MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_022221	CGT	2	6	2718169	2718174	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437928
47002	NC_022221	ACTGC	2	10	2724166	2724175	20 %	20 %	20 %	40 %	537437929
47003	NC_022221	ATC	2	6	2724185	2724190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437929
47004	NC_022221	TGC	2	6	2724243	2724248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47005	NC_022221	CTG	2	6	2724266	2724271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47006	NC_022221	TCG	2	6	2724345	2724350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47007	NC_022221	TTC	2	6	2724374	2724379	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437929
47008	NC_022221	TCA	2	6	2724462	2724467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437929
47009	NC_022221	CGGA	2	8	2724485	2724492	25 %	0 %	50 %	25 %	537437929
47010	NC_022221	ACC	2	6	2724597	2724602	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437929
47011	NC_022221	GTCA	2	8	2724635	2724642	25 %	25 %	25 %	25 %	537437929
47012	NC_022221	CGT	2	6	2724649	2724654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47013	NC_022221	CAA	2	6	2724710	2724715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437929
47014	NC_022221	GAC	2	6	2724730	2724735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47015	NC_022221	CTT	2	6	2724763	2724768	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437929
47016	NC_022221	CGT	2	6	2724856	2724861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47017	NC_022221	CAGGAA	2	12	2724926	2724937	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	537437929
47018	NC_022221	TCGGA	2	10	2724955	2724964	20 %	20 %	40 %	20 %	537437929
47019	NC_022221	ACG	2	6	2724980	2724985	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47020	NC_022221	GC	3	6	2725112	2725117	0 %	0 %	50 %	50 %	537437929
47021	NC_022221	ACGCG	2	10	2725263	2725272	20 %	0 %	40 %	40 %	537437929
47022	NC_022221	CTT	2	6	2725357	2725362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437929
47023	NC_022221	TTC	2	6	2725397	2725402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437929
47024	NC_022221	T	6	6	2725421	2725426	0 %	100 %	0 %	0 %	537437929
47025	NC_022221	TCA	2	6	2725447	2725452	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437929
47026	NC_022221	CTG	2	6	2725457	2725462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47027	NC_022221	AAT	2	6	2725478	2725483	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437929
47028	NC_022221	CGG	2	6	2725485	2725490	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437929
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47030	NC_022221	GCC	3	9	2725617	2725625	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437929
47031	NC_022221	TGG	2	6	2725653	2725658	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437929
47032	NC_022221	ACG	2	6	2725742	2725747	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437929
47033	NC_022221	GTG	2	6	2725794	2725799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437929
47034	NC_022221	CA	3	6	2725805	2725810	50 %	0 %	0 %	50 %	537437929
47035	NC_022221	CAC	2	6	2725819	2725824	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437929
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47038	NC_022221	GC	3	6	2726005	2726010	0 %	0 %	50 %	50 %	537437929
47039	NC_022221	TAA	2	6	2726065	2726070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437929
47040	NC_022221	TGCGC	2	10	2726071	2726080	0 %	20 %	40 %	40 %	537437929
47041	NC_022221	CAA	2	6	2726089	2726094	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437929
47042	NC_022221	GTT	2	6	2726135	2726140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437929
47043	NC_022221	ACG	2	6	2726147	2726152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437929
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47045	NC_022221	T	6	6	2726249	2726254	0 %	100 %	0 %	0 %	537437929
47046	NC_022221	CAG	2	6	2726360	2726365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437929
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47048	NC_022221	AACA	2	8	2726402	2726409	75 %	0 %	0 %	25 %	537437929
47049	NC_022221	GAA	2	6	2726484	2726489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437929
47050	NC_022221	CGC	2	6	2726500	2726505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437929
47051	NC_022221	TTCC	2	8	2726509	2726516	0 %	50 %	0 %	50 %	537437929
47052	NC_022221	CGG	2	6	2726578	2726583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437929
47053	NC_022221	TAA	2	6	2726588	2726593	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437929
47054	NC_022221	GCGA	2	8	2726676	2726683	25 %	0 %	50 %	25 %	537437929
47055	NC_022221	GTC	2	6	2726901	2726906	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437930
47056	NC_022221	CGA	2	6	2726913	2726918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437930
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47058	NC_022221	GAT	2	6	2727149	2727154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437930
47059	NC_022221	TCC	2	6	2727189	2727194	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437930
47060	NC_022221	GCC	3	9	2727231	2727239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437930
47061	NC_022221	CAGG	2	8	2727271	2727278	25 %	0 %	50 %	25 %	537437930
47062	NC_022221	CGC	2	6	2727428	2727433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437930
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47064	NC_022221	GC	3	6	2727484	2727489	0 %	0 %	50 %	50 %	537437930
47065	NC_022221	GCCACT	2	12	2727571	2727582	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537437930
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47067	NC_022221	GC	3	6	2727641	2727646	0 %	0 %	50 %	50 %	537437931
47068	NC_022221	CCA	2	6	2727663	2727668	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437931
47069	NC_022221	GCA	2	6	2727729	2727734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437931
47070	NC_022221	TTG	2	6	2727735	2727740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437931
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47072	NC_022221	GTGGAC	2	12	2727804	2727815	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537437931
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47084	NC_022221	GTACC	2	10	2728236	2728245	20 %	20 %	20 %	40 %	537437931
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47098	NC_022221	GCGATC	2	12	2729110	2729121	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537437932
47099	NC_022221	GCGG	2	8	2729132	2729139	0 %	0 %	75 %	25 %	537437932
47100	NC_022221	ACC	2	6	2729190	2729195	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437932
47101	NC_022221	CG	4	8	2729270	2729277	0 %	0 %	50 %	50 %	537437932
47102	NC_022221	CG	3	6	2729344	2729349	0 %	0 %	50 %	50 %	537437932
47103	NC_022221	ATT	2	6	2729421	2729426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437932
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47117	NC_022221	CAG	2	6	2730572	2730577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437934
47118	NC_022221	GCT	2	6	2730580	2730585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437934
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47121	NC_022221	GC	3	6	2730668	2730673	0 %	0 %	50 %	50 %	537437934
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47132	NC_022221	TGC	2	6	2731260	2731265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437934
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47148	NC_022221	GCCA	2	8	2732108	2732115	25 %	0 %	25 %	50 %	537437935
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47230	NC_022221	T	7	7	2737999	2738005	0 %	100 %	0 %	0 %	537437941
47231	NC_022221	CAT	2	6	2738283	2738288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437942
47232	NC_022221	CTC	2	6	2738367	2738372	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437942
47233	NC_022221	AGA	2	6	2738419	2738424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437942
47234	NC_022221	TGA	2	6	2738459	2738464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437942
47235	NC_022221	CTG	2	6	2738505	2738510	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437942
47236	NC_022221	GGA	2	6	2738574	2738579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537437942
47237	NC_022221	GAA	2	6	2738611	2738616	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437942
47238	NC_022221	GCG	2	6	2738656	2738661	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437942
47239	NC_022221	TTGC	2	8	2738664	2738671	0 %	50 %	25 %	25 %	537437942
47240	NC_022221	TCA	2	6	2738672	2738677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437942
47241	NC_022221	GCT	2	6	2738698	2738703	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437943
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47244	NC_022221	GCGAT	2	10	2738770	2738779	20 %	20 %	40 %	20 %	537437943
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47251	NC_022221	CTT	2	6	2739261	2739266	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437944
47252	NC_022221	TCT	2	6	2739269	2739274	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437944
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47255	NC_022221	CCTGCA	2	12	2739323	2739334	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537437944
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47259	NC_022221	TGA	2	6	2739416	2739421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437944
47260	NC_022221	CATC	2	8	2739449	2739456	25 %	25 %	0 %	50 %	537437944
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47266	NC_022221	CATCG	2	10	2739885	2739894	20 %	20 %	20 %	40 %	537437944
47267	NC_022221	CAT	2	6	2739951	2739956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437944
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47295	NC_022221	AT	3	6	2741060	2741065	50 %	50 %	0 %	0 %	537437945
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47302	NC_022221	CTG	2	6	2741277	2741282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437945
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47333	NC_022221	GAC	2	6	2742643	2742648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437946
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47335	NC_022221	GGA	2	6	2742684	2742689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537437946
47336	NC_022221	CG	3	6	2742707	2742712	0 %	0 %	50 %	50 %	537437946
47337	NC_022221	CGATAT	2	12	2742729	2742740	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	537437946
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47340	NC_022221	GAC	2	6	2742982	2742987	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437947
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47342	NC_022221	T	7	7	2743007	2743013	0 %	100 %	0 %	0 %	537437947
47343	NC_022221	CA	3	6	2743016	2743021	50 %	0 %	0 %	50 %	537437947
47344	NC_022221	TC	3	6	2743046	2743051	0 %	50 %	0 %	50 %	537437947
47345	NC_022221	TGAAGA	2	12	2743218	2743229	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537437947
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47465	NC_022221	CGG	2	6	2761657	2761662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437957
47466	NC_022221	TCG	2	6	2761672	2761677	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437957
47467	NC_022221	GCAGC	2	10	2761706	2761715	20 %	0 %	40 %	40 %	537437957
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47469	NC_022221	GAATC	2	10	2761762	2761771	40 %	20 %	20 %	20 %	537437957
47470	NC_022221	TGA	2	6	2761828	2761833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437957
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47485	NC_022221	AACTG	2	10	2762437	2762446	40 %	20 %	20 %	20 %	537437957
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47494	NC_022221	GC	3	6	2765139	2765144	0 %	0 %	50 %	50 %	537437958
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47498	NC_022221	A	6	6	2765271	2765276	100 %	0 %	0 %	0 %	537437958
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