MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17501	NC_022221	ACG	2	6	1000519	1000524	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436260
17502	NC_022221	GC	3	6	1000593	1000598	0 %	0 %	50 %	50 %	537436260
17503	NC_022221	CG	4	8	1000720	1000727	0 %	0 %	50 %	50 %	537436260
17504	NC_022221	GTG	2	6	1000770	1000775	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436260
17505	NC_022221	CGA	2	6	1000873	1000878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436260
17506	NC_022221	AGC	2	6	1000983	1000988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436260
17507	NC_022221	AAGGT	2	10	1001119	1001128	40 %	20 %	40 %	0 %	537436260
17508	NC_022221	ATG	2	6	1001152	1001157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436260
17509	NC_022221	TCG	2	6	1001173	1001178	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436260
17510	NC_022221	TGC	2	6	1001290	1001295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436260
17511	NC_022221	CGC	2	6	1001301	1001306	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436260
17512	NC_022221	TGG	2	6	1001368	1001373	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436260
17513	NC_022221	A	6	6	1001394	1001399	100 %	0 %	0 %	0 %	537436260
17514	NC_022221	GCC	2	6	1001402	1001407	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436260
17515	NC_022221	TGC	2	6	1001506	1001511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436260
17516	NC_022221	GAA	2	6	1001531	1001536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436260
17517	NC_022221	AAC	2	6	1001622	1001627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436261
17518	NC_022221	CTG	2	6	1001644	1001649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17519	NC_022221	AGA	2	6	1001739	1001744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436261
17520	NC_022221	TTAA	2	8	1001815	1001822	50 %	50 %	0 %	0 %	537436261
17521	NC_022221	GAT	2	6	1001824	1001829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436261
17522	NC_022221	AACC	2	8	1001898	1001905	50 %	0 %	0 %	50 %	537436261
17523	NC_022221	CGC	2	6	1001948	1001953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17524	NC_022221	AGA	2	6	1001976	1001981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436261
17525	NC_022221	GCGA	2	8	1001986	1001993	25 %	0 %	50 %	25 %	537436261
17526	NC_022221	CGC	2	6	1002022	1002027	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17527	NC_022221	CGT	2	6	1002060	1002065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17528	NC_022221	TCA	2	6	1002113	1002118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436261
17529	NC_022221	TGG	2	6	1002131	1002136	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436261
17530	NC_022221	TGC	2	6	1002179	1002184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17531	NC_022221	CTG	2	6	1002219	1002224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17532	NC_022221	GC	3	6	1002399	1002404	0 %	0 %	50 %	50 %	537436261
17533	NC_022221	CGC	2	6	1002435	1002440	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17534	NC_022221	TGGA	2	8	1002508	1002515	25 %	25 %	50 %	0 %	537436261
17535	NC_022221	T	6	6	1002548	1002553	0 %	100 %	0 %	0 %	537436261
17536	NC_022221	CGC	4	12	1002559	1002570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17537	NC_022221	GCC	2	6	1002608	1002613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17538	NC_022221	TGG	2	6	1002638	1002643	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436261
17539	NC_022221	TGA	2	6	1002662	1002667	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436261
17540	NC_022221	GCG	2	6	1002668	1002673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436261
17541	NC_022221	GGAT	2	8	1002752	1002759	25 %	25 %	50 %	0 %	537436261
17542	NC_022221	CCG	2	6	1002815	1002820	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17543	NC_022221	ACT	2	6	1002851	1002856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436261
17544	NC_022221	GTTC	2	8	1002929	1002936	0 %	50 %	25 %	25 %	537436261
17545	NC_022221	GGC	2	6	1002969	1002974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436261
17546	NC_022221	GCC	2	6	1003041	1003046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17547	NC_022221	CTG	2	6	1003051	1003056	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17548	NC_022221	CCG	2	6	1003074	1003079	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17549	NC_022221	TGA	2	6	1003097	1003102	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436261
17550	NC_022221	TGC	2	6	1003340	1003345	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17551	NC_022221	GCT	2	6	1003359	1003364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17552	NC_022221	TAT	2	6	1003368	1003373	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436261
17553	NC_022221	CGA	2	6	1003548	1003553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17554	NC_022221	CTG	3	9	1003600	1003608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436261
17555	NC_022221	CTGG	2	8	1003659	1003666	0 %	25 %	50 %	25 %	537436261
17556	NC_022221	CGC	2	6	1003781	1003786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17557	NC_022221	CGC	2	6	1003828	1003833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436261
17558	NC_022221	ATGC	2	8	1003855	1003862	25 %	25 %	25 %	25 %	537436261
17559	NC_022221	AAACG	2	10	1003971	1003980	60 %	0 %	20 %	20 %	537436261
17560	NC_022221	AG	3	6	1004070	1004075	50 %	0 %	50 %	0 %	537436261
17561	NC_022221	TC	3	6	1004104	1004109	0 %	50 %	0 %	50 %	537436261
17562	NC_022221	TAT	2	6	1004284	1004289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436262
17563	NC_022221	CAG	2	6	1004290	1004295	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436262
17564	NC_022221	CAC	2	6	1004438	1004443	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436262
17565	NC_022221	ATT	2	6	1004914	1004919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436263
17566	NC_022221	CGT	2	6	1004937	1004942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436263
17567	NC_022221	ATAG	2	8	1004957	1004964	50 %	25 %	25 %	0 %	537436263
17568	NC_022221	AAC	2	6	1004970	1004975	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436263
17569	NC_022221	TGGT	2	8	1005108	1005115	0 %	50 %	50 %	0 %	537436263
17570	NC_022221	CAG	2	6	1005128	1005133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436263
17571	NC_022221	GCA	2	6	1005148	1005153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436263
17572	NC_022221	GC	3	6	1005154	1005159	0 %	0 %	50 %	50 %	537436263
17573	NC_022221	CCG	2	6	1005163	1005168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436263
17574	NC_022221	CAG	3	9	1005230	1005238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436263
17575	NC_022221	AAT	2	6	1005245	1005250	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436263
17576	NC_022221	CGA	2	6	1005256	1005261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436263
17577	NC_022221	G	6	6	1005307	1005312	0 %	0 %	100 %	0 %	537436263
17578	NC_022221	GCC	2	6	1005324	1005329	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436263
17579	NC_022221	ATC	2	6	1005348	1005353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436263
17580	NC_022221	AAT	2	6	1005443	1005448	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436263
17581	NC_022221	GTG	2	6	1005453	1005458	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436263
17582	NC_022221	T	6	6	1005486	1005491	0 %	100 %	0 %	0 %	537436263
17583	NC_022221	T	6	6	1005527	1005532	0 %	100 %	0 %	0 %	537436263
17584	NC_022221	TGAA	2	8	1005555	1005562	50 %	25 %	25 %	0 %	537436263
17585	NC_022221	AAG	2	6	1005564	1005569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436263
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17587	NC_022221	A	6	6	1005608	1005613	100 %	0 %	0 %	0 %	537436263
17588	NC_022221	CCGC	2	8	1005648	1005655	0 %	0 %	25 %	75 %	537436263
17589	NC_022221	CGC	2	6	1005673	1005678	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436263
17590	NC_022221	CGC	2	6	1005682	1005687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436263
17591	NC_022221	AG	3	6	1005692	1005697	50 %	0 %	50 %	0 %	537436263
17592	NC_022221	CAG	2	6	1005776	1005781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436263
17593	NC_022221	TAA	2	6	1005785	1005790	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436263
17594	NC_022221	CG	3	6	1005791	1005796	0 %	0 %	50 %	50 %	537436263
17595	NC_022221	GC	3	6	1005982	1005987	0 %	0 %	50 %	50 %	537436263
17596	NC_022221	AG	3	6	1006018	1006023	50 %	0 %	50 %	0 %	537436263
17597	NC_022221	TGC	2	6	1006049	1006054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436263
17598	NC_022221	A	6	6	1006062	1006067	100 %	0 %	0 %	0 %	537436263
17599	NC_022221	CAGCC	2	10	1006068	1006077	20 %	0 %	20 %	60 %	537436263
17600	NC_022221	GCG	2	6	1006323	1006328	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436264
17601	NC_022221	CAT	2	6	1006356	1006361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436264
17602	NC_022221	CAA	2	6	1006373	1006378	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436264
17603	NC_022221	GAA	2	6	1006439	1006444	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436264
17604	NC_022221	ATA	2	6	1006495	1006500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436264
17605	NC_022221	GC	3	6	1006515	1006520	0 %	0 %	50 %	50 %	537436264
17606	NC_022221	GC	3	6	1006585	1006590	0 %	0 %	50 %	50 %	537436264
17607	NC_022221	CGC	2	6	1006628	1006633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436264
17608	NC_022221	CGCT	2	8	1006871	1006878	0 %	25 %	25 %	50 %	537436264
17609	NC_022221	TCCA	2	8	1006879	1006886	25 %	25 %	0 %	50 %	537436264
17610	NC_022221	ACC	2	6	1006966	1006971	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436264
17611	NC_022221	GCG	2	6	1007040	1007045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436264
17612	NC_022221	ACCA	2	8	1007119	1007126	50 %	0 %	0 %	50 %	537436264
17613	NC_022221	GC	3	6	1007129	1007134	0 %	0 %	50 %	50 %	537436264
17614	NC_022221	TCGCC	2	10	1007527	1007536	0 %	20 %	20 %	60 %	537436265
17615	NC_022221	GCA	2	6	1007537	1007542	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436265
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17617	NC_022221	TGC	2	6	1007746	1007751	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436265
17618	NC_022221	TCG	2	6	1007773	1007778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436265
17619	NC_022221	GGC	2	6	1007834	1007839	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436265
17620	NC_022221	CGG	2	6	1007941	1007946	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436265
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17967	NC_022221	CTG	2	6	1025448	1025453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436288
17968	NC_022221	GCA	2	6	1025520	1025525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436289
17969	NC_022221	GC	3	6	1025589	1025594	0 %	0 %	50 %	50 %	537436289
17970	NC_022221	TGT	2	6	1025609	1025614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436289
17971	NC_022221	GC	3	6	1025636	1025641	0 %	0 %	50 %	50 %	537436289
17972	NC_022221	GTC	2	6	1025643	1025648	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436289
17973	NC_022221	GAC	2	6	1025655	1025660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436289
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17996	NC_022221	GCA	2	6	1026887	1026892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436290
17997	NC_022221	GCTG	2	8	1026974	1026981	0 %	25 %	50 %	25 %	537436290
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