MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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48002	NC_022221	TGG	2	6	2799418	2799423	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437984
48003	NC_022221	GTG	2	6	2799441	2799446	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437984
48004	NC_022221	CTC	2	6	2799489	2799494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437984
48005	NC_022221	CG	4	8	2799506	2799513	0 %	0 %	50 %	50 %	537437984
48006	NC_022221	GAT	2	6	2799558	2799563	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437984
48007	NC_022221	CCA	2	6	2799659	2799664	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437984
48008	NC_022221	GGC	2	6	2799740	2799745	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437984
48009	NC_022221	GC	3	6	2799843	2799848	0 %	0 %	50 %	50 %	537437984
48010	NC_022221	GGC	2	6	2799851	2799856	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437984
48011	NC_022221	ATT	2	6	2799903	2799908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437984
48012	NC_022221	ATT	2	6	2799956	2799961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437985
48013	NC_022221	AT	3	6	2799990	2799995	50 %	50 %	0 %	0 %	537437985
48014	NC_022221	T	6	6	2799995	2800000	0 %	100 %	0 %	0 %	537437985
48015	NC_022221	TAT	2	6	2800040	2800045	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437985
48016	NC_022221	CGT	2	6	2800134	2800139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437985
48017	NC_022221	GCT	2	6	2800161	2800166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437985
48018	NC_022221	T	6	6	2800199	2800204	0 %	100 %	0 %	0 %	537437985
48019	NC_022221	CCT	2	6	2800211	2800216	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437985
48020	NC_022221	TTTA	2	8	2800296	2800303	25 %	75 %	0 %	0 %	537437985
48021	NC_022221	T	6	6	2800317	2800322	0 %	100 %	0 %	0 %	537437985
48022	NC_022221	TAAT	2	8	2800503	2800510	50 %	50 %	0 %	0 %	537437986
48023	NC_022221	AT	3	6	2800549	2800554	50 %	50 %	0 %	0 %	537437986
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48034	NC_022221	TGAT	2	8	2801217	2801224	25 %	50 %	25 %	0 %	537437988
48035	NC_022221	CGA	2	6	2801236	2801241	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437988
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48050	NC_022221	TGGG	2	8	2801796	2801803	0 %	25 %	75 %	0 %	537437989
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48053	NC_022221	GTT	2	6	2803184	2803189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437991
48054	NC_022221	CTGTT	2	10	2803192	2803201	0 %	60 %	20 %	20 %	537437991
48055	NC_022221	TTC	2	6	2803255	2803260	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437991
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48057	NC_022221	CG	3	6	2803336	2803341	0 %	0 %	50 %	50 %	537437991
48058	NC_022221	CGG	2	6	2803353	2803358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437991
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48070	NC_022221	CGC	2	6	2803868	2803873	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437992
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48088	NC_022221	GC	3	6	2806908	2806913	0 %	0 %	50 %	50 %	537437996
48089	NC_022221	CAG	2	6	2806927	2806932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437996
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48091	NC_022221	CGGTG	2	10	2807068	2807077	0 %	20 %	60 %	20 %	537437996
48092	NC_022221	ATG	2	6	2807103	2807108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437996
48093	NC_022221	GC	3	6	2807120	2807125	0 %	0 %	50 %	50 %	537437996
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48100	NC_022221	CCGC	2	8	2807433	2807440	0 %	0 %	25 %	75 %	537437997
48101	NC_022221	GCCA	2	8	2807455	2807462	25 %	0 %	25 %	50 %	537437997
48102	NC_022221	CG	3	6	2807517	2807522	0 %	0 %	50 %	50 %	537437997
48103	NC_022221	TCC	2	6	2807540	2807545	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437997
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48105	NC_022221	TGG	2	6	2807681	2807686	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437997
48106	NC_022221	T	6	6	2807775	2807780	0 %	100 %	0 %	0 %	537437997
48107	NC_022221	CAG	2	6	2807794	2807799	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437997
48108	NC_022221	ACA	2	6	2807840	2807845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437997
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48110	NC_022221	CGG	3	9	2807895	2807903	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437997
48111	NC_022221	GGCG	2	8	2807934	2807941	0 %	0 %	75 %	25 %	537437997
48112	NC_022221	TGA	2	6	2807987	2807992	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437997
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48118	NC_022221	GTG	2	6	2808154	2808159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437997
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48223	NC_022221	TCACC	2	10	2815072	2815081	20 %	20 %	0 %	60 %	537438001
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48228	NC_022221	TCCGCC	2	12	2815310	2815321	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	537438001
48229	NC_022221	CTTA	2	8	2815372	2815379	25 %	50 %	0 %	25 %	537438001
48230	NC_022221	CTGGT	2	10	2815385	2815394	0 %	40 %	40 %	20 %	537438001
48231	NC_022221	GGC	2	6	2815768	2815773	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438002
48232	NC_022221	GCAAG	2	10	2816033	2816042	40 %	0 %	40 %	20 %	537438003
48233	NC_022221	GTT	2	6	2816093	2816098	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438003
48234	NC_022221	GC	3	6	2816161	2816166	0 %	0 %	50 %	50 %	537438003
48235	NC_022221	CGT	2	6	2816232	2816237	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438003
48236	NC_022221	CCG	2	6	2816252	2816257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438003
48237	NC_022221	AAG	2	6	2816302	2816307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438003
48238	NC_022221	CAT	2	6	2816322	2816327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438003
48239	NC_022221	TCA	2	6	2816346	2816351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438003
48240	NC_022221	GCGCT	2	10	2816445	2816454	0 %	20 %	40 %	40 %	537438003
48241	NC_022221	GCA	2	6	2816612	2816617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438004
48242	NC_022221	AAG	2	6	2816625	2816630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438004
48243	NC_022221	GCT	2	6	2816651	2816656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438004
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48246	NC_022221	GAT	2	6	2816739	2816744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438004
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48253	NC_022221	CTGG	2	8	2817209	2817216	0 %	25 %	50 %	25 %	537438004
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48255	NC_022221	GC	3	6	2817283	2817288	0 %	0 %	50 %	50 %	537438004
48256	NC_022221	CAC	2	6	2817299	2817304	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438004
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48258	NC_022221	CGA	2	6	2817422	2817427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438004
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48260	NC_022221	CTG	2	6	2817486	2817491	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438004
48261	NC_022221	CGCC	2	8	2817560	2817567	0 %	0 %	25 %	75 %	537438004
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48265	NC_022221	ACGC	2	8	2817685	2817692	25 %	0 %	25 %	50 %	537438004
48266	NC_022221	CGA	2	6	2817725	2817730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438004
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48329	NC_022221	A	8	8	2823444	2823451	100 %	0 %	0 %	0 %	537438009
48330	NC_022221	CATC	2	8	2823476	2823483	25 %	25 %	0 %	50 %	537438009
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48336	NC_022221	TTG	2	6	2823655	2823660	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537438009
48337	NC_022221	TAAGAC	2	12	2823665	2823676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	537438009
48338	NC_022221	TGAC	2	8	2823684	2823691	25 %	25 %	25 %	25 %	537438009
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48347	NC_022221	ACCG	2	8	2824039	2824046	25 %	0 %	25 %	50 %	537438010
48348	NC_022221	CGC	2	6	2824055	2824060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438010
48349	NC_022221	ACC	2	6	2824076	2824081	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438010
48350	NC_022221	CAGCGG	2	12	2824087	2824098	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	537438010
48351	NC_022221	CAG	2	6	2824111	2824116	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438010
48352	NC_022221	TCA	2	6	2824244	2824249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438010
48353	NC_022221	CACGC	2	10	2824278	2824287	20 %	0 %	20 %	60 %	537438010
48354	NC_022221	ATT	2	6	2824493	2824498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438010
48355	NC_022221	CTG	2	6	2825496	2825501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438011
48356	NC_022221	CTT	2	6	2825552	2825557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438011
48357	NC_022221	CGA	2	6	2825650	2825655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438011
48358	NC_022221	ATT	2	6	2825903	2825908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537438012
48359	NC_022221	GCAG	2	8	2825950	2825957	25 %	0 %	50 %	25 %	537438012
48360	NC_022221	ACC	2	6	2825973	2825978	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438012
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48362	NC_022221	CTG	2	6	2826021	2826026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438012
48363	NC_022221	CAAT	2	8	2826038	2826045	50 %	25 %	0 %	25 %	537438012
48364	NC_022221	CGGT	2	8	2826061	2826068	0 %	25 %	50 %	25 %	537438012
48365	NC_022221	ACCTT	2	10	2826100	2826109	20 %	40 %	0 %	40 %	537438012
48366	NC_022221	CAA	2	6	2826110	2826115	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537438012
48367	NC_022221	ATC	2	6	2826159	2826164	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438012
48368	NC_022221	GCA	2	6	2826176	2826181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438012
48369	NC_022221	CTGCG	2	10	2826267	2826276	0 %	20 %	40 %	40 %	537438012
48370	NC_022221	CTG	2	6	2826291	2826296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438012
48371	NC_022221	GCACG	2	10	2826329	2826338	20 %	0 %	40 %	40 %	537438012
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48379	NC_022221	GCG	2	6	2826669	2826674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438012
48380	NC_022221	GCA	2	6	2826752	2826757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438012
48381	NC_022221	GT	3	6	2826792	2826797	0 %	50 %	50 %	0 %	537438012
48382	NC_022221	CGC	2	6	2826816	2826821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438012
48383	NC_022221	GCGCG	2	10	2826862	2826871	0 %	0 %	60 %	40 %	537438012
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48388	NC_022221	GGC	2	6	2827251	2827256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438012
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48402	NC_022221	TGC	2	6	2827786	2827791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438012
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48409	NC_022221	CTT	2	6	2828096	2828101	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438012
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48419	NC_022221	CGGCG	2	10	2829684	2829693	0 %	0 %	60 %	40 %	537438014
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48429	NC_022221	TGCG	2	8	2830130	2830137	0 %	25 %	50 %	25 %	537438014
48430	NC_022221	CGA	2	6	2830259	2830264	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537438014
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48432	NC_022221	ATG	2	6	2830366	2830371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438014
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48434	NC_022221	TGTT	2	8	2830426	2830433	0 %	75 %	25 %	0 %	537438014
48435	NC_022221	TCG	2	6	2830435	2830440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438014
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48442	NC_022221	CCGGC	2	10	2830706	2830715	0 %	0 %	40 %	60 %	537438015
48443	NC_022221	TGC	2	6	2830807	2830812	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438015
48444	NC_022221	CACG	2	8	2830826	2830833	25 %	0 %	25 %	50 %	537438015
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48447	NC_022221	GCC	2	6	2830932	2830937	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438015
48448	NC_022221	CTG	2	6	2830949	2830954	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438015
48449	NC_022221	CG	3	6	2830970	2830975	0 %	0 %	50 %	50 %	537438015
48450	NC_022221	GTCA	2	8	2831022	2831029	25 %	25 %	25 %	25 %	537438015
48451	NC_022221	TTC	2	6	2832930	2832935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438016
48452	NC_022221	CTG	2	6	2832950	2832955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438016
48453	NC_022221	TCA	2	6	2832972	2832977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537438016
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48455	NC_022221	GTTT	2	8	2833069	2833076	0 %	75 %	25 %	0 %	537438016
48456	NC_022221	T	6	6	2833074	2833079	0 %	100 %	0 %	0 %	537438016
48457	NC_022221	CGG	2	6	2833143	2833148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438016
48458	NC_022221	CCT	2	6	2833149	2833154	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537438016
48459	NC_022221	TGTT	2	8	2833206	2833213	0 %	75 %	25 %	0 %	537438016
48460	NC_022221	CAC	2	6	2833237	2833242	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438016
48461	NC_022221	CTG	2	6	2833280	2833285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438016
48462	NC_022221	CTT	2	6	2833303	2833308	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537438016
48463	NC_022221	CAC	2	6	2833330	2833335	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537438016
48464	NC_022221	A	7	7	2833349	2833355	100 %	0 %	0 %	0 %	537438016
48465	NC_022221	CGG	2	6	2833431	2833436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438017
48466	NC_022221	GGC	2	6	2833441	2833446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438017
48467	NC_022221	TCG	2	6	2833514	2833519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438017
48468	NC_022221	AAG	2	6	2833565	2833570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438017
48469	NC_022221	CCG	2	6	2833576	2833581	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537438017
48470	NC_022221	CGCTG	2	10	2833622	2833631	0 %	20 %	40 %	40 %	537438017
48471	NC_022221	TATC	2	8	2833635	2833642	25 %	50 %	0 %	25 %	537438017
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48474	NC_022221	A	7	7	2833825	2833831	100 %	0 %	0 %	0 %	537438017
48475	NC_022221	GCT	2	6	2833851	2833856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537438017
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48481	NC_022221	C	6	6	2834172	2834177	0 %	0 %	0 %	100 %	537438017
48482	NC_022221	GGC	2	6	2834217	2834222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438017
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48484	NC_022221	GTTT	2	8	2834346	2834353	0 %	75 %	25 %	0 %	537438017
48485	NC_022221	TATC	2	8	2834361	2834368	25 %	50 %	0 %	25 %	537438017
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48489	NC_022221	CGG	2	6	2834482	2834487	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438018
48490	NC_022221	GAA	2	6	2834493	2834498	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438018
48491	NC_022221	GC	3	6	2834533	2834538	0 %	0 %	50 %	50 %	537438018
48492	NC_022221	GC	3	6	2834548	2834553	0 %	0 %	50 %	50 %	537438018
48493	NC_022221	CGG	2	6	2834587	2834592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537438018
48494	NC_022221	AGA	2	6	2834827	2834832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537438019
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48498	NC_022221	CGCT	2	8	2835077	2835084	0 %	25 %	25 %	50 %	537438019
48499	NC_022221	TGG	2	6	2835096	2835101	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537438019
48500	NC_022221	TGA	2	6	2835135	2835140	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537438019

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