MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
85001	NC_022241	TAC	2	6	4659391	4659396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365162
85002	NC_022241	GCAA	2	8	4659515	4659522	50 %	0 %	25 %	25 %	538365162
85003	NC_022241	CGG	2	6	4659608	4659613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365162
85004	NC_022241	CGCA	2	8	4659678	4659685	25 %	0 %	25 %	50 %	538365162
85005	NC_022241	CGCC	2	8	4659741	4659748	0 %	0 %	25 %	75 %	538365162
85006	NC_022241	TGA	2	6	4659770	4659775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365162
85007	NC_022241	GCG	2	6	4659933	4659938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365162
85008	NC_022241	TCG	2	6	4659966	4659971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365162
85009	NC_022241	GAAAGA	2	12	4660011	4660022	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538365162
85010	NC_022241	GC	3	6	4660264	4660269	0 %	0 %	50 %	50 %	538365162
85011	NC_022241	GTA	2	6	4660298	4660303	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365162
85012	NC_022241	GC	3	6	4660324	4660329	0 %	0 %	50 %	50 %	538365162
85013	NC_022241	TGG	2	6	4660348	4660353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365162
85014	NC_022241	CGA	2	6	4660370	4660375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365162
85015	NC_022241	ATC	2	6	4660394	4660399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365162
85016	NC_022241	GGA	2	6	4660401	4660406	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538365162
85017	NC_022241	CTG	2	6	4660624	4660629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365162
85018	NC_022241	CAACAT	2	12	4660641	4660652	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	538365162
85019	NC_022241	CAG	2	6	4660681	4660686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365162
85020	NC_022241	TAA	2	6	4660692	4660697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365162
85021	NC_022241	CGG	2	6	4660712	4660717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365162
85022	NC_022241	GCCGG	2	10	4660726	4660735	0 %	0 %	60 %	40 %	538365162
85023	NC_022241	CG	3	6	4660817	4660822	0 %	0 %	50 %	50 %	538365162
85024	NC_022241	AAC	2	6	4661018	4661023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538365163
85025	NC_022241	ATCTGC	2	12	4661078	4661089	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538365163
85026	NC_022241	TTA	2	6	4661092	4661097	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365163
85027	NC_022241	CG	3	6	4661138	4661143	0 %	0 %	50 %	50 %	538365163
85028	NC_022241	ATT	2	6	4661149	4661154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365163
85029	NC_022241	GAG	2	6	4661155	4661160	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538365163
85030	NC_022241	TGC	2	6	4661162	4661167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365163
85031	NC_022241	GGGC	2	8	4661207	4661214	0 %	0 %	75 %	25 %	538365163
85032	NC_022241	CCA	2	6	4661219	4661224	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538365163
85033	NC_022241	CG	3	6	4661228	4661233	0 %	0 %	50 %	50 %	538365163
85034	NC_022241	CTG	2	6	4661290	4661295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365163
85035	NC_022241	AAT	2	6	4661404	4661409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365164
85036	NC_022241	GTA	2	6	4661460	4661465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365164
85037	NC_022241	CGG	2	6	4661489	4661494	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365164
85038	NC_022241	CGG	2	6	4661600	4661605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365164
85039	NC_022241	GCAGCG	2	12	4661606	4661617	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538365164
85040	NC_022241	ATCA	2	8	4661652	4661659	50 %	25 %	0 %	25 %	538365164
85041	NC_022241	GCT	2	6	4661792	4661797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365164
85042	NC_022241	CGC	2	6	4661804	4661809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365164
85043	NC_022241	CGACGG	2	12	4661813	4661824	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538365164
85044	NC_022241	TGG	2	6	4661897	4661902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365164
85045	NC_022241	AGC	2	6	4662070	4662075	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365165
85046	NC_022241	ATC	2	6	4662123	4662128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365165
85047	NC_022241	AGC	2	6	4662129	4662134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365165
85048	NC_022241	CGG	2	6	4662157	4662162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365165
85049	NC_022241	GAA	3	9	4662264	4662272	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538365165
85050	NC_022241	CGT	2	6	4662282	4662287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365165
85051	NC_022241	CGG	2	6	4662323	4662328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365165
85052	NC_022241	GTCA	2	8	4662414	4662421	25 %	25 %	25 %	25 %	538365165
85053	NC_022241	TGGC	2	8	4662537	4662544	0 %	25 %	50 %	25 %	538365165
85054	NC_022241	TGGG	2	8	4662548	4662555	0 %	25 %	75 %	0 %	538365165
85055	NC_022241	CGCAG	2	10	4662643	4662652	20 %	0 %	40 %	40 %	538365166
85056	NC_022241	TCT	2	6	4662681	4662686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538365166
85057	NC_022241	GTA	2	6	4662692	4662697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365166
85058	NC_022241	ACG	2	6	4662719	4662724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365166
85059	NC_022241	GGT	2	6	4662887	4662892	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365166
85060	NC_022241	GCG	2	6	4663075	4663080	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365166
85061	NC_022241	GGCG	2	8	4663137	4663144	0 %	0 %	75 %	25 %	538365166
85062	NC_022241	GAG	2	6	4663167	4663172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538365166
85063	NC_022241	CGA	2	6	4663173	4663178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365166
85064	NC_022241	GC	3	6	4663215	4663220	0 %	0 %	50 %	50 %	538365166
85065	NC_022241	CG	3	6	4663275	4663280	0 %	0 %	50 %	50 %	538365166
85066	NC_022241	CTG	2	6	4663297	4663302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365166
85067	NC_022241	ACG	2	6	4663313	4663318	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365166
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85069	NC_022241	CCAG	2	8	4663444	4663451	25 %	0 %	25 %	50 %	538365166
85070	NC_022241	TGC	2	6	4663735	4663740	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365167
85071	NC_022241	CG	3	6	4663755	4663760	0 %	0 %	50 %	50 %	538365167
85072	NC_022241	GTG	2	6	4663818	4663823	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365167
85073	NC_022241	ACGTG	2	10	4663852	4663861	20 %	20 %	40 %	20 %	538365167
85074	NC_022241	GGC	2	6	4663884	4663889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365167
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85076	NC_022241	CAG	2	6	4663944	4663949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365167
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85078	NC_022241	A	6	6	4664013	4664018	100 %	0 %	0 %	0 %	538365167
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85080	NC_022241	AGT	2	6	4664108	4664113	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365167
85081	NC_022241	GAA	2	6	4664126	4664131	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538365167
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85084	NC_022241	GAT	2	6	4664478	4664483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365168
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85088	NC_022241	GGT	2	6	4664573	4664578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365168
85089	NC_022241	CGG	2	6	4664608	4664613	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365168
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85095	NC_022241	CG	3	6	4664802	4664807	0 %	0 %	50 %	50 %	538365168
85096	NC_022241	TC	3	6	4664819	4664824	0 %	50 %	0 %	50 %	538365168
85097	NC_022241	TGGGA	2	10	4664843	4664852	20 %	20 %	60 %	0 %	538365168
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85100	NC_022241	GTCGCC	2	12	4664915	4664926	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	538365169
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85102	NC_022241	CG	3	6	4664978	4664983	0 %	0 %	50 %	50 %	538365169
85103	NC_022241	GCT	2	6	4665013	4665018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365169
85104	NC_022241	GGC	2	6	4665019	4665024	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365169
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85113	NC_022241	CCGC	2	8	4665541	4665548	0 %	0 %	25 %	75 %	538365169
85114	NC_022241	GCA	2	6	4665567	4665572	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365169
85115	NC_022241	GGC	2	6	4665685	4665690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365169
85116	NC_022241	CGCGG	2	10	4665695	4665704	0 %	0 %	60 %	40 %	538365169
85117	NC_022241	CCGC	2	8	4665725	4665732	0 %	0 %	25 %	75 %	538365169
85118	NC_022241	CTG	2	6	4665803	4665808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365169
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85219	NC_022241	ATTG	2	8	4672607	4672614	25 %	50 %	25 %	0 %	538365174
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85222	NC_022241	T	6	6	4672729	4672734	0 %	100 %	0 %	0 %	538365174
85223	NC_022241	GGC	2	6	4672878	4672883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365175
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85225	NC_022241	ATC	2	6	4673049	4673054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365175
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85228	NC_022241	TTA	2	6	4673335	4673340	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365175
85229	NC_022241	TA	3	6	4673738	4673743	50 %	50 %	0 %	0 %	538365176
85230	NC_022241	CTG	2	6	4673804	4673809	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365176
85231	NC_022241	TCA	2	6	4673985	4673990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365176
85232	NC_022241	ATA	2	6	4674023	4674028	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365176
85233	NC_022241	GGT	2	6	4674035	4674040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365176
85234	NC_022241	A	6	6	4674050	4674055	100 %	0 %	0 %	0 %	538365176
85235	NC_022241	TCT	2	6	4674069	4674074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538365176
85236	NC_022241	GATT	2	8	4674201	4674208	25 %	50 %	25 %	0 %	538365176
85237	NC_022241	T	7	7	4674303	4674309	0 %	100 %	0 %	0 %	538365176
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85240	NC_022241	TCA	2	6	4674817	4674822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365177
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85244	NC_022241	AGC	2	6	4675030	4675035	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365177
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85252	NC_022241	CG	3	6	4675534	4675539	0 %	0 %	50 %	50 %	538365178
85253	NC_022241	ACG	2	6	4675642	4675647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365178
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85255	NC_022241	ATC	2	6	4675741	4675746	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365178
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85259	NC_022241	ATT	2	6	4676832	4676837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365179
85260	NC_022241	ATA	2	6	4676839	4676844	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365179
85261	NC_022241	CGA	2	6	4676899	4676904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365179
85262	NC_022241	TAC	2	6	4676931	4676936	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365179
85263	NC_022241	TTA	2	6	4676961	4676966	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365179
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85265	NC_022241	GGC	2	6	4677077	4677082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365179
85266	NC_022241	TGA	2	6	4677179	4677184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365179
85267	NC_022241	CG	4	8	4677204	4677211	0 %	0 %	50 %	50 %	538365179
85268	NC_022241	ACA	2	6	4677272	4677277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538365179
85269	NC_022241	CTG	2	6	4677288	4677293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365179
85270	NC_022241	A	8	8	4677340	4677347	100 %	0 %	0 %	0 %	538365179

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