MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 1699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_022358	GCAG	2	8	76567	76574	25 %	0 %	50 %	25 %	543966511
1502	NC_022358	GTG	2	6	76602	76607	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966511
1503	NC_022358	TCC	3	9	76609	76617	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543966511
1504	NC_022358	CGC	2	6	76736	76741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966511
1505	NC_022358	TGA	2	6	76856	76861	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966511
1506	NC_022358	GTA	2	6	76887	76892	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966511
1507	NC_022358	ATC	2	6	76987	76992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966511
1508	NC_022358	CAGG	2	8	77057	77064	25 %	0 %	50 %	25 %	543966511
1509	NC_022358	TGA	2	6	77111	77116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966511
1510	NC_022358	GCA	2	6	77246	77251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1511	NC_022358	CTT	2	6	77301	77306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966511
1512	NC_022358	GTC	2	6	77340	77345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1513	NC_022358	CCCT	2	8	77394	77401	0 %	25 %	0 %	75 %	543966511
1514	NC_022358	GTGGGC	2	12	77469	77480	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	543966511
1515	NC_022358	GATGGC	2	12	77493	77504	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	543966511
1516	NC_022358	GTG	2	6	77512	77517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966511
1517	NC_022358	CG	3	6	77525	77530	0 %	0 %	50 %	50 %	543966511
1518	NC_022358	TGG	2	6	77558	77563	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966511
1519	NC_022358	GCC	2	6	77572	77577	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966511
1520	NC_022358	CCA	2	6	77610	77615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966511
1521	NC_022358	CAGG	2	8	77618	77625	25 %	0 %	50 %	25 %	543966511
1522	NC_022358	T	6	6	77682	77687	0 %	100 %	0 %	0 %	543966511
1523	NC_022358	TTGC	2	8	77709	77716	0 %	50 %	25 %	25 %	543966511
1524	NC_022358	T	6	6	77739	77744	0 %	100 %	0 %	0 %	543966511
1525	NC_022358	GCA	2	6	77779	77784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1526	NC_022358	AGC	2	6	77830	77835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1527	NC_022358	CCT	2	6	77846	77851	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543966511
1528	NC_022358	GCA	2	6	77881	77886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1529	NC_022358	T	7	7	77887	77893	0 %	100 %	0 %	0 %	543966511
1530	NC_022358	GCA	2	6	77932	77937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1531	NC_022358	CGA	2	6	78011	78016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1532	NC_022358	CGA	2	6	78023	78028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1533	NC_022358	GAG	2	6	78054	78059	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543966511
1534	NC_022358	CCGT	2	8	78088	78095	0 %	25 %	25 %	50 %	543966511
1535	NC_022358	CAG	2	6	78108	78113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1536	NC_022358	CGC	2	6	78126	78131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966511
1537	NC_022358	TCT	2	6	78320	78325	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966511
1538	NC_022358	CGA	2	6	78354	78359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1539	NC_022358	CTG	2	6	78394	78399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1540	NC_022358	CTT	2	6	78564	78569	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966511
1541	NC_022358	CAG	2	6	78615	78620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1542	NC_022358	AGT	2	6	78708	78713	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966511
1543	NC_022358	GCCA	2	8	78864	78871	25 %	0 %	25 %	50 %	543966511
1544	NC_022358	CGC	2	6	78876	78881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966511
1545	NC_022358	CGA	2	6	78895	78900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966511
1546	NC_022358	TTG	2	6	78905	78910	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543966511
1547	NC_022358	CGG	2	6	79004	79009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966512
1548	NC_022358	CG	3	6	79052	79057	0 %	0 %	50 %	50 %	543966512
1549	NC_022358	CA	3	6	79187	79192	50 %	0 %	0 %	50 %	543966512
1550	NC_022358	CCG	2	6	79340	79345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966512
1551	NC_022358	CGC	2	6	79355	79360	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966512
1552	NC_022358	TGC	2	6	79365	79370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966512
1553	NC_022358	T	6	6	79415	79420	0 %	100 %	0 %	0 %	543966512
1554	NC_022358	TGGT	2	8	79454	79461	0 %	50 %	50 %	0 %	543966512
1555	NC_022358	GTTC	2	8	79468	79475	0 %	50 %	25 %	25 %	543966512
1556	NC_022358	CAC	2	6	79479	79484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966512
1557	NC_022358	CGG	2	6	79487	79492	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966512
1558	NC_022358	TGCC	2	8	79496	79503	0 %	25 %	25 %	50 %	543966512
1559	NC_022358	A	6	6	79513	79518	100 %	0 %	0 %	0 %	543966512
1560	NC_022358	CGC	2	6	79522	79527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966512
1561	NC_022358	CAGGAA	2	12	79547	79558	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	543966512
1562	NC_022358	GGCA	2	8	79578	79585	25 %	0 %	50 %	25 %	543966512
1563	NC_022358	GC	3	6	79642	79647	0 %	0 %	50 %	50 %	543966512
1564	NC_022358	G	6	6	79674	79679	0 %	0 %	100 %	0 %	543966512
1565	NC_022358	CCA	2	6	79724	79729	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966512
1566	NC_022358	GCAC	2	8	79760	79767	25 %	0 %	25 %	50 %	543966512
1567	NC_022358	GCC	2	6	79780	79785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966512
1568	NC_022358	GGC	2	6	79837	79842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966512
1569	NC_022358	GC	3	6	79919	79924	0 %	0 %	50 %	50 %	543966512
1570	NC_022358	GCG	2	6	80023	80028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966512
1571	NC_022358	TGA	2	6	80049	80054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966512
1572	NC_022358	GGCAA	2	10	80061	80070	40 %	0 %	40 %	20 %	543966512
1573	NC_022358	CTT	2	6	80072	80077	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966512
1574	NC_022358	CTAT	2	8	80358	80365	25 %	50 %	0 %	25 %	543966513
1575	NC_022358	T	6	6	80379	80384	0 %	100 %	0 %	0 %	543966513
1576	NC_022358	CGT	2	6	80472	80477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966513
1577	NC_022358	CGA	2	6	80481	80486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966513
1578	NC_022358	GC	3	6	80490	80495	0 %	0 %	50 %	50 %	543966513
1579	NC_022358	AAG	2	6	80506	80511	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543966513
1580	NC_022358	CTG	2	6	80566	80571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966513
1581	NC_022358	GCT	2	6	80640	80645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966513
1582	NC_022358	CCGC	2	8	80699	80706	0 %	0 %	25 %	75 %	543966513
1583	NC_022358	TCGC	2	8	80722	80729	0 %	25 %	25 %	50 %	543966513
1584	NC_022358	CTT	2	6	80847	80852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966513
1585	NC_022358	GCG	2	6	80891	80896	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966513
1586	NC_022358	TG	3	6	80925	80930	0 %	50 %	50 %	0 %	543966513
1587	NC_022358	AGTC	2	8	80946	80953	25 %	25 %	25 %	25 %	543966513
1588	NC_022358	CG	3	6	80964	80969	0 %	0 %	50 %	50 %	543966513
1589	NC_022358	CAT	2	6	80976	80981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966513
1590	NC_022358	GGTT	2	8	81065	81072	0 %	50 %	50 %	0 %	543966513
1591	NC_022358	CCA	2	6	81146	81151	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966513
1592	NC_022358	ATG	2	6	81172	81177	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966513
1593	NC_022358	CTG	2	6	81249	81254	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1594	NC_022358	TGG	2	6	81274	81279	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966514
1595	NC_022358	ACG	2	6	81304	81309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1596	NC_022358	TCA	2	6	81328	81333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966514
1597	NC_022358	CT	3	6	81355	81360	0 %	50 %	0 %	50 %	543966514
1598	NC_022358	TGC	2	6	81382	81387	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1599	NC_022358	ACG	3	9	81388	81396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1600	NC_022358	GC	3	6	81401	81406	0 %	0 %	50 %	50 %	543966514
1601	NC_022358	ATC	2	6	81414	81419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966514
1602	NC_022358	CTG	2	6	81477	81482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1603	NC_022358	AGA	2	6	81599	81604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543966514
1604	NC_022358	ACC	2	6	81606	81611	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966514
1605	NC_022358	CGC	2	6	81650	81655	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966514
1606	NC_022358	TGG	2	6	81668	81673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966514
1607	NC_022358	CTG	2	6	81690	81695	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1608	NC_022358	GC	3	6	81746	81751	0 %	0 %	50 %	50 %	543966514
1609	NC_022358	GCA	2	6	81754	81759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1610	NC_022358	TGCTGG	2	12	81766	81777	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	543966514
1611	NC_022358	ACGCCT	2	12	81892	81903	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	543966514
1612	NC_022358	GTT	2	6	81923	81928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543966514
1613	NC_022358	TGG	2	6	81946	81951	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543966514
1614	NC_022358	AGCG	2	8	81966	81973	25 %	0 %	50 %	25 %	543966514
1615	NC_022358	CAA	2	6	82049	82054	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543966514
1616	NC_022358	TG	3	6	82060	82065	0 %	50 %	50 %	0 %	543966514
1617	NC_022358	CCG	2	6	82075	82080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966514
1618	NC_022358	CG	3	6	82114	82119	0 %	0 %	50 %	50 %	543966514
1619	NC_022358	TGA	2	6	82120	82125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966514
1620	NC_022358	CTG	2	6	82182	82187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1621	NC_022358	GCT	2	6	82247	82252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1622	NC_022358	A	8	8	82269	82276	100 %	0 %	0 %	0 %	543966514
1623	NC_022358	TGCCC	2	10	82316	82325	0 %	20 %	20 %	60 %	543966514
1624	NC_022358	CTG	3	9	82356	82364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1625	NC_022358	CCA	3	9	82504	82512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966514
1626	NC_022358	CAG	2	6	82560	82565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1627	NC_022358	GCA	2	6	82573	82578	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966514
1628	NC_022358	CGC	2	6	82580	82585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966514
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1630	NC_022358	GAC	2	6	82679	82684	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966515
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