MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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41002	NC_022221	GC	3	6	2369413	2369418	0 %	0 %	50 %	50 %	537437593
41003	NC_022221	GCC	2	6	2369589	2369594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437593
41004	NC_022221	ACA	2	6	2369632	2369637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437593
41005	NC_022221	GCT	2	6	2369666	2369671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437593
41006	NC_022221	ATT	2	6	2369737	2369742	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437593
41007	NC_022221	TTG	2	6	2369754	2369759	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437593
41008	NC_022221	GCC	2	6	2369772	2369777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437593
41009	NC_022221	TCA	2	6	2369846	2369851	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437594
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41011	NC_022221	CAG	3	9	2369909	2369917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437594
41012	NC_022221	TCA	2	6	2369971	2369976	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437594
41013	NC_022221	GCGCC	2	10	2369998	2370007	0 %	0 %	40 %	60 %	537437594
41014	NC_022221	CATT	2	8	2370046	2370053	25 %	50 %	0 %	25 %	537437594
41015	NC_022221	GCA	2	6	2370085	2370090	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437594
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41017	NC_022221	AGCC	2	8	2370123	2370130	25 %	0 %	25 %	50 %	537437594
41018	NC_022221	CAGA	2	8	2370140	2370147	50 %	0 %	25 %	25 %	537437594
41019	NC_022221	ATG	2	6	2370171	2370176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437594
41020	NC_022221	GC	3	6	2370268	2370273	0 %	0 %	50 %	50 %	537437594
41021	NC_022221	GCC	2	6	2370279	2370284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437594
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41032	NC_022221	CGC	2	6	2370692	2370697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437594
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41034	NC_022221	CG	3	6	2370826	2370831	0 %	0 %	50 %	50 %	537437594
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41043	NC_022221	TTG	2	6	2371249	2371254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437595
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41051	NC_022221	CGC	2	6	2371550	2371555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437595
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41053	NC_022221	GCG	2	6	2371580	2371585	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437595
41054	NC_022221	ATCGC	2	10	2371591	2371600	20 %	20 %	20 %	40 %	537437595
41055	NC_022221	GCG	2	6	2371628	2371633	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437595
41056	NC_022221	GGCG	2	8	2371662	2371669	0 %	0 %	75 %	25 %	537437595
41057	NC_022221	GCTTC	2	10	2371740	2371749	0 %	40 %	20 %	40 %	537437595
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41062	NC_022221	ACC	2	6	2372033	2372038	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437595
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41066	NC_022221	GTC	2	6	2372137	2372142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437595
41067	NC_022221	GC	3	6	2372156	2372161	0 %	0 %	50 %	50 %	537437595
41068	NC_022221	GGC	2	6	2372200	2372205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437595
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41084	NC_022221	CGTCA	2	10	2372588	2372597	20 %	20 %	20 %	40 %	537437596
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41088	NC_022221	CCG	2	6	2372734	2372739	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437596
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41101	NC_022221	TGCG	2	8	2373086	2373093	0 %	25 %	50 %	25 %	537437596
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41105	NC_022221	GCG	2	6	2373222	2373227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437597
41106	NC_022221	A	6	6	2373265	2373270	100 %	0 %	0 %	0 %	537437597
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41111	NC_022221	GGCGC	2	10	2373433	2373442	0 %	0 %	60 %	40 %	537437597
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41114	NC_022221	CGG	2	6	2373631	2373636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437597
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41232	NC_022221	CGT	2	6	2378333	2378338	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437599
41233	NC_022221	TGG	2	6	2378344	2378349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437599
41234	NC_022221	TCT	2	6	2378357	2378362	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537437599
41235	NC_022221	CGC	2	6	2378466	2378471	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437599
41236	NC_022221	CCG	2	6	2378481	2378486	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437599
41237	NC_022221	CGG	2	6	2378501	2378506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437599
41238	NC_022221	GCC	2	6	2378593	2378598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437599
41239	NC_022221	CCG	2	6	2378615	2378620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437599
41240	NC_022221	CGG	3	9	2378694	2378702	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437599
41241	NC_022221	GCT	2	6	2378714	2378719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437599
41242	NC_022221	CGC	2	6	2378850	2378855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437599
41243	NC_022221	CCA	2	6	2378891	2378896	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437599
41244	NC_022221	ATACCA	2	12	2378916	2378927	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	537437599
41245	NC_022221	ATC	2	6	2378934	2378939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437599
41246	NC_022221	GC	3	6	2378983	2378988	0 %	0 %	50 %	50 %	537437599
41247	NC_022221	CTACCG	2	12	2379164	2379175	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	537437599
41248	NC_022221	GGC	2	6	2379189	2379194	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437599
41249	NC_022221	AG	3	6	2379252	2379257	50 %	0 %	50 %	0 %	537437599
41250	NC_022221	GCG	2	6	2379286	2379291	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437599
41251	NC_022221	CCT	2	6	2379319	2379324	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537437600
41252	NC_022221	CTG	2	6	2379377	2379382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437600
41253	NC_022221	CGC	2	6	2379440	2379445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437600
41254	NC_022221	AGC	2	6	2379588	2379593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437601
41255	NC_022221	CGC	2	6	2379613	2379618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437601
41256	NC_022221	CCG	2	6	2379639	2379644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437601
41257	NC_022221	CTG	2	6	2379668	2379673	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437601
41258	NC_022221	CACG	2	8	2379727	2379734	25 %	0 %	25 %	50 %	537437601
41259	NC_022221	CG	3	6	2379760	2379765	0 %	0 %	50 %	50 %	537437601
41260	NC_022221	CGG	2	6	2379809	2379814	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437601
41261	NC_022221	CCA	2	6	2379830	2379835	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437601
41262	NC_022221	GCC	2	6	2379908	2379913	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437601
41263	NC_022221	ACC	2	6	2379930	2379935	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437601
41264	NC_022221	CAT	2	6	2379946	2379951	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437601
41265	NC_022221	CTG	2	6	2379992	2379997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437601
41266	NC_022221	GCCA	2	8	2380002	2380009	25 %	0 %	25 %	50 %	537437601
41267	NC_022221	GGT	2	6	2380042	2380047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437601
41268	NC_022221	CAG	2	6	2380067	2380072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437601
41269	NC_022221	TGA	2	6	2380098	2380103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437601
41270	NC_022221	CAG	2	6	2380160	2380165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437601
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41272	NC_022221	GTC	2	6	2380203	2380208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437601
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41283	NC_022221	ATA	2	6	2380826	2380831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437602
41284	NC_022221	ATTTGC	2	12	2380844	2380855	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	537437602
41285	NC_022221	CG	3	6	2380881	2380886	0 %	0 %	50 %	50 %	537437602
41286	NC_022221	CAC	2	6	2380897	2380902	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437602
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41288	NC_022221	ATTC	2	8	2380975	2380982	25 %	50 %	0 %	25 %	537437603
41289	NC_022221	GCGCT	2	10	2381054	2381063	0 %	20 %	40 %	40 %	537437603
41290	NC_022221	GTG	2	6	2381083	2381088	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437603
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41294	NC_022221	GC	3	6	2381164	2381169	0 %	0 %	50 %	50 %	537437603
41295	NC_022221	ATC	2	6	2381182	2381187	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437603
41296	NC_022221	CCA	2	6	2381222	2381227	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437603
41297	NC_022221	GCG	2	6	2381345	2381350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437603
41298	NC_022221	GCC	2	6	2381382	2381387	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437603
41299	NC_022221	GAT	2	6	2381391	2381396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437603
41300	NC_022221	TGC	2	6	2381411	2381416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437603
41301	NC_022221	CGGCG	2	10	2381445	2381454	0 %	0 %	60 %	40 %	537437603
41302	NC_022221	A	6	6	2381479	2381484	100 %	0 %	0 %	0 %	537437603
41303	NC_022221	CTGGAG	2	12	2381779	2381790	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	537437603
41304	NC_022221	ACT	2	6	2381903	2381908	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437603
41305	NC_022221	CT	3	6	2381907	2381912	0 %	50 %	0 %	50 %	537437603
41306	NC_022221	CGG	2	6	2381922	2381927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437603
41307	NC_022221	AAT	2	6	2381932	2381937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437603
41308	NC_022221	ACC	2	6	2381944	2381949	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437603
41309	NC_022221	GGC	2	6	2382007	2382012	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437603
41310	NC_022221	ATGCCG	2	12	2382050	2382061	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	537437603
41311	NC_022221	CCTT	2	8	2382096	2382103	0 %	50 %	0 %	50 %	537437603
41312	NC_022221	CTG	2	6	2382109	2382114	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437603
41313	NC_022221	G	6	6	2382195	2382200	0 %	0 %	100 %	0 %	537437603
41314	NC_022221	CAG	2	6	2382216	2382221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437603
41315	NC_022221	TC	3	6	2382257	2382262	0 %	50 %	0 %	50 %	537437603
41316	NC_022221	ACA	2	6	2382275	2382280	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437603
41317	NC_022221	ATC	2	6	2382326	2382331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437603
41318	NC_022221	GCT	2	6	2382518	2382523	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437603
41319	NC_022221	ATG	2	6	2382526	2382531	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437603
41320	NC_022221	GAT	2	6	2382538	2382543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437603
41321	NC_022221	TGGC	3	12	2382597	2382608	0 %	25 %	50 %	25 %	537437603
41322	NC_022221	CAA	2	6	2382678	2382683	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437603
41323	NC_022221	TGC	2	6	2382803	2382808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437603
41324	NC_022221	ATT	2	6	2382844	2382849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437603
41325	NC_022221	GAA	2	6	2382942	2382947	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437603
41326	NC_022221	AAGC	2	8	2382985	2382992	50 %	0 %	25 %	25 %	537437603
41327	NC_022221	TTG	2	6	2383010	2383015	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537437603
41328	NC_022221	GGCG	2	8	2383146	2383153	0 %	0 %	75 %	25 %	537437603
41329	NC_022221	ACGT	2	8	2383182	2383189	25 %	25 %	25 %	25 %	537437603
41330	NC_022221	CCCTT	2	10	2383283	2383292	0 %	40 %	0 %	60 %	537437604
41331	NC_022221	TCG	2	6	2383313	2383318	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437604
41332	NC_022221	AGC	2	6	2383330	2383335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437604
41333	NC_022221	TCA	2	6	2383365	2383370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437604
41334	NC_022221	GCC	2	6	2383429	2383434	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437604
41335	NC_022221	GCA	2	6	2383520	2383525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437604
41336	NC_022221	A	6	6	2383589	2383594	100 %	0 %	0 %	0 %	537437604
41337	NC_022221	AC	3	6	2383605	2383610	50 %	0 %	0 %	50 %	537437604
41338	NC_022221	ATT	2	6	2383633	2383638	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437604
41339	NC_022221	GCTC	2	8	2383670	2383677	0 %	25 %	25 %	50 %	537437604
41340	NC_022221	AG	3	6	2383716	2383721	50 %	0 %	50 %	0 %	537437604
41341	NC_022221	CTG	2	6	2383813	2383818	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437604
41342	NC_022221	GCC	2	6	2383828	2383833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437604
41343	NC_022221	ATG	2	6	2383834	2383839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437604
41344	NC_022221	CCGT	2	8	2383850	2383857	0 %	25 %	25 %	50 %	537437604
41345	NC_022221	TTA	2	6	2383886	2383891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437604
41346	NC_022221	GGC	3	9	2384193	2384201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437605
41347	NC_022221	GCA	2	6	2384217	2384222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437605
41348	NC_022221	GGC	2	6	2384235	2384240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437605
41349	NC_022221	GCG	3	9	2384264	2384272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437605
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41450	NC_022221	TAT	2	6	2389707	2389712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437611
41451	NC_022221	CGC	2	6	2389743	2389748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437611
41452	NC_022221	CGG	2	6	2389749	2389754	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437611
41453	NC_022221	TCG	2	6	2389817	2389822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437611
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41455	NC_022221	GCCAGC	2	12	2389934	2389945	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537437611
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41459	NC_022221	TCA	2	6	2390264	2390269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437612
41460	NC_022221	AGA	2	6	2390320	2390325	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537437613
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41462	NC_022221	TGG	2	6	2390361	2390366	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437613
41463	NC_022221	TAT	2	6	2390377	2390382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437613
41464	NC_022221	CAG	2	6	2390391	2390396	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437613
41465	NC_022221	ATT	2	6	2390408	2390413	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437613
41466	NC_022221	GC	3	6	2390431	2390436	0 %	0 %	50 %	50 %	537437613
41467	NC_022221	CGCCAG	2	12	2390449	2390460	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	537437613
41468	NC_022221	ATT	2	6	2390480	2390485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437613
41469	NC_022221	ATT	2	6	2390497	2390502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537437613
41470	NC_022221	CAT	2	6	2390530	2390535	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437613
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41473	NC_022221	CTG	2	6	2390630	2390635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437613
41474	NC_022221	CTG	2	6	2390648	2390653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437613
41475	NC_022221	CGC	2	6	2390686	2390691	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437613
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41478	NC_022221	CTG	2	6	2390771	2390776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437613
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41480	NC_022221	ATA	2	6	2390994	2390999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537437613
41481	NC_022221	CAC	2	6	2391004	2391009	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437613
41482	NC_022221	CGG	2	6	2391070	2391075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437613
41483	NC_022221	GCA	2	6	2391090	2391095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437613
41484	NC_022221	GAT	3	9	2391128	2391136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537437613
41485	NC_022221	TCA	2	6	2391190	2391195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437613
41486	NC_022221	AAC	2	6	2391216	2391221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537437613
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41488	NC_022221	CCA	2	6	2391304	2391309	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537437613
41489	NC_022221	CGT	2	6	2391403	2391408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537437613
41490	NC_022221	GTG	2	6	2391461	2391466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537437613
41491	NC_022221	TCA	2	6	2391487	2391492	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537437613
41492	NC_022221	GCA	2	6	2391645	2391650	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437614
41493	NC_022221	CGG	2	6	2391732	2391737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537437614
41494	NC_022221	ACG	2	6	2391775	2391780	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537437614
41495	NC_022221	CGC	2	6	2391784	2391789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437614
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41497	NC_022221	CGC	2	6	2391951	2391956	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437614
41498	NC_022221	CGC	2	6	2392035	2392040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537437614
41499	NC_022221	TA	3	6	2392044	2392049	50 %	50 %	0 %	0 %	537437614
41500	NC_022221	GCGAC	2	10	2392056	2392065	20 %	0 %	40 %	40 %	537437614

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