MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022241	TAT	2	6	888466	888471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361404
16502	NC_022241	ACGCG	2	10	888490	888499	20 %	0 %	40 %	40 %	538361404
16503	NC_022241	GCG	2	6	888720	888725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361405
16504	NC_022241	CGT	2	6	888785	888790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361405
16505	NC_022241	CGT	2	6	888808	888813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361405
16506	NC_022241	TGAA	2	8	888914	888921	50 %	25 %	25 %	0 %	538361405
16507	NC_022241	CG	5	10	888937	888946	0 %	0 %	50 %	50 %	538361405
16508	NC_022241	GC	3	6	888973	888978	0 %	0 %	50 %	50 %	538361405
16509	NC_022241	GATC	2	8	888984	888991	25 %	25 %	25 %	25 %	538361405
16510	NC_022241	GAT	2	6	889021	889026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361405
16511	NC_022241	TTA	2	6	889037	889042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361405
16512	NC_022241	GCT	2	6	889126	889131	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361405
16513	NC_022241	GTC	2	6	889225	889230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361405
16514	NC_022241	GGC	2	6	889245	889250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361405
16515	NC_022241	CGA	2	6	889319	889324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361405
16516	NC_022241	CGCGC	2	10	889402	889411	0 %	0 %	40 %	60 %	538361405
16517	NC_022241	CGG	2	6	889545	889550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361405
16518	NC_022241	CGA	2	6	889697	889702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361406
16519	NC_022241	TTC	2	6	889716	889721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361406
16520	NC_022241	TGG	2	6	889798	889803	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361406
16521	NC_022241	ACA	2	6	889804	889809	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361406
16522	NC_022241	T	6	6	889816	889821	0 %	100 %	0 %	0 %	538361406
16523	NC_022241	TGC	2	6	889852	889857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361406
16524	NC_022241	GGC	2	6	889862	889867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361406
16525	NC_022241	TC	3	6	889871	889876	0 %	50 %	0 %	50 %	538361406
16526	NC_022241	GAT	2	6	889926	889931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361406
16527	NC_022241	TG	3	6	889949	889954	0 %	50 %	50 %	0 %	538361406
16528	NC_022241	GAA	2	6	890079	890084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361406
16529	NC_022241	A	6	6	890092	890097	100 %	0 %	0 %	0 %	538361406
16530	NC_022241	TTC	2	6	890116	890121	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361406
16531	NC_022241	GAT	2	6	890470	890475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361407
16532	NC_022241	A	6	6	890489	890494	100 %	0 %	0 %	0 %	538361407
16533	NC_022241	GTC	2	6	890528	890533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361407
16534	NC_022241	CGCT	2	8	890544	890551	0 %	25 %	25 %	50 %	538361407
16535	NC_022241	A	6	6	890559	890564	100 %	0 %	0 %	0 %	538361407
16536	NC_022241	ATG	2	6	890649	890654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361407
16537	NC_022241	GGCA	2	8	890692	890699	25 %	0 %	50 %	25 %	538361407
16538	NC_022241	TGG	2	6	890715	890720	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361407
16539	NC_022241	CTG	2	6	890819	890824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361407
16540	NC_022241	ACA	2	6	890850	890855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361407
16541	NC_022241	ACG	2	6	890882	890887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361407
16542	NC_022241	GAT	2	6	890930	890935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361407
16543	NC_022241	GCG	2	6	890997	891002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361407
16544	NC_022241	GAA	2	6	891023	891028	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361407
16545	NC_022241	AGC	2	6	891071	891076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361407
16546	NC_022241	CCGGC	2	10	891093	891102	0 %	0 %	40 %	60 %	538361407
16547	NC_022241	TGT	2	6	891111	891116	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361407
16548	NC_022241	CTC	2	6	891148	891153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361407
16549	NC_022241	TG	3	6	891188	891193	0 %	50 %	50 %	0 %	538361407
16550	NC_022241	GGGC	2	8	891204	891211	0 %	0 %	75 %	25 %	538361407
16551	NC_022241	T	6	6	891299	891304	0 %	100 %	0 %	0 %	538361407
16552	NC_022241	CTG	2	6	891368	891373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361407
16553	NC_022241	CAG	2	6	891452	891457	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361407
16554	NC_022241	CCG	2	6	891482	891487	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361407
16555	NC_022241	GTT	2	6	891505	891510	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361407
16556	NC_022241	GTAA	2	8	891579	891586	50 %	25 %	25 %	0 %	538361407
16557	NC_022241	CCG	2	6	891881	891886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361408
16558	NC_022241	AGC	2	6	891887	891892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361408
16559	NC_022241	CCG	2	6	891932	891937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361408
16560	NC_022241	ATG	2	6	891956	891961	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361408
16561	NC_022241	GTT	2	6	891976	891981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361408
16562	NC_022241	CGG	2	6	892126	892131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361408
16563	NC_022241	TCAGCG	2	12	892132	892143	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538361408
16564	NC_022241	GC	3	6	892154	892159	0 %	0 %	50 %	50 %	538361408
16565	NC_022241	GCT	2	6	892180	892185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361408
16566	NC_022241	TTG	2	6	892187	892192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361408
16567	NC_022241	GC	3	6	892206	892211	0 %	0 %	50 %	50 %	538361408
16568	NC_022241	A	6	6	892217	892222	100 %	0 %	0 %	0 %	538361408
16569	NC_022241	GTG	2	6	892247	892252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361408
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16571	NC_022241	CAT	2	6	892336	892341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361408
16572	NC_022241	GGA	2	6	892375	892380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361408
16573	NC_022241	CGA	2	6	892395	892400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361408
16574	NC_022241	ATCGG	2	10	892421	892430	20 %	20 %	40 %	20 %	538361408
16575	NC_022241	TGGTT	2	10	892492	892501	0 %	60 %	40 %	0 %	538361408
16576	NC_022241	A	6	6	892572	892577	100 %	0 %	0 %	0 %	538361408
16577	NC_022241	CGC	2	6	892593	892598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361408
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16580	NC_022241	GCG	2	6	892862	892867	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361409
16581	NC_022241	CTG	2	6	892940	892945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361409
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16583	NC_022241	CTG	2	6	893021	893026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361409
16584	NC_022241	T	6	6	893071	893076	0 %	100 %	0 %	0 %	538361409
16585	NC_022241	CGA	2	6	893086	893091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361409
16586	NC_022241	CTG	2	6	893149	893154	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361409
16587	NC_022241	CTG	2	6	893156	893161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361409
16588	NC_022241	CTG	3	9	893219	893227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361409
16589	NC_022241	T	6	6	893254	893259	0 %	100 %	0 %	0 %	538361409
16590	NC_022241	AAC	2	6	893294	893299	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361409
16591	NC_022241	ATT	2	6	893448	893453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361409
16592	NC_022241	TGG	2	6	893457	893462	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361409
16593	NC_022241	T	6	6	893501	893506	0 %	100 %	0 %	0 %	538361409
16594	NC_022241	CAT	2	6	893509	893514	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361409
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16598	NC_022241	TGC	3	9	893700	893708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361409
16599	NC_022241	A	6	6	893745	893750	100 %	0 %	0 %	0 %	538361409
16600	NC_022241	TCGC	2	8	893787	893794	0 %	25 %	25 %	50 %	538361410
16601	NC_022241	ATTCTG	2	12	893803	893814	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	538361410
16602	NC_022241	ATG	2	6	893947	893952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361410
16603	NC_022241	GCC	2	6	893980	893985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361410
16604	NC_022241	GCG	2	6	893989	893994	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361410
16605	NC_022241	GGT	2	6	894003	894008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361410
16606	NC_022241	CGC	2	6	894021	894026	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361410
16607	NC_022241	GGT	2	6	894027	894032	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361410
16608	NC_022241	CGC	2	6	894089	894094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361410
16609	NC_022241	GCT	4	12	894126	894137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361410
16610	NC_022241	GTG	2	6	894235	894240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361410
16611	NC_022241	GGC	2	6	894282	894287	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361410
16612	NC_022241	GGCGC	2	10	894298	894307	0 %	0 %	60 %	40 %	538361410
16613	NC_022241	GAT	2	6	894339	894344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361410
16614	NC_022241	GCTG	2	8	894365	894372	0 %	25 %	50 %	25 %	538361410
16615	NC_022241	CCA	2	6	894434	894439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361410
16616	NC_022241	TCG	2	6	894530	894535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361410
16617	NC_022241	ATT	2	6	894764	894769	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361411
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16619	NC_022241	TTG	2	6	894900	894905	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361411
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16740	NC_022241	GTA	2	6	901454	901459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361418
16741	NC_022241	CAA	2	6	901478	901483	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361418
16742	NC_022241	AAC	2	6	901497	901502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361418
16743	NC_022241	CAC	2	6	901526	901531	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361418
16744	NC_022241	GT	3	6	901620	901625	0 %	50 %	50 %	0 %	538361418
16745	NC_022241	CG	3	6	901687	901692	0 %	0 %	50 %	50 %	538361419
16746	NC_022241	ACTG	2	8	901716	901723	25 %	25 %	25 %	25 %	538361419
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16765	NC_022241	CTG	2	6	902770	902775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361420
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16851	NC_022241	A	6	6	907356	907361	100 %	0 %	0 %	0 %	538361426
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16979	NC_022241	TTG	2	6	912663	912668	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361430
16980	NC_022241	TGG	2	6	912721	912726	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361430
16981	NC_022241	AGT	2	6	912739	912744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361430
16982	NC_022241	CGC	2	6	912751	912756	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361430
16983	NC_022241	GC	4	8	912755	912762	0 %	0 %	50 %	50 %	538361430
16984	NC_022241	GCC	2	6	912770	912775	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361430
16985	NC_022241	CTG	2	6	912908	912913	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16986	NC_022241	CGA	2	6	912973	912978	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16987	NC_022241	GTC	2	6	912998	913003	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16988	NC_022241	GGTCG	2	10	913016	913025	0 %	20 %	60 %	20 %	538361430
16989	NC_022241	TCA	2	6	913042	913047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361430
16990	NC_022241	CTG	2	6	913079	913084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16991	NC_022241	GCA	2	6	913156	913161	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16992	NC_022241	CAG	2	6	913208	913213	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16993	NC_022241	TGG	2	6	913309	913314	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361430
16994	NC_022241	TCA	2	6	913336	913341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361430
16995	NC_022241	CAG	2	6	913379	913384	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16996	NC_022241	CAG	2	6	913396	913401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361430
16997	NC_022241	CCAG	2	8	913411	913418	25 %	0 %	25 %	50 %	538361430
16998	NC_022241	TGTCGT	2	12	913447	913458	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	538361430
16999	NC_022241	CGC	3	9	913490	913498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361430
17000	NC_022241	CAG	2	6	913520	913525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361430

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