MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_022221	ATT	2	6	2835164	2835169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438019
48502	NC_022221	GCG	2	6	2835224	2835229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438019
48503	NC_022221	CGG	2	6	2835235	2835240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438019
48504	NC_022221	CTG	2	6	2835344	2835349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438019
48505	NC_022221	CGA	2	6	2835382	2835387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438019
48506	NC_022221	TGC	2	6	2835456	2835461	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438019
48507	NC_022221	CGG	2	6	2835517	2835522	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438019
48508	NC_022221	GGC	2	6	2835672	2835677	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438020
48509	NC_022221	CGG	2	6	2835749	2835754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438020
48510	NC_022221	GTG	2	6	2835771	2835776	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438020
48511	NC_022221	CAG	2	6	2835798	2835803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438020
48512	NC_022221	TGA	2	6	2835823	2835828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438020
48513	NC_022221	TCGC	2	8	2835924	2835931	0 %	25 %	25 %	50 %	537438020
48514	NC_022221	CGTCAG	2	12	2836181	2836192	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537438021
48515	NC_022221	CAC	2	6	2836270	2836275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438021
48516	NC_022221	GGC	2	6	2836331	2836336	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438021
48517	NC_022221	GTG	2	6	2836337	2836342	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438021
48518	NC_022221	AGA	2	6	2836351	2836356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438021
48519	NC_022221	A	6	6	2836400	2836405	100 %	0 %	0 %	0 %	537438021
48520	NC_022221	AGCCGC	2	12	2836414	2836425	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537438021
48521	NC_022221	AT	3	6	2836432	2836437	50 %	50 %	0 %	0 %	537438021
48522	NC_022221	ATG	2	6	2836440	2836445	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438021
48523	NC_022221	ATT	2	6	2836454	2836459	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438021
48524	NC_022221	TGA	2	6	2836524	2836529	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438021
48525	NC_022221	CGG	2	6	2836594	2836599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438021
48526	NC_022221	A	6	6	2836610	2836615	100 %	0 %	0 %	0 %	537438021
48527	NC_022221	CGT	2	6	2836620	2836625	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438021
48528	NC_022221	GCA	2	6	2836763	2836768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438021
48529	NC_022221	CTC	2	6	2836792	2836797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438021
48530	NC_022221	ACT	2	6	2836949	2836954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438022
48531	NC_022221	AAG	2	6	2836990	2836995	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438022
48532	NC_022221	GAT	2	6	2837022	2837027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438022
48533	NC_022221	CGC	2	6	2837036	2837041	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438022
48534	NC_022221	ATT	2	6	2837049	2837054	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438022
48535	NC_022221	A	7	7	2837109	2837115	100 %	0 %	0 %	0 %	537438022
48536	NC_022221	CGC	2	6	2837117	2837122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438022
48537	NC_022221	T	7	7	2837150	2837156	0 %	100 %	0 %	0 %	537438022
48538	NC_022221	CGG	2	6	2837164	2837169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438022
48539	NC_022221	GAT	2	6	2837192	2837197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438022
48540	NC_022221	GATGT	2	10	2837208	2837217	20 %	40 %	40 %	0 %	537438022
48541	NC_022221	CGG	2	6	2837234	2837239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438022
48542	NC_022221	TCA	2	6	2837257	2837262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438022
48543	NC_022221	GCT	2	6	2837291	2837296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438022
48544	NC_022221	CT	4	8	2837314	2837321	0 %	50 %	0 %	50 %	537438022
48545	NC_022221	TGA	2	6	2837419	2837424	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438022
48546	NC_022221	GC	3	6	2837457	2837462	0 %	0 %	50 %	50 %	537438022
48547	NC_022221	GAA	2	6	2837472	2837477	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438022
48548	NC_022221	GC	3	6	2837512	2837517	0 %	0 %	50 %	50 %	537438022
48549	NC_022221	AAT	2	6	2837526	2837531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438022
48550	NC_022221	CCA	2	6	2837581	2837586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438022
48551	NC_022221	GATG	2	8	2837591	2837598	25 %	25 %	50 %	0 %	537438022
48552	NC_022221	GGGCTG	2	12	2837622	2837633	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	537438022
48553	NC_022221	TGT	2	6	2837657	2837662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438022
48554	NC_022221	GCTG	2	8	2837695	2837702	0 %	25 %	50 %	25 %	537438022
48555	NC_022221	GCG	3	9	2837707	2837715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438022
48556	NC_022221	CAC	2	6	2837720	2837725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438022
48557	NC_022221	TGA	2	6	2837803	2837808	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438022
48558	NC_022221	CCG	2	6	2837821	2837826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438022
48559	NC_022221	GGT	2	6	2837831	2837836	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438022
48560	NC_022221	GCC	2	6	2837973	2837978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438023
48561	NC_022221	ATT	2	6	2837987	2837992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438023
48562	NC_022221	ATC	2	6	2838012	2838017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438023
48563	NC_022221	TC	3	6	2838016	2838021	0 %	50 %	0 %	50 %	537438023
48564	NC_022221	GGCA	3	12	2838055	2838066	25 %	0 %	50 %	25 %	537438023
48565	NC_022221	TGC	2	6	2838123	2838128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438023
48566	NC_022221	TCC	2	6	2838129	2838134	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438023
48567	NC_022221	ACC	2	6	2838138	2838143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438023
48568	NC_022221	GCCA	2	8	2838220	2838227	25 %	0 %	25 %	50 %	537438023
48569	NC_022221	GGC	2	6	2838241	2838246	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438023
48570	NC_022221	GC	4	8	2838245	2838252	0 %	0 %	50 %	50 %	537438023
48571	NC_022221	CAT	2	6	2838328	2838333	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438023
48572	NC_022221	CGC	2	6	2838334	2838339	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438023
48573	NC_022221	GCG	2	6	2838349	2838354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438023
48574	NC_022221	CGC	2	6	2838443	2838448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438023
48575	NC_022221	TCG	2	6	2838480	2838485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438023
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48583	NC_022221	CGG	2	6	2838958	2838963	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438023
48584	NC_022221	GCG	2	6	2838969	2838974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438023
48585	NC_022221	CAC	2	6	2839163	2839168	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438023
48586	NC_022221	CG	3	6	2839175	2839180	0 %	0 %	50 %	50 %	537438023
48587	NC_022221	GTA	2	6	2839329	2839334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438023
48588	NC_022221	ATA	2	6	2839625	2839630	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438024
48589	NC_022221	GCA	2	6	2839700	2839705	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438024
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48591	NC_022221	CAT	3	9	2839827	2839835	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438024
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48593	NC_022221	GC	3	6	2839862	2839867	0 %	0 %	50 %	50 %	537438024
48594	NC_022221	CCATCA	2	12	2839941	2839952	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	537438024
48595	NC_022221	GGAAT	2	10	2839956	2839965	40 %	20 %	40 %	0 %	537438024
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48597	NC_022221	CGGCAA	2	12	2840001	2840012	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438024
48598	NC_022221	TGC	2	6	2840039	2840044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438024
48599	NC_022221	ATG	2	6	2840059	2840064	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438024
48600	NC_022221	ACG	2	6	2840099	2840104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438024
48601	NC_022221	ACT	2	6	2840117	2840122	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438024
48602	NC_022221	CGA	2	6	2840124	2840129	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438024
48603	NC_022221	ATG	2	6	2840141	2840146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438024
48604	NC_022221	CTA	2	6	2840184	2840189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438024
48605	NC_022221	GGC	2	6	2840340	2840345	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438024
48606	NC_022221	ATG	2	6	2840404	2840409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438024
48607	NC_022221	AAC	2	6	2840551	2840556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438024
48608	NC_022221	TGA	2	6	2840558	2840563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438024
48609	NC_022221	CTGGT	2	10	2840576	2840585	0 %	40 %	40 %	20 %	537438024
48610	NC_022221	CAA	2	6	2840613	2840618	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438024
48611	NC_022221	GCG	3	9	2840651	2840659	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438024
48612	NC_022221	CG	3	6	2840781	2840786	0 %	0 %	50 %	50 %	537438024
48613	NC_022221	CA	3	6	2840817	2840822	50 %	0 %	0 %	50 %	537438024
48614	NC_022221	GAA	2	6	2840839	2840844	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438024
48615	NC_022221	GCC	2	6	2840857	2840862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438024
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48726	NC_022221	GC	3	6	2847363	2847368	0 %	0 %	50 %	50 %	537438031
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48732	NC_022221	GCG	2	6	2847693	2847698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438031
48733	NC_022221	GATTTC	2	12	2847712	2847723	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	537438031
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48963	NC_022221	AGC	2	6	2858019	2858024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438044
48964	NC_022221	GCA	2	6	2858304	2858309	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48965	NC_022221	CGG	2	6	2858634	2858639	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438045
48966	NC_022221	AAT	2	6	2858755	2858760	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438045
48967	NC_022221	TGT	2	6	2858774	2858779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438045
48968	NC_022221	TGA	2	6	2858847	2858852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438045
48969	NC_022221	CCA	2	6	2858880	2858885	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438045
48970	NC_022221	CCAC	2	8	2858954	2858961	25 %	0 %	0 %	75 %	537438045
48971	NC_022221	TGA	2	6	2858967	2858972	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438045
48972	NC_022221	CAT	2	6	2858974	2858979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438045
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48974	NC_022221	TGC	2	6	2859050	2859055	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48975	NC_022221	AACG	2	8	2859067	2859074	50 %	0 %	25 %	25 %	537438045
48976	NC_022221	CTG	2	6	2859142	2859147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48977	NC_022221	GAA	2	6	2859199	2859204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438045
48978	NC_022221	ACC	2	6	2859214	2859219	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438045
48979	NC_022221	GCT	2	6	2859231	2859236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48980	NC_022221	CGA	2	6	2859321	2859326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48981	NC_022221	AGC	2	6	2859344	2859349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48982	NC_022221	TAA	2	6	2859351	2859356	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537438045
48983	NC_022221	ATC	2	6	2859379	2859384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438045
48984	NC_022221	AGCGA	2	10	2859391	2859400	40 %	0 %	40 %	20 %	537438045
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48986	NC_022221	CGG	2	6	2859563	2859568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438045
48987	NC_022221	GCT	2	6	2859570	2859575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48988	NC_022221	TTTG	2	8	2859585	2859592	0 %	75 %	25 %	0 %	537438045
48989	NC_022221	GCGCG	2	10	2859600	2859609	0 %	0 %	60 %	40 %	537438045
48990	NC_022221	GC	3	6	2859623	2859628	0 %	0 %	50 %	50 %	537438045
48991	NC_022221	GCT	2	6	2859714	2859719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48992	NC_022221	GCA	2	6	2859755	2859760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438045
48993	NC_022221	CGC	2	6	2859792	2859797	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438045
48994	NC_022221	A	7	7	2859814	2859820	100 %	0 %	0 %	0 %	537438045
48995	NC_022221	CTA	2	6	2859852	2859857	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438045
48996	NC_022221	TCC	2	6	2859885	2859890	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438045
48997	NC_022221	ACT	2	6	2859918	2859923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438045
48998	NC_022221	CGCC	2	8	2859948	2859955	0 %	0 %	25 %	75 %	537438045
48999	NC_022221	CCG	2	6	2859983	2859988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438045
49000	NC_022221	CAG	2	6	2860005	2860010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438045

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