MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_022221	GGC	2	6	936655	936660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436190
16502	NC_022221	GAC	2	6	936663	936668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436190
16503	NC_022221	TGCCG	2	10	936739	936748	0 %	20 %	40 %	40 %	537436190
16504	NC_022221	GCGTT	2	10	936830	936839	0 %	40 %	40 %	20 %	537436190
16505	NC_022221	TGT	2	6	936870	936875	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436190
16506	NC_022221	CA	3	6	936900	936905	50 %	0 %	0 %	50 %	537436190
16507	NC_022221	TTA	2	6	936931	936936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436190
16508	NC_022221	A	7	7	937001	937007	100 %	0 %	0 %	0 %	537436191
16509	NC_022221	TGT	2	6	937014	937019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436191
16510	NC_022221	TGG	3	9	937026	937034	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436191
16511	NC_022221	T	6	6	937052	937057	0 %	100 %	0 %	0 %	537436191
16512	NC_022221	CTG	2	6	937184	937189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436191
16513	NC_022221	CT	3	6	937204	937209	0 %	50 %	0 %	50 %	537436191
16514	NC_022221	GCG	2	6	937214	937219	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436191
16515	NC_022221	T	6	6	937224	937229	0 %	100 %	0 %	0 %	537436191
16516	NC_022221	AAC	2	6	937254	937259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436191
16517	NC_022221	TGA	2	6	937264	937269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436191
16518	NC_022221	TGGC	2	8	937338	937345	0 %	25 %	50 %	25 %	537436192
16519	NC_022221	GAT	2	6	937346	937351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436192
16520	NC_022221	GCC	2	6	937370	937375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436192
16521	NC_022221	AGGGC	2	10	937379	937388	20 %	0 %	60 %	20 %	537436192
16522	NC_022221	GCT	2	6	937394	937399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436192
16523	NC_022221	GATG	2	8	937456	937463	25 %	25 %	50 %	0 %	537436192
16524	NC_022221	TTG	2	6	937482	937487	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436192
16525	NC_022221	TGC	2	6	937534	937539	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436192
16526	NC_022221	TGGC	2	8	937540	937547	0 %	25 %	50 %	25 %	537436192
16527	NC_022221	TGA	2	6	937654	937659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436192
16528	NC_022221	GCTT	2	8	937684	937691	0 %	50 %	25 %	25 %	537436192
16529	NC_022221	GC	4	8	937694	937701	0 %	0 %	50 %	50 %	537436192
16530	NC_022221	TTC	2	6	937756	937761	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436192
16531	NC_022221	GGC	3	9	937769	937777	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436192
16532	NC_022221	TCG	2	6	937781	937786	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436192
16533	NC_022221	TAT	2	6	937948	937953	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436193
16534	NC_022221	TGG	2	6	938046	938051	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436193
16535	NC_022221	ACT	2	6	938164	938169	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436193
16536	NC_022221	CAG	2	6	938213	938218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436193
16537	NC_022221	T	6	6	938220	938225	0 %	100 %	0 %	0 %	537436193
16538	NC_022221	GTTTA	2	10	938251	938260	20 %	60 %	20 %	0 %	537436193
16539	NC_022221	CGC	2	6	938294	938299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436193
16540	NC_022221	CGA	2	6	938302	938307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436193
16541	NC_022221	A	8	8	938373	938380	100 %	0 %	0 %	0 %	537436193
16542	NC_022221	GC	3	6	938414	938419	0 %	0 %	50 %	50 %	537436193
16543	NC_022221	CTG	2	6	938442	938447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436193
16544	NC_022221	TGCT	2	8	938475	938482	0 %	50 %	25 %	25 %	537436193
16545	NC_022221	ATC	2	6	938483	938488	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436193
16546	NC_022221	TTAT	2	8	938544	938551	25 %	75 %	0 %	0 %	537436193
16547	NC_022221	GC	3	6	938604	938609	0 %	0 %	50 %	50 %	537436193
16548	NC_022221	CTGG	2	8	938665	938672	0 %	25 %	50 %	25 %	537436193
16549	NC_022221	T	6	6	938723	938728	0 %	100 %	0 %	0 %	537436193
16550	NC_022221	GCAG	2	8	938769	938776	25 %	0 %	50 %	25 %	537436194
16551	NC_022221	GGC	2	6	938820	938825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436194
16552	NC_022221	T	6	6	938840	938845	0 %	100 %	0 %	0 %	537436194
16553	NC_022221	GGGC	2	8	938929	938936	0 %	0 %	75 %	25 %	537436194
16554	NC_022221	TGC	2	6	938993	938998	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436194
16555	NC_022221	CGG	2	6	939173	939178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436194
16556	NC_022221	AATC	2	8	939180	939187	50 %	25 %	0 %	25 %	537436194
16557	NC_022221	TGG	2	6	939248	939253	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436194
16558	NC_022221	GGC	2	6	939268	939273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436194
16559	NC_022221	CGC	2	6	939279	939284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436194
16560	NC_022221	GCT	2	6	939303	939308	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436194
16561	NC_022221	CAA	2	6	939348	939353	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436194
16562	NC_022221	AATCG	2	10	939396	939405	40 %	20 %	20 %	20 %	537436194
16563	NC_022221	GAAGAT	2	12	939457	939468	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	537436194
16564	NC_022221	C	6	6	939506	939511	0 %	0 %	0 %	100 %	537436194
16565	NC_022221	GGC	2	6	939576	939581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436194
16566	NC_022221	CGC	2	6	939610	939615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436194
16567	NC_022221	TGAC	2	8	939626	939633	25 %	25 %	25 %	25 %	537436194
16568	NC_022221	GCT	2	6	939834	939839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436194
16569	NC_022221	ACG	2	6	939874	939879	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436194
16570	NC_022221	GCTG	3	12	939914	939925	0 %	25 %	50 %	25 %	537436194
16571	NC_022221	CGG	2	6	939929	939934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436194
16572	NC_022221	TGC	2	6	939977	939982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436194
16573	NC_022221	AGGA	2	8	939983	939990	50 %	0 %	50 %	0 %	537436194
16574	NC_022221	CCG	2	6	940049	940054	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436194
16575	NC_022221	GGT	2	6	940116	940121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436194
16576	NC_022221	CTG	2	6	940204	940209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436194
16577	NC_022221	CAT	2	6	940248	940253	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436194
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16579	NC_022221	CGGG	2	8	940291	940298	0 %	0 %	75 %	25 %	537436195
16580	NC_022221	TGA	2	6	940382	940387	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436195
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16582	NC_022221	CAT	2	6	940410	940415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436195
16583	NC_022221	GGC	2	6	940456	940461	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436195
16584	NC_022221	GAC	2	6	940497	940502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436195
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16586	NC_022221	CTG	2	6	940542	940547	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436195
16587	NC_022221	GC	3	6	940601	940606	0 %	0 %	50 %	50 %	537436195
16588	NC_022221	GC	3	6	940716	940721	0 %	0 %	50 %	50 %	537436195
16589	NC_022221	CAAC	2	8	940748	940755	50 %	0 %	0 %	50 %	537436195
16590	NC_022221	GCG	2	6	940767	940772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436195
16591	NC_022221	CTGG	2	8	940781	940788	0 %	25 %	50 %	25 %	537436195
16592	NC_022221	TTA	2	6	940848	940853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436196
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16594	NC_022221	GCG	2	6	941006	941011	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436196
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16598	NC_022221	CG	3	6	941095	941100	0 %	0 %	50 %	50 %	537436196
16599	NC_022221	CCG	2	6	941101	941106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436196
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16603	NC_022221	GGC	3	9	941242	941250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436196
16604	NC_022221	TCG	2	6	941385	941390	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436196
16605	NC_022221	TGG	2	6	941430	941435	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436196
16606	NC_022221	GCG	2	6	941444	941449	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436196
16607	NC_022221	GCG	2	6	941513	941518	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436196
16608	NC_022221	CTG	2	6	941543	941548	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436196
16609	NC_022221	GCA	2	6	941652	941657	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436197
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16612	NC_022221	AGGT	2	8	941756	941763	25 %	25 %	50 %	0 %	537436197
16613	NC_022221	GGC	2	6	941850	941855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436197
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16616	NC_022221	GCC	2	6	942133	942138	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436197
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16619	NC_022221	CGT	2	6	942231	942236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436197
16620	NC_022221	GCG	2	6	942237	942242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436197
16621	NC_022221	GCGATT	2	12	942244	942255	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537436197
16622	NC_022221	CG	3	6	942269	942274	0 %	0 %	50 %	50 %	537436197
16623	NC_022221	TGT	2	6	942287	942292	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436197
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16625	NC_022221	CTTT	2	8	942378	942385	0 %	75 %	0 %	25 %	537436197
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16631	NC_022221	GGC	2	6	942609	942614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436197
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16652	NC_022221	CGAG	2	8	946842	946849	25 %	0 %	50 %	25 %	537436199
16653	NC_022221	CTT	2	6	947028	947033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436200
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16664	NC_022221	CGG	2	6	947889	947894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436201
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16732	NC_022221	AATA	2	8	951620	951627	75 %	25 %	0 %	0 %	537436206
16733	NC_022221	GA	3	6	951629	951634	50 %	0 %	50 %	0 %	537436206
16734	NC_022221	T	6	6	951637	951642	0 %	100 %	0 %	0 %	537436206
16735	NC_022221	CGT	2	6	951666	951671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436206
16736	NC_022221	GC	3	6	951696	951701	0 %	0 %	50 %	50 %	537436206
16737	NC_022221	GAT	2	6	951705	951710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436206
16738	NC_022221	CGC	2	6	951742	951747	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436206
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16740	NC_022221	TCA	2	6	951899	951904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436206
16741	NC_022221	CTT	2	6	951909	951914	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436206
16742	NC_022221	CCTT	2	8	951920	951927	0 %	50 %	0 %	50 %	537436206
16743	NC_022221	GCC	2	6	951928	951933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436206
16744	NC_022221	CT	3	6	951982	951987	0 %	50 %	0 %	50 %	537436206
16745	NC_022221	TTTC	2	8	951998	952005	0 %	75 %	0 %	25 %	537436206
16746	NC_022221	CAA	2	6	952029	952034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436206
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16749	NC_022221	CAT	2	6	952224	952229	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436206
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16760	NC_022221	AGGGG	2	10	953016	953025	20 %	0 %	80 %	0 %	537436206
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16772	NC_022221	AT	3	6	953451	953456	50 %	50 %	0 %	0 %	537436206
16773	NC_022221	TTC	2	6	953495	953500	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436206
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16843	NC_022221	A	8	8	957941	957948	100 %	0 %	0 %	0 %	537436213
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16854	NC_022221	T	6	6	958872	958877	0 %	100 %	0 %	0 %	537436214
16855	NC_022221	ATG	2	6	958895	958900	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436214
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16857	NC_022221	TAT	2	6	958978	958983	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436214
16858	NC_022221	A	7	7	959013	959019	100 %	0 %	0 %	0 %	537436214
16859	NC_022221	TAA	2	6	959025	959030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436214
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16983	NC_022221	TGA	2	6	967787	967792	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436222
16984	NC_022221	GAT	2	6	967844	967849	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436222
16985	NC_022221	TAA	2	6	967916	967921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	537436222
16986	NC_022221	AGAA	2	8	967992	967999	75 %	0 %	25 %	0 %	537436222
16987	NC_022221	TAATC	2	10	968002	968011	40 %	40 %	0 %	20 %	537436222
16988	NC_022221	AATC	2	8	968089	968096	50 %	25 %	0 %	25 %	537436223
16989	NC_022221	TG	3	6	968182	968187	0 %	50 %	50 %	0 %	537436223
16990	NC_022221	TGC	2	6	968191	968196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436223
16991	NC_022221	ATC	2	6	968605	968610	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436224
16992	NC_022221	AGACC	2	10	968624	968633	40 %	0 %	20 %	40 %	537436224
16993	NC_022221	TTA	2	6	968636	968641	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436224
16994	NC_022221	GTT	2	6	968649	968654	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436224
16995	NC_022221	ATT	2	6	968677	968682	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436224
16996	NC_022221	ACC	2	6	968716	968721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436224
16997	NC_022221	ATTT	2	8	968737	968744	25 %	75 %	0 %	0 %	537436224
16998	NC_022221	TCA	2	6	968753	968758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436224
16999	NC_022221	TCTTTA	2	12	968774	968785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	537436224
17000	NC_022221	CTG	2	6	968833	968838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436224

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