MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
45001	NC_022221	GGC	2	6	2582080	2582085	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437804
45002	NC_022221	CTG	2	6	2582117	2582122	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437804
45003	NC_022221	AGCGC	2	10	2582140	2582149	20 %	0 %	40 %	40 %	537437804
45004	NC_022221	AGG	2	6	2582158	2582163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537437804
45005	NC_022221	A	6	6	2582166	2582171	100 %	0 %	0 %	0 %	537437804
45006	NC_022221	CTG	2	6	2582172	2582177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437804
45007	NC_022221	TGA	2	6	2582258	2582263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437804
45008	NC_022221	GCC	2	6	2582283	2582288	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437804
45009	NC_022221	TAA	2	6	2582388	2582393	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437804
45010	NC_022221	AAT	2	6	2582441	2582446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437804
45011	NC_022221	CGG	2	6	2582615	2582620	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437805
45012	NC_022221	CGAT	2	8	2582663	2582670	25 %	25 %	25 %	25 %	537437805
45013	NC_022221	GATA	2	8	2582700	2582707	50 %	25 %	25 %	0 %	537437805
45014	NC_022221	ATT	2	6	2582741	2582746	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437805
45015	NC_022221	TGC	2	6	2582930	2582935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437805
45016	NC_022221	TTA	2	6	2583047	2583052	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437805
45017	NC_022221	CGAA	2	8	2583061	2583068	50 %	0 %	25 %	25 %	537437805
45018	NC_022221	TCGG	2	8	2583148	2583155	0 %	25 %	50 %	25 %	537437805
45019	NC_022221	CAG	2	6	2583187	2583192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437805
45020	NC_022221	GTG	3	9	2583226	2583234	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437805
45021	NC_022221	GCG	2	6	2583305	2583310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437805
45022	NC_022221	TGA	2	6	2583357	2583362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437805
45023	NC_022221	CTTC	2	8	2583394	2583401	0 %	50 %	0 %	50 %	537437805
45024	NC_022221	CG	3	6	2583421	2583426	0 %	0 %	50 %	50 %	537437805
45025	NC_022221	TCT	2	6	2583482	2583487	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437805
45026	NC_022221	GTAT	2	8	2583551	2583558	25 %	50 %	25 %	0 %	537437805
45027	NC_022221	GCC	2	6	2583605	2583610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437805
45028	NC_022221	TCA	2	6	2583714	2583719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437806
45029	NC_022221	AAT	2	6	2583734	2583739	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437806
45030	NC_022221	GCCA	2	8	2583747	2583754	25 %	0 %	25 %	50 %	537437806
45031	NC_022221	TAA	2	6	2583760	2583765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437806
45032	NC_022221	ACG	2	6	2583828	2583833	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437806
45033	NC_022221	TAG	2	6	2583870	2583875	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437806
45034	NC_022221	ACG	2	6	2583884	2583889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437806
45035	NC_022221	CT	3	6	2584191	2584196	0 %	50 %	0 %	50 %	537437807
45036	NC_022221	CCT	2	6	2584230	2584235	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437807
45037	NC_022221	CTG	2	6	2584307	2584312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437807
45038	NC_022221	TGGGC	2	10	2584381	2584390	0 %	20 %	60 %	20 %	537437807
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45040	NC_022221	CGTCAC	2	12	2584469	2584480	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537437807
45041	NC_022221	CGCC	2	8	2584542	2584549	0 %	0 %	25 %	75 %	537437808
45042	NC_022221	TCA	2	6	2584552	2584557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437808
45043	NC_022221	GTC	2	6	2584579	2584584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437808
45044	NC_022221	T	6	6	2584697	2584702	0 %	100 %	0 %	0 %	537437808
45045	NC_022221	CTCA	2	8	2584749	2584756	25 %	25 %	0 %	50 %	537437808
45046	NC_022221	CTGCC	2	10	2584764	2584773	0 %	20 %	20 %	60 %	537437808
45047	NC_022221	GC	3	6	2584940	2584945	0 %	0 %	50 %	50 %	537437808
45048	NC_022221	CCT	2	6	2585012	2585017	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437808
45049	NC_022221	CGTAC	2	10	2585020	2585029	20 %	20 %	20 %	40 %	537437808
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45051	NC_022221	ATC	2	6	2585160	2585165	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437808
45052	NC_022221	GCG	2	6	2585292	2585297	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437808
45053	NC_022221	GCC	2	6	2585344	2585349	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437808
45054	NC_022221	CTG	2	6	2585364	2585369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437808
45055	NC_022221	CAGC	2	8	2585375	2585382	25 %	0 %	25 %	50 %	537437808
45056	NC_022221	CT	3	6	2585457	2585462	0 %	50 %	0 %	50 %	537437808
45057	NC_022221	CTGG	2	8	2585473	2585480	0 %	25 %	50 %	25 %	537437808
45058	NC_022221	TAC	2	6	2585493	2585498	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437808
45059	NC_022221	ACT	2	6	2585550	2585555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437808
45060	NC_022221	CAGC	2	8	2585557	2585564	25 %	0 %	25 %	50 %	537437808
45061	NC_022221	CGC	2	6	2585607	2585612	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437808
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45068	NC_022221	CAG	2	6	2585840	2585845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437809
45069	NC_022221	GC	3	6	2585885	2585890	0 %	0 %	50 %	50 %	537437809
45070	NC_022221	AGT	2	6	2585926	2585931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437809
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45090	NC_022221	A	6	6	2586837	2586842	100 %	0 %	0 %	0 %	537437809
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45099	NC_022221	CGG	2	6	2587640	2587645	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437810
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45104	NC_022221	TAA	2	6	2587925	2587930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437810
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45109	NC_022221	ATC	2	6	2588085	2588090	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437810
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45117	NC_022221	CCA	2	6	2588494	2588499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437811
45118	NC_022221	CG	3	6	2588512	2588517	0 %	0 %	50 %	50 %	537437811
45119	NC_022221	TGA	2	6	2588523	2588528	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437811
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45124	NC_022221	TGA	3	9	2588726	2588734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437811
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45331	NC_022221	AG	3	6	2599268	2599273	50 %	0 %	50 %	0 %	537437818
45332	NC_022221	TGCC	2	8	2599286	2599293	0 %	25 %	25 %	50 %	537437818
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45346	NC_022221	ATG	2	6	2600146	2600151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437819
45347	NC_022221	CGC	2	6	2600251	2600256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437819
45348	NC_022221	AGC	2	6	2600263	2600268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437819
45349	NC_022221	GGC	2	6	2600348	2600353	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437819
45350	NC_022221	T	6	6	2600373	2600378	0 %	100 %	0 %	0 %	537437819
45351	NC_022221	CCCT	2	8	2600411	2600418	0 %	25 %	0 %	75 %	537437819
45352	NC_022221	GCG	2	6	2600434	2600439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437819
45353	NC_022221	ACG	2	6	2600504	2600509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437819
45354	NC_022221	AGG	2	6	2600510	2600515	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537437819
45355	NC_022221	CGGG	2	8	2600517	2600524	0 %	0 %	75 %	25 %	537437819
45356	NC_022221	CGG	2	6	2600543	2600548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437819
45357	NC_022221	GCT	2	6	2600552	2600557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437819
45358	NC_022221	GGA	2	6	2600615	2600620	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537437819
45359	NC_022221	CGG	2	6	2600639	2600644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437819
45360	NC_022221	TCC	2	6	2600771	2600776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437819
45361	NC_022221	GGC	2	6	2600837	2600842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437819
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45363	NC_022221	ATG	2	6	2600946	2600951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437819
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45368	NC_022221	CGG	2	6	2601121	2601126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437819
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45373	NC_022221	TCT	2	6	2601445	2601450	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437820
45374	NC_022221	GCG	2	6	2601461	2601466	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437820
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45377	NC_022221	T	6	6	2601897	2601902	0 %	100 %	0 %	0 %	537437821
45378	NC_022221	TGG	2	6	2601925	2601930	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437821
45379	NC_022221	CGGG	2	8	2601957	2601964	0 %	0 %	75 %	25 %	537437821
45380	NC_022221	TCA	2	6	2601967	2601972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437821
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45383	NC_022221	CCA	2	6	2602124	2602129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437821
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45387	NC_022221	T	6	6	2602236	2602241	0 %	100 %	0 %	0 %	537437821
45388	NC_022221	T	6	6	2602249	2602254	0 %	100 %	0 %	0 %	537437821
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45402	NC_022221	AGT	2	6	2603476	2603481	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437822
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45406	NC_022221	CCA	2	6	2603739	2603744	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437822
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45408	NC_022221	CGC	2	6	2604010	2604015	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437822
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45413	NC_022221	CAT	2	6	2604256	2604261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437822
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45421	NC_022221	CGCC	2	8	2606035	2606042	0 %	0 %	25 %	75 %	537437823
45422	NC_022221	CCAT	2	8	2606074	2606081	25 %	25 %	0 %	50 %	537437823
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45424	NC_022221	T	6	6	2606099	2606104	0 %	100 %	0 %	0 %	537437823
45425	NC_022221	GTA	2	6	2606158	2606163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437824
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45435	NC_022221	CAA	3	9	2606515	2606523	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437824
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45449	NC_022221	ATA	2	6	2607089	2607094	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437824
45450	NC_022221	CG	3	6	2607172	2607177	0 %	0 %	50 %	50 %	537437825
45451	NC_022221	CGGT	2	8	2607197	2607204	0 %	25 %	50 %	25 %	537437825
45452	NC_022221	CCG	2	6	2607209	2607214	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437825
45453	NC_022221	AAG	2	6	2607286	2607291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437825
45454	NC_022221	GCA	2	6	2607350	2607355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437825
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45456	NC_022221	GTC	2	6	2607391	2607396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437825
45457	NC_022221	GTAGC	2	10	2607486	2607495	20 %	20 %	40 %	20 %	537437825
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45462	NC_022221	CCA	2	6	2607839	2607844	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437825
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45464	NC_022221	CGG	2	6	2607877	2607882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437825
45465	NC_022221	CGC	2	6	2607957	2607962	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437825
45466	NC_022221	ACG	2	6	2607992	2607997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437825
45467	NC_022221	ACC	2	6	2608030	2608035	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437825
45468	NC_022221	CCA	2	6	2608124	2608129	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437825
45469	NC_022221	GGCCC	2	10	2608151	2608160	0 %	0 %	40 %	60 %	537437825
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45471	NC_022221	TAA	2	6	2608236	2608241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437825
45472	NC_022221	GTTC	2	8	2608284	2608291	0 %	50 %	25 %	25 %	537437825
45473	NC_022221	AGCG	2	8	2608372	2608379	25 %	0 %	50 %	25 %	537437825
45474	NC_022221	ACC	2	6	2608420	2608425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437825
45475	NC_022221	ATA	2	6	2608462	2608467	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437825
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45480	NC_022221	GCA	2	6	2614188	2614193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437826
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45484	NC_022221	CCG	2	6	2614409	2614414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437826
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45486	NC_022221	A	6	6	2614434	2614439	100 %	0 %	0 %	0 %	537437826
45487	NC_022221	TGC	2	6	2614475	2614480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437826
45488	NC_022221	AGC	2	6	2614592	2614597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437826
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45490	NC_022221	ACA	2	6	2614676	2614681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437826
45491	NC_022221	AGA	2	6	2614728	2614733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437826
45492	NC_022221	TGA	2	6	2614837	2614842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437826
45493	NC_022221	AGC	2	6	2615009	2615014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437826
45494	NC_022221	GC	3	6	2615013	2615018	0 %	0 %	50 %	50 %	537437826
45495	NC_022221	GTC	3	9	2615180	2615188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437826
45496	NC_022221	G	6	6	2615196	2615201	0 %	0 %	100 %	0 %	537437826
45497	NC_022221	ATT	2	6	2615373	2615378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437827
45498	NC_022221	T	6	6	2615410	2615415	0 %	100 %	0 %	0 %	537437827
45499	NC_022221	AAGCG	2	10	2615440	2615449	40 %	0 %	40 %	20 %	537437827
45500	NC_022221	CG	3	6	2615508	2615513	0 %	0 %	50 %	50 %	537437828

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