MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Sulfuricella denitrificans skB26 DNA

Total Repeats: 58560

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_022357	CTC	2	6	3126796	3126801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	543964828
58502	NC_022357	A	6	6	3126805	3126810	100 %	0 %	0 %	0 %	543964828
58503	NC_022357	GCC	2	6	3126833	3126838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543964828
58504	NC_022357	CG	3	6	3126885	3126890	0 %	0 %	50 %	50 %	543964828
58505	NC_022357	AC	3	6	3126897	3126902	50 %	0 %	0 %	50 %	543964828
58506	NC_022357	CCAA	2	8	3126919	3126926	50 %	0 %	0 %	50 %	543964828
58507	NC_022357	CTCCCG	2	12	3126960	3126971	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	543964828
58508	NC_022357	CCCA	2	8	3127000	3127007	25 %	0 %	0 %	75 %	543964828
58509	NC_022357	AAG	2	6	3127033	3127038	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543964828
58510	NC_022357	AGC	2	6	3127061	3127066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543964828
58511	NC_022357	TAA	2	6	3127089	3127094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543964828
58512	NC_022357	GCA	2	6	3127124	3127129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543964828
58513	NC_022357	CGC	2	6	3127144	3127149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543964828
58514	NC_022357	CTG	2	6	3127156	3127161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543964828
58515	NC_022357	CAG	2	6	3127224	3127229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543964828
58516	NC_022357	CTCGAT	2	12	3127255	3127266	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	543964828
58517	NC_022357	TGG	2	6	3127568	3127573	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543964828
58518	NC_022357	GCC	2	6	3127619	3127624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543964828
58519	NC_022357	GATCA	2	10	3127642	3127651	40 %	20 %	20 %	20 %	543964828
58520	NC_022357	GC	3	6	3127697	3127702	0 %	0 %	50 %	50 %	543964828
58521	NC_022357	CGG	2	6	3127722	3127727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543964828
58522	NC_022357	CCG	2	6	3127781	3127786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543964828
58523	NC_022357	G	6	6	3127827	3127832	0 %	0 %	100 %	0 %	543964828
58524	NC_022357	GATC	2	8	3127857	3127864	25 %	25 %	25 %	25 %	543964828
58525	NC_022357	CAC	2	6	3127972	3127977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543964828
58526	NC_022357	ACC	2	6	3127984	3127989	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543964828
58527	NC_022357	TGC	2	6	3128011	3128016	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543964828
58528	NC_022357	GCG	2	6	3128046	3128051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543964829
58529	NC_022357	GTGA	2	8	3128072	3128079	25 %	25 %	50 %	0 %	543964829
58530	NC_022357	CAC	2	6	3128114	3128119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543964829
58531	NC_022357	CGG	2	6	3128137	3128142	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	543964829
58532	NC_022357	GAAA	2	8	3128143	3128150	75 %	0 %	25 %	0 %	543964829
58533	NC_022357	AAG	2	6	3128151	3128156	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	543964829
58534	NC_022357	CAT	2	6	3128183	3128188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543964829
58535	NC_022357	ATC	2	6	3128241	3128246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543964829
58536	NC_022357	CAC	2	6	3128384	3128389	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543964829
58537	NC_022357	CAT	2	6	3128441	3128446	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543964829
58538	NC_022357	TCG	2	6	3128469	3128474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543964829
58539	NC_022357	GCC	2	6	3128598	3128603	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	543964829
58540	NC_022357	C	6	6	3128602	3128607	0 %	0 %	0 %	100 %	543964829
58541	NC_022357	CAA	2	6	3128683	3128688	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543964829
58542	NC_022357	GGT	2	6	3128719	3128724	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	543964829
58543	NC_022357	TTC	2	6	3128763	3128768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	543964829
58544	NC_022357	TCAA	2	8	3128781	3128788	50 %	25 %	0 %	25 %	543964829
58545	NC_022357	ATC	2	6	3128822	3128827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543964829
58546	NC_022357	ATA	2	6	3128843	3128848	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543964829
58547	NC_022357	AAT	2	6	3128887	3128892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	543964829
58548	NC_022357	CAT	2	6	3128914	3128919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	543964829
58549	NC_022357	GTT	2	6	3129107	3129112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	543964829
58550	NC_022357	CACC	2	8	3129187	3129194	25 %	0 %	0 %	75 %	543964829
58551	NC_022357	AGTC	2	8	3129197	3129204	25 %	25 %	25 %	25 %	543964829
58552	NC_022357	CTGA	2	8	3129301	3129308	25 %	25 %	25 %	25 %	543964829
58553	NC_022357	GTC	2	6	3129329	3129334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543964829
58554	NC_022357	CAA	2	6	3129383	3129388	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	543964829
58555	NC_022357	CCA	2	6	3129408	3129413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543964829
58556	NC_022357	AAATC	2	10	3129433	3129442	60 %	20 %	0 %	20 %	543964829
58557	NC_022357	CCA	2	6	3129480	3129485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	543964829
58558	NC_022357	CAG	2	6	3129505	3129510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	543964829
58559	NC_022357	A	6	6	3129628	3129633	100 %	0 %	0 %	0 %	543964829
58560	NC_022357	TGC	2	6	3129664	3129669	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	543964829

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.