MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022443	TTTG	2	8	640076	640083	0 %	75 %	25 %	0 %	545637027
12502	NC_022443	TAT	2	6	640112	640117	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637027
12503	NC_022443	TTG	2	6	640222	640227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637027
12504	NC_022443	TAA	2	6	640265	640270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637027
12505	NC_022443	TTA	2	6	640314	640319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637027
12506	NC_022443	TTTTTC	2	12	640383	640394	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	545637027
12507	NC_022443	TAT	2	6	640400	640405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637027
12508	NC_022443	A	6	6	640471	640476	100 %	0 %	0 %	0 %	545637027
12509	NC_022443	T	6	6	640516	640521	0 %	100 %	0 %	0 %	545637027
12510	NC_022443	ATTA	2	8	640523	640530	50 %	50 %	0 %	0 %	545637027
12511	NC_022443	ATT	2	6	640538	640543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637027
12512	NC_022443	TA	3	6	640556	640561	50 %	50 %	0 %	0 %	545637027
12513	NC_022443	CAT	3	9	640897	640905	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637028
12514	NC_022443	TACT	2	8	640912	640919	25 %	50 %	0 %	25 %	545637028
12515	NC_022443	TCT	2	6	640944	640949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637028
12516	NC_022443	GAA	2	6	641120	641125	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637028
12517	NC_022443	GAT	2	6	641172	641177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637028
12518	NC_022443	TAA	2	6	641189	641194	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637028
12519	NC_022443	AGA	2	6	641242	641247	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637028
12520	NC_022443	AT	3	6	641274	641279	50 %	50 %	0 %	0 %	545637028
12521	NC_022443	GAT	2	6	641295	641300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637028
12522	NC_022443	A	7	7	641354	641360	100 %	0 %	0 %	0 %	545637028
12523	NC_022443	TTAA	2	8	641382	641389	50 %	50 %	0 %	0 %	545637028
12524	NC_022443	T	6	6	641444	641449	0 %	100 %	0 %	0 %	545637028
12525	NC_022443	A	7	7	641460	641466	100 %	0 %	0 %	0 %	545637028
12526	NC_022443	GAA	2	6	641499	641504	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545637028
12527	NC_022443	TTA	2	6	641522	641527	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637028
12528	NC_022443	ATA	2	6	641552	641557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637028
12529	NC_022443	GTT	2	6	641823	641828	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637029
12530	NC_022443	TTTA	2	8	641844	641851	25 %	75 %	0 %	0 %	545637029
12531	NC_022443	AAT	2	6	641860	641865	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637029
12532	NC_022443	T	7	7	641873	641879	0 %	100 %	0 %	0 %	545637029
12533	NC_022443	GTT	2	6	641882	641887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637029
12534	NC_022443	TCA	2	6	641917	641922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637029
12535	NC_022443	T	6	6	641934	641939	0 %	100 %	0 %	0 %	545637029
12536	NC_022443	TCT	2	6	641950	641955	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637029
12537	NC_022443	AAC	2	6	641979	641984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637029
12538	NC_022443	GTT	2	6	641990	641995	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637029
12539	NC_022443	TAA	2	6	642011	642016	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637029
12540	NC_022443	TTCT	2	8	642033	642040	0 %	75 %	0 %	25 %	545637029
12541	NC_022443	ATGT	2	8	642055	642062	25 %	50 %	25 %	0 %	545637029
12542	NC_022443	TTC	2	6	642075	642080	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637029
12543	NC_022443	TTAA	2	8	642103	642110	50 %	50 %	0 %	0 %	545637029
12544	NC_022443	AAC	2	6	642145	642150	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637029
12545	NC_022443	TTAAA	2	10	643125	643134	60 %	40 %	0 %	0 %	545637030
12546	NC_022443	ATA	2	6	643168	643173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637030
12547	NC_022443	AAT	2	6	643218	643223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637030
12548	NC_022443	GTT	2	6	643278	643283	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637030
12549	NC_022443	TGC	2	6	643286	643291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545637030
12550	NC_022443	ATAG	2	8	643358	643365	50 %	25 %	25 %	0 %	545637030
12551	NC_022443	ATG	2	6	643471	643476	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637030
12552	NC_022443	ATTG	2	8	643514	643521	25 %	50 %	25 %	0 %	545637030
12553	NC_022443	GAAA	2	8	643537	643544	75 %	0 %	25 %	0 %	545637030
12554	NC_022443	TAA	2	6	643598	643603	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637030
12555	NC_022443	ATT	2	6	643604	643609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637030
12556	NC_022443	AATTA	2	10	643670	643679	60 %	40 %	0 %	0 %	545637030
12557	NC_022443	AAT	2	6	643718	643723	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637030
12558	NC_022443	ATA	2	6	643731	643736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637030
12559	NC_022443	CAATAA	2	12	643787	643798	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	545637030
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12561	NC_022443	ATGAA	2	10	643942	643951	60 %	20 %	20 %	0 %	545637030
12562	NC_022443	GTT	3	9	644279	644287	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637031
12563	NC_022443	AAT	2	6	644293	644298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637031
12564	NC_022443	CTA	2	6	644355	644360	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637031
12565	NC_022443	GTT	2	6	644401	644406	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637031
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12567	NC_022443	TGTT	2	8	644630	644637	0 %	75 %	25 %	0 %	545637032
12568	NC_022443	ATA	2	6	644665	644670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637032
12569	NC_022443	ATG	2	6	644885	644890	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637033
12570	NC_022443	TATT	2	8	644938	644945	25 %	75 %	0 %	0 %	545637033
12571	NC_022443	ATT	2	6	644985	644990	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637033
12572	NC_022443	TC	3	6	645002	645007	0 %	50 %	0 %	50 %	545637033
12573	NC_022443	ATTAAA	2	12	645073	645084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637033
12574	NC_022443	ACT	2	6	645108	645113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637033
12575	NC_022443	AT	3	6	645117	645122	50 %	50 %	0 %	0 %	545637033
12576	NC_022443	TAT	2	6	645182	645187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637033
12577	NC_022443	AGCA	2	8	645194	645201	50 %	0 %	25 %	25 %	545637033
12578	NC_022443	ATT	2	6	645208	645213	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637033
12579	NC_022443	TATACC	2	12	645300	645311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637033
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12581	NC_022443	TTTA	2	8	645446	645453	25 %	75 %	0 %	0 %	545637034
12582	NC_022443	GAT	2	6	645480	645485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637034
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12588	NC_022443	TTTTAT	2	12	645769	645780	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	545637034
12589	NC_022443	TTAT	2	8	645787	645794	25 %	75 %	0 %	0 %	545637034
12590	NC_022443	GTATT	2	10	645809	645818	20 %	60 %	20 %	0 %	545637034
12591	NC_022443	T	6	6	645845	645850	0 %	100 %	0 %	0 %	545637034
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12594	NC_022443	TTA	2	6	645964	645969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637034
12595	NC_022443	TTA	2	6	646084	646089	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637034
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12598	NC_022443	AT	4	8	646255	646262	50 %	50 %	0 %	0 %	545637034
12599	NC_022443	TAA	2	6	646280	646285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545637034
12600	NC_022443	CAA	2	6	646349	646354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545637034
12601	NC_022443	GGT	2	6	646393	646398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545637034
12602	NC_022443	GCA	2	6	646456	646461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545637034
12603	NC_022443	CTAT	2	8	646615	646622	25 %	50 %	0 %	25 %	545637034
12604	NC_022443	TTG	2	6	646736	646741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637034
12605	NC_022443	A	8	8	646831	646838	100 %	0 %	0 %	0 %	545637034
12606	NC_022443	GTT	2	6	646854	646859	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545637034
12607	NC_022443	T	6	6	646903	646908	0 %	100 %	0 %	0 %	545637034
12608	NC_022443	AT	3	6	646916	646921	50 %	50 %	0 %	0 %	545637034
12609	NC_022443	ATC	2	6	646970	646975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637034
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12611	NC_022443	CTT	2	6	647029	647034	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545637034
12612	NC_022443	CAT	3	9	647040	647048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545637034
12613	NC_022443	A	6	6	647089	647094	100 %	0 %	0 %	0 %	545637034
12614	NC_022443	CAGA	2	8	647112	647119	50 %	0 %	25 %	25 %	545637034
12615	NC_022443	GAT	2	6	647142	647147	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545637034
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12617	NC_022443	ATT	2	6	647218	647223	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545637034
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