MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_022241	CTGGT	2	10	701497	701506	0 %	40 %	40 %	20 %	538361222
13002	NC_022241	TTC	2	6	701531	701536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361222
13003	NC_022241	TCTG	2	8	701574	701581	0 %	50 %	25 %	25 %	538361222
13004	NC_022241	GCC	2	6	701611	701616	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361222
13005	NC_022241	GCGG	2	8	701636	701643	0 %	0 %	75 %	25 %	538361222
13006	NC_022241	GC	3	6	701664	701669	0 %	0 %	50 %	50 %	538361222
13007	NC_022241	TCA	2	6	701691	701696	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361222
13008	NC_022241	CTG	2	6	701702	701707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13009	NC_022241	ACGGC	2	10	701823	701832	20 %	0 %	40 %	40 %	538361222
13010	NC_022241	CTT	2	6	701851	701856	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361222
13011	NC_022241	ATG	2	6	701864	701869	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361222
13012	NC_022241	CGC	2	6	701905	701910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361222
13013	NC_022241	CGT	2	6	701921	701926	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13014	NC_022241	CGG	2	6	701935	701940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361222
13015	NC_022241	TGC	2	6	701943	701948	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13016	NC_022241	TGTC	2	8	701949	701956	0 %	50 %	25 %	25 %	538361222
13017	NC_022241	GCT	2	6	702022	702027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13018	NC_022241	CCT	2	6	702031	702036	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361222
13019	NC_022241	TCG	2	6	702066	702071	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13020	NC_022241	ATC	2	6	702200	702205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361222
13021	NC_022241	CTG	2	6	702212	702217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13022	NC_022241	TGA	2	6	702274	702279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361222
13023	NC_022241	GAA	2	6	702290	702295	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361222
13024	NC_022241	GAA	2	6	702311	702316	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361222
13025	NC_022241	TGC	2	6	702346	702351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13026	NC_022241	CGAT	2	8	702378	702385	25 %	25 %	25 %	25 %	538361222
13027	NC_022241	GTG	2	6	702470	702475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361222
13028	NC_022241	AACA	2	8	702482	702489	75 %	0 %	0 %	25 %	538361222
13029	NC_022241	ATGAA	2	10	702534	702543	60 %	20 %	20 %	0 %	538361222
13030	NC_022241	GTG	2	6	702548	702553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361222
13031	NC_022241	CTG	2	6	702579	702584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13032	NC_022241	CGG	2	6	702612	702617	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361222
13033	NC_022241	TC	3	6	702663	702668	0 %	50 %	0 %	50 %	538361222
13034	NC_022241	CGG	3	9	702780	702788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361222
13035	NC_022241	TCTG	2	8	702825	702832	0 %	50 %	25 %	25 %	538361222
13036	NC_022241	AGA	2	6	702916	702921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361222
13037	NC_022241	CGG	2	6	702936	702941	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361222
13038	NC_022241	CG	3	6	702985	702990	0 %	0 %	50 %	50 %	538361222
13039	NC_022241	GTT	2	6	703007	703012	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361222
13040	NC_022241	GCA	2	6	703014	703019	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361222
13041	NC_022241	TCA	2	6	703044	703049	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361222
13042	NC_022241	AAT	2	6	703104	703109	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361222
13043	NC_022241	TGAG	2	8	703319	703326	25 %	25 %	50 %	0 %	538361223
13044	NC_022241	GCCC	2	8	703333	703340	0 %	0 %	25 %	75 %	538361223
13045	NC_022241	ATT	2	6	703360	703365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361223
13046	NC_022241	CCG	2	6	703414	703419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361223
13047	NC_022241	ATCT	2	8	703455	703462	25 %	50 %	0 %	25 %	538361223
13048	NC_022241	AGA	2	6	703536	703541	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361223
13049	NC_022241	ACG	2	6	703568	703573	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361223
13050	NC_022241	CTC	2	6	703614	703619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361223
13051	NC_022241	AGGCC	2	10	703668	703677	20 %	0 %	40 %	40 %	538361223
13052	NC_022241	TGA	2	6	703683	703688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361223
13053	NC_022241	A	6	6	703793	703798	100 %	0 %	0 %	0 %	538361223
13054	NC_022241	CGG	2	6	703806	703811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361223
13055	NC_022241	GC	3	6	703836	703841	0 %	0 %	50 %	50 %	538361223
13056	NC_022241	CAT	2	6	703912	703917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361223
13057	NC_022241	CAA	2	6	703926	703931	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361223
13058	NC_022241	GTG	2	6	703932	703937	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361223
13059	NC_022241	CGT	2	6	704029	704034	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361223
13060	NC_022241	ACA	2	6	704054	704059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361223
13061	NC_022241	CTG	2	6	704143	704148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361223
13062	NC_022241	ACA	2	6	704276	704281	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361223
13063	NC_022241	CGCGC	2	10	704334	704343	0 %	0 %	40 %	60 %	538361223
13064	NC_022241	GATC	2	8	704481	704488	25 %	25 %	25 %	25 %	538361223
13065	NC_022241	GAA	2	6	704503	704508	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361223
13066	NC_022241	AAG	2	6	704543	704548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361223
13067	NC_022241	CAC	2	6	704613	704618	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361223
13068	NC_022241	TCT	2	6	704621	704626	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361223
13069	NC_022241	ATG	2	6	704633	704638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361223
13070	NC_022241	GCA	2	6	704704	704709	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361223
13071	NC_022241	GGA	2	6	704775	704780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361223
13072	NC_022241	CTGT	2	8	704785	704792	0 %	50 %	25 %	25 %	538361223
13073	NC_022241	GCG	2	6	704848	704853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361223
13074	NC_022241	GTA	2	6	705459	705464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361224
13075	NC_022241	CTGGCT	2	12	705467	705478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361224
13076	NC_022241	GTT	2	6	705512	705517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361224
13077	NC_022241	CGA	2	6	705544	705549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361224
13078	NC_022241	GGC	2	6	705563	705568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361224
13079	NC_022241	TAT	2	6	705572	705577	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361224
13080	NC_022241	ACG	2	6	705795	705800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361224
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13082	NC_022241	A	7	7	706076	706082	100 %	0 %	0 %	0 %	538361224
13083	NC_022241	CTCCA	2	10	706097	706106	20 %	20 %	0 %	60 %	538361224
13084	NC_022241	GCG	2	6	706148	706153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361224
13085	NC_022241	GGC	2	6	706217	706222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361224
13086	NC_022241	CAC	2	6	706231	706236	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361224
13087	NC_022241	GC	4	8	706254	706261	0 %	0 %	50 %	50 %	538361224
13088	NC_022241	ACG	2	6	706296	706301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361224
13089	NC_022241	CAG	2	6	706394	706399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361224
13090	NC_022241	GTC	2	6	706446	706451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361224
13091	NC_022241	TGG	2	6	706460	706465	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361224
13092	NC_022241	TTC	2	6	706508	706513	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361224
13093	NC_022241	GGGCT	2	10	706549	706558	0 %	20 %	60 %	20 %	538361224
13094	NC_022241	TAC	2	6	706625	706630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361224
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13097	NC_022241	CGTGA	2	10	706799	706808	20 %	20 %	40 %	20 %	538361224
13098	NC_022241	A	7	7	706896	706902	100 %	0 %	0 %	0 %	538361225
13099	NC_022241	CCG	2	6	706924	706929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361225
13100	NC_022241	TCA	2	6	706947	706952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361225
13101	NC_022241	GAA	2	6	706962	706967	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361225
13102	NC_022241	A	6	6	707064	707069	100 %	0 %	0 %	0 %	538361225
13103	NC_022241	GAA	2	6	707097	707102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361225
13104	NC_022241	CAG	2	6	707124	707129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361225
13105	NC_022241	ATA	2	6	707209	707214	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361225
13106	NC_022241	T	6	6	707269	707274	0 %	100 %	0 %	0 %	538361226
13107	NC_022241	CCA	2	6	707367	707372	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361226
13108	NC_022241	GCC	2	6	707433	707438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361226
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13110	NC_022241	A	6	6	707544	707549	100 %	0 %	0 %	0 %	538361226
13111	NC_022241	CAG	2	6	707562	707567	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361226
13112	NC_022241	GCG	2	6	707596	707601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361226
13113	NC_022241	GGT	2	6	707625	707630	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361226
13114	NC_022241	CGC	2	6	707693	707698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361226
13115	NC_022241	CCA	2	6	707729	707734	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361226
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13117	NC_022241	ATAAA	2	10	707809	707818	80 %	20 %	0 %	0 %	538361226
13118	NC_022241	TGG	2	6	707825	707830	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361226
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13238	NC_022241	GTC	2	6	713939	713944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361232
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13240	NC_022241	GC	3	6	714059	714064	0 %	0 %	50 %	50 %	538361233
13241	NC_022241	CAT	2	6	714065	714070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361233
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13243	NC_022241	CGG	2	6	714161	714166	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361234
13244	NC_022241	GC	3	6	714170	714175	0 %	0 %	50 %	50 %	538361234
13245	NC_022241	GC	5	10	714231	714240	0 %	0 %	50 %	50 %	538361234
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13253	NC_022241	CTG	2	6	714673	714678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361234
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13478	NC_022241	GGC	2	6	725307	725312	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361242
13479	NC_022241	GCC	2	6	725336	725341	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361242
13480	NC_022241	GGC	2	6	725362	725367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361242
13481	NC_022241	GCG	2	6	725392	725397	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361242
13482	NC_022241	CAC	2	6	725433	725438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361242
13483	NC_022241	GAA	2	6	725514	725519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361242
13484	NC_022241	GGGGCG	2	12	725540	725551	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	538361242
13485	NC_022241	CAA	2	6	725559	725564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361242
13486	NC_022241	TCG	2	6	725590	725595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361242
13487	NC_022241	CAA	2	6	725644	725649	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361243
13488	NC_022241	CAC	2	6	725654	725659	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361243
13489	NC_022241	GCC	3	9	725742	725750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361243
13490	NC_022241	ATT	2	6	725789	725794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361243
13491	NC_022241	CGT	2	6	725816	725821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361243
13492	NC_022241	GCG	2	6	725859	725864	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361243
13493	NC_022241	GCG	2	6	725871	725876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361243
13494	NC_022241	GGC	2	6	725915	725920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361243
13495	NC_022241	CGG	2	6	725962	725967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361243
13496	NC_022241	GGCC	2	8	725976	725983	0 %	0 %	50 %	50 %	538361243
13497	NC_022241	CGG	2	6	725998	726003	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361243
13498	NC_022241	ACC	2	6	726082	726087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361243
13499	NC_022241	CGC	2	6	726121	726126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361243
13500	NC_022241	CAG	2	6	726137	726142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361243

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