MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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12002	NC_022241	CCG	2	6	647122	647127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361171
12003	NC_022241	GAT	2	6	647168	647173	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361171
12004	NC_022241	GGC	2	6	647174	647179	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361171
12005	NC_022241	GCCGC	2	10	647202	647211	0 %	0 %	40 %	60 %	538361171
12006	NC_022241	AG	3	6	647242	647247	50 %	0 %	50 %	0 %	538361171
12007	NC_022241	CAGG	2	8	647300	647307	25 %	0 %	50 %	25 %	538361171
12008	NC_022241	GCA	2	6	647319	647324	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361171
12009	NC_022241	ATC	2	6	647325	647330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361171
12010	NC_022241	GGC	2	6	647414	647419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361171
12011	NC_022241	CAT	2	6	647432	647437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361171
12012	NC_022241	ATC	2	6	647439	647444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361171
12013	NC_022241	CGC	3	9	647455	647463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361171
12014	NC_022241	CAA	2	6	647491	647496	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361171
12015	NC_022241	GC	3	6	647557	647562	0 %	0 %	50 %	50 %	538361171
12016	NC_022241	ATA	2	6	647565	647570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361171
12017	NC_022241	CCG	2	6	647583	647588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361171
12018	NC_022241	ATG	2	6	647622	647627	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361171
12019	NC_022241	GC	3	6	647630	647635	0 %	0 %	50 %	50 %	538361171
12020	NC_022241	ACG	2	6	647649	647654	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361171
12021	NC_022241	GAT	2	6	648075	648080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361172
12022	NC_022241	TTA	2	6	648098	648103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361172
12023	NC_022241	TGGC	2	8	648124	648131	0 %	25 %	50 %	25 %	538361172
12024	NC_022241	GCG	2	6	648148	648153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361172
12025	NC_022241	GGT	2	6	648161	648166	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361172
12026	NC_022241	GC	3	6	648250	648255	0 %	0 %	50 %	50 %	538361172
12027	NC_022241	ATG	2	6	648361	648366	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361172
12028	NC_022241	A	6	6	648419	648424	100 %	0 %	0 %	0 %	538361172
12029	NC_022241	CG	4	8	648486	648493	0 %	0 %	50 %	50 %	538361172
12030	NC_022241	AAC	2	6	648592	648597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361172
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12033	NC_022241	GCG	2	6	649104	649109	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361174
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12036	NC_022241	GTC	2	6	649239	649244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361174
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12040	NC_022241	TGA	2	6	649383	649388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361174
12041	NC_022241	GGC	2	6	649645	649650	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361175
12042	NC_022241	CGCGC	2	10	649727	649736	0 %	0 %	40 %	60 %	538361175
12043	NC_022241	GAA	2	6	649772	649777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361175
12044	NC_022241	ATA	3	9	649785	649793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361175
12045	NC_022241	GAC	2	6	649795	649800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361175
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12047	NC_022241	CGGG	2	8	649862	649869	0 %	0 %	75 %	25 %	538361175
12048	NC_022241	CG	3	6	649879	649884	0 %	0 %	50 %	50 %	538361175
12049	NC_022241	ATG	2	6	649905	649910	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361175
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12051	NC_022241	GCT	2	6	650119	650124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361175
12052	NC_022241	GGC	2	6	650125	650130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361175
12053	NC_022241	ACC	2	6	650144	650149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361175
12054	NC_022241	TAT	2	6	650203	650208	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361175
12055	NC_022241	TCG	2	6	650259	650264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361175
12056	NC_022241	GCA	2	6	650317	650322	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361175
12057	NC_022241	ACG	2	6	650323	650328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361175
12058	NC_022241	ATT	2	6	650344	650349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361175
12059	NC_022241	ATG	2	6	650350	650355	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361175
12060	NC_022241	CTG	2	6	650506	650511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361176
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12062	NC_022241	CTG	2	6	650533	650538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361176
12063	NC_022241	AAG	2	6	650548	650553	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361176
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12071	NC_022241	CGG	2	6	651173	651178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361177
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12085	NC_022241	GCT	2	6	652164	652169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361179
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12089	NC_022241	GGC	2	6	652313	652318	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361179
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12100	NC_022241	ATT	2	6	653224	653229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361180
12101	NC_022241	CTTC	2	8	653286	653293	0 %	50 %	0 %	50 %	538361180
12102	NC_022241	AGC	2	6	653397	653402	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361180
12103	NC_022241	TTTTC	2	10	653433	653442	0 %	80 %	0 %	20 %	538361180
12104	NC_022241	GC	3	6	653468	653473	0 %	0 %	50 %	50 %	538361180
12105	NC_022241	CAGC	2	8	653496	653503	25 %	0 %	25 %	50 %	538361180
12106	NC_022241	CAC	2	6	653509	653514	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361180
12107	NC_022241	CACG	2	8	653541	653548	25 %	0 %	25 %	50 %	538361180
12108	NC_022241	CGT	2	6	653558	653563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361180
12109	NC_022241	TCC	2	6	653620	653625	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361180
12110	NC_022241	AT	3	6	653664	653669	50 %	50 %	0 %	0 %	538361180
12111	NC_022241	CAAC	2	8	653715	653722	50 %	0 %	0 %	50 %	538361180
12112	NC_022241	TCA	2	6	653729	653734	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361180
12113	NC_022241	TTC	2	6	653975	653980	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361181
12114	NC_022241	TGC	2	6	654049	654054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361181
12115	NC_022241	ACC	2	6	654108	654113	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361181
12116	NC_022241	GTAA	2	8	654152	654159	50 %	25 %	25 %	0 %	538361181
12117	NC_022241	TTAAT	2	10	654333	654342	40 %	60 %	0 %	0 %	538361182
12118	NC_022241	GAA	2	6	654361	654366	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361182
12119	NC_022241	GCT	2	6	654405	654410	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361182
12120	NC_022241	ACC	2	6	654449	654454	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361182
12121	NC_022241	GCG	2	6	654468	654473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361182
12122	NC_022241	CAG	2	6	654667	654672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361182
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12124	NC_022241	GTCC	2	8	654704	654711	0 %	25 %	25 %	50 %	538361182
12125	NC_022241	CGG	2	6	654720	654725	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361182
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12132	NC_022241	GA	3	6	655134	655139	50 %	0 %	50 %	0 %	538361182
12133	NC_022241	TCA	2	6	655287	655292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361182
12134	NC_022241	TCG	2	6	655322	655327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361182
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12143	NC_022241	GCG	2	6	655932	655937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361183
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12145	NC_022241	CTGT	2	8	655996	656003	0 %	50 %	25 %	25 %	538361183
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12150	NC_022241	CGT	2	6	656231	656236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361183
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12154	NC_022241	CG	3	6	656336	656341	0 %	0 %	50 %	50 %	538361183
12155	NC_022241	ACG	2	6	656394	656399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361183
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12160	NC_022241	GCG	2	6	656695	656700	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361183
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12192	NC_022241	ATG	2	6	657987	657992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361185
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12197	NC_022241	GCCGT	2	10	658233	658242	0 %	20 %	40 %	40 %	538361185
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12203	NC_022241	CGAT	2	8	658614	658621	25 %	25 %	25 %	25 %	538361185
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12217	NC_022241	GCG	2	6	659089	659094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361185
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12219	NC_022241	TAG	2	6	659181	659186	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361185
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12222	NC_022241	ATA	2	6	659324	659329	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361185
12223	NC_022241	GCG	2	6	659330	659335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361185
12224	NC_022241	GC	3	6	659387	659392	0 %	0 %	50 %	50 %	538361185
12225	NC_022241	GTTT	2	8	659411	659418	0 %	75 %	25 %	0 %	538361185
12226	NC_022241	GC	3	6	659451	659456	0 %	0 %	50 %	50 %	538361185
12227	NC_022241	T	6	6	659459	659464	0 %	100 %	0 %	0 %	538361185
12228	NC_022241	GGC	2	6	659468	659473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361185
12229	NC_022241	TCG	3	9	659478	659486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361185
12230	NC_022241	CAT	2	6	659549	659554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361185
12231	NC_022241	GATA	2	8	659563	659570	50 %	25 %	25 %	0 %	538361185
12232	NC_022241	TTCG	2	8	659654	659661	0 %	50 %	25 %	25 %	538361185
12233	NC_022241	CAG	2	6	659729	659734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361185
12234	NC_022241	TCAC	2	8	659852	659859	25 %	25 %	0 %	50 %	538361186
12235	NC_022241	TGGT	2	8	659871	659878	0 %	50 %	50 %	0 %	538361186
12236	NC_022241	GCC	2	6	660008	660013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361186
12237	NC_022241	GCG	2	6	660073	660078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361186
12238	NC_022241	CGG	3	9	660127	660135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361186
12239	NC_022241	ACG	2	6	660242	660247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361186
12240	NC_022241	GGC	2	6	660352	660357	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361187
12241	NC_022241	TTC	2	6	660362	660367	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361187
12242	NC_022241	CGA	2	6	660400	660405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361187
12243	NC_022241	GCA	2	6	660445	660450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361187
12244	NC_022241	CG	4	8	660458	660465	0 %	0 %	50 %	50 %	538361187
12245	NC_022241	CAC	2	6	660473	660478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361187
12246	NC_022241	AAT	2	6	660524	660529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361187
12247	NC_022241	GAT	2	6	660572	660577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361187
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12249	NC_022241	TCA	2	6	660966	660971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361188
12250	NC_022241	GCC	2	6	660977	660982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361188
12251	NC_022241	GGC	2	6	661080	661085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361188
12252	NC_022241	CAG	2	6	661143	661148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361188
12253	NC_022241	GGC	2	6	661263	661268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361188
12254	NC_022241	GC	5	10	661401	661410	0 %	0 %	50 %	50 %	538361188
12255	NC_022241	GC	3	6	661690	661695	0 %	0 %	50 %	50 %	538361189
12256	NC_022241	CG	3	6	661803	661808	0 %	0 %	50 %	50 %	538361189
12257	NC_022241	ATT	2	6	661852	661857	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361189
12258	NC_022241	TCA	3	9	661883	661891	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361189
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12260	NC_022241	TCG	2	6	662039	662044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361189
12261	NC_022241	TGGC	2	8	662066	662073	0 %	25 %	50 %	25 %	538361189
12262	NC_022241	AAT	2	6	662139	662144	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361189
12263	NC_022241	CTG	2	6	662154	662159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361189
12264	NC_022241	TTA	2	6	662172	662177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361189
12265	NC_022241	TGC	2	6	662302	662307	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361189
12266	NC_022241	CGG	2	6	662374	662379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361189
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12268	NC_022241	GGC	2	6	662426	662431	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361189
12269	NC_022241	GAG	2	6	662496	662501	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361189
12270	NC_022241	CTG	2	6	662538	662543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361189
12271	NC_022241	CGGG	2	8	662555	662562	0 %	0 %	75 %	25 %	538361189
12272	NC_022241	TGT	2	6	662572	662577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361189
12273	NC_022241	CTG	2	6	662759	662764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361190
12274	NC_022241	TCG	2	6	662799	662804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361190
12275	NC_022241	CTG	2	6	662942	662947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361190
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12279	NC_022241	GCG	2	6	663082	663087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361190
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12282	NC_022241	GC	3	6	663223	663228	0 %	0 %	50 %	50 %	538361190
12283	NC_022241	GCG	2	6	663253	663258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361190
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12287	NC_022241	GC	3	6	663605	663610	0 %	0 %	50 %	50 %	538361191
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12291	NC_022241	GCG	2	6	663790	663795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361191
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12294	NC_022241	ATAGCA	2	12	663897	663908	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	538361191
12295	NC_022241	CAG	2	6	663909	663914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361191
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12301	NC_022241	GCTC	2	8	664112	664119	0 %	25 %	25 %	50 %	538361191
12302	NC_022241	TCAT	2	8	664135	664142	25 %	50 %	0 %	25 %	538361191
12303	NC_022241	GCA	2	6	664172	664177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361191
12304	NC_022241	GGCG	2	8	664457	664464	0 %	0 %	75 %	25 %	538361192
12305	NC_022241	CCG	2	6	664465	664470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361192
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12309	NC_022241	CCG	2	6	664513	664518	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361192
12310	NC_022241	CG	3	6	664517	664522	0 %	0 %	50 %	50 %	538361192
12311	NC_022241	GAA	2	6	664628	664633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361192
12312	NC_022241	GATAG	2	10	664655	664664	40 %	20 %	40 %	0 %	538361192
12313	NC_022241	CCG	2	6	664720	664725	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361192
12314	NC_022241	ATC	2	6	664899	664904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361192
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12318	NC_022241	GTG	2	6	665207	665212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361193
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12320	NC_022241	TCG	2	6	665231	665236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361193
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12325	NC_022241	ATC	2	6	665461	665466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361193
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12327	NC_022241	TAA	2	6	665595	665600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361193
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12336	NC_022241	TTCC	2	8	666072	666079	0 %	50 %	0 %	50 %	538361193
12337	NC_022241	CG	3	6	666101	666106	0 %	0 %	50 %	50 %	538361193
12338	NC_022241	GGT	2	6	666175	666180	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361193
12339	NC_022241	GAC	2	6	666229	666234	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361193
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12341	NC_022241	GC	3	6	666315	666320	0 %	0 %	50 %	50 %	538361193
12342	NC_022241	CGC	2	6	666421	666426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361193
12343	NC_022241	AGGCC	2	10	666432	666441	20 %	0 %	40 %	40 %	538361193
12344	NC_022241	CGG	2	6	666516	666521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361193
12345	NC_022241	GCC	2	6	666638	666643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361193
12346	NC_022241	T	6	6	666703	666708	0 %	100 %	0 %	0 %	538361193
12347	NC_022241	TTCGGC	2	12	666724	666735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361193
12348	NC_022241	TCG	2	6	666755	666760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361193
12349	NC_022241	CGC	2	6	666766	666771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361193
12350	NC_022241	GTT	2	6	666781	666786	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361193
12351	NC_022241	CGC	3	9	666787	666795	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361193
12352	NC_022241	CGG	2	6	666816	666821	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361193
12353	NC_022241	CGGG	2	8	666856	666863	0 %	0 %	75 %	25 %	538361193
12354	NC_022241	CAG	3	9	667076	667084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361193
12355	NC_022241	TCT	2	6	667149	667154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361193
12356	NC_022241	T	6	6	667168	667173	0 %	100 %	0 %	0 %	538361193
12357	NC_022241	GAA	2	6	667186	667191	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361193
12358	NC_022241	GTA	2	6	667207	667212	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361193
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12360	NC_022241	GTT	2	6	667324	667329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361193
12361	NC_022241	CCG	2	6	667335	667340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361193
12362	NC_022241	CCG	2	6	667347	667352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361193
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12368	NC_022241	CCG	2	6	668232	668237	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361195
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12463	NC_022241	AG	3	6	672664	672669	50 %	0 %	50 %	0 %	538361198
12464	NC_022241	TCT	2	6	672684	672689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361198
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12477	NC_022241	CT	3	6	673352	673357	0 %	50 %	0 %	50 %	538361199
12478	NC_022241	GC	3	6	673362	673367	0 %	0 %	50 %	50 %	538361199
12479	NC_022241	TCT	2	6	673368	673373	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361199
12480	NC_022241	GGC	2	6	673384	673389	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361199
12481	NC_022241	CATA	2	8	673425	673432	50 %	25 %	0 %	25 %	538361199
12482	NC_022241	CTGG	2	8	673447	673454	0 %	25 %	50 %	25 %	538361199
12483	NC_022241	TGC	2	6	673471	673476	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361199
12484	NC_022241	TCCT	2	8	673636	673643	0 %	50 %	0 %	50 %	538361199
12485	NC_022241	TAT	2	6	673719	673724	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361199
12486	NC_022241	GCC	2	6	673796	673801	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361199
12487	NC_022241	TGC	2	6	673802	673807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361199
12488	NC_022241	AG	3	6	673819	673824	50 %	0 %	50 %	0 %	538361199
12489	NC_022241	TA	3	6	673860	673865	50 %	50 %	0 %	0 %	538361199
12490	NC_022241	AT	4	8	673875	673882	50 %	50 %	0 %	0 %	538361199
12491	NC_022241	T	6	6	673971	673976	0 %	100 %	0 %	0 %	538361199
12492	NC_022241	TCG	2	6	674222	674227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361200
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12498	NC_022241	AATG	2	8	674489	674496	50 %	25 %	25 %	0 %	538361200
12499	NC_022241	TAT	2	6	674555	674560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361200
12500	NC_022241	TTA	2	6	674587	674592	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361200

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