MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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18502	NC_022241	ATT	2	6	994919	994924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361497
18503	NC_022241	AATT	2	8	994939	994946	50 %	50 %	0 %	0 %	538361497
18504	NC_022241	GC	4	8	996521	996528	0 %	0 %	50 %	50 %	538361498
18505	NC_022241	GGC	2	6	996951	996956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361498
18506	NC_022241	GCTG	2	8	996968	996975	0 %	25 %	50 %	25 %	538361498
18507	NC_022241	TTG	2	6	996996	997001	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361498
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18509	NC_022241	CGA	2	6	997082	997087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361498
18510	NC_022241	CTG	2	6	997098	997103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361498
18511	NC_022241	CTG	2	6	997122	997127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361498
18512	NC_022241	GA	3	6	997136	997141	50 %	0 %	50 %	0 %	538361498
18513	NC_022241	CGG	3	9	997144	997152	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361498
18514	NC_022241	TGA	2	6	997276	997281	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361498
18515	NC_022241	CAG	2	6	997302	997307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361498
18516	NC_022241	A	6	6	997440	997445	100 %	0 %	0 %	0 %	538361498
18517	NC_022241	TCC	2	6	997474	997479	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361498
18518	NC_022241	TGC	2	6	997492	997497	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361498
18519	NC_022241	CAG	2	6	997539	997544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361498
18520	NC_022241	GTC	2	6	997545	997550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361498
18521	NC_022241	CAT	2	6	997583	997588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361498
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18524	NC_022241	GCT	2	6	997881	997886	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361499
18525	NC_022241	TCT	2	6	997957	997962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361499
18526	NC_022241	GCAT	2	8	998063	998070	25 %	25 %	25 %	25 %	538361499
18527	NC_022241	TTA	2	6	998139	998144	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361499
18528	NC_022241	ACTTC	2	10	998251	998260	20 %	40 %	0 %	40 %	538361499
18529	NC_022241	AT	3	6	998333	998338	50 %	50 %	0 %	0 %	538361499
18530	NC_022241	CTG	2	6	998510	998515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361499
18531	NC_022241	TGA	2	6	998539	998544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361499
18532	NC_022241	CAT	2	6	998666	998671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361499
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18536	NC_022241	AGT	2	6	998780	998785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361499
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18540	NC_022241	CCG	2	6	999123	999128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361499
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18543	NC_022241	T	8	8	999236	999243	0 %	100 %	0 %	0 %	538361500
18544	NC_022241	TGT	2	6	999276	999281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361500
18545	NC_022241	TCG	2	6	999840	999845	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361501
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18548	NC_022241	TCG	2	6	1000106	1000111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361501
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18550	NC_022241	CTGGA	2	10	1000195	1000204	20 %	20 %	40 %	20 %	538361501
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18555	NC_022241	GT	3	6	1000654	1000659	0 %	50 %	50 %	0 %	538361501
18556	NC_022241	CTG	2	6	1000855	1000860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361501
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18586	NC_022241	TCGCCT	2	12	1002336	1002347	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	538361503
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18589	NC_022241	GGT	2	6	1002512	1002517	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361503
18590	NC_022241	GGCT	2	8	1002519	1002526	0 %	25 %	50 %	25 %	538361503
18591	NC_022241	GTT	2	6	1002601	1002606	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361503
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18600	NC_022241	GAT	2	6	1003124	1003129	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361503
18601	NC_022241	CTC	2	6	1003175	1003180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361503
18602	NC_022241	TG	3	6	1003216	1003221	0 %	50 %	50 %	0 %	538361503
18603	NC_022241	CGT	2	6	1003261	1003266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361503
18604	NC_022241	T	7	7	1003291	1003297	0 %	100 %	0 %	0 %	538361503
18605	NC_022241	TTC	2	6	1003314	1003319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361503
18606	NC_022241	CAG	2	6	1003343	1003348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361503
18607	NC_022241	A	6	6	1003385	1003390	100 %	0 %	0 %	0 %	538361503
18608	NC_022241	GTG	2	6	1003398	1003403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361503
18609	NC_022241	T	6	6	1003484	1003489	0 %	100 %	0 %	0 %	538361503
18610	NC_022241	GCG	2	6	1003509	1003514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361503
18611	NC_022241	T	6	6	1003571	1003576	0 %	100 %	0 %	0 %	538361503
18612	NC_022241	CAG	2	6	1003765	1003770	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361503
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18615	NC_022241	GCA	2	6	1003929	1003934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361503
18616	NC_022241	A	6	6	1003992	1003997	100 %	0 %	0 %	0 %	538361503
18617	NC_022241	TAA	2	6	1004046	1004051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361503
18618	NC_022241	TTC	2	6	1004060	1004065	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361503
18619	NC_022241	T	6	6	1004229	1004234	0 %	100 %	0 %	0 %	538361504
18620	NC_022241	ACAG	2	8	1004276	1004283	50 %	0 %	25 %	25 %	538361504
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18622	NC_022241	T	6	6	1004373	1004378	0 %	100 %	0 %	0 %	538361504
18623	NC_022241	ATTT	2	8	1004400	1004407	25 %	75 %	0 %	0 %	538361504
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18625	NC_022241	ATTA	2	8	1004623	1004630	50 %	50 %	0 %	0 %	538361505
18626	NC_022241	TGGC	2	8	1004653	1004660	0 %	25 %	50 %	25 %	538361505
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18628	NC_022241	AT	4	8	1004713	1004720	50 %	50 %	0 %	0 %	538361505
18629	NC_022241	TTAA	2	8	1004776	1004783	50 %	50 %	0 %	0 %	538361505
18630	NC_022241	GAGTA	2	10	1004805	1004814	40 %	20 %	40 %	0 %	538361505
18631	NC_022241	CTG	2	6	1004856	1004861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361505
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18641	NC_022241	T	6	6	1006318	1006323	0 %	100 %	0 %	0 %	538361508
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18728	NC_022241	GAAGA	2	10	1012153	1012162	60 %	0 %	40 %	0 %	538361515
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18730	NC_022241	AT	3	6	1012257	1012262	50 %	50 %	0 %	0 %	538361515
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18734	NC_022241	CTG	2	6	1012354	1012359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361515
18735	NC_022241	CGA	2	6	1012431	1012436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361515
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18852	NC_022241	A	6	6	1020177	1020182	100 %	0 %	0 %	0 %	538361528
18853	NC_022241	TTA	2	6	1020239	1020244	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361528
18854	NC_022241	T	7	7	1020275	1020281	0 %	100 %	0 %	0 %	538361528
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18862	NC_022241	GAG	2	6	1020625	1020630	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361528
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18968	NC_022241	TGC	2	6	1025983	1025988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361535
18969	NC_022241	GGC	2	6	1025990	1025995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361535
18970	NC_022241	TGG	2	6	1026079	1026084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361535
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18994	NC_022241	A	6	6	1027489	1027494	100 %	0 %	0 %	0 %	538361538
18995	NC_022241	GCG	2	6	1027514	1027519	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361538
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18997	NC_022241	CAA	2	6	1027721	1027726	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361538
18998	NC_022241	TGC	2	6	1027793	1027798	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361538
18999	NC_022241	CGA	2	6	1027817	1027822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361538
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