MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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10002	NC_022241	ATTT	2	8	545750	545757	25 %	75 %	0 %	0 %	538361073
10003	NC_022241	GTC	2	6	545835	545840	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361073
10004	NC_022241	TA	3	6	545845	545850	50 %	50 %	0 %	0 %	538361073
10005	NC_022241	GCAAC	2	10	545859	545868	40 %	0 %	20 %	40 %	538361073
10006	NC_022241	AG	3	6	545993	545998	50 %	0 %	50 %	0 %	538361074
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10008	NC_022241	TTA	2	6	546029	546034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
10009	NC_022241	ATGG	2	8	546085	546092	25 %	25 %	50 %	0 %	538361074
10010	NC_022241	CGG	2	6	546127	546132	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
10011	NC_022241	T	7	7	546133	546139	0 %	100 %	0 %	0 %	538361074
10012	NC_022241	ATT	2	6	546176	546181	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
10013	NC_022241	ATT	2	6	546190	546195	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
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10015	NC_022241	AATG	2	8	546214	546221	50 %	25 %	25 %	0 %	538361074
10016	NC_022241	GGCA	2	8	546226	546233	25 %	0 %	50 %	25 %	538361074
10017	NC_022241	GC	3	6	546288	546293	0 %	0 %	50 %	50 %	538361074
10018	NC_022241	ATT	2	6	546304	546309	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
10019	NC_022241	GCT	2	6	546430	546435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361074
10020	NC_022241	ATT	2	6	546479	546484	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
10021	NC_022241	GGT	2	6	546506	546511	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361074
10022	NC_022241	TAAA	2	8	546519	546526	75 %	25 %	0 %	0 %	538361074
10023	NC_022241	GGC	2	6	546566	546571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
10024	NC_022241	TGG	2	6	546669	546674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361074
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10027	NC_022241	TA	3	6	546794	546799	50 %	50 %	0 %	0 %	538361074
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10029	NC_022241	TATGG	2	10	546848	546857	20 %	40 %	40 %	0 %	538361074
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10032	NC_022241	GCG	2	6	546992	546997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
10033	NC_022241	TAT	2	6	547045	547050	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361074
10034	NC_022241	CGG	2	6	547120	547125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361074
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10041	NC_022241	A	6	6	547418	547423	100 %	0 %	0 %	0 %	538361074
10042	NC_022241	ATT	2	6	547529	547534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361075
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10045	NC_022241	GCG	3	9	547748	547756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361075
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10049	NC_022241	GC	3	6	548028	548033	0 %	0 %	50 %	50 %	538361075
10050	NC_022241	TCG	2	6	548185	548190	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361075
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10052	NC_022241	CG	5	10	548271	548280	0 %	0 %	50 %	50 %	538361075
10053	NC_022241	TCC	2	6	548470	548475	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361075
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10056	NC_022241	CAG	2	6	548695	548700	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361075
10057	NC_022241	AGTC	2	8	548740	548747	25 %	25 %	25 %	25 %	538361075
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10061	NC_022241	GCC	2	6	548836	548841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361075
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10087	NC_022241	CTG	2	6	549912	549917	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361076
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10089	NC_022241	CTTTA	2	10	550003	550012	20 %	60 %	0 %	20 %	538361076
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10091	NC_022241	CG	3	6	550049	550054	0 %	0 %	50 %	50 %	538361076
10092	NC_022241	T	7	7	550093	550099	0 %	100 %	0 %	0 %	538361076
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10098	NC_022241	GC	3	6	550354	550359	0 %	0 %	50 %	50 %	538361077
10099	NC_022241	TGTT	2	8	550362	550369	0 %	75 %	25 %	0 %	538361077
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10120	NC_022241	GCTG	2	8	551808	551815	0 %	25 %	50 %	25 %	538361078
10121	NC_022241	ACCA	2	8	551828	551835	50 %	0 %	0 %	50 %	538361078
10122	NC_022241	GCG	2	6	551863	551868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361078
10123	NC_022241	TA	3	6	551871	551876	50 %	50 %	0 %	0 %	538361078
10124	NC_022241	GCTG	2	8	551883	551890	0 %	25 %	50 %	25 %	538361078
10125	NC_022241	TCA	2	6	551916	551921	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361078
10126	NC_022241	CGC	2	6	552033	552038	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361078
10127	NC_022241	CTG	2	6	552046	552051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361078
10128	NC_022241	GCC	2	6	552055	552060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361078
10129	NC_022241	CGA	2	6	552087	552092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361078
10130	NC_022241	AAG	2	6	552093	552098	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361078
10131	NC_022241	AAT	2	6	552151	552156	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361078
10132	NC_022241	ATC	2	6	552229	552234	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361078
10133	NC_022241	GCA	2	6	552301	552306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361079
10134	NC_022241	CCG	2	6	552358	552363	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361079
10135	NC_022241	CG	3	6	552415	552420	0 %	0 %	50 %	50 %	538361079
10136	NC_022241	GTT	2	6	552475	552480	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538361079
10137	NC_022241	CA	3	6	552487	552492	50 %	0 %	0 %	50 %	538361079
10138	NC_022241	TCCA	2	8	552543	552550	25 %	25 %	0 %	50 %	538361079
10139	NC_022241	ATCGAT	2	12	552554	552565	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	538361079
10140	NC_022241	GC	3	6	552591	552596	0 %	0 %	50 %	50 %	538361079
10141	NC_022241	GACT	2	8	552768	552775	25 %	25 %	25 %	25 %	538361079
10142	NC_022241	CGA	2	6	552807	552812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361079
10143	NC_022241	CGA	2	6	552880	552885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361079
10144	NC_022241	GAC	2	6	552893	552898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361079
10145	NC_022241	CAA	2	6	552952	552957	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361079
10146	NC_022241	AGCG	2	8	552980	552987	25 %	0 %	50 %	25 %	538361079
10147	NC_022241	GCG	2	6	552990	552995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361079
10148	NC_022241	TGC	2	6	553099	553104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361079
10149	NC_022241	A	6	6	553108	553113	100 %	0 %	0 %	0 %	538361079
10150	NC_022241	CTT	2	6	553132	553137	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361079
10151	NC_022241	GCG	2	6	553171	553176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361079
10152	NC_022241	GCCA	2	8	553206	553213	25 %	0 %	25 %	50 %	538361079
10153	NC_022241	GGC	2	6	553214	553219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361079
10154	NC_022241	GC	3	6	553222	553227	0 %	0 %	50 %	50 %	538361079
10155	NC_022241	GCC	2	6	553247	553252	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361079
10156	NC_022241	GAC	2	6	553256	553261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361079
10157	NC_022241	TG	3	6	553305	553310	0 %	50 %	50 %	0 %	538361079
10158	NC_022241	GGC	2	6	553318	553323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361079
10159	NC_022241	TCA	2	6	553341	553346	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361079
10160	NC_022241	CTG	3	9	553388	553396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361079
10161	NC_022241	AG	3	6	553463	553468	50 %	0 %	50 %	0 %	538361079
10162	NC_022241	TCT	2	6	553482	553487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361079
10163	NC_022241	AAT	2	6	553530	553535	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361080
10164	NC_022241	T	6	6	553551	553556	0 %	100 %	0 %	0 %	538361080
10165	NC_022241	ATC	2	6	553607	553612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361080
10166	NC_022241	ATCCTG	2	12	553655	553666	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538361080
10167	NC_022241	ATA	2	6	553673	553678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361080
10168	NC_022241	GGGC	2	8	553696	553703	0 %	0 %	75 %	25 %	538361080
10169	NC_022241	AAT	2	6	553749	553754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361080
10170	NC_022241	GAA	2	6	553761	553766	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361080
10171	NC_022241	GGC	2	6	553846	553851	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361080
10172	NC_022241	CAG	2	6	553865	553870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361080
10173	NC_022241	ATC	4	12	553890	553901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361080
10174	NC_022241	GCG	2	6	553923	553928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361080
10175	NC_022241	TAA	2	6	553931	553936	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361080
10176	NC_022241	GC	3	6	553966	553971	0 %	0 %	50 %	50 %	538361080
10177	NC_022241	GGT	2	6	554051	554056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361080
10178	NC_022241	ATG	2	6	554073	554078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361080
10179	NC_022241	TCG	2	6	554079	554084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361080
10180	NC_022241	CCGCC	2	10	554134	554143	0 %	0 %	20 %	80 %	538361080
10181	NC_022241	AGAC	2	8	554177	554184	50 %	0 %	25 %	25 %	538361080
10182	NC_022241	AGC	2	6	554201	554206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361080
10183	NC_022241	T	8	8	554274	554281	0 %	100 %	0 %	0 %	538361080
10184	NC_022241	GCA	2	6	554331	554336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361080
10185	NC_022241	GCC	2	6	554405	554410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361080
10186	NC_022241	TTCG	2	8	554419	554426	0 %	50 %	25 %	25 %	538361080
10187	NC_022241	ATA	2	6	554429	554434	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361080
10188	NC_022241	CGA	2	6	554497	554502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361080
10189	NC_022241	GGC	2	6	554504	554509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361080
10190	NC_022241	A	6	6	554918	554923	100 %	0 %	0 %	0 %	538361081
10191	NC_022241	ATT	2	6	554954	554959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361081
10192	NC_022241	TGAG	2	8	554970	554977	25 %	25 %	50 %	0 %	538361081
10193	NC_022241	TGA	2	6	554989	554994	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361081
10194	NC_022241	ATG	2	6	555005	555010	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361081
10195	NC_022241	GCT	2	6	555031	555036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361081
10196	NC_022241	GAA	2	6	555155	555160	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538361081
10197	NC_022241	GCA	2	6	555166	555171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361081
10198	NC_022241	AGC	2	6	555185	555190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361081
10199	NC_022241	GCG	2	6	555287	555292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361081
10200	NC_022241	TCGT	2	8	555316	555323	0 %	50 %	25 %	25 %	538361081
10201	NC_022241	TGA	2	6	555330	555335	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361081
10202	NC_022241	TCT	2	6	555336	555341	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361081
10203	NC_022241	CTG	2	6	555401	555406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361081
10204	NC_022241	CGC	2	6	555447	555452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361081
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10206	NC_022241	GC	3	6	555615	555620	0 %	0 %	50 %	50 %	538361081
10207	NC_022241	TCC	2	6	555767	555772	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538361081
10208	NC_022241	GCC	2	6	555821	555826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361081
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10210	NC_022241	CGG	2	6	555910	555915	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361081
10211	NC_022241	GGC	2	6	555922	555927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361081
10212	NC_022241	GCG	2	6	555932	555937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361081
10213	NC_022241	CTG	2	6	555941	555946	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361081
10214	NC_022241	ATG	2	6	555992	555997	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361081
10215	NC_022241	CCA	2	6	556012	556017	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538361081
10216	NC_022241	GAT	2	6	556066	556071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538361081
10217	NC_022241	GC	3	6	556110	556115	0 %	0 %	50 %	50 %	538361081
10218	NC_022241	TTA	2	6	556133	556138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538361081
10219	NC_022241	CGT	2	6	556144	556149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361081
10220	NC_022241	CCG	2	6	556167	556172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361081
10221	NC_022241	CGC	2	6	556177	556182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361081
10222	NC_022241	ACGC	2	8	556215	556222	25 %	0 %	25 %	50 %	538361081
10223	NC_022241	CGGAA	2	10	556261	556270	40 %	0 %	40 %	20 %	538361081
10224	NC_022241	CAA	2	6	556292	556297	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361081
10225	NC_022241	CGC	2	6	556300	556305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361081
10226	NC_022241	TTCCC	2	10	556336	556345	0 %	40 %	0 %	60 %	538361081
10227	NC_022241	CT	4	8	556383	556390	0 %	50 %	0 %	50 %	538361081
10228	NC_022241	CATC	2	8	556397	556404	25 %	25 %	0 %	50 %	538361081
10229	NC_022241	C	6	6	556407	556412	0 %	0 %	0 %	100 %	538361081
10230	NC_022241	GCGGTG	2	12	556424	556435	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	538361081
10231	NC_022241	GTG	2	6	556490	556495	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361081
10232	NC_022241	TAA	2	6	556525	556530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361081
10233	NC_022241	A	6	6	556529	556534	100 %	0 %	0 %	0 %	538361081
10234	NC_022241	TCG	2	6	556621	556626	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538361082
10235	NC_022241	CTGG	2	8	556639	556646	0 %	25 %	50 %	25 %	538361082
10236	NC_022241	CTT	2	6	556659	556664	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361082
10237	NC_022241	ATTA	2	8	556666	556673	50 %	50 %	0 %	0 %	538361082
10238	NC_022241	TCAA	2	8	556680	556687	50 %	25 %	0 %	25 %	538361082
10239	NC_022241	CTT	2	6	556697	556702	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538361082
10240	NC_022241	CCG	2	6	556712	556717	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538361082
10241	NC_022241	GC	3	6	556803	556808	0 %	0 %	50 %	50 %	538361082
10242	NC_022241	CG	3	6	556937	556942	0 %	0 %	50 %	50 %	538361082
10243	NC_022241	GCG	2	6	557054	557059	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361082
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10354	NC_022241	CG	4	8	563173	563180	0 %	0 %	50 %	50 %	538361089
10355	NC_022241	CGAGC	2	10	563245	563254	20 %	0 %	40 %	40 %	538361089
10356	NC_022241	CGG	3	9	563347	563355	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361089
10357	NC_022241	GC	3	6	563406	563411	0 %	0 %	50 %	50 %	538361089
10358	NC_022241	ACT	2	6	563430	563435	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361089
10359	NC_022241	ATGGTG	2	12	563450	563461	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	538361089
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10362	NC_022241	TAC	2	6	563522	563527	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361089
10363	NC_022241	GC	4	8	563609	563616	0 %	0 %	50 %	50 %	538361089
10364	NC_022241	CGG	2	6	563670	563675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361089
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10370	NC_022241	GCG	3	9	563972	563980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361089
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10393	NC_022241	T	6	6	565036	565041	0 %	100 %	0 %	0 %	538361091
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10473	NC_022241	GGCG	2	8	569850	569857	0 %	0 %	75 %	25 %	538361098
10474	NC_022241	CGG	2	6	569880	569885	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361098
10475	NC_022241	GC	3	6	570077	570082	0 %	0 %	50 %	50 %	538361098
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10477	NC_022241	ATTA	2	8	570133	570140	50 %	50 %	0 %	0 %	538361098
10478	NC_022241	ACAG	2	8	570163	570170	50 %	0 %	25 %	25 %	538361098
10479	NC_022241	T	6	6	570180	570185	0 %	100 %	0 %	0 %	538361098
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10481	NC_022241	TAA	2	6	570228	570233	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538361098
10482	NC_022241	AAC	2	6	570283	570288	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361098
10483	NC_022241	GC	3	6	570306	570311	0 %	0 %	50 %	50 %	538361098
10484	NC_022241	CAT	2	6	570312	570317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538361098
10485	NC_022241	CGG	2	6	570473	570478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361098
10486	NC_022241	GCG	2	6	570575	570580	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361098
10487	NC_022241	CAA	2	6	570616	570621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538361098
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10489	NC_022241	CAG	2	6	570718	570723	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538361098
10490	NC_022241	GCCT	2	8	570761	570768	0 %	25 %	25 %	50 %	538361098
10491	NC_022241	CGG	2	6	570786	570791	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538361098
10492	NC_022241	TGG	2	6	570821	570826	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538361098
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10499	NC_022241	GACG	2	8	571072	571079	25 %	0 %	50 %	25 %	538361098
10500	NC_022241	A	6	6	571129	571134	100 %	0 %	0 %	0 %	538361098

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