MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Streptococcus intermedius B196

Total Repeats: 36991

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022246	A	8	8	282	289	100 %	0 %	0 %	0 %	538379296
2	NC_022246	TTAA	2	8	321	328	50 %	50 %	0 %	0 %	538379296
3	NC_022246	CTT	2	6	354	359	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379296
4	NC_022246	ATT	2	6	377	382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379296
5	NC_022246	TCA	2	6	406	411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379296
6	NC_022246	AAT	2	6	435	440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379296
7	NC_022246	AAG	2	6	466	471	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
8	NC_022246	CAA	2	6	493	498	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379296
9	NC_022246	TCC	2	6	530	535	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538379296
10	NC_022246	CAA	2	6	640	645	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379296
11	NC_022246	ATT	2	6	656	661	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379296
12	NC_022246	TGG	2	6	668	673	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538379296
13	NC_022246	CTA	2	6	696	701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379296
14	NC_022246	AT	3	6	752	757	50 %	50 %	0 %	0 %	538379296
15	NC_022246	CTG	2	6	760	765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379296
16	NC_022246	ATTG	2	8	851	858	25 %	50 %	25 %	0 %	538379296
17	NC_022246	GAAA	2	8	880	887	75 %	0 %	25 %	0 %	538379296
18	NC_022246	AAG	2	6	898	903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
19	NC_022246	T	6	6	906	911	0 %	100 %	0 %	0 %	538379296
20	NC_022246	GAA	2	6	993	998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
21	NC_022246	CCA	2	6	1044	1049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538379296
22	NC_022246	AGA	2	6	1088	1093	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379296
23	NC_022246	TC	3	6	1188	1193	0 %	50 %	0 %	50 %	538379296
24	NC_022246	TGC	2	6	1235	1240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379296
25	NC_022246	CAAAT	2	10	1270	1279	60 %	20 %	0 %	20 %	538379296
26	NC_022246	ACA	2	6	1470	1475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379296
27	NC_022246	GAT	2	6	1518	1523	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379296
28	NC_022246	TAGAAA	2	12	1534	1545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538379296
29	NC_022246	A	6	6	1550	1555	100 %	0 %	0 %	0 %	538379296
30	NC_022246	GAT	2	6	1564	1569	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379296
31	NC_022246	TAA	2	6	1741	1746	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
32	NC_022246	ATTT	2	8	1749	1756	25 %	75 %	0 %	0 %	538379297
33	NC_022246	ACC	2	6	1772	1777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538379297
34	NC_022246	ATTG	2	8	1855	1862	25 %	50 %	25 %	0 %	538379297
35	NC_022246	TAA	2	6	1926	1931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
36	NC_022246	CTT	2	6	1932	1937	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379297
37	NC_022246	T	6	6	1964	1969	0 %	100 %	0 %	0 %	538379297
38	NC_022246	TGT	2	6	1975	1980	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538379297
39	NC_022246	ATA	2	6	1997	2002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
40	NC_022246	AGTA	2	8	2113	2120	50 %	25 %	25 %	0 %	538379297
41	NC_022246	ATT	2	6	2156	2161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379297
42	NC_022246	GTC	2	6	2196	2201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379297
43	NC_022246	AGA	2	6	2286	2291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379297
44	NC_022246	GAA	2	6	2300	2305	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379297
45	NC_022246	TGT	2	6	2323	2328	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538379297
46	NC_022246	GAT	2	6	2372	2377	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379297
47	NC_022246	AAT	2	6	2405	2410	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379297
48	NC_022246	TCT	2	6	2560	2565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379297
49	NC_022246	TAGT	2	8	2616	2623	25 %	50 %	25 %	0 %	538379297
50	NC_022246	GAA	2	6	2660	2665	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379297
51	NC_022246	CAG	2	6	2778	2783	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379297
52	NC_022246	TGA	2	6	2809	2814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379297
53	NC_022246	ATG	2	6	2864	2869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379298
54	NC_022246	TTG	2	6	2879	2884	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538379298
55	NC_022246	A	6	6	2926	2931	100 %	0 %	0 %	0 %	538379298
56	NC_022246	ATT	2	6	2947	2952	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379298
57	NC_022246	A	6	6	3036	3041	100 %	0 %	0 %	0 %	538379298
58	NC_022246	ATC	2	6	3101	3106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379299
59	NC_022246	T	6	6	3164	3169	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
60	NC_022246	TCT	2	6	3351	3356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538379299
61	NC_022246	T	6	6	3356	3361	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
62	NC_022246	TAG	2	6	3397	3402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379299
63	NC_022246	TTTGT	2	10	3403	3412	0 %	80 %	20 %	0 %	538379299
64	NC_022246	ACA	2	6	3414	3419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379299
65	NC_022246	TAA	2	6	3429	3434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379299
66	NC_022246	T	7	7	3489	3495	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
67	NC_022246	TGA	2	6	3520	3525	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379299
68	NC_022246	AAT	2	6	3552	3557	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379299
69	NC_022246	T	7	7	3571	3577	0 %	100 %	0 %	0 %	538379299
70	NC_022246	CAG	2	6	3736	3741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379300
71	NC_022246	TTTA	2	8	3776	3783	25 %	75 %	0 %	0 %	538379300
72	NC_022246	TCA	2	6	3895	3900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379300
73	NC_022246	CAA	2	6	4157	4162	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379300
74	NC_022246	A	6	6	4180	4185	100 %	0 %	0 %	0 %	538379300
75	NC_022246	AAAGAT	2	12	4200	4211	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	538379300
76	NC_022246	A	6	6	4237	4242	100 %	0 %	0 %	0 %	538379300
77	NC_022246	TGA	2	6	4289	4294	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379300
78	NC_022246	AGA	2	6	4295	4300	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
79	NC_022246	A	6	6	4303	4308	100 %	0 %	0 %	0 %	538379300
80	NC_022246	ATT	2	6	4319	4324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379300
81	NC_022246	ATA	2	6	4390	4395	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379300
82	NC_022246	GAA	2	6	4473	4478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
83	NC_022246	GAT	2	6	4491	4496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379300
84	NC_022246	TGAA	2	8	4531	4538	50 %	25 %	25 %	0 %	538379300
85	NC_022246	AGC	2	6	4562	4567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379300
86	NC_022246	TTA	2	6	4575	4580	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379300
87	NC_022246	ACTT	2	8	4590	4597	25 %	50 %	0 %	25 %	538379300
88	NC_022246	AAG	2	6	4612	4617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
89	NC_022246	CAC	2	6	4651	4656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538379300
90	NC_022246	AGC	2	6	4658	4663	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538379300
91	NC_022246	ATG	2	6	4720	4725	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379300
92	NC_022246	GAA	2	6	4779	4784	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379300
93	NC_022246	AT	3	6	4793	4798	50 %	50 %	0 %	0 %	538379300
94	NC_022246	A	6	6	4908	4913	100 %	0 %	0 %	0 %	538379301
95	NC_022246	GAT	2	6	4921	4926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379301
96	NC_022246	GA	3	6	4947	4952	50 %	0 %	50 %	0 %	538379301
97	NC_022246	GAA	2	6	5075	5080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379301
98	NC_022246	CAA	2	6	5100	5105	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379301
99	NC_022246	ATGA	2	8	5111	5118	50 %	25 %	25 %	0 %	538379301
100	NC_022246	TTAT	2	8	5181	5188	25 %	75 %	0 %	0 %	538379301
101	NC_022246	GAT	2	6	5189	5194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379301
102	NC_022246	CTG	2	6	5238	5243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379301
103	NC_022246	ATT	2	6	5267	5272	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379301
104	NC_022246	ACA	2	6	5336	5341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379301
105	NC_022246	ATT	2	6	5342	5347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379301
106	NC_022246	AGA	2	6	5374	5379	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379301
107	NC_022246	AC	3	6	5397	5402	50 %	0 %	0 %	50 %	538379301
108	NC_022246	ATT	2	6	5430	5435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379301
109	NC_022246	AACA	2	8	5454	5461	75 %	0 %	0 %	25 %	538379301
110	NC_022246	CAA	2	6	5465	5470	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538379301
111	NC_022246	ATT	2	6	5493	5498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
112	NC_022246	ATT	2	6	5595	5600	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
113	NC_022246	AG	3	6	5618	5623	50 %	0 %	50 %	0 %	538379302
114	NC_022246	TGATT	2	10	5681	5690	20 %	60 %	20 %	0 %	538379302
115	NC_022246	GAA	2	6	5703	5708	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379302
116	NC_022246	GAT	2	6	5730	5735	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379302
117	NC_022246	T	7	7	5757	5763	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
118	NC_022246	T	6	6	5776	5781	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
119	NC_022246	T	6	6	5801	5806	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
120	NC_022246	GCT	2	6	5847	5852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538379302
121	NC_022246	T	7	7	5860	5866	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
122	NC_022246	TTAATT	2	12	5878	5889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
123	NC_022246	TGATT	2	10	5933	5942	20 %	60 %	20 %	0 %	538379302
124	NC_022246	T	6	6	6066	6071	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
125	NC_022246	TGA	2	6	6074	6079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379302
126	NC_022246	GT	4	8	6139	6146	0 %	50 %	50 %	0 %	538379302
127	NC_022246	TAC	2	6	6173	6178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379302
128	NC_022246	A	7	7	6201	6207	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
129	NC_022246	A	6	6	6223	6228	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
130	NC_022246	GAA	2	6	6258	6263	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538379302
131	NC_022246	A	7	7	6278	6284	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
132	NC_022246	TAT	2	6	6313	6318	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538379302
133	NC_022246	T	6	6	6322	6327	0 %	100 %	0 %	0 %	538379302
134	NC_022246	AAAT	2	8	6332	6339	75 %	25 %	0 %	0 %	538379302
135	NC_022246	TGA	2	6	6383	6388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538379302
136	NC_022246	A	6	6	6394	6399	100 %	0 %	0 %	0 %	538379302
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399	NC_022246	TAA	2	6	18543	18548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538379310
400	NC_022246	ATC	2	6	18560	18565	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538379310
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403	NC_022246	GGAT	2	8	18990	18997	25 %	25 %	50 %	0 %	538379311
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