %	545638110
35549	NC_022443	ATC	2	6	1821043	1821048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638110
35550	NC_022443	TAC	2	6	1821064	1821069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638110
35551	NC_022443	TGTTA	2	10	1821103	1821112	20 %	60 %	20 %	0 %	545638110
35552	NC_022443	GGT	3	9	1821129	1821137	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545638110
35553	NC_022443	ATCA	2	8	1821148	1821155	50 %	25 %	0 %	25 %	545638111
35554	NC_022443	GGC	2	6	1821170	1821175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638111
35555	NC_022443	ATT	2	6	1821210	1821215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638111
35556	NC_022443	T	6	6	1821277	1821282	0 %	100 %	0 %	0 %	545638111
35557	NC_022443	T	6	6	1821346	1821351	0 %	100 %	0 %	0 %	545638111
35558	NC_022443	AAC	2	6	1821361	1821366	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638111
35559	NC_022443	ATG	2	6	1821398	1821403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638111
35560	NC_022443	ATT	2	6	1821435	1821440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638111
35561	NC_022443	TCA	2	6	1821453	1821458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638111
35562	NC_022443	AAC	2	6	1821923	1821928	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638112
35563	NC_022443	TCA	2	6	1821975	1821980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638112
35564	NC_022443	TCA	2	6	1821997	1822002	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638112
35565	NC_022443	TGT	2	6	1822029	1822034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638112
35566	NC_022443	GAT	2	6	1822075	1822080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638112
35567	NC_022443	ATTA	2	8	1822091	1822098	50 %	50 %	0 %	0 %	545638112
35568	NC_022443	TAT	2	6	1822177	1822182	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638112
35569	NC_022443	TA	3	6	1822186	1822191	50 %	50 %	0 %	0 %	545638112
35570	NC_022443	TTCG	2	8	1822229	1822236	0 %	50 %	25 %	25 %	545638112
35571	NC_022443	GCT	2	6	1822308	1822313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638112
35572	NC_022443	TAA	2	6	1822354	1822359	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638112
35573	NC_022443	TCT	2	6	1822365	1822370	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638112
35574	NC_022443	TTC	2	6	1822421	1822426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638112
35575	NC_022443	TAC	2	6	1822453	1822458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638112
35576	NC_022443	TCA	2	6	1822503	1822508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638112
35577	NC_022443	CAT	2	6	1822815	1822820	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638113
35578	NC_022443	TTG	2	6	1822821	1822826	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638113
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35584	NC_022443	TCT	2	6	1823476	1823481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638113
35585	NC_022443	TGT	2	6	1823482	1823487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638113
35586	NC_022443	CTT	2	6	1823531	1823536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638113
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35588	NC_022443	TCT	2	6	1823578	1823583	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638113
35589	NC_022443	T	6	6	1823598	1823603	0 %	100 %	0 %	0 %	545638113
35590	NC_022443	TAC	2	6	1823606	1823611	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638113
35591	NC_022443	A	6	6	1823634	1823639	100 %	0 %	0 %	0 %	545638113
35592	NC_022443	ACT	2	6	1823653	1823658	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638113
35593	NC_022443	AAT	2	6	1823661	1823666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638113
35594	NC_022443	TAT	2	6	1823822	1823827	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638114
35595	NC_022443	TTC	2	6	1823845	1823850	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638114
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35597	NC_022443	GTTT	2	8	1823915	1823922	0 %	75 %	25 %	0 %	545638114
35598	NC_022443	GTT	2	6	1823931	1823936	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638114
35599	NC_022443	TAA	2	6	1823952	1823957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638114
35600	NC_022443	CAATTG	2	12	1824039	1824050	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545638114
35601	NC_022443	CTG	2	6	1824111	1824116	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638114
35602	NC_022443	CAA	2	6	1824117	1824122	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638114
35603	NC_022443	CCA	2	6	1824200	1824205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638114
35604	NC_022443	CGTA	2	8	1824222	1824229	25 %	25 %	25 %	25 %	545638114
35605	NC_022443	CAA	2	6	1824231	1824236	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638114
35606	NC_022443	TCT	2	6	1824374	1824379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638114
35607	NC_022443	TGT	2	6	1824410	1824415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638114
35608	NC_022443	TCA	2	6	1824458	1824463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638114
35609	NC_022443	AAT	2	6	1824501	1824506	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638114
35610	NC_022443	ATAA	2	8	1824558	1824565	75 %	25 %	0 %	0 %	545638114
35611	NC_022443	CACCTG	2	12	1824627	1824638	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	545638114
35612	NC_022443	TCT	2	6	1824650	1824655	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638114
35613	NC_022443	TCA	2	6	1824719	1824724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638114
35614	NC_022443	TCATAA	2	12	1824749	1824760	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545638114
35615	NC_022443	AAC	2	6	1824805	1824810	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638114
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35617	NC_022443	TGT	2	6	1824868	1824873	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638114
35618	NC_022443	GTT	2	6	1824878	1824883	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638114
35619	NC_022443	GTC	2	6	1824907	1824912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545638114
35620	NC_022443	AAT	2	6	1824995	1825000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638114
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35630	NC_022443	TTA	2	6	1825807	1825812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545638115
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35703	NC_022443	TCA	2	6	1829201	1829206	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638119
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35720	NC_022443	ATC	2	6	1830008	1830013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638120
35721	NC_022443	TAA	2	6	1830103	1830108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545638120
35722	NC_022443	TCA	2	6	1830232	1830237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638120
35723	NC_022443	CTT	2	6	1830271	1830276	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545638120
35724	NC_022443	TGCA	2	8	1830338	1830345	25 %	25 %	25 %	25 %	545638120
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35726	NC_022443	T	6	6	1830475	1830480	0 %	100 %	0 %	0 %	545638120
35727	NC_022443	TTG	2	6	1830506	1830511	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638120
35728	NC_022443	TG	4	8	1830547	1830554	0 %	50 %	50 %	0 %	545638120
35729	NC_022443	T	6	6	1830564	1830569	0 %	100 %	0 %	0 %	545638120
35730	NC_022443	ATC	2	6	1830570	1830575	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638120
35731	NC_022443	CAA	2	6	1830604	1830609	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545638120
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35733	NC_022443	CT	3	6	1830717	1830722	0 %	50 %	0 %	50 %	545638120
35734	NC_022443	TAAAT	2	10	1830824	1830833	60 %	40 %	0 %	0 %	545638120
35735	NC_022443	GCG	2	6	1830853	1830858	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545638120
35736	NC_022443	CAC	2	6	1830869	1830874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545638120
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35746	NC_022443	TTG	2	6	1831166	1831171	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545638120
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35756	NC_022443	AATA	2	8	1831706	1831713	75 %	25 %	0 %	0 %	545638121
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35845	NC_022443	TAG	2	6	1835628	1835633	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545638126
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35999	NC_022443	CAT	2	6	1846303	1846308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545638136
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