MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022241	CGT	2	6	860872	860877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361376
16002	NC_022241	GCC	2	6	860990	860995	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361376
16003	NC_022241	GGT	2	6	861100	861105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361376
16004	NC_022241	TGG	2	6	861246	861251	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361376
16005	NC_022241	CGA	2	6	861273	861278	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361376
16006	NC_022241	CG	3	6	861284	861289	0 %	0 %	50 %	50 %	538361376
16007	NC_022241	CTG	2	6	861290	861295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361376
16008	NC_022241	GGTT	2	8	861297	861304	0 %	50 %	50 %	0 %	538361376
16009	NC_022241	CTCG	2	8	861418	861425	0 %	25 %	25 %	50 %	538361376
16010	NC_022241	CGG	2	6	861577	861582	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361376
16011	NC_022241	CG	3	6	861608	861613	0 %	0 %	50 %	50 %	538361376
16012	NC_022241	ATT	2	6	861635	861640	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361376
16013	NC_022241	TTG	2	6	861807	861812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361376
16014	NC_022241	GC	3	6	861826	861831	0 %	0 %	50 %	50 %	538361376
16015	NC_022241	GCA	2	6	861847	861852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361376
16016	NC_022241	GGC	2	6	861874	861879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361376
16017	NC_022241	GAT	2	6	861932	861937	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361376
16018	NC_022241	CGCC	2	8	861972	861979	0 %	0 %	25 %	75 %	538361376
16019	NC_022241	TTA	2	6	862097	862102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361377
16020	NC_022241	TGGC	2	8	862111	862118	0 %	25 %	50 %	25 %	538361377
16021	NC_022241	GGC	2	6	862161	862166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361377
16022	NC_022241	TGG	3	9	862175	862183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361377
16023	NC_022241	CAC	2	6	862200	862205	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361377
16024	NC_022241	A	6	6	862299	862304	100 %	0 %	0 %	0 %	538361377
16025	NC_022241	TGA	2	6	862332	862337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361377
16026	NC_022241	GCG	3	9	862402	862410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361377
16027	NC_022241	ACC	2	6	862448	862453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361377
16028	NC_022241	CGGCGA	2	12	862568	862579	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538361377
16029	NC_022241	CGC	2	6	862586	862591	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361377
16030	NC_022241	CGGT	2	8	862631	862638	0 %	25 %	50 %	25 %	538361377
16031	NC_022241	GCA	2	6	862710	862715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361377
16032	NC_022241	ACA	2	6	862760	862765	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361377
16033	NC_022241	CG	3	6	862771	862776	0 %	0 %	50 %	50 %	538361377
16034	NC_022241	TGC	2	6	862781	862786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361377
16035	NC_022241	ACGCC	2	10	863003	863012	20 %	0 %	20 %	60 %	538361377
16036	NC_022241	GTG	2	6	863023	863028	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361377
16037	NC_022241	CCG	2	6	863029	863034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361377
16038	NC_022241	GC	3	6	863086	863091	0 %	0 %	50 %	50 %	538361377
16039	NC_022241	GC	3	6	863247	863252	0 %	0 %	50 %	50 %	538361377
16040	NC_022241	AG	3	6	863280	863285	50 %	0 %	50 %	0 %	538361377
16041	NC_022241	CGC	2	6	863348	863353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361377
16042	NC_022241	GCC	2	6	863373	863378	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361377
16043	NC_022241	CAA	2	6	863406	863411	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361377
16044	NC_022241	GGC	3	9	863430	863438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361377
16045	NC_022241	TGG	3	9	863525	863533	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361377
16046	NC_022241	AAGT	2	8	863620	863627	50 %	25 %	25 %	0 %	538361377
16047	NC_022241	CTG	2	6	863710	863715	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361378
16048	NC_022241	TTG	2	6	863770	863775	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361378
16049	NC_022241	CCGGA	2	10	863801	863810	20 %	0 %	40 %	40 %	538361378
16050	NC_022241	CAG	2	6	863842	863847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361378
16051	NC_022241	CGC	2	6	863935	863940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361378
16052	NC_022241	GAG	2	6	863950	863955	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361378
16053	NC_022241	CGC	3	9	864039	864047	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361378
16054	NC_022241	TTTC	2	8	864104	864111	0 %	75 %	0 %	25 %	538361378
16055	NC_022241	TGT	2	6	864131	864136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361378
16056	NC_022241	T	6	6	864146	864151	0 %	100 %	0 %	0 %	538361378
16057	NC_022241	ACCG	2	8	864171	864178	25 %	0 %	25 %	50 %	538361378
16058	NC_022241	CCCT	2	8	864211	864218	0 %	25 %	0 %	75 %	538361378
16059	NC_022241	GCG	2	6	864229	864234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361378
16060	NC_022241	CTC	2	6	864264	864269	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361378
16061	NC_022241	CG	3	6	864306	864311	0 %	0 %	50 %	50 %	538361378
16062	NC_022241	GTGG	2	8	864333	864340	0 %	25 %	75 %	0 %	538361378
16063	NC_022241	GCAAT	2	10	864359	864368	40 %	20 %	20 %	20 %	538361378
16064	NC_022241	GTC	2	6	864376	864381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361378
16065	NC_022241	ATG	2	6	864385	864390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361378
16066	NC_022241	GATC	2	8	864419	864426	25 %	25 %	25 %	25 %	538361378
16067	NC_022241	TGC	2	6	864518	864523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361378
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16069	NC_022241	GCC	2	6	864574	864579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361378
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16072	NC_022241	GGT	2	6	864656	864661	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361379
16073	NC_022241	ACGC	2	8	864677	864684	25 %	0 %	25 %	50 %	538361379
16074	NC_022241	CGT	2	6	864702	864707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361379
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16080	NC_022241	TAT	2	6	865016	865021	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361379
16081	NC_022241	CAG	2	6	865182	865187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361379
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16083	NC_022241	ATT	2	6	865308	865313	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361379
16084	NC_022241	GC	3	6	865345	865350	0 %	0 %	50 %	50 %	538361379
16085	NC_022241	GCC	2	6	865352	865357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361379
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16087	NC_022241	CGC	2	6	865411	865416	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361379
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16089	NC_022241	AGCC	2	8	865520	865527	25 %	0 %	25 %	50 %	538361379
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16091	NC_022241	CTT	2	6	865757	865762	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361380
16092	NC_022241	CGA	2	6	865775	865780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361380
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16097	NC_022241	AGC	2	6	865978	865983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361380
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16099	NC_022241	GC	3	6	866076	866081	0 %	0 %	50 %	50 %	538361380
16100	NC_022241	TCA	2	6	866111	866116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361380
16101	NC_022241	CAT	2	6	866198	866203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361380
16102	NC_022241	GGGTAG	2	12	866212	866223	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	538361380
16103	NC_022241	CGGTG	2	10	866315	866324	0 %	20 %	60 %	20 %	538361380
16104	NC_022241	TCGCT	2	10	866402	866411	0 %	40 %	20 %	40 %	538361380
16105	NC_022241	GAT	2	6	866460	866465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361380
16106	NC_022241	GCG	2	6	866522	866527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361380
16107	NC_022241	GCTTCG	2	12	866573	866584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361380
16108	NC_022241	ATG	2	6	866592	866597	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361380
16109	NC_022241	TGC	2	6	866602	866607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361380
16110	NC_022241	GATCT	2	10	866667	866676	20 %	40 %	20 %	20 %	538361380
16111	NC_022241	TTACC	2	10	866705	866714	20 %	40 %	0 %	40 %	538361380
16112	NC_022241	TCAG	2	8	866848	866855	25 %	25 %	25 %	25 %	538361380
16113	NC_022241	TGG	2	6	866917	866922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361380
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16115	NC_022241	GCG	2	6	867024	867029	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361381
16116	NC_022241	TCT	2	6	867193	867198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361382
16117	NC_022241	CAA	2	6	867199	867204	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361382
16118	NC_022241	CG	3	6	867214	867219	0 %	0 %	50 %	50 %	538361382
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16120	NC_022241	CT	3	6	867286	867291	0 %	50 %	0 %	50 %	538361382
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16241	NC_022241	TCA	2	6	874207	874212	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361390
16242	NC_022241	AAT	2	6	874218	874223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361390
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16362	NC_022241	TCG	2	6	881469	881474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361396
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16461	NC_022241	A	6	6	886272	886277	100 %	0 %	0 %	0 %	538361400
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16475	NC_022241	CGT	2	6	887753	887758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361403
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16481	NC_022241	CTT	2	6	887890	887895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361404
16482	NC_022241	TGAC	2	8	887936	887943	25 %	25 %	25 %	25 %	538361404
16483	NC_022241	ATT	2	6	887959	887964	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361404
16484	NC_022241	GCC	2	6	887965	887970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361404
16485	NC_022241	GC	3	6	887971	887976	0 %	0 %	50 %	50 %	538361404
16486	NC_022241	TCCAGT	2	12	887983	887994	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538361404
16487	NC_022241	T	6	6	887994	887999	0 %	100 %	0 %	0 %	538361404
16488	NC_022241	TAT	2	6	888012	888017	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361404
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16490	NC_022241	AAC	2	6	888167	888172	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361404
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16497	NC_022241	GCCT	2	8	888377	888384	0 %	25 %	25 %	50 %	538361404
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