MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
49001	NC_022221	GTC	2	6	2860048	2860053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
49002	NC_022221	GC	3	6	2860056	2860061	0 %	0 %	50 %	50 %	537438045
49003	NC_022221	TGC	2	6	2860064	2860069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
49004	NC_022221	CG	3	6	2860073	2860078	0 %	0 %	50 %	50 %	537438045
49005	NC_022221	CCG	2	6	2860112	2860117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438045
49006	NC_022221	AAG	2	6	2860157	2860162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438045
49007	NC_022221	TTA	2	6	2860181	2860186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438045
49008	NC_022221	GGCGC	2	10	2860231	2860240	0 %	0 %	60 %	40 %	537438045
49009	NC_022221	ACC	2	6	2860261	2860266	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438045
49010	NC_022221	CTG	2	6	2860267	2860272	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
49011	NC_022221	CTT	2	6	2860382	2860387	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438046
49012	NC_022221	TCG	2	6	2860428	2860433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438046
49013	NC_022221	CGT	2	6	2860618	2860623	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438046
49014	NC_022221	T	7	7	2860678	2860684	0 %	100 %	0 %	0 %	537438046
49015	NC_022221	TCA	2	6	2860999	2861004	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438047
49016	NC_022221	GGCG	2	8	2861042	2861049	0 %	0 %	75 %	25 %	537438047
49017	NC_022221	A	6	6	2861449	2861454	100 %	0 %	0 %	0 %	537438047
49018	NC_022221	CCG	2	6	2861458	2861463	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438047
49019	NC_022221	GCTG	2	8	2861470	2861477	0 %	25 %	50 %	25 %	537438047
49020	NC_022221	GC	3	6	2861508	2861513	0 %	0 %	50 %	50 %	537438047
49021	NC_022221	TGAT	2	8	2861590	2861597	25 %	50 %	25 %	0 %	537438047
49022	NC_022221	CCCG	2	8	2861655	2861662	0 %	0 %	25 %	75 %	537438047
49023	NC_022221	CG	3	6	2861669	2861674	0 %	0 %	50 %	50 %	537438047
49024	NC_022221	GC	3	6	2861683	2861688	0 %	0 %	50 %	50 %	537438047
49025	NC_022221	GGC	2	6	2861694	2861699	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438047
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49027	NC_022221	ACG	2	6	2861797	2861802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438047
49028	NC_022221	GAG	2	6	2861807	2861812	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438047
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49031	NC_022221	CAGT	2	8	2862020	2862027	25 %	25 %	25 %	25 %	537438048
49032	NC_022221	CAA	2	6	2862028	2862033	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438048
49033	NC_022221	A	8	8	2862041	2862048	100 %	0 %	0 %	0 %	537438048
49034	NC_022221	GAA	2	6	2862074	2862079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438048
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49036	NC_022221	TGA	2	6	2862117	2862122	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438048
49037	NC_022221	GGCT	2	8	2862143	2862150	0 %	25 %	50 %	25 %	537438048
49038	NC_022221	CGC	2	6	2862187	2862192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438048
49039	NC_022221	CGG	2	6	2862247	2862252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438048
49040	NC_022221	A	6	6	2862257	2862262	100 %	0 %	0 %	0 %	537438048
49041	NC_022221	GT	3	6	2862264	2862269	0 %	50 %	50 %	0 %	537438048
49042	NC_022221	CTG	2	6	2862308	2862313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438048
49043	NC_022221	ATC	2	6	2862356	2862361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438048
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49050	NC_022221	TGG	2	6	2862701	2862706	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438049
49051	NC_022221	TC	3	6	2862723	2862728	0 %	50 %	0 %	50 %	537438049
49052	NC_022221	TTTC	2	8	2862841	2862848	0 %	75 %	0 %	25 %	537438049
49053	NC_022221	CGG	2	6	2862849	2862854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438049
49054	NC_022221	GGC	2	6	2862858	2862863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438049
49055	NC_022221	AGA	2	6	2862903	2862908	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438049
49056	NC_022221	TCT	2	6	2862926	2862931	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438049
49057	NC_022221	T	7	7	2862936	2862942	0 %	100 %	0 %	0 %	537438049
49058	NC_022221	ATT	2	6	2862997	2863002	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438049
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49062	NC_022221	GGC	2	6	2863200	2863205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438049
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49066	NC_022221	CTGG	2	8	2863356	2863363	0 %	25 %	50 %	25 %	537438049
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49070	NC_022221	CGCC	2	8	2863464	2863471	0 %	0 %	25 %	75 %	537438049
49071	NC_022221	AAC	2	6	2863496	2863501	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438049
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49083	NC_022221	T	7	7	2864469	2864475	0 %	100 %	0 %	0 %	537438051
49084	NC_022221	AG	3	6	2864488	2864493	50 %	0 %	50 %	0 %	537438051
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49089	NC_022221	T	6	6	2864755	2864760	0 %	100 %	0 %	0 %	537438051
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49102	NC_022221	T	6	6	2865695	2865700	0 %	100 %	0 %	0 %	537438052
49103	NC_022221	GGA	2	6	2865725	2865730	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438052
49104	NC_022221	TAA	2	6	2865731	2865736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438052
49105	NC_022221	CAG	2	6	2865740	2865745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438052
49106	NC_022221	CCA	2	6	2865782	2865787	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438052
49107	NC_022221	ATTG	2	8	2865793	2865800	25 %	50 %	25 %	0 %	537438052
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49110	NC_022221	GCA	2	6	2865985	2865990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438052
49111	NC_022221	CA	3	6	2865989	2865994	50 %	0 %	0 %	50 %	537438052
49112	NC_022221	CGAT	2	8	2865996	2866003	25 %	25 %	25 %	25 %	537438052
49113	NC_022221	ATA	2	6	2866004	2866009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438052
49114	NC_022221	TA	3	6	2866239	2866244	50 %	50 %	0 %	0 %	537438052
49115	NC_022221	ATTT	2	8	2866257	2866264	25 %	75 %	0 %	0 %	537438052
49116	NC_022221	AAG	2	6	2866714	2866719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438053
49117	NC_022221	CA	3	6	2866732	2866737	50 %	0 %	0 %	50 %	537438053
49118	NC_022221	TCG	2	6	2866738	2866743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438053
49119	NC_022221	TAA	2	6	2866775	2866780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438053
49120	NC_022221	ATA	2	6	2866926	2866931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438053
49121	NC_022221	GCTC	2	8	2866968	2866975	0 %	25 %	25 %	50 %	537438053
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49123	NC_022221	ATC	2	6	2867051	2867056	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438053
49124	NC_022221	TAC	2	6	2867068	2867073	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438053
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49127	NC_022221	A	6	6	2867209	2867214	100 %	0 %	0 %	0 %	537438053
49128	NC_022221	GAA	2	6	2867256	2867261	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438053
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49130	NC_022221	TTA	2	6	2867388	2867393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438053
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49132	NC_022221	TTA	2	6	2867449	2867454	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438053
49133	NC_022221	ATT	2	6	2867483	2867488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438053
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49137	NC_022221	TGC	2	6	2868044	2868049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438054
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49142	NC_022221	GC	3	6	2868213	2868218	0 %	0 %	50 %	50 %	537438054
49143	NC_022221	ATT	2	6	2868226	2868231	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438054
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49145	NC_022221	TCA	2	6	2868418	2868423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438055
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49147	NC_022221	CAA	2	6	2868455	2868460	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438055
49148	NC_022221	CGC	2	6	2868491	2868496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438055
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49151	NC_022221	A	7	7	2868613	2868619	100 %	0 %	0 %	0 %	537438055
49152	NC_022221	T	6	6	2868728	2868733	0 %	100 %	0 %	0 %	537438055
49153	NC_022221	GCG	2	6	2868775	2868780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438055
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49188	NC_022221	CTG	2	6	2871127	2871132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438060
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49193	NC_022221	CCAG	2	8	2871348	2871355	25 %	0 %	25 %	50 %	537438060
49194	NC_022221	TTCGTT	2	12	2871376	2871387	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	537438060
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49198	NC_022221	T	6	6	2871659	2871664	0 %	100 %	0 %	0 %	537438060
49199	NC_022221	GCT	2	6	2871687	2871692	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438060
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49201	NC_022221	CGTATC	2	12	2871820	2871831	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537438060
49202	NC_022221	A	6	6	2871874	2871879	100 %	0 %	0 %	0 %	537438060
49203	NC_022221	ATA	2	6	2872367	2872372	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438061
49204	NC_022221	GTAA	2	8	2872390	2872397	50 %	25 %	25 %	0 %	537438061
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49209	NC_022221	ACGAT	2	10	2872568	2872577	40 %	20 %	20 %	20 %	537438061
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49211	NC_022221	CT	3	6	2872700	2872705	0 %	50 %	0 %	50 %	537438061
49212	NC_022221	AGC	2	6	2872724	2872729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438061
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49219	NC_022221	AT	3	6	2873063	2873068	50 %	50 %	0 %	0 %	537438061
49220	NC_022221	AGA	2	6	2873103	2873108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438061
49221	NC_022221	GAAT	2	8	2873144	2873151	50 %	25 %	25 %	0 %	537438061
49222	NC_022221	GCA	2	6	2873155	2873160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438061
49223	NC_022221	TTCA	2	8	2873233	2873240	25 %	50 %	0 %	25 %	537438061
49224	NC_022221	A	6	6	2873248	2873253	100 %	0 %	0 %	0 %	537438061
49225	NC_022221	TCCTGT	2	12	2874406	2874417	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	537438062
49226	NC_022221	A	6	6	2874425	2874430	100 %	0 %	0 %	0 %	537438062
49227	NC_022221	TGA	2	6	2874439	2874444	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438062
49228	NC_022221	AGAAA	2	10	2874481	2874490	80 %	0 %	20 %	0 %	537438062
49229	NC_022221	GCC	2	6	2874539	2874544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438062
49230	NC_022221	GAA	2	6	2874605	2874610	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438062
49231	NC_022221	ACG	2	6	2874637	2874642	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438062
49232	NC_022221	GTG	2	6	2874722	2874727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438062
49233	NC_022221	TGC	2	6	2874864	2874869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438062
49234	NC_022221	GAA	2	6	2874883	2874888	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438062
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49347	NC_022221	TGC	2	6	2880658	2880663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438068
49348	NC_022221	CCT	2	6	2880727	2880732	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438068
49349	NC_022221	TCG	2	6	2880745	2880750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438068
49350	NC_022221	CAC	2	6	2880766	2880771	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438068
49351	NC_022221	ATA	2	6	2880786	2880791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438068
49352	NC_022221	GCT	2	6	2880799	2880804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438068
49353	NC_022221	GCTTC	2	10	2880820	2880829	0 %	40 %	20 %	40 %	537438068
49354	NC_022221	CTTT	2	8	2880832	2880839	0 %	75 %	0 %	25 %	537438068
49355	NC_022221	TTTC	2	8	2880871	2880878	0 %	75 %	0 %	25 %	537438068
49356	NC_022221	TCA	2	6	2880922	2880927	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438068
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49362	NC_022221	GC	3	6	2881504	2881509	0 %	0 %	50 %	50 %	537438069
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49370	NC_022221	TGAG	2	8	2881741	2881748	25 %	25 %	50 %	0 %	537438069
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49455	NC_022221	TTAC	2	8	2885932	2885939	25 %	50 %	0 %	25 %	537438072
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49459	NC_022221	GC	3	6	2886214	2886219	0 %	0 %	50 %	50 %	537438073
49460	NC_022221	CGA	2	6	2886231	2886236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438073
49461	NC_022221	GC	3	6	2886281	2886286	0 %	0 %	50 %	50 %	537438073
49462	NC_022221	ATC	2	6	2886308	2886313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438073
49463	NC_022221	AAAT	2	8	2886338	2886345	75 %	25 %	0 %	0 %	537438073
49464	NC_022221	CAA	2	6	2886372	2886377	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438073
49465	NC_022221	CAGA	2	8	2886414	2886421	50 %	0 %	25 %	25 %	537438073
49466	NC_022221	CTT	2	6	2886495	2886500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438073
49467	NC_022221	AAT	2	6	2886554	2886559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438073
49468	NC_022221	CAAT	2	8	2886564	2886571	50 %	25 %	0 %	25 %	537438073
49469	NC_022221	GCAA	2	8	2886574	2886581	50 %	0 %	25 %	25 %	537438073
49470	NC_022221	GAG	2	6	2886601	2886606	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537438073
49471	NC_022221	TTC	2	6	2886677	2886682	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438073
49472	NC_022221	ATG	2	6	2886689	2886694	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438073
49473	NC_022221	CCA	2	6	2886699	2886704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438073
49474	NC_022221	GA	3	6	2886713	2886718	50 %	0 %	50 %	0 %	537438073
49475	NC_022221	T	7	7	2886766	2886772	0 %	100 %	0 %	0 %	537438073
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49478	NC_022221	AGCAG	2	10	2886873	2886882	40 %	0 %	40 %	20 %	537438073
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49480	NC_022221	TCC	2	6	2887027	2887032	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438073
49481	NC_022221	CAGG	2	8	2887039	2887046	25 %	0 %	50 %	25 %	537438073
49482	NC_022221	T	6	6	2887081	2887086	0 %	100 %	0 %	0 %	537438073
49483	NC_022221	T	6	6	2887105	2887110	0 %	100 %	0 %	0 %	537438073
49484	NC_022221	CTCG	2	8	2887150	2887157	0 %	25 %	25 %	50 %	537438074
49485	NC_022221	AG	3	6	2887190	2887195	50 %	0 %	50 %	0 %	537438074
49486	NC_022221	GTA	2	6	2887213	2887218	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438074
49487	NC_022221	GA	3	6	2887222	2887227	50 %	0 %	50 %	0 %	537438074
49488	NC_022221	AGC	2	6	2887233	2887238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438074
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49491	NC_022221	TAA	2	6	2887396	2887401	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438074
49492	NC_022221	GCG	2	6	2887411	2887416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438074
49493	NC_022221	TTTA	2	8	2887463	2887470	25 %	75 %	0 %	0 %	537438074
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49495	NC_022221	TAAA	2	8	2887505	2887512	75 %	25 %	0 %	0 %	537438074
49496	NC_022221	ATA	2	6	2887614	2887619	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438074
49497	NC_022221	GCAT	2	8	2887629	2887636	25 %	25 %	25 %	25 %	537438074
49498	NC_022221	CAG	2	6	2887655	2887660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438074
49499	NC_022221	CCG	2	6	2887681	2887686	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438074
49500	NC_022221	CTT	2	6	2887687	2887692	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438074

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