MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19502	NC_022241	GCG	2	6	1055372	1055377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361564
19503	NC_022241	GGC	2	6	1055398	1055403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361564
19504	NC_022241	ATG	2	6	1055408	1055413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361564
19505	NC_022241	GCA	2	6	1055421	1055426	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19506	NC_022241	AGC	2	6	1055429	1055434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19507	NC_022241	CGA	2	6	1055441	1055446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19508	NC_022241	A	8	8	1055461	1055468	100 %	0 %	0 %	0 %	538361564
19509	NC_022241	GAAGC	2	10	1055578	1055587	40 %	0 %	40 %	20 %	538361564
19510	NC_022241	T	6	6	1055623	1055628	0 %	100 %	0 %	0 %	538361564
19511	NC_022241	TG	3	6	1055761	1055766	0 %	50 %	50 %	0 %	538361565
19512	NC_022241	TGC	2	6	1055777	1055782	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361565
19513	NC_022241	TGG	2	6	1055815	1055820	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361565
19514	NC_022241	AGC	2	6	1055849	1055854	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361565
19515	NC_022241	GCG	2	6	1055866	1055871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361565
19516	NC_022241	TGC	2	6	1055944	1055949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361565
19517	NC_022241	TAT	2	6	1056070	1056075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361565
19518	NC_022241	A	8	8	1056152	1056159	100 %	0 %	0 %	0 %	538361565
19519	NC_022241	TCC	2	6	1056178	1056183	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361565
19520	NC_022241	ATCGGC	2	12	1056261	1056272	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538361565
19521	NC_022241	GT	3	6	1056326	1056331	0 %	50 %	50 %	0 %	538361565
19522	NC_022241	CGC	2	6	1056336	1056341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361565
19523	NC_022241	GAT	2	6	1056351	1056356	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361565
19524	NC_022241	CTG	2	6	1056434	1056439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361565
19525	NC_022241	CCTG	2	8	1056449	1056456	0 %	25 %	25 %	50 %	538361565
19526	NC_022241	TTA	2	6	1056534	1056539	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361565
19527	NC_022241	CTGG	2	8	1056627	1056634	0 %	25 %	50 %	25 %	538361565
19528	NC_022241	GGC	2	6	1056671	1056676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361565
19529	NC_022241	TAT	2	6	1056695	1056700	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361565
19530	NC_022241	TTG	2	6	1056737	1056742	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361565
19531	NC_022241	AGT	2	6	1056797	1056802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361565
19532	NC_022241	TGAT	2	8	1056826	1056833	25 %	50 %	25 %	0 %	538361565
19533	NC_022241	CT	3	6	1056852	1056857	0 %	50 %	0 %	50 %	538361565
19534	NC_022241	GTC	2	6	1056924	1056929	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361565
19535	NC_022241	GAG	2	6	1057002	1057007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361565
19536	NC_022241	A	6	6	1057027	1057032	100 %	0 %	0 %	0 %	538361566
19537	NC_022241	CCA	2	6	1057134	1057139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361566
19538	NC_022241	CAC	2	6	1057161	1057166	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361566
19539	NC_022241	ACG	2	6	1057195	1057200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361566
19540	NC_022241	CTGA	2	8	1057246	1057253	25 %	25 %	25 %	25 %	538361566
19541	NC_022241	TGC	2	6	1057307	1057312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361566
19542	NC_022241	GGT	2	6	1057332	1057337	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361566
19543	NC_022241	GCT	2	6	1057380	1057385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361566
19544	NC_022241	CTT	2	6	1057447	1057452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361566
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19546	NC_022241	GCC	2	6	1057470	1057475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361566
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19549	NC_022241	GAC	2	6	1057737	1057742	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361566
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19551	NC_022241	GGC	3	9	1057750	1057758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361566
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19553	NC_022241	ACG	2	6	1057829	1057834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361566
19554	NC_022241	A	6	6	1057838	1057843	100 %	0 %	0 %	0 %	538361566
19555	NC_022241	GC	3	6	1057922	1057927	0 %	0 %	50 %	50 %	538361566
19556	NC_022241	CTTT	2	8	1057973	1057980	0 %	75 %	0 %	25 %	538361566
19557	NC_022241	ACG	2	6	1058006	1058011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361566
19558	NC_022241	GC	3	6	1058087	1058092	0 %	0 %	50 %	50 %	538361566
19559	NC_022241	CGCTT	2	10	1058124	1058133	0 %	40 %	20 %	40 %	538361566
19560	NC_022241	GCC	2	6	1058193	1058198	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361566
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19564	NC_022241	CAA	2	6	1058301	1058306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361566
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19566	NC_022241	ATA	2	6	1058393	1058398	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361566
19567	NC_022241	CAGT	2	8	1058415	1058422	25 %	25 %	25 %	25 %	538361566
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19573	NC_022241	A	6	6	1058658	1058663	100 %	0 %	0 %	0 %	538361566
19574	NC_022241	CTGG	2	8	1058687	1058694	0 %	25 %	50 %	25 %	538361567
19575	NC_022241	CGG	2	6	1058708	1058713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361567
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19580	NC_022241	GTC	2	6	1058961	1058966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361567
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19582	NC_022241	TTA	2	6	1059066	1059071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361567
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19584	NC_022241	ATG	2	6	1059136	1059141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361567
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19587	NC_022241	GTT	2	6	1059296	1059301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361568
19588	NC_022241	GAC	2	6	1059800	1059805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361569
19589	NC_022241	CCA	2	6	1059809	1059814	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361569
19590	NC_022241	AATG	2	8	1059869	1059876	50 %	25 %	25 %	0 %	538361569
19591	NC_022241	CGCCCA	2	12	1059929	1059940	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	538361569
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19598	NC_022241	CAT	2	6	1060149	1060154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361569
19599	NC_022241	CAC	2	6	1060202	1060207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361569
19600	NC_022241	AAG	2	6	1060218	1060223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361569
19601	NC_022241	TCT	2	6	1060225	1060230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361569
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19603	NC_022241	CGT	2	6	1060492	1060497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361570
19604	NC_022241	CTTCT	2	10	1060517	1060526	0 %	60 %	0 %	40 %	538361570
19605	NC_022241	GCA	2	6	1060537	1060542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361570
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19607	NC_022241	GCT	2	6	1060615	1060620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361570
19608	NC_022241	GAA	2	6	1060631	1060636	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361570
19609	NC_022241	T	6	6	1060645	1060650	0 %	100 %	0 %	0 %	538361570
19610	NC_022241	GCCC	2	8	1060657	1060664	0 %	0 %	25 %	75 %	538361570
19611	NC_022241	GC	3	6	1060672	1060677	0 %	0 %	50 %	50 %	538361570
19612	NC_022241	GC	3	6	1060738	1060743	0 %	0 %	50 %	50 %	538361570
19613	NC_022241	TGA	2	6	1060744	1060749	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361570
19614	NC_022241	TTG	2	6	1060835	1060840	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361570
19615	NC_022241	ATC	2	6	1060878	1060883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361570
19616	NC_022241	GC	3	6	1060992	1060997	0 %	0 %	50 %	50 %	538361570
19617	NC_022241	CCT	2	6	1061194	1061199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361570
19618	NC_022241	AAT	2	6	1061621	1061626	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361570
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19620	NC_022241	TGA	2	6	1061646	1061651	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361570
19621	NC_022241	GAC	2	6	1061735	1061740	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361570
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19623	NC_022241	GCGCG	2	10	1061776	1061785	0 %	0 %	60 %	40 %	538361570
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19732	NC_022241	CGC	2	6	1068560	1068565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361577
19733	NC_022241	GGA	2	6	1068704	1068709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361577
19734	NC_022241	GCA	3	9	1068776	1068784	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361577
19735	NC_022241	T	6	6	1068828	1068833	0 %	100 %	0 %	0 %	538361577
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19737	NC_022241	GGT	2	6	1068878	1068883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361577
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19742	NC_022241	GC	3	6	1068969	1068974	0 %	0 %	50 %	50 %	538361577
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19761	NC_022241	A	6	6	1069869	1069874	100 %	0 %	0 %	0 %	538361577
19762	NC_022241	GAAG	2	8	1069937	1069944	50 %	0 %	50 %	0 %	538361577
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19832	NC_022241	A	6	6	1073399	1073404	100 %	0 %	0 %	0 %	538361582
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19836	NC_022241	GCCA	2	8	1073489	1073496	25 %	0 %	25 %	50 %	538361582
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19840	NC_022241	CGA	2	6	1073640	1073645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361582
19841	NC_022241	GGC	2	6	1073715	1073720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361582
19842	NC_022241	TCT	2	6	1074015	1074020	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361583
19843	NC_022241	ATG	2	6	1074038	1074043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361583
19844	NC_022241	CGG	2	6	1074102	1074107	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361583
19845	NC_022241	CGC	2	6	1074168	1074173	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361583
19846	NC_022241	AGCTG	2	10	1074174	1074183	20 %	20 %	40 %	20 %	538361583
19847	NC_022241	TGG	2	6	1074257	1074262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361583
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19966	NC_022241	CTT	3	9	1081386	1081394	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361592
19967	NC_022241	TTG	2	6	1081398	1081403	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361592
19968	NC_022241	AAG	2	6	1081498	1081503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361592
19969	NC_022241	AAT	2	6	1081600	1081605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361592
19970	NC_022241	GA	3	6	1081652	1081657	50 %	0 %	50 %	0 %	538361592
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19972	NC_022241	CCT	2	6	1081701	1081706	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361592
19973	NC_022241	AAC	2	6	1082291	1082296	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361594
19974	NC_022241	TA	3	6	1082302	1082307	50 %	50 %	0 %	0 %	538361594
19975	NC_022241	CCT	2	6	1082308	1082313	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361594
19976	NC_022241	TC	3	6	1082332	1082337	0 %	50 %	0 %	50 %	538361594
19977	NC_022241	CT	3	6	1082371	1082376	0 %	50 %	0 %	50 %	538361594
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19980	NC_022241	TAA	2	6	1082527	1082532	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361595
19981	NC_022241	TAT	2	6	1082533	1082538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361595
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19984	NC_022241	GTAG	2	8	1082771	1082778	25 %	25 %	50 %	0 %	538361595
19985	NC_022241	ATC	2	6	1082807	1082812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361595
19986	NC_022241	ATA	2	6	1082840	1082845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361595
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19991	NC_022241	GGT	2	6	1083173	1083178	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361595
19992	NC_022241	TGA	2	6	1083207	1083212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361595
19993	NC_022241	CGC	2	6	1083223	1083228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361595
19994	NC_022241	GCCA	2	8	1083372	1083379	25 %	0 %	25 %	50 %	538361595
19995	NC_022241	TGA	2	6	1083381	1083386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361595
19996	NC_022241	AAT	2	6	1083467	1083472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361595
19997	NC_022241	CAGC	2	8	1083577	1083584	25 %	0 %	25 %	50 %	538361595
19998	NC_022241	CGCC	2	8	1083628	1083635	0 %	0 %	25 %	75 %	538361595
19999	NC_022241	TTG	2	6	1083732	1083737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361595
20000	NC_022241	TTG	2	6	1083758	1083763	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361595

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