MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
44001	NC_022221	GCT	2	6	2530556	2530561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437748
44002	NC_022221	CAT	2	6	2530604	2530609	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437748
44003	NC_022221	CGG	2	6	2530619	2530624	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437748
44004	NC_022221	GCT	2	6	2530658	2530663	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437748
44005	NC_022221	AAGAT	2	10	2530792	2530801	60 %	20 %	20 %	0 %	537437748
44006	NC_022221	CCG	2	6	2530804	2530809	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437748
44007	NC_022221	GTGTG	2	10	2530828	2530837	0 %	40 %	60 %	0 %	537437748
44008	NC_022221	ATT	2	6	2530853	2530858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437748
44009	NC_022221	CCAG	2	8	2530861	2530868	25 %	0 %	25 %	50 %	537437748
44010	NC_022221	ATC	2	6	2530902	2530907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437748
44011	NC_022221	GTTG	2	8	2530913	2530920	0 %	50 %	50 %	0 %	537437748
44012	NC_022221	GGC	2	6	2530961	2530966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437748
44013	NC_022221	ACT	2	6	2530978	2530983	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437748
44014	NC_022221	CCA	2	6	2531159	2531164	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437749
44015	NC_022221	CGG	2	6	2531177	2531182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437749
44016	NC_022221	CGG	2	6	2531209	2531214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437749
44017	NC_022221	CAT	2	6	2531339	2531344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437749
44018	NC_022221	ACC	2	6	2531421	2531426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437749
44019	NC_022221	GTC	2	6	2531436	2531441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437749
44020	NC_022221	CGG	4	12	2531477	2531488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437749
44021	NC_022221	GAA	2	6	2531593	2531598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437749
44022	NC_022221	GCG	2	6	2531635	2531640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437749
44023	NC_022221	CTG	2	6	2531657	2531662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437749
44024	NC_022221	TGCC	2	8	2531685	2531692	0 %	25 %	25 %	50 %	537437749
44025	NC_022221	GC	3	6	2531694	2531699	0 %	0 %	50 %	50 %	537437749
44026	NC_022221	CAG	2	6	2531705	2531710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437749
44027	NC_022221	CGA	2	6	2531813	2531818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437749
44028	NC_022221	GGT	2	6	2531853	2531858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437749
44029	NC_022221	GCCC	2	8	2531859	2531866	0 %	0 %	25 %	75 %	537437749
44030	NC_022221	TCA	2	6	2531894	2531899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437749
44031	NC_022221	CAG	2	6	2531943	2531948	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437750
44032	NC_022221	CGG	2	6	2531960	2531965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437750
44033	NC_022221	GATA	2	8	2532023	2532030	50 %	25 %	25 %	0 %	537437750
44034	NC_022221	GGC	2	6	2532050	2532055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437750
44035	NC_022221	CAG	2	6	2532135	2532140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437750
44036	NC_022221	CCA	2	6	2532170	2532175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437750
44037	NC_022221	TGA	2	6	2532202	2532207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437750
44038	NC_022221	GCC	2	6	2532211	2532216	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437750
44039	NC_022221	CTT	2	6	2532224	2532229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437750
44040	NC_022221	TG	3	6	2532271	2532276	0 %	50 %	50 %	0 %	537437750
44041	NC_022221	TCC	2	6	2532307	2532312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437750
44042	NC_022221	AGCG	2	8	2532346	2532353	25 %	0 %	50 %	25 %	537437750
44043	NC_022221	TGC	2	6	2532465	2532470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437750
44044	NC_022221	GCC	2	6	2532486	2532491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437750
44045	NC_022221	TCA	2	6	2532553	2532558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437750
44046	NC_022221	GGT	2	6	2532576	2532581	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437750
44047	NC_022221	TCG	2	6	2532614	2532619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437750
44048	NC_022221	GC	3	6	2532660	2532665	0 %	0 %	50 %	50 %	537437750
44049	NC_022221	CGC	2	6	2532671	2532676	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437750
44050	NC_022221	GGCC	2	8	2532707	2532714	0 %	0 %	50 %	50 %	537437750
44051	NC_022221	GCTGCC	2	12	2532810	2532821	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	537437750
44052	NC_022221	AGT	2	6	2532826	2532831	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437750
44053	NC_022221	GCT	2	6	2532872	2532877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437750
44054	NC_022221	CCA	2	6	2532890	2532895	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437750
44055	NC_022221	ATC	3	9	2532909	2532917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437750
44056	NC_022221	AAC	2	6	2532934	2532939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437750
44057	NC_022221	CTT	2	6	2532944	2532949	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437750
44058	NC_022221	GGT	2	6	2532963	2532968	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437750
44059	NC_022221	GC	3	6	2533341	2533346	0 %	0 %	50 %	50 %	537437751
44060	NC_022221	TCG	2	6	2533350	2533355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437751
44061	NC_022221	GGTT	2	8	2533357	2533364	0 %	50 %	50 %	0 %	537437751
44062	NC_022221	GCG	2	6	2533463	2533468	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437751
44063	NC_022221	ACC	2	6	2533474	2533479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437751
44064	NC_022221	CTCCAG	2	12	2533504	2533515	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537437751
44065	NC_022221	ATCT	2	8	2533528	2533535	25 %	50 %	0 %	25 %	537437751
44066	NC_022221	GCCC	2	8	2533596	2533603	0 %	0 %	25 %	75 %	537437751
44067	NC_022221	GCT	2	6	2533614	2533619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437751
44068	NC_022221	GCAT	2	8	2533685	2533692	25 %	25 %	25 %	25 %	537437751
44069	NC_022221	GCC	2	6	2533775	2533780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437751
44070	NC_022221	CTGGAT	2	12	2533807	2533818	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537437751
44071	NC_022221	CTG	2	6	2534088	2534093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437752
44072	NC_022221	GGT	2	6	2534135	2534140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437752
44073	NC_022221	GGT	2	6	2534250	2534255	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437752
44074	NC_022221	CGC	2	6	2534320	2534325	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437752
44075	NC_022221	CATT	2	8	2534326	2534333	25 %	50 %	0 %	25 %	537437752
44076	NC_022221	GC	3	6	2534336	2534341	0 %	0 %	50 %	50 %	537437752
44077	NC_022221	CGC	3	9	2534339	2534347	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437752
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44081	NC_022221	CGC	2	6	2534416	2534421	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437752
44082	NC_022221	ACA	2	6	2534449	2534454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437752
44083	NC_022221	GCT	2	6	2534459	2534464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437752
44084	NC_022221	ACGGC	2	10	2534551	2534560	20 %	0 %	40 %	40 %	537437752
44085	NC_022221	TGC	2	6	2534566	2534571	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437752
44086	NC_022221	TAA	2	6	2534681	2534686	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437752
44087	NC_022221	TCT	2	6	2534761	2534766	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437752
44088	NC_022221	GGCC	2	8	2534767	2534774	0 %	0 %	50 %	50 %	537437752
44089	NC_022221	AGCGC	2	10	2534788	2534797	20 %	0 %	40 %	40 %	537437752
44090	NC_022221	CTG	2	6	2534874	2534879	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437752
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44094	NC_022221	CTGATG	2	12	2535083	2535094	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537437753
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44096	NC_022221	CT	3	6	2535194	2535199	0 %	50 %	0 %	50 %	537437753
44097	NC_022221	ACG	2	6	2535257	2535262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437753
44098	NC_022221	TGC	2	6	2535264	2535269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437753
44099	NC_022221	TGG	2	6	2535366	2535371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437753
44100	NC_022221	TGCG	2	8	2535429	2535436	0 %	25 %	50 %	25 %	537437753
44101	NC_022221	AGC	2	6	2535441	2535446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437753
44102	NC_022221	TAAT	2	8	2535456	2535463	50 %	50 %	0 %	0 %	537437753
44103	NC_022221	CGC	2	6	2535508	2535513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437753
44104	NC_022221	CGG	2	6	2535535	2535540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437753
44105	NC_022221	CAG	2	6	2535542	2535547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437753
44106	NC_022221	CG	3	6	2535566	2535571	0 %	0 %	50 %	50 %	537437753
44107	NC_022221	CG	3	6	2535585	2535590	0 %	0 %	50 %	50 %	537437753
44108	NC_022221	ATA	2	6	2535639	2535644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437753
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44110	NC_022221	CG	3	6	2535788	2535793	0 %	0 %	50 %	50 %	537437753
44111	NC_022221	GCC	2	6	2535821	2535826	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437753
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44113	NC_022221	TGG	2	6	2535891	2535896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437753
44114	NC_022221	GCG	2	6	2535906	2535911	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437753
44115	NC_022221	CG	3	6	2535923	2535928	0 %	0 %	50 %	50 %	537437753
44116	NC_022221	CCA	2	6	2535943	2535948	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437753
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44119	NC_022221	CTG	2	6	2536070	2536075	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437753
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44128	NC_022221	CTG	3	9	2536444	2536452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437754
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44145	NC_022221	GCG	2	6	2537316	2537321	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437755
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44214	NC_022221	TACCC	2	10	2540747	2540756	20 %	20 %	0 %	60 %	537437759
44215	NC_022221	AG	3	6	2540800	2540805	50 %	0 %	50 %	0 %	537437759
44216	NC_022221	CGA	2	6	2540821	2540826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437759
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44218	NC_022221	TACT	2	8	2540837	2540844	25 %	50 %	0 %	25 %	537437759
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44220	NC_022221	GTC	2	6	2540994	2540999	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437759
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44222	NC_022221	CGGTAT	2	12	2541112	2541123	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537437759
44223	NC_022221	GGC	2	6	2541130	2541135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437759
44224	NC_022221	AAG	2	6	2541141	2541146	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437759
44225	NC_022221	CGC	2	6	2541155	2541160	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437759
44226	NC_022221	TG	3	6	2541167	2541172	0 %	50 %	50 %	0 %	537437759
44227	NC_022221	CCG	2	6	2541192	2541197	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437759
44228	NC_022221	CCGAC	2	10	2541235	2541244	20 %	0 %	20 %	60 %	537437759
44229	NC_022221	GC	3	6	2541294	2541299	0 %	0 %	50 %	50 %	537437759
44230	NC_022221	CAA	2	6	2541301	2541306	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437759
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44349	NC_022221	AC	3	6	2547729	2547734	50 %	0 %	0 %	50 %	537437766
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44453	NC_022221	CTGG	2	8	2554273	2554280	0 %	25 %	50 %	25 %	537437776
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44457	NC_022221	TATCCA	2	12	2554467	2554478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437776
44458	NC_022221	CGC	3	9	2554497	2554505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437776
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44461	NC_022221	GCG	2	6	2554557	2554562	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437776
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44463	NC_022221	GGT	2	6	2554645	2554650	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437776
44464	NC_022221	GC	3	6	2554657	2554662	0 %	0 %	50 %	50 %	537437776
44465	NC_022221	T	6	6	2554704	2554709	0 %	100 %	0 %	0 %	537437776
44466	NC_022221	CTT	2	6	2554710	2554715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437776
44467	NC_022221	GGC	2	6	2554753	2554758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437776
44468	NC_022221	CGC	2	6	2554761	2554766	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437776
44469	NC_022221	CGA	2	6	2554830	2554835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437776
44470	NC_022221	ACG	2	6	2554841	2554846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437776
44471	NC_022221	ATG	2	6	2554853	2554858	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437776
44472	NC_022221	GTG	2	6	2554982	2554987	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437777
44473	NC_022221	CGAC	2	8	2555036	2555043	25 %	0 %	25 %	50 %	537437777
44474	NC_022221	TCA	2	6	2555066	2555071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437777
44475	NC_022221	CTG	2	6	2555119	2555124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437777
44476	NC_022221	ACC	2	6	2555162	2555167	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437777
44477	NC_022221	A	6	6	2555236	2555241	100 %	0 %	0 %	0 %	537437777
44478	NC_022221	CT	3	6	2555331	2555336	0 %	50 %	0 %	50 %	537437778
44479	NC_022221	GTA	2	6	2555384	2555389	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437778
44480	NC_022221	GAT	2	6	2555446	2555451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437778
44481	NC_022221	AAT	2	6	2555467	2555472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437778
44482	NC_022221	CAC	2	6	2555546	2555551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437778
44483	NC_022221	CCA	2	6	2555638	2555643	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437778
44484	NC_022221	CCG	2	6	2555757	2555762	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437778
44485	NC_022221	ATG	2	6	2555841	2555846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437778
44486	NC_022221	CAACG	2	10	2555904	2555913	40 %	0 %	20 %	40 %	537437778
44487	NC_022221	TCA	2	6	2555967	2555972	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437778
44488	NC_022221	ATC	2	6	2555976	2555981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437778
44489	NC_022221	GCC	2	6	2556122	2556127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437778
44490	NC_022221	AAT	2	6	2556236	2556241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437778
44491	NC_022221	GC	3	6	2556244	2556249	0 %	0 %	50 %	50 %	537437778
44492	NC_022221	CTT	2	6	2556262	2556267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437778
44493	NC_022221	GAC	2	6	2556349	2556354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437778
44494	NC_022221	CG	4	8	2556360	2556367	0 %	0 %	50 %	50 %	537437778
44495	NC_022221	GGT	2	6	2556374	2556379	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437778
44496	NC_022221	CTT	2	6	2556590	2556595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437779
44497	NC_022221	A	6	6	2556654	2556659	100 %	0 %	0 %	0 %	537437779
44498	NC_022221	GT	3	6	2556700	2556705	0 %	50 %	50 %	0 %	537437779
44499	NC_022221	ATCA	2	8	2556777	2556784	50 %	25 %	0 %	25 %	537437779
44500	NC_022221	ATAA	2	8	2556804	2556811	75 %	25 %	0 %	0 %	537437779

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