MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_022241	CAAT	2	8	781093	781100	50 %	25 %	0 %	25 %	538361296
14502	NC_022241	T	6	6	781116	781121	0 %	100 %	0 %	0 %	538361296
14503	NC_022241	GC	3	6	781208	781213	0 %	0 %	50 %	50 %	538361296
14504	NC_022241	GCT	2	6	781235	781240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361296
14505	NC_022241	GGA	2	6	781275	781280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361296
14506	NC_022241	TGA	2	6	781313	781318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361296
14507	NC_022241	CGC	2	6	781328	781333	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361296
14508	NC_022241	GTT	2	6	781341	781346	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361296
14509	NC_022241	CGC	2	6	781370	781375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361296
14510	NC_022241	CTG	2	6	781392	781397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361296
14511	NC_022241	CGG	2	6	781457	781462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361296
14512	NC_022241	GTACG	2	10	781472	781481	20 %	20 %	40 %	20 %	538361296
14513	NC_022241	TCG	2	6	781483	781488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361296
14514	NC_022241	CG	3	6	781487	781492	0 %	0 %	50 %	50 %	538361296
14515	NC_022241	CAT	2	6	781544	781549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361296
14516	NC_022241	GTGG	2	8	781602	781609	0 %	25 %	75 %	0 %	538361296
14517	NC_022241	GC	4	8	781637	781644	0 %	0 %	50 %	50 %	538361296
14518	NC_022241	CG	3	6	781703	781708	0 %	0 %	50 %	50 %	538361297
14519	NC_022241	ACGG	2	8	781784	781791	25 %	0 %	50 %	25 %	538361297
14520	NC_022241	GCA	2	6	781801	781806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361297
14521	NC_022241	GCG	2	6	781807	781812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361297
14522	NC_022241	TTC	2	6	781847	781852	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361297
14523	NC_022241	GC	3	6	781864	781869	0 %	0 %	50 %	50 %	538361297
14524	NC_022241	GGAA	2	8	781891	781898	50 %	0 %	50 %	0 %	538361297
14525	NC_022241	CGCCAG	2	12	781940	781951	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538361297
14526	NC_022241	AG	3	6	781950	781955	50 %	0 %	50 %	0 %	538361297
14527	NC_022241	GCT	2	6	781960	781965	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361297
14528	NC_022241	CGC	2	6	782030	782035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361297
14529	NC_022241	CAC	2	6	782045	782050	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361297
14530	NC_022241	GCCA	2	8	782052	782059	25 %	0 %	25 %	50 %	538361297
14531	NC_022241	CCA	2	6	782116	782121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361297
14532	NC_022241	ATGCGG	2	12	782216	782227	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538361297
14533	NC_022241	CGC	2	6	782243	782248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361297
14534	NC_022241	CGG	2	6	782296	782301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361297
14535	NC_022241	CG	4	8	782404	782411	0 %	0 %	50 %	50 %	538361297
14536	NC_022241	CA	3	6	782548	782553	50 %	0 %	0 %	50 %	538361297
14537	NC_022241	GCA	2	6	782578	782583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361297
14538	NC_022241	GCG	2	6	782635	782640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361297
14539	NC_022241	GAT	2	6	782686	782691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361297
14540	NC_022241	TGCCAG	2	12	782755	782766	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538361298
14541	NC_022241	CGCGG	2	10	782864	782873	0 %	0 %	60 %	40 %	538361298
14542	NC_022241	TAAT	2	8	782884	782891	50 %	50 %	0 %	0 %	538361298
14543	NC_022241	ACG	2	6	783007	783012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361298
14544	NC_022241	TCGG	2	8	783067	783074	0 %	25 %	50 %	25 %	538361298
14545	NC_022241	GCGA	2	8	783094	783101	25 %	0 %	50 %	25 %	538361298
14546	NC_022241	CGA	2	6	783106	783111	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361298
14547	NC_022241	TCT	2	6	783166	783171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361298
14548	NC_022241	GC	3	6	783191	783196	0 %	0 %	50 %	50 %	538361298
14549	NC_022241	GCA	2	6	783215	783220	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361298
14550	NC_022241	ACTCC	2	10	783228	783237	20 %	20 %	0 %	60 %	538361298
14551	NC_022241	GCG	2	6	783305	783310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361298
14552	NC_022241	CGCA	2	8	783402	783409	25 %	0 %	25 %	50 %	538361298
14553	NC_022241	GTT	2	6	783441	783446	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361298
14554	NC_022241	GCA	2	6	783617	783622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361298
14555	NC_022241	GAC	2	6	783657	783662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361298
14556	NC_022241	GCA	2	6	783677	783682	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361298
14557	NC_022241	ACC	2	6	783717	783722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361298
14558	NC_022241	T	6	6	783969	783974	0 %	100 %	0 %	0 %	538361299
14559	NC_022241	CGA	2	6	784010	784015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361299
14560	NC_022241	AGCA	2	8	784065	784072	50 %	0 %	25 %	25 %	538361299
14561	NC_022241	GCG	2	6	784108	784113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361299
14562	NC_022241	AGCGT	2	10	784155	784164	20 %	20 %	40 %	20 %	538361299
14563	NC_022241	GTCA	2	8	784236	784243	25 %	25 %	25 %	25 %	538361299
14564	NC_022241	CAG	2	6	784275	784280	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361299
14565	NC_022241	TTCA	2	8	784305	784312	25 %	50 %	0 %	25 %	538361299
14566	NC_022241	GGC	2	6	784341	784346	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361299
14567	NC_022241	GAT	2	6	784361	784366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361299
14568	NC_022241	GTAG	2	8	784377	784384	25 %	25 %	50 %	0 %	538361299
14569	NC_022241	AAT	2	6	784401	784406	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361299
14570	NC_022241	CTT	2	6	784448	784453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361299
14571	NC_022241	T	6	6	784498	784503	0 %	100 %	0 %	0 %	538361299
14572	NC_022241	CAT	3	9	784505	784513	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361299
14573	NC_022241	ATC	2	6	784530	784535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361299
14574	NC_022241	AAAT	2	8	784547	784554	75 %	25 %	0 %	0 %	538361299
14575	NC_022241	CATT	2	8	784556	784563	25 %	50 %	0 %	25 %	538361299
14576	NC_022241	CCG	2	6	784631	784636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361299
14577	NC_022241	CTT	2	6	784637	784642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361299
14578	NC_022241	CGG	2	6	784721	784726	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361299
14579	NC_022241	CGG	2	6	784757	784762	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361299
14580	NC_022241	CCT	2	6	784772	784777	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361299
14581	NC_022241	TAT	2	6	784845	784850	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361299
14582	NC_022241	ATT	2	6	785045	785050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361300
14583	NC_022241	CAGG	2	8	785115	785122	25 %	0 %	50 %	25 %	538361300
14584	NC_022241	ATG	2	6	785135	785140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361300
14585	NC_022241	CAG	2	6	785150	785155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14586	NC_022241	TC	3	6	785161	785166	0 %	50 %	0 %	50 %	538361300
14587	NC_022241	ACG	2	6	785192	785197	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14588	NC_022241	GC	4	8	785272	785279	0 %	0 %	50 %	50 %	538361300
14589	NC_022241	GCT	2	6	785296	785301	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14590	NC_022241	GA	3	6	785310	785315	50 %	0 %	50 %	0 %	538361300
14591	NC_022241	CCG	2	6	785332	785337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361300
14592	NC_022241	GA	3	6	785436	785441	50 %	0 %	50 %	0 %	538361300
14593	NC_022241	CTG	3	9	785487	785495	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14594	NC_022241	T	6	6	785510	785515	0 %	100 %	0 %	0 %	538361300
14595	NC_022241	CGC	2	6	785533	785538	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361300
14596	NC_022241	CGC	3	9	785544	785552	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361300
14597	NC_022241	GAT	2	6	785587	785592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361300
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14599	NC_022241	CGA	2	6	785641	785646	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14600	NC_022241	GGT	2	6	785683	785688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361300
14601	NC_022241	GGA	2	6	785689	785694	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361300
14602	NC_022241	GGCG	2	8	785764	785771	0 %	0 %	75 %	25 %	538361300
14603	NC_022241	CGCT	2	8	785811	785818	0 %	25 %	25 %	50 %	538361300
14604	NC_022241	GTC	2	6	785859	785864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14605	NC_022241	TCA	2	6	785928	785933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361300
14606	NC_022241	GTT	2	6	785998	786003	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361300
14607	NC_022241	TCA	2	6	786036	786041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361300
14608	NC_022241	CAG	2	6	786080	786085	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14609	NC_022241	CTG	2	6	786152	786157	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361300
14610	NC_022241	AAT	2	6	786200	786205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361300
14611	NC_022241	TTA	2	6	786258	786263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361300
14612	NC_022241	TAA	2	6	786350	786355	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361300
14613	NC_022241	GC	3	6	786373	786378	0 %	0 %	50 %	50 %	538361300
14614	NC_022241	AAT	2	6	786600	786605	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361301
14615	NC_022241	CCTT	2	8	786643	786650	0 %	50 %	0 %	50 %	538361301
14616	NC_022241	GGC	2	6	786657	786662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361301
14617	NC_022241	CCGCG	2	10	786731	786740	0 %	0 %	40 %	60 %	538361301
14618	NC_022241	GCG	2	6	786778	786783	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361301
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14620	NC_022241	CTT	2	6	786842	786847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361301
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14741	NC_022241	ATCG	2	8	793309	793316	25 %	25 %	25 %	25 %	538361308
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14861	NC_022241	GGC	2	6	800091	800096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361313
14862	NC_022241	CAT	2	6	800109	800114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361313
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14978	NC_022241	GCAG	2	8	805563	805570	25 %	0 %	50 %	25 %	538361319
14979	NC_022241	GCGG	2	8	805591	805598	0 %	0 %	75 %	25 %	538361319
14980	NC_022241	CT	3	6	805612	805617	0 %	50 %	0 %	50 %	538361319
14981	NC_022241	AGC	2	6	805652	805657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361319
14982	NC_022241	GTT	2	6	805672	805677	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361319
14983	NC_022241	GGAT	2	8	805753	805760	25 %	25 %	50 %	0 %	538361319
14984	NC_022241	GCC	2	6	805776	805781	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361319
14985	NC_022241	GC	3	6	805784	805789	0 %	0 %	50 %	50 %	538361319
14986	NC_022241	CGC	2	6	805816	805821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361319
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14991	NC_022241	GGC	2	6	806783	806788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361320
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