MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10502	NC_022241	CGG	2	6	571220	571225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361098
10503	NC_022241	TCCGT	2	10	571351	571360	0 %	40 %	20 %	40 %	538361098
10504	NC_022241	GC	3	6	571387	571392	0 %	0 %	50 %	50 %	538361098
10505	NC_022241	CAACCG	2	12	571431	571442	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	538361098
10506	NC_022241	GGC	2	6	571474	571479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361098
10507	NC_022241	CAGCGC	2	12	571551	571562	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	538361098
10508	NC_022241	CGG	2	6	571644	571649	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361098
10509	NC_022241	GGTC	2	8	571653	571660	0 %	25 %	50 %	25 %	538361098
10510	NC_022241	CGCGT	2	10	571819	571828	0 %	20 %	40 %	40 %	538361098
10511	NC_022241	CAG	2	6	571875	571880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361098
10512	NC_022241	GC	3	6	571898	571903	0 %	0 %	50 %	50 %	538361098
10513	NC_022241	GCT	2	6	571912	571917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361098
10514	NC_022241	GGA	2	6	572136	572141	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361098
10515	NC_022241	TCCG	2	8	572183	572190	0 %	25 %	25 %	50 %	538361098
10516	NC_022241	AAT	2	6	572352	572357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361099
10517	NC_022241	GGT	2	6	572369	572374	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361099
10518	NC_022241	TACC	2	8	572444	572451	25 %	25 %	0 %	50 %	538361099
10519	NC_022241	GCA	2	6	572615	572620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361099
10520	NC_022241	TTAAA	2	10	572656	572665	60 %	40 %	0 %	0 %	538361099
10521	NC_022241	TTA	2	6	572680	572685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361099
10522	NC_022241	GAC	2	6	572729	572734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361099
10523	NC_022241	CGT	2	6	572860	572865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361099
10524	NC_022241	GGCGGG	2	12	572876	572887	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	538361099
10525	NC_022241	CGC	2	6	572908	572913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361099
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10528	NC_022241	TGA	2	6	573104	573109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361099
10529	NC_022241	CGC	3	9	573113	573121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361099
10530	NC_022241	CGG	2	6	573169	573174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361099
10531	NC_022241	GC	3	6	573189	573194	0 %	0 %	50 %	50 %	538361099
10532	NC_022241	AGG	2	6	573221	573226	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361099
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10540	NC_022241	AT	3	6	573863	573868	50 %	50 %	0 %	0 %	538361101
10541	NC_022241	GC	3	6	573878	573883	0 %	0 %	50 %	50 %	538361101
10542	NC_022241	GCA	2	6	573953	573958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361101
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10544	NC_022241	TTAC	2	8	574111	574118	25 %	50 %	0 %	25 %	538361101
10545	NC_022241	CGA	2	6	574173	574178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361101
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10547	NC_022241	TAAG	2	8	574223	574230	50 %	25 %	25 %	0 %	538361101
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10550	NC_022241	TTG	2	6	574427	574432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361101
10551	NC_022241	A	6	6	575033	575038	100 %	0 %	0 %	0 %	538361102
10552	NC_022241	GCT	2	6	575060	575065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361102
10553	NC_022241	GAA	2	6	575075	575080	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361102
10554	NC_022241	AGG	2	6	575104	575109	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538361102
10555	NC_022241	GTT	2	6	575117	575122	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361102
10556	NC_022241	GAT	2	6	575141	575146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361102
10557	NC_022241	ATC	2	6	575206	575211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361102
10558	NC_022241	CAGT	2	8	575215	575222	25 %	25 %	25 %	25 %	538361102
10559	NC_022241	GTC	2	6	575294	575299	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361102
10560	NC_022241	A	7	7	575310	575316	100 %	0 %	0 %	0 %	538361102
10561	NC_022241	CAG	2	6	575367	575372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361102
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10563	NC_022241	GC	3	6	575405	575410	0 %	0 %	50 %	50 %	538361102
10564	NC_022241	TGC	2	6	575523	575528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361102
10565	NC_022241	AGT	2	6	575549	575554	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361102
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10568	NC_022241	CGG	2	6	575719	575724	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361102
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10570	NC_022241	TGGC	2	8	575792	575799	0 %	25 %	50 %	25 %	538361103
10571	NC_022241	ATAA	2	8	575801	575808	75 %	25 %	0 %	0 %	538361103
10572	NC_022241	CTG	2	6	575886	575891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361104
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10574	NC_022241	GA	3	6	575962	575967	50 %	0 %	50 %	0 %	538361104
10575	NC_022241	ATGA	2	8	576008	576015	50 %	25 %	25 %	0 %	538361104
10576	NC_022241	TCCTT	2	10	576050	576059	0 %	60 %	0 %	40 %	538361104
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10580	NC_022241	CTG	2	6	576293	576298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361105
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10583	NC_022241	AGT	2	6	576457	576462	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361105
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10588	NC_022241	CAGC	2	8	576666	576673	25 %	0 %	25 %	50 %	538361105
10589	NC_022241	ATC	3	9	576683	576691	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361105
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10591	NC_022241	TCT	2	6	576726	576731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361105
10592	NC_022241	GGC	2	6	576732	576737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361105
10593	NC_022241	CTG	2	6	576752	576757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361105
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10597	NC_022241	ACAT	2	8	578236	578243	50 %	25 %	0 %	25 %	538361106
10598	NC_022241	TATT	2	8	578324	578331	25 %	75 %	0 %	0 %	538361106
10599	NC_022241	T	8	8	578346	578353	0 %	100 %	0 %	0 %	538361106
10600	NC_022241	TA	3	6	578359	578364	50 %	50 %	0 %	0 %	538361106
10601	NC_022241	A	6	6	578367	578372	100 %	0 %	0 %	0 %	538361106
10602	NC_022241	ACC	2	6	578418	578423	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361106
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10605	NC_022241	CTTC	2	8	578531	578538	0 %	50 %	0 %	50 %	538361106
10606	NC_022241	CAT	2	6	578547	578552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361106
10607	NC_022241	AT	3	6	578600	578605	50 %	50 %	0 %	0 %	538361106
10608	NC_022241	TTC	2	6	578629	578634	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361106
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10610	NC_022241	CAA	2	6	578661	578666	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361106
10611	NC_022241	T	6	6	578728	578733	0 %	100 %	0 %	0 %	538361106
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10621	NC_022241	A	6	6	579166	579171	100 %	0 %	0 %	0 %	538361106
10622	NC_022241	ATG	2	6	579180	579185	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361106
10623	NC_022241	AGA	2	6	579196	579201	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361106
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10625	NC_022241	A	7	7	579235	579241	100 %	0 %	0 %	0 %	538361106
10626	NC_022241	AAT	2	6	579251	579256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361106
10627	NC_022241	TAAC	2	8	579305	579312	50 %	25 %	0 %	25 %	538361106
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10629	NC_022241	A	8	8	579342	579349	100 %	0 %	0 %	0 %	538361106
10630	NC_022241	A	6	6	579386	579391	100 %	0 %	0 %	0 %	538361106
10631	NC_022241	A	6	6	579396	579401	100 %	0 %	0 %	0 %	538361106
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10633	NC_022241	AT	3	6	579484	579489	50 %	50 %	0 %	0 %	538361106
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10638	NC_022241	TCT	2	6	579556	579561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361106
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10646	NC_022241	T	6	6	580014	580019	0 %	100 %	0 %	0 %	538361106
10647	NC_022241	T	6	6	580047	580052	0 %	100 %	0 %	0 %	538361107
10648	NC_022241	AT	3	6	580075	580080	50 %	50 %	0 %	0 %	538361107
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10652	NC_022241	GCCA	2	8	580329	580336	25 %	0 %	25 %	50 %	538361107
10653	NC_022241	GC	5	10	580343	580352	0 %	0 %	50 %	50 %	538361107
10654	NC_022241	CCCAA	2	10	580377	580386	40 %	0 %	0 %	60 %	538361107
10655	NC_022241	TTAAT	2	10	580424	580433	40 %	60 %	0 %	0 %	538361107
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10671	NC_022241	GGGA	2	8	582300	582307	25 %	0 %	75 %	0 %	538361110
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10684	NC_022241	CTG	2	6	583239	583244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361111
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10730	NC_022241	CAC	2	6	585979	585984	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361114
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10734	NC_022241	GCC	2	6	586342	586347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361115
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10736	NC_022241	CAT	2	6	586460	586465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361115
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10738	NC_022241	GCC	2	6	586509	586514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361115
10739	NC_022241	CAT	2	6	586550	586555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361115
10740	NC_022241	TTTC	2	8	586567	586574	0 %	75 %	0 %	25 %	538361115
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10742	NC_022241	CTG	3	9	586694	586702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361115
10743	NC_022241	GTC	2	6	586760	586765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361115
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10745	NC_022241	CTG	3	9	586829	586837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361115
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10747	NC_022241	GGC	2	6	586871	586876	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361115
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10848	NC_022241	AT	3	6	591734	591739	50 %	50 %	0 %	0 %	538361119
10849	NC_022241	CAG	2	6	591837	591842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361119
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10851	NC_022241	ATA	2	6	591946	591951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361119
10852	NC_022241	CTG	2	6	591993	591998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361119
10853	NC_022241	GCC	2	6	592074	592079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361119
10854	NC_022241	ATG	2	6	592257	592262	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361119
10855	NC_022241	GACCG	2	10	592274	592283	20 %	0 %	40 %	40 %	538361119
10856	NC_022241	TGC	2	6	592285	592290	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361119
10857	NC_022241	TCAT	2	8	592426	592433	25 %	50 %	0 %	25 %	538361119
10858	NC_022241	ATTA	2	8	592446	592453	50 %	50 %	0 %	0 %	538361119
10859	NC_022241	GAT	2	6	592470	592475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361119
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10981	NC_022241	GCA	2	6	599269	599274	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361128
10982	NC_022241	ATC	2	6	599289	599294	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361128
10983	NC_022241	CGG	2	6	599297	599302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361128
10984	NC_022241	CGC	2	6	599317	599322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361128
10985	NC_022241	CGC	2	6	599335	599340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361128
10986	NC_022241	TGG	2	6	599458	599463	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361128
10987	NC_022241	GAT	2	6	599498	599503	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361128
10988	NC_022241	CG	4	8	599515	599522	0 %	0 %	50 %	50 %	538361128
10989	NC_022241	CGG	2	6	599545	599550	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361128
10990	NC_022241	TGG	2	6	599554	599559	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361128
10991	NC_022241	CAC	2	6	599597	599602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361128
10992	NC_022241	AGCGC	2	10	599622	599631	20 %	0 %	40 %	40 %	538361128
10993	NC_022241	GAAT	2	8	599703	599710	50 %	25 %	25 %	0 %	538361128
10994	NC_022241	CTT	2	6	599711	599716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361128
10995	NC_022241	TGG	2	6	599944	599949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361129
10996	NC_022241	TGG	2	6	600010	600015	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361129
10997	NC_022241	GAAAC	2	10	600029	600038	60 %	0 %	20 %	20 %	538361129
10998	NC_022241	AC	3	6	600037	600042	50 %	0 %	0 %	50 %	538361129
10999	NC_022241	ATC	3	9	600086	600094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361129
11000	NC_022241	TGC	2	6	600257	600262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361129

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