MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus SA40

Total Repeats: 52219

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_022443	TGA	2	6	510066	510071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636918
10003	NC_022443	ATG	2	6	510073	510078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636918
10004	NC_022443	CAT	2	6	510112	510117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636918
10005	NC_022443	TAT	2	6	510138	510143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636918
10006	NC_022443	TAA	2	6	510174	510179	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636918
10007	NC_022443	TGA	2	6	510189	510194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636918
10008	NC_022443	A	6	6	510247	510252	100 %	0 %	0 %	0 %	545636918
10009	NC_022443	AG	3	6	510270	510275	50 %	0 %	50 %	0 %	545636918
10010	NC_022443	TAA	2	6	510306	510311	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636918
10011	NC_022443	ATT	2	6	510349	510354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636918
10012	NC_022443	TGA	2	6	510363	510368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636918
10013	NC_022443	AAT	2	6	510370	510375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636918
10014	NC_022443	ATTAAA	2	12	510396	510407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636918
10015	NC_022443	ATG	2	6	510416	510421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636918
10016	NC_022443	TGA	2	6	510480	510485	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636918
10017	NC_022443	TAA	2	6	510522	510527	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636918
10018	NC_022443	TAT	2	6	510566	510571	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636918
10019	NC_022443	TAT	2	6	510577	510582	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636918
10020	NC_022443	GTT	2	6	510585	510590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636918
10021	NC_022443	TAG	2	6	510633	510638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636918
10022	NC_022443	TAA	3	9	510704	510712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636918
10023	NC_022443	AAT	2	6	510721	510726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636918
10024	NC_022443	ACA	2	6	510969	510974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636918
10025	NC_022443	ATT	2	6	510979	510984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636918
10026	NC_022443	CAA	3	9	511003	511011	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636918
10027	NC_022443	AAG	2	6	511077	511082	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636919
10028	NC_022443	GAA	2	6	511094	511099	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636919
10029	NC_022443	TTAA	2	8	511211	511218	50 %	50 %	0 %	0 %	545636919
10030	NC_022443	TTC	2	6	511318	511323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636919
10031	NC_022443	ATTA	2	8	511342	511349	50 %	50 %	0 %	0 %	545636919
10032	NC_022443	TAC	2	6	511372	511377	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636919
10033	NC_022443	ATT	2	6	511396	511401	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636919
10034	NC_022443	TTA	2	6	511439	511444	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636919
10035	NC_022443	AAACC	2	10	511448	511457	60 %	0 %	0 %	40 %	545636919
10036	NC_022443	A	7	7	511493	511499	100 %	0 %	0 %	0 %	545636919
10037	NC_022443	TGT	2	6	511513	511518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636919
10038	NC_022443	AT	3	6	511561	511566	50 %	50 %	0 %	0 %	545636919
10039	NC_022443	TAA	2	6	511892	511897	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636920
10040	NC_022443	TTA	2	6	511904	511909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636920
10041	NC_022443	CAA	2	6	512026	512031	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	545636920
10042	NC_022443	ATG	2	6	512063	512068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636920
10043	NC_022443	TCA	2	6	512077	512082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636920
10044	NC_022443	TA	3	6	512090	512095	50 %	50 %	0 %	0 %	545636920
10045	NC_022443	A	6	6	512114	512119	100 %	0 %	0 %	0 %	545636920
10046	NC_022443	TGC	2	6	512127	512132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636920
10047	NC_022443	AGA	3	9	512166	512174	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636920
10048	NC_022443	TTA	2	6	512233	512238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636920
10049	NC_022443	TTC	2	6	512245	512250	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636920
10050	NC_022443	ATG	2	6	512287	512292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636920
10051	NC_022443	ATA	3	9	512324	512332	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636920
10052	NC_022443	CGT	2	6	512335	512340	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636920
10053	NC_022443	GAA	2	6	512371	512376	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636920
10054	NC_022443	AATT	2	8	512384	512391	50 %	50 %	0 %	0 %	545636920
10055	NC_022443	TTG	2	6	512396	512401	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636920
10056	NC_022443	ATA	2	6	512414	512419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636920
10057	NC_022443	A	6	6	512419	512424	100 %	0 %	0 %	0 %	545636920
10058	NC_022443	TTG	2	6	512465	512470	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636920
10059	NC_022443	TTC	2	6	512533	512538	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636920
10060	NC_022443	TGTT	2	8	512567	512574	0 %	75 %	25 %	0 %	545636920
10061	NC_022443	ATC	2	6	512635	512640	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636920
10062	NC_022443	GTC	2	6	512666	512671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636920
10063	NC_022443	GTG	2	6	512675	512680	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636920
10064	NC_022443	TGG	2	6	512688	512693	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636920
10065	NC_022443	ATG	2	6	512699	512704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636920
10066	NC_022443	ATT	2	6	512727	512732	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636920
10067	NC_022443	ATGG	2	8	512740	512747	25 %	25 %	50 %	0 %	545636920
10068	NC_022443	GCT	2	6	512779	512784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636920
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10070	NC_022443	GTC	2	6	512855	512860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636920
10071	NC_022443	TTC	2	6	512885	512890	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636920
10072	NC_022443	TGA	2	6	512916	512921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636920
10073	NC_022443	TTA	2	6	512986	512991	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636920
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10075	NC_022443	AAGA	2	8	513109	513116	75 %	0 %	25 %	0 %	545636920
10076	NC_022443	TTG	2	6	513125	513130	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636920
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10078	NC_022443	TGA	2	6	513171	513176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636920
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10091	NC_022443	AGA	2	6	513630	513635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636920
10092	NC_022443	ATT	2	6	513663	513668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636920
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10098	NC_022443	A	6	6	513850	513855	100 %	0 %	0 %	0 %	545636920
10099	NC_022443	TGA	2	6	513870	513875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636920
10100	NC_022443	AATA	2	8	513943	513950	75 %	25 %	0 %	0 %	545636920
10101	NC_022443	AC	3	6	514197	514202	50 %	0 %	0 %	50 %	545636921
10102	NC_022443	AGCATT	2	12	514217	514228	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	545636921
10103	NC_022443	TGC	2	6	514250	514255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636921
10104	NC_022443	AAG	2	6	514276	514281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636921
10105	NC_022443	CTG	2	6	514315	514320	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636921
10106	NC_022443	GAA	2	6	514327	514332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636921
10107	NC_022443	ATG	2	6	514350	514355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636921
10108	NC_022443	ATT	2	6	514422	514427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636921
10109	NC_022443	GTGC	2	8	514452	514459	0 %	25 %	50 %	25 %	545636921
10110	NC_022443	TAT	2	6	514544	514549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636921
10111	NC_022443	GTT	2	6	514551	514556	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636921
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10113	NC_022443	AACA	2	8	514651	514658	75 %	0 %	0 %	25 %	545636921
10114	NC_022443	ATA	2	6	514696	514701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636921
10115	NC_022443	AGC	2	6	514709	514714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	545636921
10116	NC_022443	AGG	2	6	514715	514720	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	545636921
10117	NC_022443	AATT	2	8	514807	514814	50 %	50 %	0 %	0 %	545636921
10118	NC_022443	AGA	2	6	514979	514984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636921
10119	NC_022443	AAAT	2	8	515018	515025	75 %	25 %	0 %	0 %	545636921
10120	NC_022443	GAA	3	9	515037	515045	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	545636921
10121	NC_022443	TAATT	2	10	515073	515082	40 %	60 %	0 %	0 %	545636921
10122	NC_022443	ATA	2	6	515273	515278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636922
10123	NC_022443	ATT	2	6	515287	515292	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636922
10124	NC_022443	GTA	2	6	515323	515328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636922
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10128	NC_022443	TGC	2	6	515508	515513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636922
10129	NC_022443	CGT	2	6	515563	515568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636922
10130	NC_022443	TTA	2	6	515572	515577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	545636922
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10138	NC_022443	TTG	2	6	515855	515860	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	545636922
10139	NC_022443	GGT	2	6	515893	515898	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636922
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10144	NC_022443	TGC	2	6	516075	516080	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636922
10145	NC_022443	AGT	2	6	516117	516122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	545636922
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10147	NC_022443	TAAT	2	8	516184	516191	50 %	50 %	0 %	0 %	545636922
10148	NC_022443	ATTC	2	8	516445	516452	25 %	50 %	0 %	25 %	545636923
10149	NC_022443	TGG	2	6	516458	516463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636923
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10220	NC_022443	T	6	6	527600	527605	0 %	100 %	0 %	0 %	545636927
10221	NC_022443	GCT	2	6	527652	527657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	545636927
10222	NC_022443	TTTA	2	8	527719	527726	25 %	75 %	0 %	0 %	545636927
10223	NC_022443	ACC	2	6	527740	527745	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	545636927
10224	NC_022443	T	6	6	527824	527829	0 %	100 %	0 %	0 %	545636927
10225	NC_022443	AT	3	6	527852	527857	50 %	50 %	0 %	0 %	545636927
10226	NC_022443	AATCAT	2	12	527976	527987	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	545636927
10227	NC_022443	TAA	2	6	527994	527999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636927
10228	NC_022443	TTC	2	6	528004	528009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	545636927
10229	NC_022443	T	6	6	528044	528049	0 %	100 %	0 %	0 %	545636927
10230	NC_022443	TA	4	8	528091	528098	50 %	50 %	0 %	0 %	545636927
10231	NC_022443	T	7	7	528104	528110	0 %	100 %	0 %	0 %	545636927
10232	NC_022443	TAA	2	6	528117	528122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636927
10233	NC_022443	CTTCAA	2	12	528147	528158	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636927
10234	NC_022443	T	6	6	528178	528183	0 %	100 %	0 %	0 %	545636927
10235	NC_022443	TGG	2	6	528202	528207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	545636927
10236	NC_022443	ATA	2	6	528224	528229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636927
10237	NC_022443	TAAA	3	12	528330	528341	75 %	25 %	0 %	0 %	545636927
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10239	NC_022443	TCA	2	6	528503	528508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	545636927
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10243	NC_022443	TAA	2	6	528637	528642	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	545636927
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