MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Gallinarum/pullorum str. CDC1983-67

Total Repeats: 79873

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16001	NC_022221	CGC	2	6	911065	911070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436162
16002	NC_022221	GC	3	6	911078	911083	0 %	0 %	50 %	50 %	537436162
16003	NC_022221	TGC	2	6	911088	911093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436162
16004	NC_022221	CGG	2	6	911134	911139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436162
16005	NC_022221	GCC	2	6	911198	911203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436162
16006	NC_022221	TCC	2	6	911297	911302	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	537436163
16007	NC_022221	TTC	2	6	911317	911322	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436163
16008	NC_022221	TGCG	2	8	911391	911398	0 %	25 %	50 %	25 %	537436163
16009	NC_022221	CTTC	2	8	911411	911418	0 %	50 %	0 %	50 %	537436163
16010	NC_022221	CGC	2	6	911494	911499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436163
16011	NC_022221	CG	3	6	911546	911551	0 %	0 %	50 %	50 %	537436163
16012	NC_022221	GGC	2	6	911560	911565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436163
16013	NC_022221	GC	3	6	911564	911569	0 %	0 %	50 %	50 %	537436163
16014	NC_022221	CAG	2	6	911605	911610	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436163
16015	NC_022221	GGCCA	2	10	911617	911626	20 %	0 %	40 %	40 %	537436163
16016	NC_022221	TGG	2	6	911654	911659	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436163
16017	NC_022221	AGCCCC	2	12	911675	911686	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	537436163
16018	NC_022221	CG	3	6	911736	911741	0 %	0 %	50 %	50 %	537436163
16019	NC_022221	CCG	2	6	911766	911771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436163
16020	NC_022221	GGC	2	6	911797	911802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436163
16021	NC_022221	GC	3	6	911834	911839	0 %	0 %	50 %	50 %	537436163
16022	NC_022221	GCG	2	6	911901	911906	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436163
16023	NC_022221	ACC	2	6	911915	911920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436163
16024	NC_022221	TTG	2	6	911960	911965	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436163
16025	NC_022221	TGG	2	6	912039	912044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436163
16026	NC_022221	CTG	2	6	912082	912087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436163
16027	NC_022221	CGC	2	6	912109	912114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436163
16028	NC_022221	GCC	3	9	912127	912135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436163
16029	NC_022221	CAC	2	6	912145	912150	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436163
16030	NC_022221	TG	3	6	912193	912198	0 %	50 %	50 %	0 %	537436163
16031	NC_022221	TGG	2	6	912201	912206	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436163
16032	NC_022221	CAG	2	6	912274	912279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436163
16033	NC_022221	GC	3	6	912286	912291	0 %	0 %	50 %	50 %	537436163
16034	NC_022221	TGGCG	2	10	912492	912501	0 %	20 %	60 %	20 %	537436164
16035	NC_022221	GGT	2	6	912510	912515	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436164
16036	NC_022221	CGC	2	6	912524	912529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436164
16037	NC_022221	ATG	2	6	912639	912644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436164
16038	NC_022221	ACC	2	6	912703	912708	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436164
16039	NC_022221	GCA	2	6	912710	912715	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16040	NC_022221	TCG	2	6	912748	912753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16041	NC_022221	CAG	2	6	912771	912776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16042	NC_022221	CGG	2	6	912806	912811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436164
16043	NC_022221	T	6	6	912846	912851	0 %	100 %	0 %	0 %	537436164
16044	NC_022221	CAGG	2	8	912866	912873	25 %	0 %	50 %	25 %	537436164
16045	NC_022221	TCGG	2	8	912898	912905	0 %	25 %	50 %	25 %	537436164
16046	NC_022221	AGC	3	9	912910	912918	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16047	NC_022221	GC	3	6	912917	912922	0 %	0 %	50 %	50 %	537436164
16048	NC_022221	TGC	2	6	912937	912942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16049	NC_022221	GCAGG	2	10	912993	913002	20 %	0 %	60 %	20 %	537436164
16050	NC_022221	TGA	2	6	913025	913030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436164
16051	NC_022221	CCG	2	6	913037	913042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436164
16052	NC_022221	CCG	2	6	913055	913060	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436164
16053	NC_022221	TCA	2	6	913063	913068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436164
16054	NC_022221	CTT	2	6	913107	913112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436164
16055	NC_022221	GCC	2	6	913146	913151	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436164
16056	NC_022221	CAT	2	6	913185	913190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	537436164
16057	NC_022221	CTG	2	6	913191	913196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16058	NC_022221	CAC	2	6	913227	913232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436164
16059	NC_022221	GCA	2	6	913248	913253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16060	NC_022221	TGA	2	6	913280	913285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436164
16061	NC_022221	AG	3	6	913291	913296	50 %	0 %	50 %	0 %	537436164
16062	NC_022221	CGC	2	6	913341	913346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436164
16063	NC_022221	ATGCTG	2	12	913351	913362	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	537436164
16064	NC_022221	TTG	2	6	913363	913368	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436164
16065	NC_022221	ATG	2	6	913369	913374	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436164
16066	NC_022221	ACCGA	2	10	913402	913411	40 %	0 %	20 %	40 %	537436164
16067	NC_022221	GCC	2	6	913446	913451	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436164
16068	NC_022221	GGT	3	9	913467	913475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436164
16069	NC_022221	TCT	2	6	913480	913485	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436164
16070	NC_022221	TCT	2	6	913531	913536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	537436164
16071	NC_022221	TTG	2	6	913537	913542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436164
16072	NC_022221	CT	3	6	913564	913569	0 %	50 %	0 %	50 %	537436164
16073	NC_022221	CAG	2	6	913584	913589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16074	NC_022221	CTG	2	6	913647	913652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436164
16075	NC_022221	GCG	2	6	913675	913680	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436164
16076	NC_022221	A	6	6	914847	914852	100 %	0 %	0 %	0 %	537436165
16077	NC_022221	GCC	2	6	914869	914874	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436165
16078	NC_022221	CAG	3	9	914983	914991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436165
16079	NC_022221	AAG	2	6	915006	915011	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	537436165
16080	NC_022221	TTAA	2	8	915074	915081	50 %	50 %	0 %	0 %	537436166
16081	NC_022221	GCT	2	6	915101	915106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436166
16082	NC_022221	CG	3	6	915108	915113	0 %	0 %	50 %	50 %	537436166
16083	NC_022221	AGC	2	6	915164	915169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436166
16084	NC_022221	T	7	7	915259	915265	0 %	100 %	0 %	0 %	537436166
16085	NC_022221	GCA	2	6	915279	915284	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436166
16086	NC_022221	GCTG	2	8	915285	915292	0 %	25 %	50 %	25 %	537436166
16087	NC_022221	CGT	2	6	915330	915335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436166
16088	NC_022221	GCG	2	6	915347	915352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436166
16089	NC_022221	TCG	2	6	915356	915361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436166
16090	NC_022221	CAG	2	6	915385	915390	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436166
16091	NC_022221	CGA	2	6	915399	915404	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436166
16092	NC_022221	GCG	2	6	915601	915606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436167
16093	NC_022221	TTG	2	6	915670	915675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436167
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16096	NC_022221	CGA	2	6	915782	915787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436167
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16098	NC_022221	TTG	2	6	915958	915963	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436167
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16101	NC_022221	T	8	8	916032	916039	0 %	100 %	0 %	0 %	537436167
16102	NC_022221	GATGG	2	10	916044	916053	20 %	20 %	60 %	0 %	537436167
16103	NC_022221	TCG	2	6	916138	916143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436167
16104	NC_022221	GAAT	2	8	916206	916213	50 %	25 %	25 %	0 %	537436168
16105	NC_022221	GGAGGG	2	12	916367	916378	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	537436168
16106	NC_022221	CCA	2	6	916429	916434	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436168
16107	NC_022221	GGT	2	6	916466	916471	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436168
16108	NC_022221	GCC	2	6	916476	916481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436168
16109	NC_022221	AGC	2	6	916551	916556	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436168
16110	NC_022221	ACG	2	6	916746	916751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436169
16111	NC_022221	GCC	2	6	916755	916760	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436169
16112	NC_022221	GCT	2	6	916779	916784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436169
16113	NC_022221	CGC	2	6	916801	916806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436169
16114	NC_022221	T	6	6	916837	916842	0 %	100 %	0 %	0 %	537436169
16115	NC_022221	CCA	2	6	916849	916854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	537436169
16116	NC_022221	CGG	2	6	916885	916890	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436169
16117	NC_022221	TTA	2	6	917013	917018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436170
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16119	NC_022221	GCG	2	6	917068	917073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436170
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16240	NC_022221	CTG	2	6	923959	923964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436177
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16358	NC_022221	GTT	2	6	930440	930445	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436182
16359	NC_022221	GCC	2	6	930456	930461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436182
16360	NC_022221	GTG	2	6	930480	930485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436182
16361	NC_022221	TGG	2	6	930529	930534	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436182
16362	NC_022221	GC	3	6	930595	930600	0 %	0 %	50 %	50 %	537436182
16363	NC_022221	ATGA	2	8	930615	930622	50 %	25 %	25 %	0 %	537436182
16364	NC_022221	CG	3	6	930728	930733	0 %	0 %	50 %	50 %	537436182
16365	NC_022221	CG	3	6	930743	930748	0 %	0 %	50 %	50 %	537436182
16366	NC_022221	ATGAA	2	10	930844	930853	60 %	20 %	20 %	0 %	537436182
16367	NC_022221	GTG	2	6	930858	930863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436182
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16371	NC_022221	GCG	2	6	931015	931020	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436183
16372	NC_022221	GCT	2	6	931077	931082	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436183
16373	NC_022221	TGA	2	6	931083	931088	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436183
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16375	NC_022221	TGA	2	6	931253	931258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436183
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16377	NC_022221	CAGCTT	2	12	931336	931347	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	537436183
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16383	NC_022221	CTG	2	6	931520	931525	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436184
16384	NC_022221	CTG	2	6	931574	931579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436184
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16386	NC_022221	GGC	2	6	931651	931656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436184
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16389	NC_022221	GCG	2	6	931802	931807	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436184
16390	NC_022221	TACCG	2	10	931825	931834	20 %	20 %	20 %	40 %	537436184
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16394	NC_022221	CGG	2	6	931987	931992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436184
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16400	NC_022221	GTC	2	6	932460	932465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436185
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16437	NC_022221	GTC	2	6	934118	934123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436187
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16452	NC_022221	GC	3	6	934657	934662	0 %	0 %	50 %	50 %	537436187
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16457	NC_022221	A	6	6	934761	934766	100 %	0 %	0 %	0 %	537436188
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16460	NC_022221	GGC	2	6	934844	934849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	537436188
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16463	NC_022221	A	6	6	935029	935034	100 %	0 %	0 %	0 %	537436188
16464	NC_022221	AGC	2	6	935100	935105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	537436188
16465	NC_022221	ACA	2	6	935141	935146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436188
16466	NC_022221	GCCA	2	8	935196	935203	25 %	0 %	25 %	50 %	537436188
16467	NC_022221	ATG	2	6	935238	935243	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436188
16468	NC_022221	GC	3	6	935262	935267	0 %	0 %	50 %	50 %	537436188
16469	NC_022221	TGG	2	6	935362	935367	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	537436188
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16475	NC_022221	G	6	6	935665	935670	0 %	0 %	100 %	0 %	537436189
16476	NC_022221	GTT	2	6	935727	935732	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	537436189
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16479	NC_022221	TTA	2	6	935835	935840	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	537436189
16480	NC_022221	GCGAT	2	10	935847	935856	20 %	20 %	40 %	20 %	537436189
16481	NC_022221	T	7	7	935874	935880	0 %	100 %	0 %	0 %	537436189
16482	NC_022221	CGC	2	6	935938	935943	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436189
16483	NC_022221	GCC	2	6	935948	935953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	537436189
16484	NC_022221	CG	3	6	935954	935959	0 %	0 %	50 %	50 %	537436189
16485	NC_022221	ACA	2	6	936040	936045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	537436189
16486	NC_022221	TGA	2	6	936063	936068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436189
16487	NC_022221	CTG	2	6	936119	936124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	537436189
16488	NC_022221	ATG	2	6	936137	936142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	537436189
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