MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022443	GAA	2	6	667305	667310	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637053
13002	NC_022443	GAT	2	6	667318	667323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637053
13003	NC_022443	AGTG	2	8	667350	667357	25 %	25 %	50 %	0 %	545637053
13004	NC_022443	GTAT	2	8	667412	667419	25 %	50 %	25 %	0 %	545637053
13005	NC_022443	GAT	2	6	667521	667526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637053
13006	NC_022443	GAA	2	6	667582	667587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637053
13007	NC_022443	TTA	2	6	667589	667594	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637053
13008	NC_022443	TGA	2	6	667638	667643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637053
13009	NC_022443	CAACGT	2	12	667693	667704	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	545637053
13010	NC_022443	TGA	2	6	667752	667757	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637053
13011	NC_022443	AGTGAA	2	12	667777	667788	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	545637053
13012	NC_022443	AAG	2	6	667799	667804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637053
13013	NC_022443	AAC	2	6	667830	667835	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637053
13014	NC_022443	A	6	6	667867	667872	100 %	0 %	0 %	0 %	545637053
13015	NC_022443	TTA	2	6	668357	668362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13016	NC_022443	ATT	2	6	668369	668374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13017	NC_022443	TAT	2	6	668403	668408	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13018	NC_022443	CAAT	2	8	668438	668445	50 %	25 %	0 %	25 %	545637054
13019	NC_022443	GTT	2	6	668456	668461	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637054
13020	NC_022443	TTTA	2	8	668486	668493	25 %	75 %	0 %	0 %	545637054
13021	NC_022443	AGC	2	6	668524	668529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637054
13022	NC_022443	TCAG	2	8	668551	668558	25 %	25 %	25 %	25 %	545637054
13023	NC_022443	TTTGCA	2	12	668576	668587	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	545637054
13024	NC_022443	ATG	2	6	668606	668611	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637054
13025	NC_022443	TTA	2	6	668642	668647	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13026	NC_022443	ATT	2	6	668656	668661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13027	NC_022443	ATT	2	6	668696	668701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13028	NC_022443	TTGG	2	8	668709	668716	0 %	50 %	50 %	0 %	545637054
13029	NC_022443	ATG	2	6	668771	668776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637054
13030	NC_022443	ATGA	2	8	668828	668835	50 %	25 %	25 %	0 %	545637054
13031	NC_022443	ATG	2	6	668858	668863	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637054
13032	NC_022443	ATT	2	6	668963	668968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13033	NC_022443	TTG	2	6	668978	668983	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637054
13034	NC_022443	AGAA	2	8	669003	669010	75 %	0 %	25 %	0 %	545637054
13035	NC_022443	ATT	2	6	669014	669019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13036	NC_022443	TTC	2	6	669056	669061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637054
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13038	NC_022443	ATC	3	9	669107	669115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637054
13039	NC_022443	TTA	2	6	669123	669128	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13040	NC_022443	GGAT	2	8	669191	669198	25 %	25 %	50 %	0 %	545637054
13041	NC_022443	GT	3	6	669237	669242	0 %	50 %	50 %	0 %	545637054
13042	NC_022443	ATG	2	6	669279	669284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637054
13043	NC_022443	TGGT	2	8	669290	669297	0 %	50 %	50 %	0 %	545637054
13044	NC_022443	CAA	2	6	669302	669307	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637054
13045	NC_022443	TGT	2	6	669337	669342	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637054
13046	NC_022443	ACACC	2	10	669377	669386	40 %	0 %	0 %	60 %	545637054
13047	NC_022443	TTA	2	6	669396	669401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
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13049	NC_022443	ATG	2	6	669512	669517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637054
13050	NC_022443	TAT	2	6	669519	669524	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13051	NC_022443	ATT	2	6	669541	669546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637054
13052	NC_022443	CAG	2	6	669549	669554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637054
13053	NC_022443	TGC	2	6	670158	670163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637055
13054	NC_022443	TAT	2	6	670179	670184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637055
13055	NC_022443	ATT	2	6	670225	670230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637055
13056	NC_022443	TAT	2	6	670234	670239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637055
13057	NC_022443	CTT	2	6	670269	670274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637055
13058	NC_022443	ATTG	2	8	670287	670294	25 %	50 %	25 %	0 %	545637055
13059	NC_022443	TGG	2	6	670428	670433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637055
13060	NC_022443	ACA	2	6	670480	670485	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637055
13061	NC_022443	ACA	2	6	670492	670497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637055
13062	NC_022443	TGCTT	2	10	670545	670554	0 %	60 %	20 %	20 %	545637055
13063	NC_022443	TTC	2	6	670555	670560	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637055
13064	NC_022443	GTT	2	6	670570	670575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637055
13065	NC_022443	TA	3	6	670633	670638	50 %	50 %	0 %	0 %	545637055
13066	NC_022443	A	6	6	670681	670686	100 %	0 %	0 %	0 %	545637055
13067	NC_022443	ATT	2	6	670696	670701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637055
13068	NC_022443	TTA	2	6	670779	670784	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637055
13069	NC_022443	GAA	2	6	670792	670797	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637055
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13071	NC_022443	CAAAG	2	10	670839	670848	60 %	0 %	20 %	20 %	545637055
13072	NC_022443	ATTA	2	8	670851	670858	50 %	50 %	0 %	0 %	545637055
13073	NC_022443	ATG	2	6	670892	670897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637055
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13078	NC_022443	AAG	2	6	671386	671391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637056
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13080	NC_022443	CTG	2	6	671557	671562	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637056
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13082	NC_022443	ATTG	2	8	671577	671584	25 %	50 %	25 %	0 %	545637056
13083	NC_022443	TCAA	2	8	671625	671632	50 %	25 %	0 %	25 %	545637056
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13090	NC_022443	ATC	2	6	671871	671876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637056
13091	NC_022443	AGA	2	6	671891	671896	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637056
13092	NC_022443	TGT	2	6	671939	671944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637056
13093	NC_022443	TTAA	2	8	672014	672021	50 %	50 %	0 %	0 %	545637056
13094	NC_022443	AGG	2	6	672454	672459	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545637057
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13101	NC_022443	TTG	2	6	672942	672947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637057
13102	NC_022443	TCATT	2	10	672993	673002	20 %	60 %	0 %	20 %	545637057
13103	NC_022443	A	6	6	673034	673039	100 %	0 %	0 %	0 %	545637057
13104	NC_022443	GGA	2	6	673040	673045	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545637057
13105	NC_022443	ATA	2	6	673067	673072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637058
13106	NC_022443	CTA	2	6	673111	673116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637058
13107	NC_022443	ACA	2	6	673154	673159	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637058
13108	NC_022443	TGA	2	6	673209	673214	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637058
13109	NC_022443	TTA	2	6	673222	673227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
13110	NC_022443	GAT	3	9	673245	673253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637058
13111	NC_022443	TGGC	2	8	673262	673269	0 %	25 %	50 %	25 %	545637058
13112	NC_022443	GTG	2	6	673286	673291	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637058
13113	NC_022443	GGC	2	6	673354	673359	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	545637058
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13118	NC_022443	ATT	2	6	673465	673470	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637058
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13120	NC_022443	TGG	2	6	673554	673559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637058
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13480	NC_022443	AGA	2	6	691344	691349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637075
13481	NC_022443	TACT	2	8	692072	692079	25 %	50 %	0 %	25 %	545637076
13482	NC_022443	AAT	2	6	692080	692085	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637076
13483	NC_022443	GTAAAA	2	12	692165	692176	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	545637076
13484	NC_022443	GAT	2	6	692185	692190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637076
13485	NC_022443	AT	5	10	692189	692198	50 %	50 %	0 %	0 %	545637076
13486	NC_022443	ATC	2	6	692204	692209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637076
13487	NC_022443	AAT	2	6	692230	692235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637076
13488	NC_022443	A	7	7	692236	692242	100 %	0 %	0 %	0 %	545637076
13489	NC_022443	TGT	2	6	692249	692254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637076
13490	NC_022443	CTTT	2	8	692291	692298	0 %	75 %	0 %	25 %	545637076
13491	NC_022443	TTAA	2	8	692320	692327	50 %	50 %	0 %	0 %	545637076
13492	NC_022443	ATC	2	6	692328	692333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637076
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13499	NC_022443	ATT	2	6	692577	692582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637076
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