MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15501	NC_022241	CGG	2	6	832645	832650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361344
15502	NC_022241	CAG	2	6	832675	832680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361344
15503	NC_022241	CGG	2	6	832681	832686	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361344
15504	NC_022241	GTG	2	6	832722	832727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361344
15505	NC_022241	AAAG	2	8	832809	832816	75 %	0 %	25 %	0 %	538361344
15506	NC_022241	TC	3	6	832868	832873	0 %	50 %	0 %	50 %	538361345
15507	NC_022241	TGA	2	6	832912	832917	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361345
15508	NC_022241	T	6	6	832927	832932	0 %	100 %	0 %	0 %	538361345
15509	NC_022241	CGC	2	6	833261	833266	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361346
15510	NC_022241	CGC	2	6	833283	833288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361346
15511	NC_022241	CGC	2	6	833328	833333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361346
15512	NC_022241	TTG	2	6	833363	833368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361346
15513	NC_022241	TTCA	2	8	833374	833381	25 %	50 %	0 %	25 %	538361346
15514	NC_022241	CGT	2	6	833385	833390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361346
15515	NC_022241	CGC	2	6	833676	833681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361347
15516	NC_022241	CGCC	2	8	833726	833733	0 %	0 %	25 %	75 %	538361347
15517	NC_022241	CA	3	6	833814	833819	50 %	0 %	0 %	50 %	538361347
15518	NC_022241	CCG	2	6	833848	833853	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361347
15519	NC_022241	CAT	2	6	833878	833883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361347
15520	NC_022241	CGTGGG	2	12	833943	833954	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	538361347
15521	NC_022241	TGGC	2	8	833994	834001	0 %	25 %	50 %	25 %	538361347
15522	NC_022241	GC	3	6	834041	834046	0 %	0 %	50 %	50 %	538361347
15523	NC_022241	CGG	2	6	834110	834115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361347
15524	NC_022241	TAT	2	6	834129	834134	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361347
15525	NC_022241	CCG	3	9	834188	834196	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361347
15526	NC_022241	CG	3	6	834202	834207	0 %	0 %	50 %	50 %	538361347
15527	NC_022241	AGCG	2	8	834211	834218	25 %	0 %	50 %	25 %	538361347
15528	NC_022241	GAT	2	6	834247	834252	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361347
15529	NC_022241	CAG	2	6	834274	834279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361347
15530	NC_022241	GGC	2	6	834295	834300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361347
15531	NC_022241	A	7	7	834316	834322	100 %	0 %	0 %	0 %	538361347
15532	NC_022241	CCG	2	6	834345	834350	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361347
15533	NC_022241	ACG	2	6	834367	834372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361347
15534	NC_022241	CG	3	6	834380	834385	0 %	0 %	50 %	50 %	538361347
15535	NC_022241	GCT	2	6	834399	834404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361347
15536	NC_022241	GTG	2	6	834439	834444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361347
15537	NC_022241	A	6	6	834445	834450	100 %	0 %	0 %	0 %	538361347
15538	NC_022241	AAAGC	2	10	834468	834477	60 %	0 %	20 %	20 %	538361347
15539	NC_022241	GAC	2	6	834505	834510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361347
15540	NC_022241	TCG	2	6	834545	834550	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361348
15541	NC_022241	CG	3	6	834554	834559	0 %	0 %	50 %	50 %	538361348
15542	NC_022241	GCC	2	6	834582	834587	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361348
15543	NC_022241	GGCGGG	2	12	834588	834599	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	538361348
15544	NC_022241	GC	4	8	834623	834630	0 %	0 %	50 %	50 %	538361348
15545	NC_022241	GTG	2	6	834706	834711	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361348
15546	NC_022241	GTAAA	2	10	834722	834731	60 %	20 %	20 %	0 %	538361348
15547	NC_022241	TCC	2	6	834796	834801	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361348
15548	NC_022241	ACA	2	6	834886	834891	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361348
15549	NC_022241	GTG	2	6	834922	834927	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361348
15550	NC_022241	ATA	2	6	834943	834948	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361348
15551	NC_022241	ATA	2	6	835081	835086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361348
15552	NC_022241	GCCA	2	8	835140	835147	25 %	0 %	25 %	50 %	538361348
15553	NC_022241	ATG	2	6	835189	835194	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361348
15554	NC_022241	CAG	2	6	835239	835244	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361348
15555	NC_022241	CGTGCG	2	12	835245	835256	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538361348
15556	NC_022241	CGG	2	6	835334	835339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361348
15557	NC_022241	AGA	2	6	835340	835345	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361348
15558	NC_022241	AAT	2	6	835423	835428	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361348
15559	NC_022241	GAG	2	6	835495	835500	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361348
15560	NC_022241	AGCC	2	8	835501	835508	25 %	0 %	25 %	50 %	538361348
15561	NC_022241	CGC	2	6	835605	835610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361348
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15563	NC_022241	CAT	2	6	835647	835652	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361348
15564	NC_022241	GAA	2	6	835686	835691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361348
15565	NC_022241	GCCA	2	8	835717	835724	25 %	0 %	25 %	50 %	538361348
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15568	NC_022241	AAT	2	6	835911	835916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361348
15569	NC_022241	CAA	2	6	835925	835930	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361348
15570	NC_022241	A	6	6	836036	836041	100 %	0 %	0 %	0 %	538361348
15571	NC_022241	ATAA	2	8	836158	836165	75 %	25 %	0 %	0 %	538361348
15572	NC_022241	AGC	2	6	836179	836184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361348
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15574	NC_022241	CGA	2	6	836204	836209	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361348
15575	NC_022241	TGC	2	6	836234	836239	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361348
15576	NC_022241	GC	3	6	836256	836261	0 %	0 %	50 %	50 %	538361348
15577	NC_022241	GCG	2	6	836393	836398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361348
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15579	NC_022241	GGC	2	6	836509	836514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361348
15580	NC_022241	TCGG	2	8	836533	836540	0 %	25 %	50 %	25 %	538361348
15581	NC_022241	T	8	8	836631	836638	0 %	100 %	0 %	0 %	538361348
15582	NC_022241	GCT	2	6	836659	836664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361348
15583	NC_022241	GCTG	2	8	836666	836673	0 %	25 %	50 %	25 %	538361348
15584	NC_022241	GC	3	6	836720	836725	0 %	0 %	50 %	50 %	538361348
15585	NC_022241	A	6	6	836735	836740	100 %	0 %	0 %	0 %	538361348
15586	NC_022241	GTGA	2	8	837022	837029	25 %	25 %	50 %	0 %	538361349
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15588	NC_022241	CAT	2	6	837130	837135	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361349
15589	NC_022241	TGT	2	6	837176	837181	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361349
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15591	NC_022241	CTT	3	9	837267	837275	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361349
15592	NC_022241	CGC	2	6	837282	837287	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361349
15593	NC_022241	TAA	2	6	837472	837477	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361349
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15595	NC_022241	TGGG	2	8	837560	837567	0 %	25 %	75 %	0 %	538361349
15596	NC_022241	CTT	2	6	837616	837621	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361350
15597	NC_022241	GAC	2	6	837626	837631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361350
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15602	NC_022241	GCA	2	6	837815	837820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361350
15603	NC_022241	ATA	2	6	837917	837922	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361350
15604	NC_022241	CGCTG	2	10	837981	837990	0 %	20 %	40 %	40 %	538361350
15605	NC_022241	AAT	2	6	838074	838079	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361350
15606	NC_022241	GCC	2	6	838116	838121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361350
15607	NC_022241	GCC	2	6	838141	838146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361350
15608	NC_022241	GCC	2	6	838161	838166	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361350
15609	NC_022241	TTTA	2	8	838403	838410	25 %	75 %	0 %	0 %	538361351
15610	NC_022241	T	6	6	838428	838433	0 %	100 %	0 %	0 %	538361351
15611	NC_022241	GC	3	6	838475	838480	0 %	0 %	50 %	50 %	538361351
15612	NC_022241	TTG	2	6	838792	838797	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361351
15613	NC_022241	T	6	6	838854	838859	0 %	100 %	0 %	0 %	538361351
15614	NC_022241	CGTAAT	2	12	838869	838880	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538361351
15615	NC_022241	CGCCAG	2	12	838884	838895	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538361351
15616	NC_022241	AAT	2	6	838923	838928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361351
15617	NC_022241	GAAC	2	8	839042	839049	50 %	0 %	25 %	25 %	538361351
15618	NC_022241	A	6	6	839206	839211	100 %	0 %	0 %	0 %	538361352
15619	NC_022241	GCG	2	6	839679	839684	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361353
15620	NC_022241	CAT	2	6	839737	839742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361353
15621	NC_022241	ACA	2	6	839748	839753	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361353
15622	NC_022241	GTG	2	6	839847	839852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361353
15623	NC_022241	GAT	2	6	839902	839907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361353
15624	NC_022241	T	6	6	840050	840055	0 %	100 %	0 %	0 %	538361353
15625	NC_022241	CT	3	6	840060	840065	0 %	50 %	0 %	50 %	538361353
15626	NC_022241	ATTT	2	8	840251	840258	25 %	75 %	0 %	0 %	538361354
15627	NC_022241	TGG	2	6	840295	840300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361354
15628	NC_022241	TAA	2	6	840302	840307	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361354
15629	NC_022241	A	6	6	840323	840328	100 %	0 %	0 %	0 %	538361354
15630	NC_022241	A	6	6	840333	840338	100 %	0 %	0 %	0 %	538361354
15631	NC_022241	A	6	6	840345	840350	100 %	0 %	0 %	0 %	538361354
15632	NC_022241	AAT	2	6	840368	840373	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361354
15633	NC_022241	GGC	2	6	840496	840501	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361355
15634	NC_022241	ATG	2	6	840503	840508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361355
15635	NC_022241	ATC	2	6	840557	840562	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361355
15636	NC_022241	CGG	2	6	840570	840575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361355
15637	NC_022241	TCA	2	6	840594	840599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361355
15638	NC_022241	GAA	2	6	840696	840701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361355
15639	NC_022241	ATG	2	6	840755	840760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361355
15640	NC_022241	GCA	2	6	840912	840917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361355
15641	NC_022241	GCC	2	6	840966	840971	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361355
15642	NC_022241	ATAGA	2	10	841054	841063	60 %	20 %	20 %	0 %	538361355
15643	NC_022241	GCT	2	6	841110	841115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361355
15644	NC_022241	AAACGC	2	12	841124	841135	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	538361355
15645	NC_022241	GATAAG	2	12	841153	841164	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	538361355
15646	NC_022241	GC	3	6	841200	841205	0 %	0 %	50 %	50 %	538361355
15647	NC_022241	A	7	7	841677	841683	100 %	0 %	0 %	0 %	538361356
15648	NC_022241	GCT	2	6	841740	841745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361356
15649	NC_022241	GGT	2	6	841761	841766	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361356
15650	NC_022241	GAC	2	6	841839	841844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361356
15651	NC_022241	ACA	2	6	841912	841917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361356
15652	NC_022241	TAC	2	6	841926	841931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361356
15653	NC_022241	CCGGC	2	10	841942	841951	0 %	0 %	40 %	60 %	538361356
15654	NC_022241	GAC	2	6	842015	842020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361356
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15656	NC_022241	A	6	6	842263	842268	100 %	0 %	0 %	0 %	538361357
15657	NC_022241	AAAT	2	8	842347	842354	75 %	25 %	0 %	0 %	538361357
15658	NC_022241	A	6	6	842403	842408	100 %	0 %	0 %	0 %	538361357
15659	NC_022241	GTC	2	6	842510	842515	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361357
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15661	NC_022241	TCG	2	6	842637	842642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361357
15662	NC_022241	ATAA	2	8	842659	842666	75 %	25 %	0 %	0 %	538361357
15663	NC_022241	TGCG	2	8	842769	842776	0 %	25 %	50 %	25 %	538361357
15664	NC_022241	CGT	2	6	842815	842820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361357
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15684	NC_022241	CAG	2	6	843560	843565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361357
15685	NC_022241	GC	3	6	843580	843585	0 %	0 %	50 %	50 %	538361357
15686	NC_022241	AGC	2	6	843639	843644	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361357
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15690	NC_022241	GCCC	2	8	843770	843777	0 %	0 %	25 %	75 %	538361357
15691	NC_022241	CGA	2	6	843792	843797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361357
15692	NC_022241	CCTG	2	8	843885	843892	0 %	25 %	25 %	50 %	538361358
15693	NC_022241	A	6	6	843902	843907	100 %	0 %	0 %	0 %	538361358
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15701	NC_022241	A	7	7	844440	844446	100 %	0 %	0 %	0 %	538361361
15702	NC_022241	AGA	2	6	844467	844472	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361361
15703	NC_022241	GTCAG	2	10	844490	844499	20 %	20 %	40 %	20 %	538361361
15704	NC_022241	AG	3	6	844498	844503	50 %	0 %	50 %	0 %	538361361
15705	NC_022241	GAC	2	6	844525	844530	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361361
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15711	NC_022241	GCG	2	6	844907	844912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361362
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15713	NC_022241	GTT	2	6	844928	844933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361362
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15715	NC_022241	GCCTG	2	10	844983	844992	0 %	20 %	40 %	40 %	538361362
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15720	NC_022241	A	7	7	845216	845222	100 %	0 %	0 %	0 %	538361362
15721	NC_022241	GATT	2	8	845245	845252	25 %	50 %	25 %	0 %	538361362
15722	NC_022241	GCT	2	6	845285	845290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
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15724	NC_022241	ATG	3	9	845385	845393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361362
15725	NC_022241	GTTTT	2	10	845417	845426	0 %	80 %	20 %	0 %	538361362
15726	NC_022241	CGC	2	6	845464	845469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361362
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15728	NC_022241	GC	3	6	845589	845594	0 %	0 %	50 %	50 %	538361362
15729	NC_022241	TGGAC	2	10	845611	845620	20 %	20 %	40 %	20 %	538361362
15730	NC_022241	GCT	3	9	845621	845629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
15731	NC_022241	CTG	2	6	845787	845792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
15732	NC_022241	GCT	2	6	845813	845818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
15733	NC_022241	CGG	2	6	845837	845842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361362
15734	NC_022241	CTG	2	6	845850	845855	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361362
15735	NC_022241	TGG	2	6	845910	845915	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361362
15736	NC_022241	ATTTC	2	10	845918	845927	20 %	60 %	0 %	20 %	538361362
15737	NC_022241	GCG	2	6	845952	845957	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361362
15738	NC_022241	TGG	2	6	845959	845964	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361362
15739	NC_022241	ATT	2	6	845972	845977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361362
15740	NC_022241	TGT	2	6	846080	846085	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361363
15741	NC_022241	ACG	2	6	846086	846091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361363
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15743	NC_022241	CGT	2	6	846181	846186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361363
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15776	NC_022241	A	6	6	848112	848117	100 %	0 %	0 %	0 %	538361364
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15981	NC_022241	GCG	2	6	859702	859707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361375
15982	NC_022241	GCG	2	6	859730	859735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361375
15983	NC_022241	CGC	2	6	859736	859741	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361375
15984	NC_022241	ACGAA	2	10	859745	859754	60 %	0 %	20 %	20 %	538361375
15985	NC_022241	A	7	7	859753	859759	100 %	0 %	0 %	0 %	538361375
15986	NC_022241	GGC	3	9	859803	859811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361375
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