MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 plasmid pSCD DNA

Total Repeats: 1699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_022358	ACC	2	6	32132	32137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966462
502	NC_022358	GCG	2	6	32187	32192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966462
503	NC_022358	CAT	2	6	32223	32228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966462
504	NC_022358	GGC	2	6	32231	32236	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966462
505	NC_022358	CCA	2	6	32265	32270	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966462
506	NC_022358	AGT	2	6	32279	32284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966462
507	NC_022358	CACCGA	2	12	32289	32300	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	543966462
508	NC_022358	TCC	2	6	32438	32443	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543966462
509	NC_022358	GCC	3	9	32444	32452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966462
510	NC_022358	CACC	2	8	32484	32491	25 %	0 %	0 %	75 %	543966462
511	NC_022358	CGC	2	6	32546	32551	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966462
512	NC_022358	AGC	2	6	32564	32569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966462
513	NC_022358	CCA	2	6	32580	32585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966462
514	NC_022358	A	6	6	32604	32609	100 %	0 %	0 %	0 %	543966463
515	NC_022358	TCG	2	6	32616	32621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966463
516	NC_022358	CAT	2	6	32683	32688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966463
517	NC_022358	GAC	2	6	32722	32727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966463
518	NC_022358	CG	3	6	32747	32752	0 %	0 %	50 %	50 %	543966463
519	NC_022358	ACC	2	6	32781	32786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966463
520	NC_022358	CCA	2	6	32863	32868	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966463
521	NC_022358	GCCA	2	8	32888	32895	25 %	0 %	25 %	50 %	543966463
522	NC_022358	GCGG	2	8	32921	32928	0 %	0 %	75 %	25 %	543966463
523	NC_022358	TC	3	6	32972	32977	0 %	50 %	0 %	50 %	543966463
524	NC_022358	GC	3	6	32978	32983	0 %	0 %	50 %	50 %	543966463
525	NC_022358	CGG	2	6	33031	33036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966463
526	NC_022358	CGG	2	6	33055	33060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966463
527	NC_022358	GCC	2	6	33087	33092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966463
528	NC_022358	CGCC	2	8	33109	33116	0 %	0 %	25 %	75 %	543966463
529	NC_022358	GCC	2	6	33118	33123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966463
530	NC_022358	CGC	2	6	33156	33161	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966463
531	NC_022358	CGC	2	6	33164	33169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966463
532	NC_022358	A	6	6	33237	33242	100 %	0 %	0 %	0 %	543966463
533	NC_022358	CAG	2	6	33248	33253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966463
534	NC_022358	CACCAG	2	12	33257	33268	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	543966463
535	NC_022358	GTC	2	6	33294	33299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966463
536	NC_022358	CAG	2	6	33327	33332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966464
537	NC_022358	AGC	2	6	33340	33345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966464
538	NC_022358	ATC	2	6	33403	33408	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966464
539	NC_022358	GC	3	6	33459	33464	0 %	0 %	50 %	50 %	543966464
540	NC_022358	GGC	2	6	33534	33539	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966464
541	NC_022358	CCG	2	6	33547	33552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966464
542	NC_022358	TTA	2	6	33604	33609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	543966465
543	NC_022358	CGA	2	6	33686	33691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
544	NC_022358	GCA	2	6	33695	33700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
545	NC_022358	GAG	2	6	33702	33707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	543966465
546	NC_022358	CCA	2	6	33731	33736	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966465
547	NC_022358	GCA	2	6	33737	33742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
548	NC_022358	CAG	2	6	33744	33749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
549	NC_022358	CGC	2	6	33750	33755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966465
550	NC_022358	TCA	2	6	33767	33772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543966465
551	NC_022358	GCA	2	6	33836	33841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
552	NC_022358	GCA	2	6	34040	34045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
553	NC_022358	CG	3	6	34048	34053	0 %	0 %	50 %	50 %	543966465
554	NC_022358	CTG	2	6	34083	34088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966465
555	NC_022358	CGC	2	6	34150	34155	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966465
556	NC_022358	CAA	2	6	34179	34184	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543966465
557	NC_022358	CAG	2	6	34191	34196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
558	NC_022358	CAG	2	6	34248	34253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966465
559	NC_022358	CGA	2	6	34318	34323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966466
560	NC_022358	CAG	2	6	34337	34342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966466
561	NC_022358	GCC	2	6	34406	34411	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966466
562	NC_022358	CAC	2	6	34412	34417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966466
563	NC_022358	GCA	2	6	34420	34425	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966466
564	NC_022358	AAC	2	6	34428	34433	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543966466
565	NC_022358	AC	3	6	34453	34458	50 %	0 %	0 %	50 %	543966466
566	NC_022358	AGC	2	6	34467	34472	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966466
567	NC_022358	GCCTG	2	10	34504	34513	0 %	20 %	40 %	40 %	543966466
568	NC_022358	CACTC	2	10	34553	34562	20 %	20 %	0 %	60 %	543966467
569	NC_022358	CAG	2	6	34741	34746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966467
570	NC_022358	CCG	2	6	34748	34753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966467
571	NC_022358	CAG	2	6	34789	34794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966467
572	NC_022358	GC	3	6	34795	34800	0 %	0 %	50 %	50 %	543966467
573	NC_022358	TCGG	2	8	34909	34916	0 %	25 %	50 %	25 %	543966467
574	NC_022358	AGC	2	6	34979	34984	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966468
575	NC_022358	CGC	2	6	35009	35014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966468
576	NC_022358	TCAG	2	8	35032	35039	25 %	25 %	25 %	25 %	543966468
577	NC_022358	CGG	2	6	35069	35074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966468
578	NC_022358	GC	3	6	35127	35132	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
579	NC_022358	CCG	2	6	35145	35150	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966468
580	NC_022358	CTC	2	6	35166	35171	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543966468
581	NC_022358	ATG	2	6	35188	35193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966468
582	NC_022358	GC	3	6	35211	35216	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
583	NC_022358	CGT	2	6	35231	35236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966468
584	NC_022358	TGC	2	6	35285	35290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966468
585	NC_022358	CCG	2	6	35309	35314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966468
586	NC_022358	CG	3	6	35354	35359	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
587	NC_022358	GTC	2	6	35403	35408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966468
588	NC_022358	GGCA	2	8	35409	35416	25 %	0 %	50 %	25 %	543966468
589	NC_022358	CCT	2	6	35600	35605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543966468
590	NC_022358	GC	3	6	35717	35722	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
591	NC_022358	ATG	2	6	35833	35838	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	543966468
592	NC_022358	CAC	2	6	35861	35866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966468
593	NC_022358	GCC	2	6	35883	35888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966468
594	NC_022358	GCG	3	9	35969	35977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966468
595	NC_022358	CAGC	2	8	36005	36012	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
596	NC_022358	CCG	2	6	36019	36024	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966468
597	NC_022358	GC	3	6	36092	36097	0 %	0 %	50 %	50 %	543966468
598	NC_022358	GCAC	2	8	36154	36161	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
599	NC_022358	GCC	2	6	36204	36209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966468
600	NC_022358	GCG	2	6	36239	36244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966468
601	NC_022358	GCT	2	6	36248	36253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966468
602	NC_022358	CGA	2	6	36287	36292	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966468
603	NC_022358	CGAC	2	8	36295	36302	25 %	0 %	25 %	50 %	543966468
604	NC_022358	ATTC	2	8	36330	36337	25 %	50 %	0 %	25 %	543966468
605	NC_022358	CAC	2	6	36375	36380	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966469
606	NC_022358	TGC	2	6	36444	36449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966469
607	NC_022358	GCC	2	6	36465	36470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966469
608	NC_022358	CTG	2	6	36506	36511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966469
609	NC_022358	TCCA	2	8	36513	36520	25 %	25 %	0 %	50 %	543966469
610	NC_022358	TTC	2	6	36582	36587	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543966469
611	NC_022358	CGC	2	6	36595	36600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966469
612	NC_022358	CGC	2	6	36611	36616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966469
613	NC_022358	TGC	2	6	36629	36634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966469
614	NC_022358	GAA	2	6	36654	36659	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543966469
615	NC_022358	GCG	2	6	36666	36671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966469
616	NC_022358	CAC	2	6	36852	36857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543966469
617	NC_022358	GC	3	6	37023	37028	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
618	NC_022358	GTC	3	9	37080	37088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966469
619	NC_022358	CGC	2	6	37118	37123	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543966469
620	NC_022358	GGC	2	6	37127	37132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966469
621	NC_022358	A	8	8	37155	37162	100 %	0 %	0 %	0 %	543966469
622	NC_022358	GGC	2	6	37189	37194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543966469
623	NC_022358	CCATT	2	10	37203	37212	20 %	40 %	0 %	40 %	543966469
624	NC_022358	CTG	2	6	37227	37232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543966469
625	NC_022358	GC	4	8	37234	37241	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
626	NC_022358	AGC	2	6	37255	37260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543966469
627	NC_022358	GC	3	6	37259	37264	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
628	NC_022358	GC	3	6	37373	37378	0 %	0 %	50 %	50 %	543966469
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