MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
83001	NC_022241	CCG	2	6	4545978	4545983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365050
83002	NC_022241	CGTC	2	8	4545984	4545991	0 %	25 %	25 %	50 %	538365050
83003	NC_022241	GCG	2	6	4546180	4546185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365050
83004	NC_022241	CCGCG	2	10	4546213	4546222	0 %	0 %	40 %	60 %	538365050
83005	NC_022241	CGC	2	6	4546240	4546245	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365050
83006	NC_022241	TAAT	2	8	4546266	4546273	50 %	50 %	0 %	0 %	538365050
83007	NC_022241	TCG	2	6	4546278	4546283	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365050
83008	NC_022241	ATT	2	6	4546346	4546351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365050
83009	NC_022241	TA	3	6	4546402	4546407	50 %	50 %	0 %	0 %	538365050
83010	NC_022241	CAG	2	6	4546410	4546415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365050
83011	NC_022241	ATA	2	6	4546455	4546460	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365050
83012	NC_022241	ACC	2	6	4546485	4546490	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538365050
83013	NC_022241	T	6	6	4546494	4546499	0 %	100 %	0 %	0 %	538365050
83014	NC_022241	CCG	2	6	4546530	4546535	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365050
83015	NC_022241	GCCA	2	8	4546572	4546579	25 %	0 %	25 %	50 %	538365050
83016	NC_022241	GC	3	6	4546755	4546760	0 %	0 %	50 %	50 %	538365050
83017	NC_022241	ATA	2	6	4546768	4546773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538365050
83018	NC_022241	CAT	2	6	4546892	4546897	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365050
83019	NC_022241	TGA	2	6	4547020	4547025	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365051
83020	NC_022241	ATCA	2	8	4547033	4547040	50 %	25 %	0 %	25 %	538365051
83021	NC_022241	CTTA	2	8	4547056	4547063	25 %	50 %	0 %	25 %	538365051
83022	NC_022241	AT	3	6	4547064	4547069	50 %	50 %	0 %	0 %	538365051
83023	NC_022241	A	6	6	4547090	4547095	100 %	0 %	0 %	0 %	538365051
83024	NC_022241	TAC	2	6	4547116	4547121	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365051
83025	NC_022241	T	7	7	4547141	4547147	0 %	100 %	0 %	0 %	538365051
83026	NC_022241	ATT	2	6	4547155	4547160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365051
83027	NC_022241	TGTT	2	8	4547161	4547168	0 %	75 %	25 %	0 %	538365051
83028	NC_022241	GAT	2	6	4547569	4547574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365052
83029	NC_022241	CGCAG	2	10	4547744	4547753	20 %	0 %	40 %	40 %	538365052
83030	NC_022241	CGC	2	6	4547835	4547840	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365052
83031	NC_022241	CTGG	2	8	4547848	4547855	0 %	25 %	50 %	25 %	538365052
83032	NC_022241	CGA	2	6	4547880	4547885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365052
83033	NC_022241	CGA	2	6	4547890	4547895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365052
83034	NC_022241	CGT	2	6	4547902	4547907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365052
83035	NC_022241	ATT	2	6	4548095	4548100	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365053
83036	NC_022241	TCA	2	6	4548154	4548159	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365053
83037	NC_022241	TCG	2	6	4548190	4548195	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365053
83038	NC_022241	T	7	7	4548236	4548242	0 %	100 %	0 %	0 %	538365053
83039	NC_022241	TCA	2	6	4548259	4548264	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365053
83040	NC_022241	GCAG	2	8	4548271	4548278	25 %	0 %	50 %	25 %	538365053
83041	NC_022241	CAT	2	6	4548318	4548323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365053
83042	NC_022241	GCA	2	6	4548347	4548352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365053
83043	NC_022241	GCC	2	6	4548468	4548473	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365053
83044	NC_022241	CAG	2	6	4548523	4548528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365053
83045	NC_022241	CGG	2	6	4548569	4548574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365053
83046	NC_022241	TTA	2	6	4548598	4548603	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365053
83047	NC_022241	CG	3	6	4548604	4548609	0 %	0 %	50 %	50 %	538365053
83048	NC_022241	CAGC	2	8	4548746	4548753	25 %	0 %	25 %	50 %	538365053
83049	NC_022241	CGA	2	6	4548758	4548763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365053
83050	NC_022241	CG	3	6	4548881	4548886	0 %	0 %	50 %	50 %	538365053
83051	NC_022241	CCA	2	6	4548968	4548973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538365053
83052	NC_022241	TTC	2	6	4548981	4548986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538365053
83053	NC_022241	GGC	2	6	4549017	4549022	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365053
83054	NC_022241	A	6	6	4549072	4549077	100 %	0 %	0 %	0 %	538365053
83055	NC_022241	AGC	2	6	4549291	4549296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365054
83056	NC_022241	GAA	2	6	4549299	4549304	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538365054
83057	NC_022241	ATT	2	6	4549314	4549319	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365054
83058	NC_022241	TGGAAG	2	12	4549462	4549473	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	538365054
83059	NC_022241	TTG	2	6	4549490	4549495	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538365054
83060	NC_022241	TGA	2	6	4549555	4549560	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365054
83061	NC_022241	ATG	2	6	4549576	4549581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365054
83062	NC_022241	ACG	2	6	4549588	4549593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365054
83063	NC_022241	TGA	2	6	4549634	4549639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365054
83064	NC_022241	CGA	2	6	4549640	4549645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365054
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83066	NC_022241	GCGT	2	8	4549669	4549676	0 %	25 %	50 %	25 %	538365054
83067	NC_022241	CT	3	6	4549760	4549765	0 %	50 %	0 %	50 %	538365055
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83069	NC_022241	GCT	2	6	4549939	4549944	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365055
83070	NC_022241	GCCGGA	2	12	4549987	4549998	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538365055
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83074	NC_022241	CTGG	2	8	4550299	4550306	0 %	25 %	50 %	25 %	538365055
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83079	NC_022241	GC	3	6	4550411	4550416	0 %	0 %	50 %	50 %	538365055
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83083	NC_022241	GGCA	2	8	4550642	4550649	25 %	0 %	50 %	25 %	538365056
83084	NC_022241	ACTC	2	8	4550656	4550663	25 %	25 %	0 %	50 %	538365056
83085	NC_022241	TACT	2	8	4550737	4550744	25 %	50 %	0 %	25 %	538365057
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83105	NC_022241	A	6	6	4551552	4551557	100 %	0 %	0 %	0 %	538365058
83106	NC_022241	T	6	6	4551562	4551567	0 %	100 %	0 %	0 %	538365058
83107	NC_022241	CGC	4	12	4551610	4551621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538365058
83108	NC_022241	CCA	2	6	4551622	4551627	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538365058
83109	NC_022241	CA	3	6	4551626	4551631	50 %	0 %	0 %	50 %	538365058
83110	NC_022241	ACC	2	6	4551645	4551650	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538365058
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83113	NC_022241	GGCGA	2	10	4551819	4551828	20 %	0 %	60 %	20 %	538365058
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83230	NC_022241	CGGA	2	8	4557531	4557538	25 %	0 %	50 %	25 %	538365062
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83343	NC_022241	GA	3	6	4563923	4563928	50 %	0 %	50 %	0 %	538365067
83344	NC_022241	TTAT	2	8	4564021	4564028	25 %	75 %	0 %	0 %	538365067
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83463	NC_022241	CT	3	6	4571934	4571939	0 %	50 %	0 %	50 %	538365074
83464	NC_022241	TCA	2	6	4571955	4571960	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365074
83465	NC_022241	TTA	2	6	4572024	4572029	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538365074
83466	NC_022241	CTC	2	6	4572130	4572135	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538365074
83467	NC_022241	CAT	4	12	4573017	4573028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365075
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83469	NC_022241	TCT	2	6	4573067	4573072	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538365075
83470	NC_022241	TGT	2	6	4573114	4573119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538365075
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83475	NC_022241	T	7	7	4573662	4573668	0 %	100 %	0 %	0 %	538365075
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83480	NC_022241	GCG	2	6	4574389	4574394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538365076
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83483	NC_022241	TCG	2	6	4574702	4574707	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365076
83484	NC_022241	CGT	2	6	4574721	4574726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365076
83485	NC_022241	GTT	2	6	4574772	4574777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538365076
83486	NC_022241	TG	3	6	4574783	4574788	0 %	50 %	50 %	0 %	538365076
83487	NC_022241	TTCGCT	2	12	4574965	4574976	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	538365076
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83490	NC_022241	TCA	2	6	4575164	4575169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365076
83491	NC_022241	GGT	2	6	4575202	4575207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365076
83492	NC_022241	CAG	2	6	4575283	4575288	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365076
83493	NC_022241	CAA	2	6	4575381	4575386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538365076
83494	NC_022241	TGA	2	6	4575426	4575431	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538365076
83495	NC_022241	CAG	2	6	4575444	4575449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538365076
83496	NC_022241	TCA	2	6	4575477	4575482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538365076
83497	NC_022241	GGT	2	6	4575507	4575512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538365076
83498	NC_022241	CTG	2	6	4575526	4575531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365076
83499	NC_022241	CTG	2	6	4575565	4575570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538365076
83500	NC_022241	GATG	2	8	4575583	4575590	25 %	25 %	50 %	0 %	538365076

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