MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45501	NC_022221	GCG	2	6	2615537	2615542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437828
45502	NC_022221	T	6	6	2615639	2615644	0 %	100 %	0 %	0 %	537437828
45503	NC_022221	GCC	2	6	2615659	2615664	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437828
45504	NC_022221	GTCAT	2	10	2615669	2615678	20 %	40 %	20 %	20 %	537437828
45505	NC_022221	CGA	2	6	2615797	2615802	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437829
45506	NC_022221	GCA	2	6	2615901	2615906	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437829
45507	NC_022221	TGC	2	6	2615938	2615943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437829
45508	NC_022221	TCA	2	6	2615968	2615973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437829
45509	NC_022221	CG	5	10	2616074	2616083	0 %	0 %	50 %	50 %	537437829
45510	NC_022221	TCCG	2	8	2616139	2616146	0 %	25 %	25 %	50 %	537437829
45511	NC_022221	TAG	2	6	2616178	2616183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437829
45512	NC_022221	GCT	2	6	2616217	2616222	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437829
45513	NC_022221	CTC	3	9	2616241	2616249	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437830
45514	NC_022221	CATCGC	2	12	2616335	2616346	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537437830
45515	NC_022221	GCG	2	6	2616351	2616356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45516	NC_022221	AAT	2	6	2616369	2616374	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437830
45517	NC_022221	GC	3	6	2616394	2616399	0 %	0 %	50 %	50 %	537437830
45518	NC_022221	TGG	2	6	2616453	2616458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437830
45519	NC_022221	ACG	2	6	2616528	2616533	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437830
45520	NC_022221	CGG	2	6	2616535	2616540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45521	NC_022221	CGGTGC	2	12	2616556	2616567	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537437830
45522	NC_022221	CGC	2	6	2616647	2616652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437830
45523	NC_022221	CAT	2	6	2616706	2616711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437830
45524	NC_022221	GCG	2	6	2616807	2616812	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45525	NC_022221	GATCG	2	10	2616827	2616836	20 %	20 %	40 %	20 %	537437830
45526	NC_022221	CGC	2	6	2616851	2616856	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437830
45527	NC_022221	GCG	2	6	2616883	2616888	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45528	NC_022221	CGG	2	6	2616913	2616918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45529	NC_022221	TGG	2	6	2616919	2616924	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437830
45530	NC_022221	CGACA	2	10	2617073	2617082	40 %	0 %	20 %	40 %	537437830
45531	NC_022221	CCG	2	6	2617120	2617125	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437830
45532	NC_022221	GGC	2	6	2617189	2617194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45533	NC_022221	CCA	2	6	2617225	2617230	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437830
45534	NC_022221	ATA	2	6	2617311	2617316	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437830
45535	NC_022221	GCCA	2	8	2617416	2617423	25 %	0 %	25 %	50 %	537437830
45536	NC_022221	GCA	2	6	2617440	2617445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437830
45537	NC_022221	ACG	2	6	2617488	2617493	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437830
45538	NC_022221	CCA	2	6	2617528	2617533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437830
45539	NC_022221	CCG	2	6	2617563	2617568	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437830
45540	NC_022221	CGG	2	6	2617570	2617575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45541	NC_022221	GC	3	6	2617591	2617596	0 %	0 %	50 %	50 %	537437830
45542	NC_022221	CAC	2	6	2617619	2617624	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437830
45543	NC_022221	ATC	2	6	2617668	2617673	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437830
45544	NC_022221	CA	3	6	2617745	2617750	50 %	0 %	0 %	50 %	537437830
45545	NC_022221	TCG	2	6	2617767	2617772	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437830
45546	NC_022221	CCA	2	6	2617831	2617836	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437830
45547	NC_022221	CAG	2	6	2617892	2617897	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437830
45548	NC_022221	GCG	2	6	2617917	2617922	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437830
45549	NC_022221	CCA	2	6	2617978	2617983	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437830
45550	NC_022221	TTG	2	6	2618135	2618140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437830
45551	NC_022221	T	6	6	2618273	2618278	0 %	100 %	0 %	0 %	537437830
45552	NC_022221	GTC	2	6	2618288	2618293	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437830
45553	NC_022221	CCG	2	6	2618305	2618310	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437830
45554	NC_022221	T	6	6	2618338	2618343	0 %	100 %	0 %	0 %	537437830
45555	NC_022221	CGC	2	6	2618348	2618353	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437830
45556	NC_022221	CCG	2	6	2618365	2618370	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437830
45557	NC_022221	GC	3	6	2618391	2618396	0 %	0 %	50 %	50 %	537437830
45558	NC_022221	ACG	2	6	2618470	2618475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437830
45559	NC_022221	AAGC	2	8	2618495	2618502	50 %	0 %	25 %	25 %	537437830
45560	NC_022221	TCGTG	2	10	2618506	2618515	0 %	40 %	40 %	20 %	537437830
45561	NC_022221	CTGA	2	8	2618524	2618531	25 %	25 %	25 %	25 %	537437830
45562	NC_022221	GAT	2	6	2618655	2618660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437831
45563	NC_022221	CGC	2	6	2618854	2618859	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437832
45564	NC_022221	C	6	6	2618920	2618925	0 %	0 %	0 %	100 %	537437832
45565	NC_022221	GC	3	6	2618931	2618936	0 %	0 %	50 %	50 %	537437832
45566	NC_022221	CGG	2	6	2618991	2618996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437832
45567	NC_022221	CG	3	6	2619042	2619047	0 %	0 %	50 %	50 %	537437832
45568	NC_022221	GGA	2	6	2619050	2619055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537437832
45569	NC_022221	CTG	2	6	2619107	2619112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437832
45570	NC_022221	GATC	2	8	2619118	2619125	25 %	25 %	25 %	25 %	537437832
45571	NC_022221	CCG	2	6	2619153	2619158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437832
45572	NC_022221	CAGGCG	2	12	2619194	2619205	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	537437832
45573	NC_022221	GCG	2	6	2619237	2619242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437832
45574	NC_022221	GCC	2	6	2619317	2619322	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437832
45575	NC_022221	CGC	2	6	2619325	2619330	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437832
45576	NC_022221	GC	3	6	2619332	2619337	0 %	0 %	50 %	50 %	537437832
45577	NC_022221	GCG	3	9	2619420	2619428	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437832
45578	NC_022221	GAC	2	6	2619451	2619456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437832
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45581	NC_022221	GCA	2	6	2619633	2619638	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437832
45582	NC_022221	GC	3	6	2619653	2619658	0 %	0 %	50 %	50 %	537437832
45583	NC_022221	TCG	2	6	2619798	2619803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437832
45584	NC_022221	CGT	2	6	2619865	2619870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437832
45585	NC_022221	A	6	6	2619894	2619899	100 %	0 %	0 %	0 %	537437832
45586	NC_022221	TGC	2	6	2620097	2620102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437833
45587	NC_022221	TGGC	2	8	2620103	2620110	0 %	25 %	50 %	25 %	537437833
45588	NC_022221	CGC	2	6	2620157	2620162	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437833
45589	NC_022221	GCCGC	2	10	2620225	2620234	0 %	0 %	40 %	60 %	537437833
45590	NC_022221	TGT	2	6	2620265	2620270	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437833
45591	NC_022221	CG	3	6	2620378	2620383	0 %	0 %	50 %	50 %	537437833
45592	NC_022221	GAA	2	6	2620399	2620404	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437833
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45600	NC_022221	GCG	2	6	2620894	2620899	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437833
45601	NC_022221	ATT	2	6	2620912	2620917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437833
45602	NC_022221	GC	3	6	2621040	2621045	0 %	0 %	50 %	50 %	537437833
45603	NC_022221	GTC	2	6	2621092	2621097	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437833
45604	NC_022221	GTG	2	6	2621104	2621109	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437833
45605	NC_022221	GGCG	2	8	2621126	2621133	0 %	0 %	75 %	25 %	537437833
45606	NC_022221	ATT	2	6	2621137	2621142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437833
45607	NC_022221	TGG	2	6	2621147	2621152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437833
45608	NC_022221	GTTTG	2	10	2621226	2621235	0 %	60 %	40 %	0 %	537437833
45609	NC_022221	GGC	2	6	2621325	2621330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437833
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45611	NC_022221	TTCT	2	8	2621363	2621370	0 %	75 %	0 %	25 %	537437833
45612	NC_022221	CGG	2	6	2621387	2621392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437833
45613	NC_022221	CT	3	6	2621490	2621495	0 %	50 %	0 %	50 %	537437833
45614	NC_022221	GCTG	2	8	2621511	2621518	0 %	25 %	50 %	25 %	537437833
45615	NC_022221	CAC	2	6	2621536	2621541	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437833
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45617	NC_022221	TTC	2	6	2621617	2621622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437833
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45675	NC_022221	AT	3	6	2627319	2627324	50 %	50 %	0 %	0 %	537437838
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45724	NC_022221	AC	3	6	2630315	2630320	50 %	0 %	0 %	50 %	537437841
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45726	NC_022221	A	8	8	2630528	2630535	100 %	0 %	0 %	0 %	537437841
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45730	NC_022221	CCGAT	2	10	2630719	2630728	20 %	20 %	20 %	40 %	537437841
45731	NC_022221	ATA	2	6	2630854	2630859	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437842
45732	NC_022221	AG	3	6	2630897	2630902	50 %	0 %	50 %	0 %	537437842
45733	NC_022221	ACT	2	6	2630915	2630920	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437842
45734	NC_022221	A	7	7	2630989	2630995	100 %	0 %	0 %	0 %	537437842
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45853	NC_022221	ATT	2	6	2642192	2642197	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437850
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45968	NC_022221	CG	3	6	2649920	2649925	0 %	0 %	50 %	50 %	537437858
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45997	NC_022221	TCCA	2	8	2652212	2652219	25 %	25 %	0 %	50 %	537437860
45998	NC_022221	A	9	9	2652284	2652292	100 %	0 %	0 %	0 %	537437860
45999	NC_022221	GAT	2	6	2652548	2652553	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437861
46000	NC_022221	CTT	2	6	2652573	2652578	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437861

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