MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12501	NC_022241	GCT	2	6	674638	674643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361200
12502	NC_022241	TGA	2	6	674671	674676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361200
12503	NC_022241	ATG	2	6	674690	674695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361200
12504	NC_022241	AGG	2	6	674784	674789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361200
12505	NC_022241	CCA	2	6	674834	674839	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361201
12506	NC_022241	GCT	2	6	674874	674879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12507	NC_022241	ACA	2	6	674956	674961	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361201
12508	NC_022241	CGCC	2	8	674963	674970	0 %	0 %	25 %	75 %	538361201
12509	NC_022241	GGT	2	6	674976	674981	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361201
12510	NC_022241	TGA	2	6	674982	674987	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361201
12511	NC_022241	TGG	2	6	675136	675141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361201
12512	NC_022241	CTG	2	6	675193	675198	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12513	NC_022241	GCCTG	2	10	675206	675215	0 %	20 %	40 %	40 %	538361201
12514	NC_022241	GAG	2	6	675250	675255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361201
12515	NC_022241	GGA	2	6	675258	675263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361201
12516	NC_022241	TTTG	2	8	675267	675274	0 %	75 %	25 %	0 %	538361201
12517	NC_022241	CCG	2	6	675279	675284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361201
12518	NC_022241	ATT	2	6	675299	675304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361201
12519	NC_022241	TGC	2	6	675311	675316	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12520	NC_022241	ATG	2	6	675356	675361	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361201
12521	NC_022241	ACA	2	6	675368	675373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361201
12522	NC_022241	CT	3	6	675389	675394	0 %	50 %	0 %	50 %	538361201
12523	NC_022241	GCA	2	6	675414	675419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12524	NC_022241	ACG	2	6	675456	675461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12525	NC_022241	GCT	2	6	675504	675509	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12526	NC_022241	TGGCA	2	10	675521	675530	20 %	20 %	40 %	20 %	538361201
12527	NC_022241	AACGC	2	10	675547	675556	40 %	0 %	20 %	40 %	538361201
12528	NC_022241	TTA	2	6	675561	675566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361201
12529	NC_022241	CTG	2	6	675607	675612	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12530	NC_022241	GTG	2	6	675630	675635	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361201
12531	NC_022241	TGC	2	6	675668	675673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12532	NC_022241	GCT	2	6	675708	675713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12533	NC_022241	GCT	2	6	675762	675767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12534	NC_022241	TGCT	2	8	675796	675803	0 %	50 %	25 %	25 %	538361201
12535	NC_022241	GCG	2	6	675824	675829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361201
12536	NC_022241	CGC	2	6	675836	675841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361201
12537	NC_022241	GCG	2	6	675861	675866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361201
12538	NC_022241	GC	3	6	675878	675883	0 %	0 %	50 %	50 %	538361201
12539	NC_022241	GTGA	2	8	675889	675896	25 %	25 %	50 %	0 %	538361201
12540	NC_022241	TGT	2	6	675923	675928	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361201
12541	NC_022241	GAG	2	6	675958	675963	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361201
12542	NC_022241	GGGC	2	8	676054	676061	0 %	0 %	75 %	25 %	538361201
12543	NC_022241	GAA	2	6	676102	676107	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361201
12544	NC_022241	GAC	2	6	676113	676118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361201
12545	NC_022241	GGA	2	6	676137	676142	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361201
12546	NC_022241	GGC	3	9	676147	676155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361201
12547	NC_022241	TATT	2	8	676187	676194	25 %	75 %	0 %	0 %	538361201
12548	NC_022241	GAA	2	6	676254	676259	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361202
12549	NC_022241	TA	3	6	676300	676305	50 %	50 %	0 %	0 %	538361202
12550	NC_022241	CTG	2	6	676354	676359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361202
12551	NC_022241	TC	3	6	676364	676369	0 %	50 %	0 %	50 %	538361202
12552	NC_022241	GACG	2	8	676424	676431	25 %	0 %	50 %	25 %	538361202
12553	NC_022241	TTG	2	6	676546	676551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361202
12554	NC_022241	TGC	2	6	676566	676571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361202
12555	NC_022241	ACG	2	6	676708	676713	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361202
12556	NC_022241	GCC	2	6	676731	676736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361202
12557	NC_022241	ACG	2	6	676807	676812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361202
12558	NC_022241	GC	3	6	676819	676824	0 %	0 %	50 %	50 %	538361202
12559	NC_022241	AG	3	6	676853	676858	50 %	0 %	50 %	0 %	538361202
12560	NC_022241	TTA	2	6	676859	676864	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361202
12561	NC_022241	AAC	2	6	676894	676899	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361202
12562	NC_022241	ACC	2	6	676973	676978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361203
12563	NC_022241	GAA	2	6	677075	677080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361203
12564	NC_022241	GCA	2	6	677083	677088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361203
12565	NC_022241	GCC	2	6	677093	677098	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361203
12566	NC_022241	GGA	2	6	677107	677112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361203
12567	NC_022241	CGA	2	6	677134	677139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361203
12568	NC_022241	TGG	2	6	677151	677156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361203
12569	NC_022241	GATA	2	8	677251	677258	50 %	25 %	25 %	0 %	538361203
12570	NC_022241	TTG	2	6	677324	677329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361203
12571	NC_022241	GAT	2	6	677366	677371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361203
12572	NC_022241	T	7	7	677485	677491	0 %	100 %	0 %	0 %	538361203
12573	NC_022241	GAT	2	6	677570	677575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361203
12574	NC_022241	TCG	2	6	677650	677655	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361203
12575	NC_022241	GAC	2	6	677789	677794	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361203
12576	NC_022241	GCTGG	2	10	677800	677809	0 %	20 %	60 %	20 %	538361203
12577	NC_022241	GCC	2	6	677811	677816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361203
12578	NC_022241	TTC	2	6	677831	677836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361203
12579	NC_022241	GC	3	6	677861	677866	0 %	0 %	50 %	50 %	538361203
12580	NC_022241	GC	4	8	677901	677908	0 %	0 %	50 %	50 %	538361203
12581	NC_022241	TTG	2	6	677970	677975	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361203
12582	NC_022241	CGC	2	6	678048	678053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361203
12583	NC_022241	CGG	2	6	678072	678077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361203
12584	NC_022241	GGT	2	6	678082	678087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361203
12585	NC_022241	T	6	6	678116	678121	0 %	100 %	0 %	0 %	538361203
12586	NC_022241	CTG	2	6	678125	678130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361203
12587	NC_022241	GGA	2	6	678139	678144	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361203
12588	NC_022241	TCA	2	6	678188	678193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361203
12589	NC_022241	GGC	2	6	678256	678261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361203
12590	NC_022241	AGA	2	6	678268	678273	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361203
12591	NC_022241	A	6	6	678275	678280	100 %	0 %	0 %	0 %	538361203
12592	NC_022241	TCT	2	6	678284	678289	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361203
12593	NC_022241	TGA	2	6	678333	678338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361203
12594	NC_022241	TTC	2	6	678392	678397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361203
12595	NC_022241	T	6	6	678400	678405	0 %	100 %	0 %	0 %	538361203
12596	NC_022241	CAG	2	6	678512	678517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361204
12597	NC_022241	CGC	2	6	678518	678523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361204
12598	NC_022241	TAA	2	6	678535	678540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361204
12599	NC_022241	CG	3	6	678572	678577	0 %	0 %	50 %	50 %	538361204
12600	NC_022241	CTC	2	6	678587	678592	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361204
12601	NC_022241	TGC	2	6	678678	678683	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361204
12602	NC_022241	GTC	2	6	678684	678689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361204
12603	NC_022241	TGA	2	6	678709	678714	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361204
12604	NC_022241	CAG	2	6	678740	678745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361204
12605	NC_022241	CAG	2	6	678758	678763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361204
12606	NC_022241	AATC	2	8	678838	678845	50 %	25 %	0 %	25 %	538361204
12607	NC_022241	ATT	2	6	678851	678856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361204
12608	NC_022241	TGG	2	6	678919	678924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361204
12609	NC_022241	GGT	2	6	678953	678958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361204
12610	NC_022241	ATG	2	6	678969	678974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361204
12611	NC_022241	CTT	2	6	679051	679056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361204
12612	NC_022241	GGC	2	6	679082	679087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361204
12613	NC_022241	GCG	2	6	679095	679100	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361204
12614	NC_022241	CGC	2	6	679195	679200	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361204
12615	NC_022241	TCA	2	6	679473	679478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361204
12616	NC_022241	CGC	2	6	679501	679506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361204
12617	NC_022241	GCGTA	2	10	679549	679558	20 %	20 %	40 %	20 %	538361204
12618	NC_022241	C	6	6	679587	679592	0 %	0 %	0 %	100 %	538361204
12619	NC_022241	TGC	2	6	679620	679625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361204
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12726	NC_022241	TTTAGT	2	12	684796	684807	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	538361210
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12729	NC_022241	CAG	2	6	685089	685094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361210
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12731	NC_022241	TAA	2	6	685169	685174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361210
12732	NC_022241	GCA	2	6	685211	685216	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361210
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12737	NC_022241	CAG	2	6	685302	685307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361210
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12844	NC_022241	AGTA	2	8	691320	691327	50 %	25 %	25 %	0 %	538361214
12845	NC_022241	GC	3	6	691379	691384	0 %	0 %	50 %	50 %	538361214
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12853	NC_022241	CAG	2	6	691732	691737	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361214
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12855	NC_022241	CAAC	2	8	691962	691969	50 %	0 %	0 %	50 %	538361215
12856	NC_022241	CGG	2	6	691985	691990	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361215
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12858	NC_022241	CGCTGG	2	12	692008	692019	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	538361215
12859	NC_022241	GCA	2	6	692027	692032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361215
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12963	NC_022241	CGGTG	2	10	699138	699147	0 %	20 %	60 %	20 %	538361220
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12965	NC_022241	AATA	2	8	699242	699249	75 %	25 %	0 %	0 %	538361220
12966	NC_022241	GGCA	2	8	699435	699442	25 %	0 %	50 %	25 %	538361220
12967	NC_022241	TGA	2	6	699470	699475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361220
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12969	NC_022241	T	7	7	699549	699555	0 %	100 %	0 %	0 %	538361220
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12973	NC_022241	GA	3	6	699814	699819	50 %	0 %	50 %	0 %	538361220
12974	NC_022241	GTT	2	6	699839	699844	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361220
12975	NC_022241	CGG	2	6	699852	699857	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361220
12976	NC_022241	ACA	2	6	699901	699906	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361220
12977	NC_022241	TCA	2	6	699916	699921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361220
12978	NC_022241	GCAG	2	8	700142	700149	25 %	0 %	50 %	25 %	538361221
12979	NC_022241	CCG	2	6	700184	700189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361221
12980	NC_022241	ATC	2	6	700228	700233	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361221
12981	NC_022241	CTT	2	6	700235	700240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361221
12982	NC_022241	CAG	2	6	700248	700253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361221
12983	NC_022241	GCCTAC	2	12	700257	700268	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	538361221
12984	NC_022241	AAG	2	6	700309	700314	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361221
12985	NC_022241	TACGGG	2	12	700355	700366	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538361221
12986	NC_022241	GAA	2	6	700375	700380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361221
12987	NC_022241	CGT	2	6	700406	700411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361221
12988	NC_022241	CGC	2	6	700418	700423	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361221
12989	NC_022241	T	6	6	700457	700462	0 %	100 %	0 %	0 %	538361221
12990	NC_022241	CTG	2	6	700526	700531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361221
12991	NC_022241	GCG	2	6	700694	700699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361221
12992	NC_022241	GCC	2	6	700701	700706	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361221
12993	NC_022241	CGG	2	6	700736	700741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361221
12994	NC_022241	TTC	2	6	700829	700834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361221
12995	NC_022241	T	6	6	701170	701175	0 %	100 %	0 %	0 %	538361222
12996	NC_022241	GTT	2	6	701230	701235	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361222
12997	NC_022241	GCGG	2	8	701285	701292	0 %	0 %	75 %	25 %	538361222
12998	NC_022241	GCGCGG	2	12	701358	701369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361222
12999	NC_022241	ATT	2	6	701459	701464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361222
13000	NC_022241	CGG	2	6	701476	701481	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361222

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