MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
17001	NC_022221	TGT	2	6	968883	968888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436224
17002	NC_022221	TCT	2	6	968898	968903	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436224
17003	NC_022221	CTG	2	6	968910	968915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436224
17004	NC_022221	CAC	2	6	968938	968943	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436224
17005	NC_022221	TTA	2	6	969183	969188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436225
17006	NC_022221	TCGA	2	8	969189	969196	25 %	25 %	25 %	25 %	537436225
17007	NC_022221	GGT	2	6	969300	969305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436225
17008	NC_022221	GAA	2	6	969407	969412	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436226
17009	NC_022221	CTGGCG	2	12	969438	969449	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	537436226
17010	NC_022221	GTG	2	6	969454	969459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436226
17011	NC_022221	ATAACA	2	12	969526	969537	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	537436226
17012	NC_022221	A	6	6	969687	969692	100 %	0 %	0 %	0 %	537436226
17013	NC_022221	GTC	2	6	969730	969735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436226
17014	NC_022221	GT	3	6	969796	969801	0 %	50 %	50 %	0 %	537436226
17015	NC_022221	GAAT	2	8	969868	969875	50 %	25 %	25 %	0 %	537436226
17016	NC_022221	CTG	2	6	969880	969885	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436226
17017	NC_022221	AG	3	6	969984	969989	50 %	0 %	50 %	0 %	537436227
17018	NC_022221	TGC	2	6	970059	970064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436227
17019	NC_022221	TGT	2	6	970065	970070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436227
17020	NC_022221	TGT	2	6	970073	970078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436227
17021	NC_022221	CTA	2	6	970118	970123	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436227
17022	NC_022221	TTG	2	6	970154	970159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436227
17023	NC_022221	GAA	2	6	970199	970204	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436227
17024	NC_022221	ATG	2	6	970395	970400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436228
17025	NC_022221	ATT	2	6	970456	970461	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436228
17026	NC_022221	TCTT	2	8	970473	970480	0 %	75 %	0 %	25 %	537436228
17027	NC_022221	TAT	2	6	970484	970489	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436228
17028	NC_022221	A	6	6	970569	970574	100 %	0 %	0 %	0 %	537436228
17029	NC_022221	TA	3	6	970579	970584	50 %	50 %	0 %	0 %	537436228
17030	NC_022221	AT	3	6	970636	970641	50 %	50 %	0 %	0 %	537436228
17031	NC_022221	TTG	2	6	970661	970666	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436228
17032	NC_022221	TCTA	2	8	970667	970674	25 %	50 %	0 %	25 %	537436228
17033	NC_022221	GCGT	2	8	970700	970707	0 %	25 %	50 %	25 %	537436228
17034	NC_022221	ATG	2	6	970765	970770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436228
17035	NC_022221	TAA	2	6	970781	970786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436228
17036	NC_022221	AT	3	6	970819	970824	50 %	50 %	0 %	0 %	537436228
17037	NC_022221	ATTC	2	8	970879	970886	25 %	50 %	0 %	25 %	537436228
17038	NC_022221	A	7	7	970889	970895	100 %	0 %	0 %	0 %	537436228
17039	NC_022221	ATGA	2	8	970902	970909	50 %	25 %	25 %	0 %	537436228
17040	NC_022221	AATT	2	8	970957	970964	50 %	50 %	0 %	0 %	537436228
17041	NC_022221	ATT	2	6	970971	970976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436228
17042	NC_022221	AGG	2	6	971011	971016	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	537436228
17043	NC_022221	AAG	2	6	971020	971025	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436228
17044	NC_022221	ATC	3	9	971075	971083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436228
17045	NC_022221	AAT	2	6	971112	971117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436228
17046	NC_022221	TAAA	2	8	971283	971290	75 %	25 %	0 %	0 %	537436228
17047	NC_022221	ATT	3	9	971321	971329	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436229
17048	NC_022221	GAC	2	6	971440	971445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436229
17049	NC_022221	AACG	2	8	971452	971459	50 %	0 %	25 %	25 %	537436229
17050	NC_022221	TGCT	2	8	971491	971498	0 %	50 %	25 %	25 %	537436229
17051	NC_022221	TCA	2	6	971574	971579	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436229
17052	NC_022221	TC	3	6	971656	971661	0 %	50 %	0 %	50 %	537436229
17053	NC_022221	TA	3	6	971663	971668	50 %	50 %	0 %	0 %	537436229
17054	NC_022221	CTA	2	6	971671	971676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436229
17055	NC_022221	AAAC	2	8	971696	971703	75 %	0 %	0 %	25 %	537436229
17056	NC_022221	CTC	2	6	971733	971738	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436229
17057	NC_022221	TTC	2	6	971751	971756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
17058	NC_022221	TTC	2	6	971832	971837	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
17059	NC_022221	TTTAC	2	10	971847	971856	20 %	60 %	0 %	20 %	537436229
17060	NC_022221	TTG	2	6	971884	971889	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436229
17061	NC_022221	TCT	2	6	971894	971899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
17062	NC_022221	GT	3	6	971909	971914	0 %	50 %	50 %	0 %	537436229
17063	NC_022221	TTC	2	6	971966	971971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
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17065	NC_022221	CTT	2	6	972053	972058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
17066	NC_022221	GTTT	2	8	972164	972171	0 %	75 %	25 %	0 %	537436229
17067	NC_022221	TTC	2	6	972200	972205	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
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17069	NC_022221	GA	3	6	972257	972262	50 %	0 %	50 %	0 %	537436229
17070	NC_022221	TTC	2	6	972278	972283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
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17072	NC_022221	TCT	2	6	972349	972354	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436229
17073	NC_022221	T	6	6	972374	972379	0 %	100 %	0 %	0 %	537436229
17074	NC_022221	ATC	2	6	972471	972476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436229
17075	NC_022221	T	6	6	972518	972523	0 %	100 %	0 %	0 %	537436229
17076	NC_022221	TCA	2	6	972528	972533	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436229
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17080	NC_022221	AATAT	2	10	972669	972678	60 %	40 %	0 %	0 %	537436229
17081	NC_022221	TCTGT	2	10	972690	972699	0 %	60 %	20 %	20 %	537436229
17082	NC_022221	ATC	2	6	972728	972733	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436229
17083	NC_022221	CTTCG	2	10	972784	972793	0 %	40 %	20 %	40 %	537436229
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17085	NC_022221	A	6	6	974210	974215	100 %	0 %	0 %	0 %	537436230
17086	NC_022221	ATT	2	6	974233	974238	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436230
17087	NC_022221	ATT	2	6	974252	974257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436230
17088	NC_022221	TAG	3	9	974265	974273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436230
17089	NC_022221	TAA	2	6	974329	974334	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436230
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17091	NC_022221	CAGG	2	8	974348	974355	25 %	0 %	50 %	25 %	537436230
17092	NC_022221	ATA	2	6	974436	974441	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436230
17093	NC_022221	GCTG	2	8	974500	974507	0 %	25 %	50 %	25 %	537436230
17094	NC_022221	GGCA	2	8	974509	974516	25 %	0 %	50 %	25 %	537436230
17095	NC_022221	AGT	2	6	974545	974550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436230
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17099	NC_022221	TTAA	2	8	974638	974645	50 %	50 %	0 %	0 %	537436230
17100	NC_022221	AAAGA	2	10	974704	974713	80 %	0 %	20 %	0 %	537436231
17101	NC_022221	TAA	2	6	974881	974886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436231
17102	NC_022221	TGAA	2	8	974982	974989	50 %	25 %	25 %	0 %	537436231
17103	NC_022221	TCT	2	6	975032	975037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436231
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17105	NC_022221	CAG	2	6	975165	975170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436231
17106	NC_022221	TAA	2	6	975259	975264	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436231
17107	NC_022221	TAA	2	6	975379	975384	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436231
17108	NC_022221	TGG	2	6	975421	975426	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436231
17109	NC_022221	TTC	2	6	975433	975438	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436231
17110	NC_022221	AAT	2	6	975448	975453	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436231
17111	NC_022221	GCA	2	6	975455	975460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436231
17112	NC_022221	ATA	2	6	975467	975472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436231
17113	NC_022221	GGC	2	6	975506	975511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436231
17114	NC_022221	TAA	2	6	975520	975525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436231
17115	NC_022221	GCAA	2	8	975575	975582	50 %	0 %	25 %	25 %	537436231
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17118	NC_022221	TGG	2	6	975799	975804	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436231
17119	NC_022221	AAAC	2	8	975839	975846	75 %	0 %	0 %	25 %	537436231
17120	NC_022221	GTA	2	6	975891	975896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436231
17121	NC_022221	GCA	2	6	975899	975904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436231
17122	NC_022221	CGA	2	6	975942	975947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436231
17123	NC_022221	TGG	2	6	975955	975960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436231
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17126	NC_022221	TGT	2	6	976036	976041	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436231
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17128	NC_022221	TATT	2	8	976194	976201	25 %	75 %	0 %	0 %	537436231
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17130	NC_022221	GAT	2	6	976259	976264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436231
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17155	NC_022221	T	6	6	977726	977731	0 %	100 %	0 %	0 %	537436232
17156	NC_022221	GA	3	6	977764	977769	50 %	0 %	50 %	0 %	537436232
17157	NC_022221	ACGCT	2	10	977817	977826	20 %	20 %	20 %	40 %	537436232
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17162	NC_022221	CAATA	2	10	979384	979393	60 %	20 %	0 %	20 %	537436234
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17171	NC_022221	GAT	2	6	979522	979527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436234
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17228	NC_022221	A	6	6	983842	983847	100 %	0 %	0 %	0 %	537436239
17229	NC_022221	AGA	2	6	983899	983904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436239
17230	NC_022221	CAT	2	6	983918	983923	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436239
17231	NC_022221	ATC	2	6	983977	983982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436239
17232	NC_022221	CTGA	2	8	984573	984580	25 %	25 %	25 %	25 %	537436240
17233	NC_022221	CAT	2	6	984611	984616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436240
17234	NC_022221	AGA	3	9	984670	984678	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436240
17235	NC_022221	T	7	7	985206	985212	0 %	100 %	0 %	0 %	537436241
17236	NC_022221	ATG	3	9	985220	985228	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436241
17237	NC_022221	T	8	8	985252	985259	0 %	100 %	0 %	0 %	537436241
17238	NC_022221	GTCT	2	8	985280	985287	0 %	50 %	25 %	25 %	537436241
17239	NC_022221	AGGG	2	8	985394	985401	25 %	0 %	75 %	0 %	537436241
17240	NC_022221	TCA	2	6	985482	985487	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436241
17241	NC_022221	AT	3	6	985538	985543	50 %	50 %	0 %	0 %	537436241
17242	NC_022221	AAC	2	6	985694	985699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436241
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17359	NC_022221	A	6	6	992931	992936	100 %	0 %	0 %	0 %	537436250
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17363	NC_022221	GAC	2	6	993090	993095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436251
17364	NC_022221	ACTTCA	2	12	993313	993324	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436251
17365	NC_022221	CTG	2	6	993359	993364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436251
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17483	NC_022221	CACCAG	2	12	999374	999385	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	537436259
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17485	NC_022221	AG	3	6	999443	999448	50 %	0 %	50 %	0 %	537436259
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