MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Bovismorbificans str. 3114 complete genome

Total Repeats: 85270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
74001	NC_022241	GC	3	6	4046587	4046592	0 %	0 %	50 %	50 %	538364569
74002	NC_022241	CTATCG	2	12	4046650	4046661	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	538364569
74003	NC_022241	CAT	2	6	4046720	4046725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364569
74004	NC_022241	CTG	2	6	4046736	4046741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364569
74005	NC_022241	TTA	2	6	4046775	4046780	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364569
74006	NC_022241	TGG	2	6	4046851	4046856	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538364569
74007	NC_022241	ATA	2	6	4046884	4046889	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538364569
74008	NC_022241	TTC	2	6	4046925	4046930	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538364569
74009	NC_022241	GC	3	6	4046979	4046984	0 %	0 %	50 %	50 %	538364569
74010	NC_022241	TGC	2	6	4047007	4047012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364569
74011	NC_022241	CGGG	2	8	4047049	4047056	0 %	0 %	75 %	25 %	538364569
74012	NC_022241	G	6	6	4047054	4047059	0 %	0 %	100 %	0 %	538364569
74013	NC_022241	TGT	3	9	4047079	4047087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364569
74014	NC_022241	TAT	2	6	4047242	4047247	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364569
74015	NC_022241	GAT	2	6	4047261	4047266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364569
74016	NC_022241	TAA	2	6	4047299	4047304	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538364569
74017	NC_022241	GGT	2	6	4047323	4047328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538364569
74018	NC_022241	GTC	2	6	4047394	4047399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364569
74019	NC_022241	AAT	2	6	4047448	4047453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	538364569
74020	NC_022241	AGA	2	6	4047583	4047588	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	538364570
74021	NC_022241	TGG	2	6	4047729	4047734	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538364570
74022	NC_022241	CGC	2	6	4047756	4047761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364570
74023	NC_022241	CG	3	6	4047775	4047780	0 %	0 %	50 %	50 %	538364570
74024	NC_022241	ACT	2	6	4047813	4047818	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364570
74025	NC_022241	GC	3	6	4047834	4047839	0 %	0 %	50 %	50 %	538364570
74026	NC_022241	TGA	2	6	4047873	4047878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364570
74027	NC_022241	TTA	2	6	4047885	4047890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364570
74028	NC_022241	GCG	2	6	4047903	4047908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538364570
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74030	NC_022241	CAA	2	6	4047988	4047993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	538364570
74031	NC_022241	TCG	2	6	4047995	4048000	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364570
74032	NC_022241	ACC	2	6	4048795	4048800	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	538364571
74033	NC_022241	CAT	2	6	4048828	4048833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364571
74034	NC_022241	TCA	2	6	4048896	4048901	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364571
74035	NC_022241	AATT	2	8	4048904	4048911	50 %	50 %	0 %	0 %	538364571
74036	NC_022241	CATC	2	8	4049008	4049015	25 %	25 %	0 %	50 %	538364571
74037	NC_022241	CTT	2	6	4049044	4049049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538364571
74038	NC_022241	GCT	2	6	4049080	4049085	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364571
74039	NC_022241	GCC	2	6	4049106	4049111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364571
74040	NC_022241	ATG	2	6	4049165	4049170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364571
74041	NC_022241	T	6	6	4049225	4049230	0 %	100 %	0 %	0 %	538364571
74042	NC_022241	CAG	2	6	4049231	4049236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364571
74043	NC_022241	TGT	2	6	4049237	4049242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364571
74044	NC_022241	TCC	2	6	4049312	4049317	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538364572
74045	NC_022241	CCT	2	6	4049340	4049345	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538364572
74046	NC_022241	CGC	2	6	4049402	4049407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364572
74047	NC_022241	GAT	2	6	4049472	4049477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364572
74048	NC_022241	CAT	2	6	4049487	4049492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364572
74049	NC_022241	CGCTG	2	10	4049519	4049528	0 %	20 %	40 %	40 %	538364572
74050	NC_022241	CTG	2	6	4049602	4049607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364572
74051	NC_022241	GAC	2	6	4049716	4049721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364572
74052	NC_022241	GCG	2	6	4049733	4049738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538364572
74053	NC_022241	GTTCA	2	10	4049776	4049785	20 %	40 %	20 %	20 %	538364572
74054	NC_022241	TGAA	2	8	4049954	4049961	50 %	25 %	25 %	0 %	538364573
74055	NC_022241	CTC	2	6	4049971	4049976	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	538364573
74056	NC_022241	CAGC	2	8	4049977	4049984	25 %	0 %	25 %	50 %	538364573
74057	NC_022241	TGA	2	6	4050075	4050080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364573
74058	NC_022241	CGC	2	6	4050123	4050128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364573
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74062	NC_022241	TGC	2	6	4050538	4050543	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364574
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74064	NC_022241	GAT	2	6	4050941	4050946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364574
74065	NC_022241	TGC	2	6	4050981	4050986	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364574
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74068	NC_022241	GTTTA	2	10	4051104	4051113	20 %	60 %	20 %	0 %	538364574
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74073	NC_022241	GCTG	2	8	4051310	4051317	0 %	25 %	50 %	25 %	538364575
74074	NC_022241	GCA	2	6	4051344	4051349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364575
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74081	NC_022241	A	6	6	4051905	4051910	100 %	0 %	0 %	0 %	538364575
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74084	NC_022241	TTC	2	6	4052055	4052060	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538364576
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74099	NC_022241	GCGA	2	8	4053109	4053116	25 %	0 %	50 %	25 %	538364577
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74103	NC_022241	TGC	2	6	4053392	4053397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364578
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74231	NC_022241	TGT	2	6	4060945	4060950	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364583
74232	NC_022241	GCT	4	12	4060977	4060988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364583
74233	NC_022241	CG	3	6	4061005	4061010	0 %	0 %	50 %	50 %	538364583
74234	NC_022241	TCA	2	6	4061030	4061035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364583
74235	NC_022241	CTG	2	6	4061071	4061076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364583
74236	NC_022241	CGG	2	6	4061088	4061093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538364583
74237	NC_022241	ATG	2	6	4061120	4061125	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364583
74238	NC_022241	GGT	2	6	4061263	4061268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	538364583
74239	NC_022241	ATC	3	9	4061323	4061331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364583
74240	NC_022241	GAC	2	6	4061332	4061337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364583
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74242	NC_022241	GCC	2	6	4061484	4061489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364584
74243	NC_022241	GGA	2	6	4061536	4061541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	538364584
74244	NC_022241	CGC	2	6	4061574	4061579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364584
74245	NC_022241	GGTACG	2	12	4061619	4061630	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	538364584
74246	NC_022241	CGC	2	6	4061642	4061647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364584
74247	NC_022241	CAG	2	6	4061688	4061693	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364584
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74249	NC_022241	TATG	2	8	4061816	4061823	25 %	50 %	25 %	0 %	538364584
74250	NC_022241	TGC	2	6	4061848	4061853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364584
74251	NC_022241	ATG	2	6	4061902	4061907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364584
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74253	NC_022241	GCC	2	6	4061976	4061981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364584
74254	NC_022241	GCG	2	6	4062028	4062033	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	538364584
74255	NC_022241	TGC	2	6	4062037	4062042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364584
74256	NC_022241	TGC	2	6	4062046	4062051	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364584
74257	NC_022241	GAC	2	6	4062068	4062073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364584
74258	NC_022241	TCG	2	6	4062112	4062117	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364584
74259	NC_022241	AG	3	6	4062138	4062143	50 %	0 %	50 %	0 %	538364584
74260	NC_022241	GCGA	2	8	4062149	4062156	25 %	0 %	50 %	25 %	538364584
74261	NC_022241	ATCA	2	8	4062159	4062166	50 %	25 %	0 %	25 %	538364584
74262	NC_022241	CTG	2	6	4062303	4062308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364584
74263	NC_022241	CGT	2	6	4062341	4062346	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364584
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74265	NC_022241	GTA	2	6	4062700	4062705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364585
74266	NC_022241	ACGC	2	8	4062736	4062743	25 %	0 %	25 %	50 %	538364585
74267	NC_022241	TCT	2	6	4062749	4062754	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	538364585
74268	NC_022241	ATCG	2	8	4062778	4062785	25 %	25 %	25 %	25 %	538364585
74269	NC_022241	CGC	2	6	4062801	4062806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	538364585
74270	NC_022241	GGTCCA	2	12	4062825	4062836	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	538364585
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74300	NC_022241	GC	4	8	4064876	4064883	0 %	0 %	50 %	50 %	538364586
74301	NC_022241	GTT	2	6	4064893	4064898	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364586
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74303	NC_022241	CGAC	2	8	4064933	4064940	25 %	0 %	25 %	50 %	538364586
74304	NC_022241	ATC	2	6	4064959	4064964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364586
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74322	NC_022241	TGA	2	6	4066191	4066196	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364586
74323	NC_022241	CGA	2	6	4066197	4066202	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	538364586
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74327	NC_022241	T	7	7	4066349	4066355	0 %	100 %	0 %	0 %	538364587
74328	NC_022241	A	6	6	4066385	4066390	100 %	0 %	0 %	0 %	538364587
74329	NC_022241	TAT	2	6	4066407	4066412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364587
74330	NC_022241	TGCTGT	2	12	4066550	4066561	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	538364587
74331	NC_022241	TGA	2	6	4066616	4066621	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	538364587
74332	NC_022241	TGT	2	6	4066676	4066681	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364587
74333	NC_022241	GTT	2	6	4066683	4066688	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	538364587
74334	NC_022241	TCA	2	6	4066742	4066747	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364587
74335	NC_022241	ATT	2	6	4066757	4066762	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	538364587
74336	NC_022241	ATC	2	6	4066765	4066770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	538364587
74337	NC_022241	T	6	6	4066812	4066817	0 %	100 %	0 %	0 %	538364587
74338	NC_022241	CAGCGG	2	12	4066834	4066845	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	538364587
74339	NC_022241	CTG	2	6	4066855	4066860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	538364587
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