MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
19001	NC_022241	GCC	2	6	1027945	1027950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361538
19002	NC_022241	CAT	2	6	1028007	1028012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361539
19003	NC_022241	GAA	2	6	1028019	1028024	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361539
19004	NC_022241	CTTA	2	8	1028032	1028039	25 %	50 %	0 %	25 %	538361539
19005	NC_022241	ATAC	2	8	1028100	1028107	50 %	25 %	0 %	25 %	538361539
19006	NC_022241	GGA	2	6	1028139	1028144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361539
19007	NC_022241	CTGG	2	8	1028202	1028209	0 %	25 %	50 %	25 %	538361539
19008	NC_022241	ATA	2	6	1028264	1028269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361539
19009	NC_022241	CGC	2	6	1028271	1028276	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361539
19010	NC_022241	GAA	3	9	1028359	1028367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361539
19011	NC_022241	TGG	2	6	1028572	1028577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361540
19012	NC_022241	A	7	7	1028650	1028656	100 %	0 %	0 %	0 %	538361540
19013	NC_022241	TGA	2	6	1028657	1028662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361540
19014	NC_022241	ATG	2	6	1028667	1028672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361540
19015	NC_022241	TGA	2	6	1028763	1028768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361541
19016	NC_022241	GGT	2	6	1028778	1028783	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361541
19017	NC_022241	AGCC	2	8	1028862	1028869	25 %	0 %	25 %	50 %	538361541
19018	NC_022241	AGG	2	6	1028870	1028875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361541
19019	NC_022241	GGC	2	6	1029024	1029029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19020	NC_022241	GGC	2	6	1029033	1029038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19021	NC_022241	GGT	2	6	1029112	1029117	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361541
19022	NC_022241	GCT	2	6	1029211	1029216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19023	NC_022241	A	6	6	1029262	1029267	100 %	0 %	0 %	0 %	538361541
19024	NC_022241	CGG	2	6	1029299	1029304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19025	NC_022241	TGC	2	6	1029329	1029334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19026	NC_022241	GGC	2	6	1029342	1029347	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19027	NC_022241	GCC	2	6	1029367	1029372	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361541
19028	NC_022241	CAA	2	6	1029401	1029406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361541
19029	NC_022241	GC	3	6	1029442	1029447	0 %	0 %	50 %	50 %	538361541
19030	NC_022241	CCGGG	2	10	1029528	1029537	0 %	0 %	60 %	40 %	538361541
19031	NC_022241	ATG	2	6	1029568	1029573	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361541
19032	NC_022241	CGG	2	6	1029576	1029581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19033	NC_022241	GCG	2	6	1029601	1029606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19034	NC_022241	GAAA	2	8	1029642	1029649	75 %	0 %	25 %	0 %	538361541
19035	NC_022241	GAG	2	6	1029652	1029657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361541
19036	NC_022241	TCGC	2	8	1029730	1029737	0 %	25 %	25 %	50 %	538361541
19037	NC_022241	GCA	2	6	1029753	1029758	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19038	NC_022241	GGT	2	6	1029783	1029788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361541
19039	NC_022241	GCAG	2	8	1029810	1029817	25 %	0 %	50 %	25 %	538361541
19040	NC_022241	CAGT	2	8	1029865	1029872	25 %	25 %	25 %	25 %	538361541
19041	NC_022241	GAT	2	6	1029907	1029912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361541
19042	NC_022241	GAA	2	6	1030001	1030006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361541
19043	NC_022241	TGC	2	6	1030014	1030019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19044	NC_022241	CGGG	2	8	1030060	1030067	0 %	0 %	75 %	25 %	538361541
19045	NC_022241	GCG	2	6	1030123	1030128	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19046	NC_022241	CGGG	2	8	1030158	1030165	0 %	0 %	75 %	25 %	538361541
19047	NC_022241	A	6	6	1030181	1030186	100 %	0 %	0 %	0 %	538361541
19048	NC_022241	A	6	6	1030202	1030207	100 %	0 %	0 %	0 %	538361541
19049	NC_022241	CG	4	8	1030209	1030216	0 %	0 %	50 %	50 %	538361541
19050	NC_022241	TCC	2	6	1030243	1030248	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361541
19051	NC_022241	CAG	2	6	1030264	1030269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19052	NC_022241	GAAC	2	8	1030275	1030282	50 %	0 %	25 %	25 %	538361541
19053	NC_022241	CTG	2	6	1030309	1030314	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19054	NC_022241	GCAG	2	8	1030326	1030333	25 %	0 %	50 %	25 %	538361541
19055	NC_022241	AGA	2	6	1030346	1030351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361541
19056	NC_022241	CGC	2	6	1030377	1030382	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361541
19057	NC_022241	GC	3	6	1030432	1030437	0 %	0 %	50 %	50 %	538361541
19058	NC_022241	AACG	2	8	1030495	1030502	50 %	0 %	25 %	25 %	538361541
19059	NC_022241	A	6	6	1030507	1030512	100 %	0 %	0 %	0 %	538361541
19060	NC_022241	ACG	2	6	1030553	1030558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19061	NC_022241	GCC	2	6	1030618	1030623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361541
19062	NC_022241	A	6	6	1030643	1030648	100 %	0 %	0 %	0 %	538361541
19063	NC_022241	AGC	2	6	1030664	1030669	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19064	NC_022241	CAG	2	6	1030681	1030686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19065	NC_022241	A	6	6	1030708	1030713	100 %	0 %	0 %	0 %	538361541
19066	NC_022241	CGG	2	6	1030718	1030723	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19067	NC_022241	GAA	2	6	1030827	1030832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361541
19068	NC_022241	CCAG	2	8	1030850	1030857	25 %	0 %	25 %	50 %	538361541
19069	NC_022241	GAA	2	6	1030867	1030872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361541
19070	NC_022241	GCA	3	9	1030884	1030892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19071	NC_022241	AAC	2	6	1030979	1030984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361541
19072	NC_022241	AGC	2	6	1030988	1030993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19073	NC_022241	TGC	2	6	1031118	1031123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19074	NC_022241	G	6	6	1031178	1031183	0 %	0 %	100 %	0 %	538361541
19075	NC_022241	GGCA	2	8	1031190	1031197	25 %	0 %	50 %	25 %	538361541
19076	NC_022241	CAG	2	6	1031387	1031392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19077	NC_022241	GCG	2	6	1031425	1031430	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19078	NC_022241	CGG	2	6	1031454	1031459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19079	NC_022241	CAG	2	6	1031471	1031476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19080	NC_022241	TCAG	2	8	1031480	1031487	25 %	25 %	25 %	25 %	538361541
19081	NC_022241	GGC	2	6	1031538	1031543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19082	NC_022241	TCG	2	6	1031583	1031588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19083	NC_022241	GCA	2	6	1031617	1031622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19084	NC_022241	CGC	2	6	1031693	1031698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361541
19085	NC_022241	GGC	3	9	1031733	1031741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19086	NC_022241	GCA	3	9	1031751	1031759	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361541
19087	NC_022241	CGG	2	6	1031769	1031774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361541
19088	NC_022241	GAT	2	6	1031795	1031800	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361541
19089	NC_022241	GGT	2	6	1031861	1031866	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361542
19090	NC_022241	AGC	2	6	1031887	1031892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361542
19091	NC_022241	AAT	2	6	1031910	1031915	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361542
19092	NC_022241	A	6	6	1031922	1031927	100 %	0 %	0 %	0 %	538361542
19093	NC_022241	GGA	2	6	1031954	1031959	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361542
19094	NC_022241	ACA	2	6	1032090	1032095	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361542
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19096	NC_022241	GGCT	2	8	1032344	1032351	0 %	25 %	50 %	25 %	538361543
19097	NC_022241	TACA	2	8	1032430	1032437	50 %	25 %	0 %	25 %	538361543
19098	NC_022241	TAA	2	6	1032451	1032456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361543
19099	NC_022241	AGGT	2	8	1032468	1032475	25 %	25 %	50 %	0 %	538361543
19100	NC_022241	CTT	2	6	1032494	1032499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361543
19101	NC_022241	TGA	2	6	1032543	1032548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361543
19102	NC_022241	GCA	2	6	1032554	1032559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361543
19103	NC_022241	CCA	2	6	1032878	1032883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361544
19104	NC_022241	ATC	2	6	1032929	1032934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361544
19105	NC_022241	GTG	2	6	1032972	1032977	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361544
19106	NC_022241	T	6	6	1033077	1033082	0 %	100 %	0 %	0 %	538361544
19107	NC_022241	TCC	2	6	1033096	1033101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361544
19108	NC_022241	AT	3	6	1033460	1033465	50 %	50 %	0 %	0 %	538361545
19109	NC_022241	ACC	2	6	1033497	1033502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361545
19110	NC_022241	TCT	2	6	1033573	1033578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361545
19111	NC_022241	CGAAC	2	10	1033583	1033592	40 %	0 %	20 %	40 %	538361545
19112	NC_022241	TACAGG	2	12	1033645	1033656	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	538361545
19113	NC_022241	CCCG	2	8	1033687	1033694	0 %	0 %	25 %	75 %	538361545
19114	NC_022241	GTT	2	6	1033701	1033706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361545
19115	NC_022241	TGGTC	2	10	1033718	1033727	0 %	40 %	40 %	20 %	538361545
19116	NC_022241	GGA	2	6	1033739	1033744	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361545
19117	NC_022241	TCG	2	6	1033756	1033761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361545
19118	NC_022241	AGG	2	6	1033849	1033854	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361545
19119	NC_022241	GC	3	6	1033860	1033865	0 %	0 %	50 %	50 %	538361545
19120	NC_022241	TCA	2	6	1033896	1033901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361545
19121	NC_022241	ATT	2	6	1033911	1033916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361545
19122	NC_022241	ACG	2	6	1034014	1034019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361545
19123	NC_022241	GCCC	2	8	1034020	1034027	0 %	0 %	25 %	75 %	538361545
19124	NC_022241	CAA	2	6	1034144	1034149	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361545
19125	NC_022241	TCTG	2	8	1034276	1034283	0 %	50 %	25 %	25 %	538361546
19126	NC_022241	GGA	2	6	1034315	1034320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361546
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19131	NC_022241	GGC	2	6	1034636	1034641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361546
19132	NC_022241	GGA	2	6	1034663	1034668	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361546
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19144	NC_022241	TGG	2	6	1035312	1035317	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361547
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19221	NC_022241	CG	3	6	1038981	1038986	0 %	0 %	50 %	50 %	538361549
19222	NC_022241	GGC	2	6	1038997	1039002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361549
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19226	NC_022241	TGG	2	6	1039454	1039459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361550
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19229	NC_022241	GAC	2	6	1039552	1039557	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361550
19230	NC_022241	GCG	2	6	1039575	1039580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361550
19231	NC_022241	TGG	2	6	1039592	1039597	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361550
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19233	NC_022241	CCG	2	6	1039640	1039645	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361550
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19345	NC_022241	TGC	2	6	1046560	1046565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361559
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19347	NC_022241	CG	3	6	1046637	1046642	0 %	0 %	50 %	50 %	538361559
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19349	NC_022241	TGA	2	6	1047227	1047232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361559
19350	NC_022241	CCG	2	6	1047281	1047286	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361559
19351	NC_022241	CAGT	2	8	1047293	1047300	25 %	25 %	25 %	25 %	538361559
19352	NC_022241	GAT	2	6	1047327	1047332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361559
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19357	NC_022241	GC	3	6	1047645	1047650	0 %	0 %	50 %	50 %	538361559
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19461	NC_022241	A	6	6	1053755	1053760	100 %	0 %	0 %	0 %	538361563
19462	NC_022241	CTG	2	6	1053801	1053806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361563
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19465	NC_022241	AACG	2	8	1053922	1053929	50 %	0 %	25 %	25 %	538361564
19466	NC_022241	GTCT	2	8	1053931	1053938	0 %	50 %	25 %	25 %	538361564
19467	NC_022241	TGA	2	6	1053971	1053976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361564
19468	NC_022241	TAT	2	6	1054014	1054019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361564
19469	NC_022241	TCG	2	6	1054037	1054042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19470	NC_022241	CG	3	6	1054041	1054046	0 %	0 %	50 %	50 %	538361564
19471	NC_022241	GAA	2	6	1054111	1054116	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361564
19472	NC_022241	TGA	2	6	1054160	1054165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361564
19473	NC_022241	GC	3	6	1054198	1054203	0 %	0 %	50 %	50 %	538361564
19474	NC_022241	ATC	2	6	1054220	1054225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361564
19475	NC_022241	CGC	2	6	1054290	1054295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361564
19476	NC_022241	GTC	2	6	1054299	1054304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19477	NC_022241	CGG	2	6	1054311	1054316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361564
19478	NC_022241	CG	3	6	1054361	1054366	0 %	0 %	50 %	50 %	538361564
19479	NC_022241	CTGG	2	8	1054416	1054423	0 %	25 %	50 %	25 %	538361564
19480	NC_022241	ATT	2	6	1054453	1054458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361564
19481	NC_022241	TC	3	6	1054463	1054468	0 %	50 %	0 %	50 %	538361564
19482	NC_022241	TCGT	2	8	1054473	1054480	0 %	50 %	25 %	25 %	538361564
19483	NC_022241	TCGATC	2	12	1054508	1054519	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538361564
19484	NC_022241	CTG	2	6	1054561	1054566	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19485	NC_022241	AGA	2	6	1054572	1054577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361564
19486	NC_022241	AGA	2	6	1054590	1054595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361564
19487	NC_022241	GAA	2	6	1054633	1054638	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361564
19488	NC_022241	GC	3	6	1054663	1054668	0 %	0 %	50 %	50 %	538361564
19489	NC_022241	CGT	2	6	1054711	1054716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19490	NC_022241	AGCG	2	8	1054723	1054730	25 %	0 %	50 %	25 %	538361564
19491	NC_022241	AAC	2	6	1054832	1054837	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361564
19492	NC_022241	GCG	2	6	1054868	1054873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361564
19493	NC_022241	A	6	6	1055027	1055032	100 %	0 %	0 %	0 %	538361564
19494	NC_022241	GCAA	2	8	1055057	1055064	50 %	0 %	25 %	25 %	538361564
19495	NC_022241	CG	3	6	1055152	1055157	0 %	0 %	50 %	50 %	538361564
19496	NC_022241	CGG	2	6	1055163	1055168	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361564
19497	NC_022241	CTG	3	9	1055182	1055190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361564
19498	NC_022241	AACG	2	8	1055238	1055245	50 %	0 %	25 %	25 %	538361564
19499	NC_022241	AGA	2	6	1055274	1055279	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361564
19500	NC_022241	TAC	2	6	1055306	1055311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361564

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